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The map label for this gene is flhA [H]

Identifier: 57237712

GI number: 57237712

Start: 895767

End: 897941

Strand: Reverse

Name: flhA [H]

Synonym: CJE0962

Alternate gene names: 57237712

Gene position: 897941-895767 (Counterclockwise)

Preceding gene: 57237713

Following gene: 57237711

Centisome position: 50.51

GC content: 34.57

Gene sequence:

>2175_bases
ATGGCAAAAAATAAAATAGTCGATTTAGTTTTTCCTTTCTTGGGGCCTTTAATCGCTCCTGTTTTAAAAGCTAAAAGCTT
GACTATTGTTGGTTTTTTAGTTTGTATTTTAGCTATTATTATAGTTCCTTTACCAAGCCCTATTTTGGACTTTTTCTTGG
CTTTAAGCATAGCTTTATCGGTATTAATTATTTTAATTTCTATTTATATACCCAAACCGACAGATTTAACAACTTTTCCA
ACTTTAATCTTGATTATCACTTTATTTAGGCTTTCATTAAATATAGCTACCACAAGGATGATTTTAAGCGAAGGGCAAAA
CGGCCCTGAAGCTGTGAGTGAGATTATAGCAGCATTTGGAGAATTTGTTGTTGGTGGAAATATGGTCATTGGCGTGATTG
TATTTTGTATTTTAGTATTGATTAATTTCATGGTTGTAACAAAAGGTAGTACAAGGGTTTCTGAAGTACAAGCAAGATTT
ACACTTGATGCGATGCCGGGTAAACAAATGGCTATTGATGCGGATTTAAATGCAGGACTTATTGATGAACAAACCGCTAG
AGCAAGACGTCAAGAAGTTATTGCTGAGGCAAACTTCTATGGTGCAATGGATGGTTCTTCTAAATTTATCAAAGGAGATG
CTGTTGCAGGAATTATCATAACTATTATAAATATCATAGGTGGTTTTTTAATAGGATCTTTTCAGCACGATATGGCTTTA
AGCGATGCTGCTTCTACCTATACTATTTTAACCATAGGTGATGGACTTGTATCTCAAATTCCAGGGCTTATTACTTCTAC
TGCAACCGCTATAATTATCACTCGTGCAAGCAAAGATGAGGAAAATTTTGCAGAAGGAACTTTAACTCAACTTTTAAGCG
AATATCGCACGCTTTTAATAGTAGGTTTTGTACTTTTTATCTTTGCGTTAGTGCCTGGTTTGCCAACTTTATCCTTGGGC
TTTATGGCTTTAGTATTTTTAAGCCTTGGCTATCTTACCAAGCAGGTTAAGGAAGGTAAAATTGATATAACTACAGTTAA
AAAAAGCAAACCAAGTGCCGCAGTTGCATCTCAAAGTGGAGCAGGTGGGACAACGGCAGCGCCTGCTAAGAAAAGCGAAG
AAGAAATTCTCAAAGAAGAAGAGCACAAGATTAACGATATACTCAAAGTTGAAATTTTAGAACTTGAACTTGGATACGGA
CTTATTAAGCTTGCTGAAAACGAACTTACAGAAAGAATTCGCTCAATGAGAAGAAGTATTGCTGAAAGTTTAGGATTTTT
AATGCCAAAAATAAGAATAAGAGATAATTTAAGACTTAAACCAAATGAGTATAGTTTTAAACTCAAGGGCGTGTCTATAG
CAAGTGCTGAAATTTATCCGGATAAATATTTAGCCATGGATAGTGGTTTTATCACAGAAGAGATAGAAGGGATTGCTACA
AAAGAACCCGCTTTTAACTCTGATGCACTTTGGATTGATGCGAATTTAAAAGATGAAGCAACATTAAATGGCTATATAGT
AATAGATCCTGCAAGTGTTATTTCAACACATATGAGCGAACTTATCAAAGCGCACGCAAGCGAACTTCTCACACGCCAAG
AGGTACAAAATCTTCTTGATAAGGTTAAAAATGATTATCCAATCATCGTAGAAGGTGCTTTAGGTGTTGCACCTGTAAGT
CTTATTCAAAAAATTCTCAAAGACTTGCTTAAGCATCACATACCAATTAAAGATATGCTTACTATTTTAGAATCTGTAAG
CGATATAGCAGAAGTAAGCAAGAGTTTTGATATGATTATTGAACATGTAAGGGCGTCCTTAGCTAGGATGATTACAAATA
TGTATTTAGATGATAAAGGAAATTTGGATATTTTTATCTTAGACTCTGCTAGTTCTGCGGTTTTAATGGAAAATGTACAA
TTTAGAGATGGAAGTTATCACTTGCCTTTAAGTGTAGCTCAAACAGGTACTTTAGTAGATACTCTAAGGGCTGAAGTTGC
CGCAGTAGCAAATGGTCGTATCAAGCCTTTTATACTTTGCGTTGAACCGCAGCTTAGAAAATTCATTGCTGATATTTGTT
ATAATTTTAGCATTAATATAGTAGTGTTAAGTTTTGCAGAAATTGCAGAAAATACAAATTTTAATACCGAGGGTATTATT
AGGATAGAACTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAGAAGAAAATTGCACCTTAATGCCTATGTTAGTAAATTTACAAAATAAAGTAGATGAATTTTTAGATTCTATTACTTT
AGAAGATATTATGAAAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGAATATAATGAAAATTTATCATCTTTCACATACAGATCTTGATGGCTATGCTTGTCAATTTATAGTAAATTTTTATTTT
AAAAATGTGAAATTTTATAA

Product: flagellar biosynthesis protein FlhA

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 724; Mature: 723

Protein sequence:

>724_residues
MAKNKIVDLVFPFLGPLIAPVLKAKSLTIVGFLVCILAIIIVPLPSPILDFFLALSIALSVLIILISIYIPKPTDLTTFP
TLILIITLFRLSLNIATTRMILSEGQNGPEAVSEIIAAFGEFVVGGNMVIGVIVFCILVLINFMVVTKGSTRVSEVQARF
TLDAMPGKQMAIDADLNAGLIDEQTARARRQEVIAEANFYGAMDGSSKFIKGDAVAGIIITIINIIGGFLIGSFQHDMAL
SDAASTYTILTIGDGLVSQIPGLITSTATAIIITRASKDEENFAEGTLTQLLSEYRTLLIVGFVLFIFALVPGLPTLSLG
FMALVFLSLGYLTKQVKEGKIDITTVKKSKPSAAVASQSGAGGTTAAPAKKSEEEILKEEEHKINDILKVEILELELGYG
LIKLAENELTERIRSMRRSIAESLGFLMPKIRIRDNLRLKPNEYSFKLKGVSIASAEIYPDKYLAMDSGFITEEIEGIAT
KEPAFNSDALWIDANLKDEATLNGYIVIDPASVISTHMSELIKAHASELLTRQEVQNLLDKVKNDYPIIVEGALGVAPVS
LIQKILKDLLKHHIPIKDMLTILESVSDIAEVSKSFDMIIEHVRASLARMITNMYLDDKGNLDIFILDSASSAVLMENVQ
FRDGSYHLPLSVAQTGTLVDTLRAEVAAVANGRIKPFILCVEPQLRKFIADICYNFSINIVVLSFAEIAENTNFNTEGII
RIEL

Sequences:

>Translated_724_residues
MAKNKIVDLVFPFLGPLIAPVLKAKSLTIVGFLVCILAIIIVPLPSPILDFFLALSIALSVLIILISIYIPKPTDLTTFP
TLILIITLFRLSLNIATTRMILSEGQNGPEAVSEIIAAFGEFVVGGNMVIGVIVFCILVLINFMVVTKGSTRVSEVQARF
TLDAMPGKQMAIDADLNAGLIDEQTARARRQEVIAEANFYGAMDGSSKFIKGDAVAGIIITIINIIGGFLIGSFQHDMAL
SDAASTYTILTIGDGLVSQIPGLITSTATAIIITRASKDEENFAEGTLTQLLSEYRTLLIVGFVLFIFALVPGLPTLSLG
FMALVFLSLGYLTKQVKEGKIDITTVKKSKPSAAVASQSGAGGTTAAPAKKSEEEILKEEEHKINDILKVEILELELGYG
LIKLAENELTERIRSMRRSIAESLGFLMPKIRIRDNLRLKPNEYSFKLKGVSIASAEIYPDKYLAMDSGFITEEIEGIAT
KEPAFNSDALWIDANLKDEATLNGYIVIDPASVISTHMSELIKAHASELLTRQEVQNLLDKVKNDYPIIVEGALGVAPVS
LIQKILKDLLKHHIPIKDMLTILESVSDIAEVSKSFDMIIEHVRASLARMITNMYLDDKGNLDIFILDSASSAVLMENVQ
FRDGSYHLPLSVAQTGTLVDTLRAEVAAVANGRIKPFILCVEPQLRKFIADICYNFSINIVVLSFAEIAENTNFNTEGII
RIEL
>Mature_723_residues
AKNKIVDLVFPFLGPLIAPVLKAKSLTIVGFLVCILAIIIVPLPSPILDFFLALSIALSVLIILISIYIPKPTDLTTFPT
LILIITLFRLSLNIATTRMILSEGQNGPEAVSEIIAAFGEFVVGGNMVIGVIVFCILVLINFMVVTKGSTRVSEVQARFT
LDAMPGKQMAIDADLNAGLIDEQTARARRQEVIAEANFYGAMDGSSKFIKGDAVAGIIITIINIIGGFLIGSFQHDMALS
DAASTYTILTIGDGLVSQIPGLITSTATAIIITRASKDEENFAEGTLTQLLSEYRTLLIVGFVLFIFALVPGLPTLSLGF
MALVFLSLGYLTKQVKEGKIDITTVKKSKPSAAVASQSGAGGTTAAPAKKSEEEILKEEEHKINDILKVEILELELGYGL
IKLAENELTERIRSMRRSIAESLGFLMPKIRIRDNLRLKPNEYSFKLKGVSIASAEIYPDKYLAMDSGFITEEIEGIATK
EPAFNSDALWIDANLKDEATLNGYIVIDPASVISTHMSELIKAHASELLTRQEVQNLLDKVKNDYPIIVEGALGVAPVSL
IQKILKDLLKHHIPIKDMLTILESVSDIAEVSKSFDMIIEHVRASLARMITNMYLDDKGNLDIFILDSASSAVLMENVQF
RDGSYHLPLSVAQTGTLVDTLRAEVAAVANGRIKPFILCVEPQLRKFIADICYNFSINIVVLSFAEIAENTNFNTEGIIR
IEL

Specific function: Involved in the export of flagellum proteins [H]

COG id: COG1298

COG function: function code NU; Flagellar biosynthesis pathway, component FlhA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the FHIPEP (flagella/HR/invasion proteins export pore) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788187, Length=702, Percent_Identity=39.4586894586895, Blast_Score=491, Evalue=1e-140,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 (rich media) [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006301
- InterPro:   IPR001712 [H]

Pfam domain/function: PF00771 FHIPEP [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 78866; Mature: 78734

Theoretical pI: Translated: 4.87; Mature: 4.87

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAKNKIVDLVFPFLGPLIAPVLKAKSLTIVGFLVCILAIIIVPLPSPILDFFLALSIALS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
VLIILISIYIPKPTDLTTFPTLILIITLFRLSLNIATTRMILSEGQNGPEAVSEIIAAFG
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
EFVVGGNMVIGVIVFCILVLINFMVVTKGSTRVSEVQARFTLDAMPGKQMAIDADLNAGL
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHEEEECCCCCCEEEECCCCCCC
IDEQTARARRQEVIAEANFYGAMDGSSKFIKGDAVAGIIITIINIIGGFLIGSFQHDMAL
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
SDAASTYTILTIGDGLVSQIPGLITSTATAIIITRASKDEENFAEGTLTQLLSEYRTLLI
HCCCCEEEEEEECCHHHHHCCHHHHCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGFVLFIFALVPGLPTLSLGFMALVFLSLGYLTKQVKEGKIDITTVKKSKPSAAVASQSG
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHCCCCC
AGGTTAAPAKKSEEEILKEEEHKINDILKVEILELELGYGLIKLAENELTERIRSMRRSI
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AESLGFLMPKIRIRDNLRLKPNEYSFKLKGVSIASAEIYPDKYLAMDSGFITEEIEGIAT
HHHHHHHCCCCEECCCCEECCCCCEEEEECEEEEECEECCCHHEEECCCCHHHHHCCCCC
KEPAFNSDALWIDANLKDEATLNGYIVIDPASVISTHMSELIKAHASELLTRQEVQNLLD
CCCCCCCCCEEEECCCCCCCEECCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KVKNDYPIIVEGALGVAPVSLIQKILKDLLKHHIPIKDMLTILESVSDIAEVSKSFDMII
HHCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EHVRASLARMITNMYLDDKGNLDIFILDSASSAVLMENVQFRDGSYHLPLSVAQTGTLVD
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCEEHHHCCEECCCCEECCEEHHCCCHHHH
TLRAEVAAVANGRIKPFILCVEPQLRKFIADICYNFSINIVVLSFAEIAENTNFNTEGII
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEHHHHHCCCCCCCCCEE
RIEL
EEEC
>Mature Secondary Structure 
AKNKIVDLVFPFLGPLIAPVLKAKSLTIVGFLVCILAIIIVPLPSPILDFFLALSIALS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
VLIILISIYIPKPTDLTTFPTLILIITLFRLSLNIATTRMILSEGQNGPEAVSEIIAAFG
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
EFVVGGNMVIGVIVFCILVLINFMVVTKGSTRVSEVQARFTLDAMPGKQMAIDADLNAGL
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHEEEECCCCCCEEEECCCCCCC
IDEQTARARRQEVIAEANFYGAMDGSSKFIKGDAVAGIIITIINIIGGFLIGSFQHDMAL
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
SDAASTYTILTIGDGLVSQIPGLITSTATAIIITRASKDEENFAEGTLTQLLSEYRTLLI
HCCCCEEEEEEECCHHHHHCCHHHHCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGFVLFIFALVPGLPTLSLGFMALVFLSLGYLTKQVKEGKIDITTVKKSKPSAAVASQSG
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHCCCCC
AGGTTAAPAKKSEEEILKEEEHKINDILKVEILELELGYGLIKLAENELTERIRSMRRSI
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AESLGFLMPKIRIRDNLRLKPNEYSFKLKGVSIASAEIYPDKYLAMDSGFITEEIEGIAT
HHHHHHHCCCCEECCCCEECCCCCEEEEECEEEEECEECCCHHEEECCCCHHHHHCCCCC
KEPAFNSDALWIDANLKDEATLNGYIVIDPASVISTHMSELIKAHASELLTRQEVQNLLD
CCCCCCCCCEEEECCCCCCCEECCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KVKNDYPIIVEGALGVAPVSLIQKILKDLLKHHIPIKDMLTILESVSDIAEVSKSFDMII
HHCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EHVRASLARMITNMYLDDKGNLDIFILDSASSAVLMENVQFRDGSYHLPLSVAQTGTLVD
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCEEHHHCCEECCCCEECCEEHHCCCHHHH
TLRAEVAAVANGRIKPFILCVEPQLRKFIADICYNFSINIVVLSFAEIAENTNFNTEGII
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEHHHHHCCCCCCCCCEE
RIEL
EEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9923682 [H]