Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 57237466

Identifier: 57237466

GI number: 57237466

Start: 413776

End: 415962

Strand: Direct

Name: 57237466

Synonym: CJE0460

Alternate gene names: NA

Gene position: 413776-415962 (Clockwise)

Preceding gene: 57237465

Following gene: 57237467

Centisome position: 23.27

GC content: 24.46

Gene sequence:

>2187_bases
ATGAAAGAATTATTCCAAAAAATTTGGCAAAATGAACTTCAATTTTTAAATTTTGATGCTAAATTTCAAGATAAAAGCAA
ACTTGATACGGCCGAGTGTGCGATTATTTTAAGTGTCAATAAAGACAATTATGAAAGATATTTTCTCTTAAAAGAATTTC
AAGAGCTTTGCAAAAAAATTGATTTAAGAGTGGATATTTTTAGTATACAAAATGCTCAAATTTGTATTTTAAATTTTTTT
AAATCAGGTTTTATTTCAAAGCAAGATTTGCTTAAGGCTCTAAAAATTTTAGAAAAAATTTCAAAAAATACCGAAATGCT
TGATTTTATTTCACAAGAAAAAGTTCAAAGTATAGATCAAAAAGCTTTATTTCAAAATGATTTTAAAGAATTAAACACCA
TTAATTTAGAGCTTCAAAAGCTAAGTTTTGATGAAAATTTAAAATCAAGACTTCAAAAAACTTTGGAAAAATTTCAAAAT
TTAGAGTTTAATATAGCCATCACTGGCGTGATGAATGCAGGAAAATCAAGTCTTTTAAATGCTCTTTTAAAAGAAGATTT
TTTAGGGGTTTCAAACATACCTGAAACAGCTAATTTAACAGTATTAAGCTATGGTAAGAGTGAAGAAGCAAAGATATATT
TTTGGGATAAAAAAGAATGGCAAAATATACTTGAAAGTTCGCACTTTAATGCAGATTTAAAAGAATTTATTGACAAGCTG
GATAAGAGTGTAAATATAGAGGATTTTATCAAGGATAAACCTTTAATACAAAATATCGCACTTTGTGAACTTAAAAATTT
CAGTTCAGCTAAAAATAAAATTTCAGCTTTAATTAAAAAAATAGAAATTAAAAGTCATTTAGATTTTTTAAAAAATAATA
TTTCCATAGTTGATACTCCAGGGCTTGATGATGTTGTAGTCCAAAGAGAAATTGTTACAAATGAGTATCTTAGAGAAAGT
GATTTTTTAATTCATTTAATGAATGCTTCTCAAAGCTTAACTCAAAAAGATGCAGACTTTTTGGTGCATTGTCTTTTAAA
TTCAAGGCTGAGTAAGTTTTTAATTGTTTTAACTAAAGCGGATTTGTTAAGCAAAAAGGATTTAGAAGAAGTCATTGTTT
ATACCAAAGAAAGCTTAAAATCAAGACTTGTGGATTTAGATGAAAATTTGGTGGAAAAGATTGATTTTTTATGTGTGAGT
GCTAAAATGGCAAGTGATTTTTATAAGGGTTTAGCACCTAAGGAAAGTTTGCAAAAAAGTGGTATGCAAGAATTTGAAAA
CTATCTTTTTAACGAGCTTTATGCAGGAGAAAAAAGCAAGATTGCCTTAAGAGCTTACAAAAAAGAATTACATTTGGAAC
TTAAAAATATTCTAAGCAAATATGAAATGCAAAATCGTCTTATTAAGGAGAATAAACAAGGTGTAAGTGAAGAAAATCAA
AAGCTTTTACTTGAACTTCAAAAGCAAAATATCTTATTAAAAGAAGCACAAGATGAAATTTCAAATTTCATTGTAAAACT
TAAAAATATAGATAATGGTATAGATAATCTTGTTTTACTTTTGGCTAAAAAATTAAAAGAACGCTTGATAGATGAGTTTA
AATATTTAAAAAATAATGCACAAAAGCTTAATCTTTCTCGTATTTTAAATATAGTTGATATTACTACAAAAGATGGGATT
AATGATATTTTAAGAGAAATTAAATTTGAAAATATTAAAAAAATCGAGGAGCTTAAAACAAATTTGTCTTTAAAATATGA
TTTTTTAAAAGATGATTTTGATAATGGTTTTGAAGGTTTTAAAGATGGAATTTCAAAAAATATAGATAGTATTTTTCAAA
GTGAAAAATTTGCACTTTTAAGATTGAAAATTGAAAAATTAAGCAATTTAAAATCAGATTTATATGAGCTTGAAACGAAT
TTAGATATGGTTATTTTTGATACTTTTAAAGAATTTAAAATGAGCGAAATTTTAAATTCTTTAAATATCAATGGAGCATT
TTTTGAGTTTTTAAATGATAAATTAAAACATTATGAAAAAAATCAAAAATCAAAATTAGAAAGTTTTGAAAAAGTTTTAC
AGAGTCTGAAAAATCAAGATATTAATATTTTAAATTCTTTTGAAGAAAATTTAGAAAAAATTGAAAAATTAAAACAACTT
GAAATGGGGCTTTTAAATGCAGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCTAAAGAATTACCTTTACAAAGTAAAATCGCTTACATGAGAAGACAACTTGTCGCTCAAAGAAATAAATAAATCTTTC
CCCTTTTTAAGGGGAAGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTTTTAAATGATTTTATAAAAGCCTATGAAAATACTTATAGTGTGAGTTTTGATGATAGTTTTAAAGGGCGTATTCAAG
AGCTTTGCAAGGAACTTAAT

Product: GTP-binding protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF6 [H]

Number of amino acids: Translated: 728; Mature: 728

Protein sequence:

>728_residues
MKELFQKIWQNELQFLNFDAKFQDKSKLDTAECAIILSVNKDNYERYFLLKEFQELCKKIDLRVDIFSIQNAQICILNFF
KSGFISKQDLLKALKILEKISKNTEMLDFISQEKVQSIDQKALFQNDFKELNTINLELQKLSFDENLKSRLQKTLEKFQN
LEFNIAITGVMNAGKSSLLNALLKEDFLGVSNIPETANLTVLSYGKSEEAKIYFWDKKEWQNILESSHFNADLKEFIDKL
DKSVNIEDFIKDKPLIQNIALCELKNFSSAKNKISALIKKIEIKSHLDFLKNNISIVDTPGLDDVVVQREIVTNEYLRES
DFLIHLMNASQSLTQKDADFLVHCLLNSRLSKFLIVLTKADLLSKKDLEEVIVYTKESLKSRLVDLDENLVEKIDFLCVS
AKMASDFYKGLAPKESLQKSGMQEFENYLFNELYAGEKSKIALRAYKKELHLELKNILSKYEMQNRLIKENKQGVSEENQ
KLLLELQKQNILLKEAQDEISNFIVKLKNIDNGIDNLVLLLAKKLKERLIDEFKYLKNNAQKLNLSRILNIVDITTKDGI
NDILREIKFENIKKIEELKTNLSLKYDFLKDDFDNGFEGFKDGISKNIDSIFQSEKFALLRLKIEKLSNLKSDLYELETN
LDMVIFDTFKEFKMSEILNSLNINGAFFEFLNDKLKHYEKNQKSKLESFEKVLQSLKNQDINILNSFEENLEKIEKLKQL
EMGLLNAD

Sequences:

>Translated_728_residues
MKELFQKIWQNELQFLNFDAKFQDKSKLDTAECAIILSVNKDNYERYFLLKEFQELCKKIDLRVDIFSIQNAQICILNFF
KSGFISKQDLLKALKILEKISKNTEMLDFISQEKVQSIDQKALFQNDFKELNTINLELQKLSFDENLKSRLQKTLEKFQN
LEFNIAITGVMNAGKSSLLNALLKEDFLGVSNIPETANLTVLSYGKSEEAKIYFWDKKEWQNILESSHFNADLKEFIDKL
DKSVNIEDFIKDKPLIQNIALCELKNFSSAKNKISALIKKIEIKSHLDFLKNNISIVDTPGLDDVVVQREIVTNEYLRES
DFLIHLMNASQSLTQKDADFLVHCLLNSRLSKFLIVLTKADLLSKKDLEEVIVYTKESLKSRLVDLDENLVEKIDFLCVS
AKMASDFYKGLAPKESLQKSGMQEFENYLFNELYAGEKSKIALRAYKKELHLELKNILSKYEMQNRLIKENKQGVSEENQ
KLLLELQKQNILLKEAQDEISNFIVKLKNIDNGIDNLVLLLAKKLKERLIDEFKYLKNNAQKLNLSRILNIVDITTKDGI
NDILREIKFENIKKIEELKTNLSLKYDFLKDDFDNGFEGFKDGISKNIDSIFQSEKFALLRLKIEKLSNLKSDLYELETN
LDMVIFDTFKEFKMSEILNSLNINGAFFEFLNDKLKHYEKNQKSKLESFEKVLQSLKNQDINILNSFEENLEKIEKLKQL
EMGLLNAD
>Mature_728_residues
MKELFQKIWQNELQFLNFDAKFQDKSKLDTAECAIILSVNKDNYERYFLLKEFQELCKKIDLRVDIFSIQNAQICILNFF
KSGFISKQDLLKALKILEKISKNTEMLDFISQEKVQSIDQKALFQNDFKELNTINLELQKLSFDENLKSRLQKTLEKFQN
LEFNIAITGVMNAGKSSLLNALLKEDFLGVSNIPETANLTVLSYGKSEEAKIYFWDKKEWQNILESSHFNADLKEFIDKL
DKSVNIEDFIKDKPLIQNIALCELKNFSSAKNKISALIKKIEIKSHLDFLKNNISIVDTPGLDDVVVQREIVTNEYLRES
DFLIHLMNASQSLTQKDADFLVHCLLNSRLSKFLIVLTKADLLSKKDLEEVIVYTKESLKSRLVDLDENLVEKIDFLCVS
AKMASDFYKGLAPKESLQKSGMQEFENYLFNELYAGEKSKIALRAYKKELHLELKNILSKYEMQNRLIKENKQGVSEENQ
KLLLELQKQNILLKEAQDEISNFIVKLKNIDNGIDNLVLLLAKKLKERLIDEFKYLKNNAQKLNLSRILNIVDITTKDGI
NDILREIKFENIKKIEELKTNLSLKYDFLKDDFDNGFEGFKDGISKNIDSIFQSEKFALLRLKIEKLSNLKSDLYELETN
LDMVIFDTFKEFKMSEILNSLNINGAFFEFLNDKLKHYEKNQKSKLESFEKVLQSLKNQDINILNSFEENLEKIEKLKQL
EMGLLNAD

Specific function: Unknown

COG id: COG0699

COG function: function code R; Predicted GTPases (dynamin-related)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To M.genitalium MG148 [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001401 [H]

Pfam domain/function: PF00350 Dynamin_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 84788; Mature: 84788

Theoretical pI: Translated: 5.53; Mature: 5.53

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKELFQKIWQNELQFLNFDAKFQDKSKLDTAECAIILSVNKDNYERYFLLKEFQELCKKI
CHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
DLRVDIFSIQNAQICILNFFKSGFISKQDLLKALKILEKISKNTEMLDFISQEKVQSIDQ
CCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KALFQNDFKELNTINLELQKLSFDENLKSRLQKTLEKFQNLEFNIAITGVMNAGKSSLLN
HHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEHHCCHHHHHH
ALLKEDFLGVSNIPETANLTVLSYGKSEEAKIYFWDKKEWQNILESSHFNADLKEFIDKL
HHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
DKSVNIEDFIKDKPLIQNIALCELKNFSSAKNKISALIKKIEIKSHLDFLKNNISIVDTP
CCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECC
GLDDVVVQREIVTNEYLRESDFLIHLMNASQSLTQKDADFLVHCLLNSRLSKFLIVLTKA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DLLSKKDLEEVIVYTKESLKSRLVDLDENLVEKIDFLCVSAKMASDFYKGLAPKESLQKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHC
GMQEFENYLFNELYAGEKSKIALRAYKKELHLELKNILSKYEMQNRLIKENKQGVSEENQ
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
KLLLELQKQNILLKEAQDEISNFIVKLKNIDNGIDNLVLLLAKKLKERLIDEFKYLKNNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
QKLNLSRILNIVDITTKDGINDILREIKFENIKKIEELKTNLSLKYDFLKDDFDNGFEGF
HHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHCCCCCHHHHH
KDGISKNIDSIFQSEKFALLRLKIEKLSNLKSDLYELETNLDMVIFDTFKEFKMSEILNS
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHH
LNINGAFFEFLNDKLKHYEKNQKSKLESFEKVLQSLKNQDINILNSFEENLEKIEKLKQL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EMGLLNAD
HHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKELFQKIWQNELQFLNFDAKFQDKSKLDTAECAIILSVNKDNYERYFLLKEFQELCKKI
CHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
DLRVDIFSIQNAQICILNFFKSGFISKQDLLKALKILEKISKNTEMLDFISQEKVQSIDQ
CCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KALFQNDFKELNTINLELQKLSFDENLKSRLQKTLEKFQNLEFNIAITGVMNAGKSSLLN
HHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEHHCCHHHHHH
ALLKEDFLGVSNIPETANLTVLSYGKSEEAKIYFWDKKEWQNILESSHFNADLKEFIDKL
HHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
DKSVNIEDFIKDKPLIQNIALCELKNFSSAKNKISALIKKIEIKSHLDFLKNNISIVDTP
CCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECC
GLDDVVVQREIVTNEYLRESDFLIHLMNASQSLTQKDADFLVHCLLNSRLSKFLIVLTKA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DLLSKKDLEEVIVYTKESLKSRLVDLDENLVEKIDFLCVSAKMASDFYKGLAPKESLQKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHC
GMQEFENYLFNELYAGEKSKIALRAYKKELHLELKNILSKYEMQNRLIKENKQGVSEENQ
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
KLLLELQKQNILLKEAQDEISNFIVKLKNIDNGIDNLVLLLAKKLKERLIDEFKYLKNNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
QKLNLSRILNIVDITTKDGINDILREIKFENIKKIEELKTNLSLKYDFLKDDFDNGFEGF
HHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHCCCCCHHHHH
KDGISKNIDSIFQSEKFALLRLKIEKLSNLKSDLYELETNLDMVIFDTFKEFKMSEILNS
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHH
LNINGAFFEFLNDKLKHYEKNQKSKLESFEKVLQSLKNQDINILNSFEENLEKIEKLKQL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EMGLLNAD
HHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8920183 [H]