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The map label for this gene is 57238417

Identifier: 57238417

GI number: 57238417

Start: 1464548

End: 1467019

Strand: Direct

Name: 57238417

Synonym: CJE1565

Alternate gene names: NA

Gene position: 1464548-1467019 (Clockwise)

Preceding gene: 57238416

Following gene: 57238419

Centisome position: 82.38

GC content: 29.57

Gene sequence:

>2472_bases
ATGTTTGCAAAGCTTTTAAAGTTTTTTATTTCTCGTCCAAAAAGTACTTTTTTTGGAACCTTGTTTATATGCCTGCTTTT
AAGCTTTTTTGCTTTTAAGCTTAGCGTAGATGCAAGTGCTGAAAGTTTACTTTTAGAAGATGATGCAGATTTAAAAACTT
TTAGAGAAATTTCAAAACATTATAAAAGTGATAATTTTTTACTTTTAGCCTTCAAACCCTATGATGAAAAACCTTTTTCA
AATGAAAATTTAGCCAAATTAAAAAAACTTCATAAAGAATTAGAAAAGGCCCCTTTAGTAGAGCGCGTTTTTAGCATCAT
CAATGCCCCTTTGCTTCAAAGTTCACAAAATACGGATTTAAAAGAACTGTTAAAAAATATCCCAAACATAGAAAGCCAAG
ATATAAACCGCACAAAAGCCCGAAACGAAATTTTAAATAGTCCCTTTTATAAAAATAATATCATCTCAAAAGATGGAAAA
GTAACAGGGCTTATTATTTACTTAAAGCCTGATACAGTTTATAATGATCTTGTAGAAAAACGCGATCTTGCTACCGATGA
AAAAGAAAAAGATCAAATTCGTCTTGCTATAAAAAAACATCAAGACAAGCAAAAAGTTATCACGAAACAAAGTCTAGATA
CTATTAAAAGCATAGTTCGAAATTATGAAAAAAATAAAGATACGCTCTACCTTGGTGGCGTAAGCATGATCGCTGATGAT
ATGATAGCTTATATAAAATCTGATCTTGTACTCTATGGTGTTTCTCTTGTATTTTTACTAGGACTTGCACTTTATTATTT
TTTCCGTTCATGGCGCTTTGTTTTTTTACCTCTTTTTATTTGTTTTATAAGCTTAAGTGCAGCTAGTGGAGTTTTTGCAC
TTTTAAATTTTCAAATCACGGTTATTTCATCAAATTACATTGCTTTGGTTTTAATTATCACCTTAAGTGTAGTTGTTCAT
TTGATCACGCATTTTATCGAAAATACCCAAAATTATCCCAAAGCTAAAGTTGAGCGCATAGTGCTTGAAACCTTACTAGC
CAAAGCAAATCCTAGCCTTTATGCCATTGTTACAACGATGATAGGATTTTTTTCTTTAATGCTTTCAAATATCGAACCTA
TCATAAAACTTGGTATTATGATGAGTATAGGTATAGGTTTAGCTCTTATCTTTAGTTATTTATTTTTAGCAAGTATCTTA
GTTCTTTTAAAACCAAAAAACTATCATAAAAAAGAGTTTAAATTTAATCTTTTAGCCTTTTGTGCTAAAACCGCTCTTGA
TCCTAAAAAGCGTCGCATGATTTATGGAATTTCAGTTCTTGCTATAATCTTAGCTTTAATAGGCATTTCAAAACTCAGAG
TTGAAAATTCTTTTGTCAATTATTTCAAAGATGGCAGTGAAATCAAAAAAGGACTTTTGGTTATTGATAAAAATCTAGGT
GGAACCTTGCCTTTAGAAGTCATCATTCGTTTTCCAAATAATAAAAACGATCAAAATACAAGCAATACTCTTGATAGTTT
TGAAAGCGAATTTGAAAATTTAGCCACACAAGAAACTTATTGGTTTGACTCTAAAAAAACACGCATTGCAAAAAAAGTTC
ATGAATTTTTAGAAAATAAAGAATTTGTAGGCTCGATTTTAAGTCTTAATAGTCTTTTAACCCTAGGGAAAAATATCAAC
GATGGAAAAGAGTTAGATGATTTTGCTCTTGCGTTTTTAAATGAGAATTTACCTGCTAAATTTAAACAAGACTTACTTTC
ACCTTTTGTAAGTATAGAGAATAACGAGTTAAGATTTAGTATGCGTATTGTTGATTCTGATCCGAATTTAAGACGTAATG
AATTTTTAATAGATCTTAAAAAACAGCTCAACGAGCTTGTAAAAAATGATGGAGTAGAAGTTCAAATCACAGGTATAATG
GTACTTTATAATAATATGCTCCAAAGTCTTTTTTCATCGCAATTTGATACTCTTATATTTGTAATTTTAGCTATTTTTAT
ACTTTTTATCATTGTTTTTAGAGATTTAAAATTTTCAGTTGCGGCTATATTGGTAAATGTTATTCCTTTAAGTGTGGTTT
TTGCTCTTATGGGGCTTTTAGGTATTCCTTTGGATATGATGAGTATTACTATAGCTGCTATTGCTATAGGTATAGGCGTT
GATGATGCTATACATTATATTTATCGTTTTAGGGAAGAAATTAAAAACAAAAGCCTAGAAGAAGCCATTATAATTTCTCA
CCTTAGTATAGGTTCGGCACTTTATTATACCACAATTAGCATAGTTTTAGGTTTTAGTGTTATGATGAGTAGTAATTTCA
TTCCAACGATTTATTTTGGAATTTTAACCGTTTTTGTAATGATTTTGCTTTTAAGTGGAAGTTTGTTCTTATTACCAAGC
TTTTTAATCACTATTTATTCTAAGAAAACCAAGTTTCCAAACCAACATAAAGAGCATATATTAAAACAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGAGTATAGTACAAACTTATAGATCACAATTTGGAGATATTTTAGCCAACCAAGGCTTTGATGCCCTACTTCAAAAACTT
GAGAGTATTGTCATAGAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGCTATATATTTTAAAAAATTTTTCATTTTTATCCTTTATTTAAAATCTTTAAAATGATTTTTGCAAGCTCTAAAGCTT
TAAAACGATGAGAGATATTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Integral Membrane Protein; RND Superfamily Exporter; RND Efflux Transporter; Exporter Of RND Superfamily Protein-Like Protein; Exporter Of RND Superfamily Protein; Efflux Transporter Hydrophobe/Amphiphile Efflux-3 Family; Inner Membrane Transporter; Resistance-Nodulation- Family Transporter; Polyketide Cyclase/Dehydrase; Histidine Kinase; Exporter; Sterol-Sensing 5tm Box Domain Protein; MMPL Domain Protein; Resistance-Nodulation-Cell Division Superfamily Transporter; Transporter RND Superfamily

Number of amino acids: Translated: 823; Mature: 823

Protein sequence:

>823_residues
MFAKLLKFFISRPKSTFFGTLFICLLLSFFAFKLSVDASAESLLLEDDADLKTFREISKHYKSDNFLLLAFKPYDEKPFS
NENLAKLKKLHKELEKAPLVERVFSIINAPLLQSSQNTDLKELLKNIPNIESQDINRTKARNEILNSPFYKNNIISKDGK
VTGLIIYLKPDTVYNDLVEKRDLATDEKEKDQIRLAIKKHQDKQKVITKQSLDTIKSIVRNYEKNKDTLYLGGVSMIADD
MIAYIKSDLVLYGVSLVFLLGLALYYFFRSWRFVFLPLFICFISLSAASGVFALLNFQITVISSNYIALVLIITLSVVVH
LITHFIENTQNYPKAKVERIVLETLLAKANPSLYAIVTTMIGFFSLMLSNIEPIIKLGIMMSIGIGLALIFSYLFLASIL
VLLKPKNYHKKEFKFNLLAFCAKTALDPKKRRMIYGISVLAIILALIGISKLRVENSFVNYFKDGSEIKKGLLVIDKNLG
GTLPLEVIIRFPNNKNDQNTSNTLDSFESEFENLATQETYWFDSKKTRIAKKVHEFLENKEFVGSILSLNSLLTLGKNIN
DGKELDDFALAFLNENLPAKFKQDLLSPFVSIENNELRFSMRIVDSDPNLRRNEFLIDLKKQLNELVKNDGVEVQITGIM
VLYNNMLQSLFSSQFDTLIFVILAIFILFIIVFRDLKFSVAAILVNVIPLSVVFALMGLLGIPLDMMSITIAAIAIGIGV
DDAIHYIYRFREEIKNKSLEEAIIISHLSIGSALYYTTISIVLGFSVMMSSNFIPTIYFGILTVFVMILLLSGSLFLLPS
FLITIYSKKTKFPNQHKEHILKQ

Sequences:

>Translated_823_residues
MFAKLLKFFISRPKSTFFGTLFICLLLSFFAFKLSVDASAESLLLEDDADLKTFREISKHYKSDNFLLLAFKPYDEKPFS
NENLAKLKKLHKELEKAPLVERVFSIINAPLLQSSQNTDLKELLKNIPNIESQDINRTKARNEILNSPFYKNNIISKDGK
VTGLIIYLKPDTVYNDLVEKRDLATDEKEKDQIRLAIKKHQDKQKVITKQSLDTIKSIVRNYEKNKDTLYLGGVSMIADD
MIAYIKSDLVLYGVSLVFLLGLALYYFFRSWRFVFLPLFICFISLSAASGVFALLNFQITVISSNYIALVLIITLSVVVH
LITHFIENTQNYPKAKVERIVLETLLAKANPSLYAIVTTMIGFFSLMLSNIEPIIKLGIMMSIGIGLALIFSYLFLASIL
VLLKPKNYHKKEFKFNLLAFCAKTALDPKKRRMIYGISVLAIILALIGISKLRVENSFVNYFKDGSEIKKGLLVIDKNLG
GTLPLEVIIRFPNNKNDQNTSNTLDSFESEFENLATQETYWFDSKKTRIAKKVHEFLENKEFVGSILSLNSLLTLGKNIN
DGKELDDFALAFLNENLPAKFKQDLLSPFVSIENNELRFSMRIVDSDPNLRRNEFLIDLKKQLNELVKNDGVEVQITGIM
VLYNNMLQSLFSSQFDTLIFVILAIFILFIIVFRDLKFSVAAILVNVIPLSVVFALMGLLGIPLDMMSITIAAIAIGIGV
DDAIHYIYRFREEIKNKSLEEAIIISHLSIGSALYYTTISIVLGFSVMMSSNFIPTIYFGILTVFVMILLLSGSLFLLPS
FLITIYSKKTKFPNQHKEHILKQ
>Mature_823_residues
MFAKLLKFFISRPKSTFFGTLFICLLLSFFAFKLSVDASAESLLLEDDADLKTFREISKHYKSDNFLLLAFKPYDEKPFS
NENLAKLKKLHKELEKAPLVERVFSIINAPLLQSSQNTDLKELLKNIPNIESQDINRTKARNEILNSPFYKNNIISKDGK
VTGLIIYLKPDTVYNDLVEKRDLATDEKEKDQIRLAIKKHQDKQKVITKQSLDTIKSIVRNYEKNKDTLYLGGVSMIADD
MIAYIKSDLVLYGVSLVFLLGLALYYFFRSWRFVFLPLFICFISLSAASGVFALLNFQITVISSNYIALVLIITLSVVVH
LITHFIENTQNYPKAKVERIVLETLLAKANPSLYAIVTTMIGFFSLMLSNIEPIIKLGIMMSIGIGLALIFSYLFLASIL
VLLKPKNYHKKEFKFNLLAFCAKTALDPKKRRMIYGISVLAIILALIGISKLRVENSFVNYFKDGSEIKKGLLVIDKNLG
GTLPLEVIIRFPNNKNDQNTSNTLDSFESEFENLATQETYWFDSKKTRIAKKVHEFLENKEFVGSILSLNSLLTLGKNIN
DGKELDDFALAFLNENLPAKFKQDLLSPFVSIENNELRFSMRIVDSDPNLRRNEFLIDLKKQLNELVKNDGVEVQITGIM
VLYNNMLQSLFSSQFDTLIFVILAIFILFIIVFRDLKFSVAAILVNVIPLSVVFALMGLLGIPLDMMSITIAAIAIGIGV
DDAIHYIYRFREEIKNKSLEEAIIISHLSIGSALYYTTISIVLGFSVMMSSNFIPTIYFGILTVFVMILLLSGSLFLLPS
FLITIYSKKTKFPNQHKEHILKQ

Specific function: Unknown

COG id: COG1033

COG function: function code R; Predicted exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 93529; Mature: 93529

Theoretical pI: Translated: 9.54; Mature: 9.54

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFAKLLKFFISRPKSTFFGTLFICLLLSFFAFKLSVDASAESLLLEDDADLKTFREISKH
CHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHH
YKSDNFLLLAFKPYDEKPFSNENLAKLKKLHKELEKAPLVERVFSIINAPLLQSSQNTDL
CCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCH
KELLKNIPNIESQDINRTKARNEILNSPFYKNNIISKDGKVTGLIIYLKPDTVYNDLVEK
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHH
RDLATDEKEKDQIRLAIKKHQDKQKVITKQSLDTIKSIVRNYEKNKDTLYLGGVSMIADD
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHH
MIAYIKSDLVLYGVSLVFLLGLALYYFFRSWRFVFLPLFICFISLSAASGVFALLNFQIT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE
VISSNYIALVLIITLSVVVHLITHFIENTQNYPKAKVERIVLETLLAKANPSLYAIVTTM
EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
IGFFSLMLSNIEPIIKLGIMMSIGIGLALIFSYLFLASILVLLKPKNYHKKEFKFNLLAF
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
CAKTALDPKKRRMIYGISVLAIILALIGISKLRVENSFVNYFKDGSEIKKGLLVIDKNLG
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCEEEEECCCC
GTLPLEVIIRFPNNKNDQNTSNTLDSFESEFENLATQETYWFDSKKTRIAKKVHEFLENK
CCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHCH
EFVGSILSLNSLLTLGKNINDGKELDDFALAFLNENLPAKFKQDLLSPFVSIENNELRFS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEE
MRIVDSDPNLRRNEFLIDLKKQLNELVKNDGVEVQITGIMVLYNNMLQSLFSSQFDTLIF
EEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VILAIFILFIIVFRDLKFSVAAILVNVIPLSVVFALMGLLGIPLDMMSITIAAIAIGIGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCH
DDAIHYIYRFREEIKNKSLEEAIIISHLSIGSALYYTTISIVLGFSVMMSSNFIPTIYFG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
ILTVFVMILLLSGSLFLLPSFLITIYSKKTKFPNQHKEHILKQ
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MFAKLLKFFISRPKSTFFGTLFICLLLSFFAFKLSVDASAESLLLEDDADLKTFREISKH
CHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHH
YKSDNFLLLAFKPYDEKPFSNENLAKLKKLHKELEKAPLVERVFSIINAPLLQSSQNTDL
CCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCH
KELLKNIPNIESQDINRTKARNEILNSPFYKNNIISKDGKVTGLIIYLKPDTVYNDLVEK
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHH
RDLATDEKEKDQIRLAIKKHQDKQKVITKQSLDTIKSIVRNYEKNKDTLYLGGVSMIADD
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHH
MIAYIKSDLVLYGVSLVFLLGLALYYFFRSWRFVFLPLFICFISLSAASGVFALLNFQIT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE
VISSNYIALVLIITLSVVVHLITHFIENTQNYPKAKVERIVLETLLAKANPSLYAIVTTM
EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
IGFFSLMLSNIEPIIKLGIMMSIGIGLALIFSYLFLASILVLLKPKNYHKKEFKFNLLAF
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
CAKTALDPKKRRMIYGISVLAIILALIGISKLRVENSFVNYFKDGSEIKKGLLVIDKNLG
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCEEEEECCCC
GTLPLEVIIRFPNNKNDQNTSNTLDSFESEFENLATQETYWFDSKKTRIAKKVHEFLENK
CCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHCH
EFVGSILSLNSLLTLGKNINDGKELDDFALAFLNENLPAKFKQDLLSPFVSIENNELRFS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEE
MRIVDSDPNLRRNEFLIDLKKQLNELVKNDGVEVQITGIMVLYNNMLQSLFSSQFDTLIF
EEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VILAIFILFIIVFRDLKFSVAAILVNVIPLSVVFALMGLLGIPLDMMSITIAAIAIGIGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCH
DDAIHYIYRFREEIKNKSLEEAIIISHLSIGSALYYTTISIVLGFSVMMSSNFIPTIYFG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
ILTVFVMILLLSGSLFLLPSFLITIYSKKTKFPNQHKEHILKQ
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA