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The map label for this gene is 57238407

Identifier: 57238407

GI number: 57238407

Start: 1450435

End: 1451478

Strand: Direct

Name: 57238407

Synonym: CJE1555

Alternate gene names: NA

Gene position: 1450435-1451478 (Clockwise)

Preceding gene: 57238406

Following gene: 57238412

Centisome position: 81.58

GC content: 27.59

Gene sequence:

>1044_bases
TTGCAAAATGGAAAATTCTTTCTTATAAGCTTTATTTTAGTTATTTTATTTCTTTTACTTTACCTTTTTAAAGGTTTTTT
ACTTGTAATTATCATAGCTAGTTTAATGGCGGTAGCTACCTCAAACATCAATGCAAAATTTTTAAATCTTACTAAAGGAC
ATAAATTTTTAGCTTCCATTCTTACAACAGCTTGTATGGTTTTGCTTTTCTTTGCACCTTTTGTTTATGCTATGATAGAA
CTTGCCAAAGCTTTAAAGAATTTTGATATTAATTTAGTTACACAAACACTTGATTATGTCAAAAACTATCAATTCACCTT
GCCTGAAAGCTTTAATTTTTTAGAACCTAAAATTAAAGAATTTTTAGCTTCTATAGATTTAAATAGTATTTCTAAACAAA
TTCTAAGTTATGCTTCAAGTTTTACAAAATCAGGAGCTAAATTTCTTATAGATATGGTTTTAATTTGTGTGTTTTATTTC
TTTGCAAATCTATATGGAACAGAACTTGTTATCTATCTTAAATCCATCATTCCTATTGATAAAAAAGAACTCGATGATGT
TTTAAGCGAAGTGGGTAATGTTATGGCTGTTGTGCTTTACTCTATGGTAATTGTAGCAATATTTCAAGGTGCACTTTTTG
GTTTAATCACAATATTTTATGGTTATGATGGAATTTTAATGGGAGTAATTTTTGCTGTAAGTTCTCTCATACCTGCTATA
GGAGGAGCTTTAATTTATGTGCCTGTAAGTCTTTATGAATTTGCCTCAAACAATCTTAACTCAGCTCTTGTTATTTTTAT
TTATTCTGTAATTGTAATTTCTTTTATAGCAGATACTTTAATCAAACCTTTAATCATCAAATGGATCAACAAAAAACTTG
TAAAAACTCCCACTAAAATCAACGAACTTTTAATTTTCTTGGCCATGATAGCAGGAATTTCAACCTTTGGTTTTTGGGGT
ATTATACTAGGTCCTGCGATTTTAACTTTTTTTGTATCAACTTTAAGAATGTATGTGATTTTAAAAGATAAGAATTTAAT
TTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGGCTATATAGAACGCACTGCAAAAGGGCGTATAGCAAGTGCAAAAAGTTATAGTGCTTTAAAACTAAACTATGAAAAAA
CTTTATTTGAGGAGTAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTGCCTTAAAAAAGGCAAGTTTTATGTTCTAGGCTTTTGGACCTATCATTTTAGTAGGATCAACAAATTTATTGAAATC
TTCTTCGCTAACCAAACCAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 347; Mature: 347

Protein sequence:

>347_residues
MQNGKFFLISFILVILFLLLYLFKGFLLVIIIASLMAVATSNINAKFLNLTKGHKFLASILTTACMVLLFFAPFVYAMIE
LAKALKNFDINLVTQTLDYVKNYQFTLPESFNFLEPKIKEFLASIDLNSISKQILSYASSFTKSGAKFLIDMVLICVFYF
FANLYGTELVIYLKSIIPIDKKELDDVLSEVGNVMAVVLYSMVIVAIFQGALFGLITIFYGYDGILMGVIFAVSSLIPAI
GGALIYVPVSLYEFASNNLNSALVIFIYSVIVISFIADTLIKPLIIKWINKKLVKTPTKINELLIFLAMIAGISTFGFWG
IILGPAILTFFVSTLRMYVILKDKNLI

Sequences:

>Translated_347_residues
MQNGKFFLISFILVILFLLLYLFKGFLLVIIIASLMAVATSNINAKFLNLTKGHKFLASILTTACMVLLFFAPFVYAMIE
LAKALKNFDINLVTQTLDYVKNYQFTLPESFNFLEPKIKEFLASIDLNSISKQILSYASSFTKSGAKFLIDMVLICVFYF
FANLYGTELVIYLKSIIPIDKKELDDVLSEVGNVMAVVLYSMVIVAIFQGALFGLITIFYGYDGILMGVIFAVSSLIPAI
GGALIYVPVSLYEFASNNLNSALVIFIYSVIVISFIADTLIKPLIIKWINKKLVKTPTKINELLIFLAMIAGISTFGFWG
IILGPAILTFFVSTLRMYVILKDKNLI
>Mature_347_residues
MQNGKFFLISFILVILFLLLYLFKGFLLVIIIASLMAVATSNINAKFLNLTKGHKFLASILTTACMVLLFFAPFVYAMIE
LAKALKNFDINLVTQTLDYVKNYQFTLPESFNFLEPKIKEFLASIDLNSISKQILSYASSFTKSGAKFLIDMVLICVFYF
FANLYGTELVIYLKSIIPIDKKELDDVLSEVGNVMAVVLYSMVIVAIFQGALFGLITIFYGYDGILMGVIFAVSSLIPAI
GGALIYVPVSLYEFASNNLNSALVIFIYSVIVISFIADTLIKPLIIKWINKKLVKTPTKINELLIFLAMIAGISTFGFWG
IILGPAILTFFVSTLRMYVILKDKNLI

Specific function: Unknown

COG id: COG0628

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002549 [H]

Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 38755; Mature: 38755

Theoretical pI: Translated: 9.39; Mature: 9.39

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQNGKFFLISFILVILFLLLYLFKGFLLVIIIASLMAVATSNINAKFLNLTKGHKFLASI
CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LTTACMVLLFFAPFVYAMIELAKALKNFDINLVTQTLDYVKNYQFTLPESFNFLEPKIKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
FLASIDLNSISKQILSYASSFTKSGAKFLIDMVLICVFYFFANLYGTELVIYLKSIIPID
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
KKELDDVLSEVGNVMAVVLYSMVIVAIFQGALFGLITIFYGYDGILMGVIFAVSSLIPAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GGALIYVPVSLYEFASNNLNSALVIFIYSVIVISFIADTLIKPLIIKWINKKLVKTPTKI
CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
NELLIFLAMIAGISTFGFWGIILGPAILTFFVSTLRMYVILKDKNLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MQNGKFFLISFILVILFLLLYLFKGFLLVIIIASLMAVATSNINAKFLNLTKGHKFLASI
CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LTTACMVLLFFAPFVYAMIELAKALKNFDINLVTQTLDYVKNYQFTLPESFNFLEPKIKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
FLASIDLNSISKQILSYASSFTKSGAKFLIDMVLICVFYFFANLYGTELVIYLKSIIPID
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
KKELDDVLSEVGNVMAVVLYSMVIVAIFQGALFGLITIFYGYDGILMGVIFAVSSLIPAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GGALIYVPVSLYEFASNNLNSALVIFIYSVIVISFIADTLIKPLIIKWINKKLVKTPTKI
CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
NELLIFLAMIAGISTFGFWGIILGPAILTFFVSTLRMYVILKDKNLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 7.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9923682 [H]