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The map label for this gene is ydhP [H]

Identifier: 57238572

GI number: 57238572

Start: 1627804

End: 1628979

Strand: Reverse

Name: ydhP [H]

Synonym: CJE1728

Alternate gene names: 57238572

Gene position: 1628979-1627804 (Counterclockwise)

Preceding gene: 57238578

Following gene: 57238571

Centisome position: 91.63

GC content: 29.76

Gene sequence:

>1176_bases
ATGAAAAATTTAAATAAAGCTTCAAGTACTCAAATTATTCTAGTATTTTGTTTAGGGGTATTTGGGATTTTGAGCACAGA
ACTAGGGATGATGGGTATAATTCCTATTGTTTCTCAAAATTTCAGTGTAAGTATTTCAGATGCGGGTTGGTGTGCGAGTA
TTTTTGCACTCGTGATAACTTTTTGCGCCCCTATTGTCCCCCTGCTTTGTGCAAATTTCAATCCTAAAAAACTTATGCTT
ATTTGTTTAGCTGTGTTTATCTTAAGCTCGTTAACTTCTGCTTTTGTGAGTGAATTTTGGCAATTGCTTATTTTAAGAGC
TATTCCTGCTTTTTTTCATCCTATTTATATAGCTCTTGCTCTAAGTATGGTTGCAAATTTGGTCGAAGATAAGAAAGAAA
TTCCAAAAGCTACAGCTAAGATTTTTGCAGCAGTTAGTGCTGGAATGGTTTTGGGTGTACCTATGACTAGTTATTTTGGT
GGAAATTTTAGTTTTAAAATGGCAATGTTATTTTTTGTATTTTTAAATACCTTATCTTTTATAGCAACTTTATTTTTTGT
TCCTGATTTTAAAAAAGTAAATTCTGTAAAAATAAGCAAACAATTGCTTATTTTAAGATACCCACTTTTATGGATTAGCA
TACTTTGTGTTATTTGTATAAATGCTGGAATTTGGGGTTTTTACTCTTATTTTTCTGATTTCTTACATAGTGTAGGAAAG
ATGAATTTTACTTTAATTAGTATTGTATTGGCTATTTATGGTTTTTCAAATATTATAGGCAATTATATAGCCGGAAAGAC
CCTTGTTAAAAACGCAAATTTTACTTTGATTTTAACACCTTTAATTATGATAGGATTTTATATTTTACTTTTTAGTTTTT
ATAGTGAAATTATACTTATAATATTTGCCTTTATATTAGGAATTTTAGCAGGTGTGATGAATAACGGCACGCATTTTATG
ATAAGTTATCCCTTTCCAAAGGCTGCTAATTTTAGCAATGGACTTTTTATAAGCGTGGCCAATATAGGATTAAGCACCGG
AACTGCTATTTGTGGACTTGTGATTTCTTTGAGCGATACGCGTTATATTATCGTAAATACTATTGTTTTGTTGATTTTAG
GAATTATCATGATTTTTGTAAGAAGTAGGATAGAAAAAATGAAATTAAGATTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGATTTTATTTAATATAGATAAATATTTTTATTTTAGGTTATTGACTTAGACCTACTCTCATCTTTTATACTTTTAAAA
ATATTAATTGAAAGGATAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTTACTTGACTTAGAGTAGCTCTCATGTTTTATAATACTAAAAAATGAGGTAAAATGCAAGAATTAGAAAAAGCAGG
AATTCATGGAAGTTTTAAAG

Product: transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 391; Mature: 391

Protein sequence:

>391_residues
MKNLNKASSTQIILVFCLGVFGILSTELGMMGIIPIVSQNFSVSISDAGWCASIFALVITFCAPIVPLLCANFNPKKLML
ICLAVFILSSLTSAFVSEFWQLLILRAIPAFFHPIYIALALSMVANLVEDKKEIPKATAKIFAAVSAGMVLGVPMTSYFG
GNFSFKMAMLFFVFLNTLSFIATLFFVPDFKKVNSVKISKQLLILRYPLLWISILCVICINAGIWGFYSYFSDFLHSVGK
MNFTLISIVLAIYGFSNIIGNYIAGKTLVKNANFTLILTPLIMIGFYILLFSFYSEIILIIFAFILGILAGVMNNGTHFM
ISYPFPKAANFSNGLFISVANIGLSTGTAICGLVISLSDTRYIIVNTIVLLILGIIMIFVRSRIEKMKLRF

Sequences:

>Translated_391_residues
MKNLNKASSTQIILVFCLGVFGILSTELGMMGIIPIVSQNFSVSISDAGWCASIFALVITFCAPIVPLLCANFNPKKLML
ICLAVFILSSLTSAFVSEFWQLLILRAIPAFFHPIYIALALSMVANLVEDKKEIPKATAKIFAAVSAGMVLGVPMTSYFG
GNFSFKMAMLFFVFLNTLSFIATLFFVPDFKKVNSVKISKQLLILRYPLLWISILCVICINAGIWGFYSYFSDFLHSVGK
MNFTLISIVLAIYGFSNIIGNYIAGKTLVKNANFTLILTPLIMIGFYILLFSFYSEIILIIFAFILGILAGVMNNGTHFM
ISYPFPKAANFSNGLFISVANIGLSTGTAICGLVISLSDTRYIIVNTIVLLILGIIMIFVRSRIEKMKLRF
>Mature_391_residues
MKNLNKASSTQIILVFCLGVFGILSTELGMMGIIPIVSQNFSVSISDAGWCASIFALVITFCAPIVPLLCANFNPKKLML
ICLAVFILSSLTSAFVSEFWQLLILRAIPAFFHPIYIALALSMVANLVEDKKEIPKATAKIFAAVSAGMVLGVPMTSYFG
GNFSFKMAMLFFVFLNTLSFIATLFFVPDFKKVNSVKISKQLLILRYPLLWISILCVICINAGIWGFYSYFSDFLHSVGK
MNFTLISIVLAIYGFSNIIGNYIAGKTLVKNANFTLILTPLIMIGFYILLFSFYSEIILIIFAFILGILAGVMNNGTHFM
ISYPFPKAANFSNGLFISVANIGLSTGTAICGLVISLSDTRYIIVNTIVLLILGIIMIFVRSRIEKMKLRF

Specific function: Unknown

COG id: COG2814

COG function: function code G; Arabinose efflux permease

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787947, Length=264, Percent_Identity=26.1363636363636, Blast_Score=111, Evalue=1e-25,
Organism=Escherichia coli, GI1786595, Length=256, Percent_Identity=23.828125, Blast_Score=107, Evalue=2e-24,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43136; Mature: 43136

Theoretical pI: Translated: 9.80; Mature: 9.80

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.0 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
5.9 %Cys+Met (Translated Protein)
2.0 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
5.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKNLNKASSTQIILVFCLGVFGILSTELGMMGIIPIVSQNFSVSISDAGWCASIFALVIT
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHH
FCAPIVPLLCANFNPKKLMLICLAVFILSSLTSAFVSEFWQLLILRAIPAFFHPIYIALA
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSMVANLVEDKKEIPKATAKIFAAVSAGMVLGVPMTSYFGGNFSFKMAMLFFVFLNTLSF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IATLFFVPDFKKVNSVKISKQLLILRYPLLWISILCVICINAGIWGFYSYFSDFLHSVGK
HHHHHHCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHC
MNFTLISIVLAIYGFSNIIGNYIAGKTLVKNANFTLILTPLIMIGFYILLFSFYSEIILI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFAFILGILAGVMNNGTHFMISYPFPKAANFSNGLFISVANIGLSTGTAICGLVISLSDT
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCC
RYIIVNTIVLLILGIIMIFVRSRIEKMKLRF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKNLNKASSTQIILVFCLGVFGILSTELGMMGIIPIVSQNFSVSISDAGWCASIFALVIT
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHH
FCAPIVPLLCANFNPKKLMLICLAVFILSSLTSAFVSEFWQLLILRAIPAFFHPIYIALA
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSMVANLVEDKKEIPKATAKIFAAVSAGMVLGVPMTSYFGGNFSFKMAMLFFVFLNTLSF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IATLFFVPDFKKVNSVKISKQLLILRYPLLWISILCVICINAGIWGFYSYFSDFLHSVGK
HHHHHHCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHC
MNFTLISIVLAIYGFSNIIGNYIAGKTLVKNANFTLILTPLIMIGFYILLFSFYSEIILI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFAFILGILAGVMNNGTHFMISYPFPKAANFSNGLFISVANIGLSTGTAICGLVISLSDT
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCC
RYIIVNTIVLLILGIIMIFVRSRIEKMKLRF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]