| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is 57237047
Identifier: 57237047
GI number: 57237047
Start: 48472
End: 50928
Strand: Direct
Name: 57237047
Synonym: CJE0032
Alternate gene names: NA
Gene position: 48472-50928 (Clockwise)
Preceding gene: 57237046
Following gene: 57237050
Centisome position: 2.73
GC content: 23.08
Gene sequence:
>2457_bases ATGGATTTGGTAAGTAGTTTTTTATCTAAAAAAAATATCAATAATGAAGAAGATATAAAATTTGAAAATTATATAAAAGG TGAAGCAAAGTTAAATAGTGAAAAACAATATATTATAGAAAGTAGTTGTTGTTTTGATGGAAATAAAGATAATTTTAAGC GACATTATGACGAAAATAAGATTTTAGAAATACATTTAAATAATATGCTTTTTGAGCAAGATTTAGTTTTTGATAATGTG AAAAAACTATCTTTGATAATTAATGATAATGTCAAATTTAATAAATTGTTTATTAATAACTGTAATGAATTATATTTGCA ATTTAATGGGAGAGTTGAAGTTATTGATAAAATTAGCATTAATGACTGCAAATTTAAACAAATATCTATCAATAATCATA TAGATGGAAATATCGAATTTCAAAAATGTGAATTTAATGATTTTAATTTATATGGCTTTTCTAATGCTACTATAAAAGGT ACTTTTACGTTTGATTTTTGTGAAATAAAAGAAAAAGTTAATTTTATGAACTTTGAATTTGAAAATAAAGTTAGTTTTAA AATGTCTAAATTTAAAGATAATGTTTATTTTAATAATTCTCATTTTAAAGATTATGTCGACTTTCACGAATGCGAATTTG AAAAAATAGCTTGTTTTTATGGAGTGAAGTTTTATAAAACTCCGAATTTTAGCGCTTGTTATTTTAAAGAACCAAAAGCT GTAAATTTAATCAATGTCGATATAGATAAGCTAGATTTTAAATCAGTGGAGAAATATATAGAAGATAACTATCAAGATGA AAGTTATAAAAACGAACATAAATTAAGATATGCTAAAAATTTAAAAGATTCTTTCAGGGTTATAAAAGATGTTTTAATCA CTCAAAATAATACCTTAGAAGCTCAAGAGTGGCACAAGTTAGAGCTTTATGCGAAAGAGAAAGAGTTAGAAATTCAACTA GGTGGTGATAATAAAGATAGTATTAAAAATATTCAAAAAATAAAAAAATCAGTAATAAAAAAACCAAGCAACAATCCAAG CAATATACTTGCAAAGATTCAAAGTTTAAGTGACAAGTATATAAAAATTTGCGATTTTGTTGTTTGTTTTATAATGCTTA TAGGAAGATCAATCTTTGGTTTTTTATTATCAATTATTGAGATATTTTGCAATGTTATAAAAAGTATATGCAAAATAATA CAAATTATTTTATCTTGCATATTTTGTATAGCTTCAATCGACAGAATTTTAAAGCTTGAGTATTTAAAATTCTATAGAAA AATTAGTAGTCTTGGAAAAACAATGCTAGATTTTACTTTATGGTTTGATTGTGTTTTGTTACAAGTTTATAGGAATACTA GCAATCACCATACAAATTTCTTAAAAATTTTAAATTTTACGATTTTAATGATTTCATCATATGCTATTTTTGGCTTATTA TTTTTAAATAATATGGATTTTATATTATCTTTTGGTCCAATGACAATAGCTGCAATGAATTATATCGTTTTATTAATGTT ATTAATTATTTTTATTAGCCTTACAAGGCAATTATATCAACATGGTGCTATTTTATTATTTCTTATTTATGGTCTTTTTA TAATCAGCATAGTATCATTTTTATCACCAATATACATTCCAGCTTTTTATTTTTTAATTTATTTTGTAGGTATATTAATT TCCTATCTTTTATTTATCTGTAAAATTAAACTTTTTGTTTTTATTTCGAGATTGTTTGCCTATATTTGTCTAATTGGGGT TGTTATTTTAAAACCTCAACTTATCAATCCTTTTGTAGGAATTTTTTCATCAGATAAACTTTATGAAAGTAAATTTGAAA AAAGGTTAAATGATTTAAATACGAGTGCTATTGTAAATCTAGCAAGCATATTGCAAAATGATTTTAATCTCCATTTAAAA GATCAAAATATTTCTTTTACAGAGTTAAATTCAGCTAAAGCTTTGATAATAGCAAATAAAGAAAAATTAAAAGAAATTTT ATCTAAAGTGTATAATGATAAATATGTAAGTGATTATAAAAAGGTTTTAAATGAACTAGAAAATAACACATCAAATGTAA AAAATATCATAGAAGAGATAGACAATAAAAACAACAATAGCGTTGTATCTGCTCAACTTAATAAATTTTTAAAATTAAAT TTTAATCAAGAAATAGATATTTTATATGCGATAAAAAGTAATTTTTCTATATCTGAAAAACTATCACCTGAGCAAATGGC TCTTTTTGATCAAAAAGACAGTCAAGATAAATTAAAAAGTGTCTTGGCTCTTTTGAAATTTAAATCAAGTTTTGAAGGGA TTTTAAAGATTATAAATCAAGACGAGATTACAGAAAACACCATAAAATCCACTGGTGTTTTATATGGCATTATACTTTTG CTTTGTATATTCTCACTCCAAAAAACCGCACGAAAAAATTCCATAGTGCCAAGCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAACGCAAATACCCAAGAACTAGAAAATAAAATCAATTCTTTGACTTATAAACTTTACAATCTCACCGAAGAAGAAATA AAAATCATAGAAGGGAAATA
Downstream 100 bases:
>100_bases GCCTTAAAGCTTAGCTTGAAATTTTATCATCAGTCTTTTAAGTAGTATTCTATAGTAGAAACCACTCTTATAGTTTTGAT ATAAGGGGTGTTTTTATCTC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 818; Mature: 818
Protein sequence:
>818_residues MDLVSSFLSKKNINNEEDIKFENYIKGEAKLNSEKQYIIESSCCFDGNKDNFKRHYDENKILEIHLNNMLFEQDLVFDNV KKLSLIINDNVKFNKLFINNCNELYLQFNGRVEVIDKISINDCKFKQISINNHIDGNIEFQKCEFNDFNLYGFSNATIKG TFTFDFCEIKEKVNFMNFEFENKVSFKMSKFKDNVYFNNSHFKDYVDFHECEFEKIACFYGVKFYKTPNFSACYFKEPKA VNLINVDIDKLDFKSVEKYIEDNYQDESYKNEHKLRYAKNLKDSFRVIKDVLITQNNTLEAQEWHKLELYAKEKELEIQL GGDNKDSIKNIQKIKKSVIKKPSNNPSNILAKIQSLSDKYIKICDFVVCFIMLIGRSIFGFLLSIIEIFCNVIKSICKII QIILSCIFCIASIDRILKLEYLKFYRKISSLGKTMLDFTLWFDCVLLQVYRNTSNHHTNFLKILNFTILMISSYAIFGLL FLNNMDFILSFGPMTIAAMNYIVLLMLLIIFISLTRQLYQHGAILLFLIYGLFIISIVSFLSPIYIPAFYFLIYFVGILI SYLLFICKIKLFVFISRLFAYICLIGVVILKPQLINPFVGIFSSDKLYESKFEKRLNDLNTSAIVNLASILQNDFNLHLK DQNISFTELNSAKALIIANKEKLKEILSKVYNDKYVSDYKKVLNELENNTSNVKNIIEEIDNKNNNSVVSAQLNKFLKLN FNQEIDILYAIKSNFSISEKLSPEQMALFDQKDSQDKLKSVLALLKFKSSFEGILKIINQDEITENTIKSTGVLYGIILL LCIFSLQKTARKNSIVPS
Sequences:
>Translated_818_residues MDLVSSFLSKKNINNEEDIKFENYIKGEAKLNSEKQYIIESSCCFDGNKDNFKRHYDENKILEIHLNNMLFEQDLVFDNV KKLSLIINDNVKFNKLFINNCNELYLQFNGRVEVIDKISINDCKFKQISINNHIDGNIEFQKCEFNDFNLYGFSNATIKG TFTFDFCEIKEKVNFMNFEFENKVSFKMSKFKDNVYFNNSHFKDYVDFHECEFEKIACFYGVKFYKTPNFSACYFKEPKA VNLINVDIDKLDFKSVEKYIEDNYQDESYKNEHKLRYAKNLKDSFRVIKDVLITQNNTLEAQEWHKLELYAKEKELEIQL GGDNKDSIKNIQKIKKSVIKKPSNNPSNILAKIQSLSDKYIKICDFVVCFIMLIGRSIFGFLLSIIEIFCNVIKSICKII QIILSCIFCIASIDRILKLEYLKFYRKISSLGKTMLDFTLWFDCVLLQVYRNTSNHHTNFLKILNFTILMISSYAIFGLL FLNNMDFILSFGPMTIAAMNYIVLLMLLIIFISLTRQLYQHGAILLFLIYGLFIISIVSFLSPIYIPAFYFLIYFVGILI SYLLFICKIKLFVFISRLFAYICLIGVVILKPQLINPFVGIFSSDKLYESKFEKRLNDLNTSAIVNLASILQNDFNLHLK DQNISFTELNSAKALIIANKEKLKEILSKVYNDKYVSDYKKVLNELENNTSNVKNIIEEIDNKNNNSVVSAQLNKFLKLN FNQEIDILYAIKSNFSISEKLSPEQMALFDQKDSQDKLKSVLALLKFKSSFEGILKIINQDEITENTIKSTGVLYGIILL LCIFSLQKTARKNSIVPS >Mature_818_residues MDLVSSFLSKKNINNEEDIKFENYIKGEAKLNSEKQYIIESSCCFDGNKDNFKRHYDENKILEIHLNNMLFEQDLVFDNV KKLSLIINDNVKFNKLFINNCNELYLQFNGRVEVIDKISINDCKFKQISINNHIDGNIEFQKCEFNDFNLYGFSNATIKG TFTFDFCEIKEKVNFMNFEFENKVSFKMSKFKDNVYFNNSHFKDYVDFHECEFEKIACFYGVKFYKTPNFSACYFKEPKA VNLINVDIDKLDFKSVEKYIEDNYQDESYKNEHKLRYAKNLKDSFRVIKDVLITQNNTLEAQEWHKLELYAKEKELEIQL GGDNKDSIKNIQKIKKSVIKKPSNNPSNILAKIQSLSDKYIKICDFVVCFIMLIGRSIFGFLLSIIEIFCNVIKSICKII QIILSCIFCIASIDRILKLEYLKFYRKISSLGKTMLDFTLWFDCVLLQVYRNTSNHHTNFLKILNFTILMISSYAIFGLL FLNNMDFILSFGPMTIAAMNYIVLLMLLIIFISLTRQLYQHGAILLFLIYGLFIISIVSFLSPIYIPAFYFLIYFVGILI SYLLFICKIKLFVFISRLFAYICLIGVVILKPQLINPFVGIFSSDKLYESKFEKRLNDLNTSAIVNLASILQNDFNLHLK DQNISFTELNSAKALIIANKEKLKEILSKVYNDKYVSDYKKVLNELENNTSNVKNIIEEIDNKNNNSVVSAQLNKFLKLN FNQEIDILYAIKSNFSISEKLSPEQMALFDQKDSQDKLKSVLALLKFKSSFEGILKIINQDEITENTIKSTGVLYGIILL LCIFSLQKTARKNSIVPS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 95273; Mature: 95273
Theoretical pI: Translated: 8.35; Mature: 8.35
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.3 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 3.8 %Cys+Met (Translated Protein) 2.3 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 3.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDLVSSFLSKKNINNEEDIKFENYIKGEAKLNSEKQYIIESSCCFDGNKDNFKRHYDENK CCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCCCC ILEIHLNNMLFEQDLVFDNVKKLSLIINDNVKFNKLFINNCNELYLQFNGRVEVIDKISI EEEEEECCHHHHHHHHHHCHHHEEEEEECCCEEEEEEECCCCEEEEEECCEEEEEEEECC NDCKFKQISINNHIDGNIEFQKCEFNDFNLYGFSNATIKGTFTFDFCEIKEKVNFMNFEF CCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECCCCEEEEEEEEHHHHHHHHCCCCCEEE ENKVSFKMSKFKDNVYFNNSHFKDYVDFHECEFEKIACFYGVKFYKTPNFSACYFKEPKA CCCHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHCEEEEECCCCCEEEECCCCE VNLINVDIDKLDFKSVEKYIEDNYQDESYKNEHKLRYAKNLKDSFRVIKDVLITQNNTLE EEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC AQEWHKLELYAKEKELEIQLGGDNKDSIKNIQKIKKSVIKKPSNNPSNILAKIQSLSDKY HHHHHHEEEEEECCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH IKICDFVVCFIMLIGRSIFGFLLSIIEIFCNVIKSICKIIQIILSCIFCIASIDRILKLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLKFYRKISSLGKTMLDFTLWFDCVLLQVYRNTSNHHTNFLKILNFTILMISSYAIFGLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLNNMDFILSFGPMTIAAMNYIVLLMLLIIFISLTRQLYQHGAILLFLIYGLFIISIVSF HHCCCHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSPIYIPAFYFLIYFVGILISYLLFICKIKLFVFISRLFAYICLIGVVILKPQLINPFVG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCHHHH IFSSDKLYESKFEKRLNDLNTSAIVNLASILQNDFNLHLKDQNISFTELNSAKALIIANK HCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEECCCCCEEEEECH EKLKEILSKVYNDKYVSDYKKVLNELENNTSNVKNIIEEIDNKNNNSVVSAQLNKFLKLN HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHEEC FNQEIDILYAIKSNFSISEKLSPEQMALFDQKDSQDKLKSVLALLKFKSSFEGILKIINQ CCCCEEEEEEEECCCCCHHCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC DEITENTIKSTGVLYGIILLLCIFSLQKTARKNSIVPS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MDLVSSFLSKKNINNEEDIKFENYIKGEAKLNSEKQYIIESSCCFDGNKDNFKRHYDENK CCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCCCC ILEIHLNNMLFEQDLVFDNVKKLSLIINDNVKFNKLFINNCNELYLQFNGRVEVIDKISI EEEEEECCHHHHHHHHHHCHHHEEEEEECCCEEEEEEECCCCEEEEEECCEEEEEEEECC NDCKFKQISINNHIDGNIEFQKCEFNDFNLYGFSNATIKGTFTFDFCEIKEKVNFMNFEF CCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECCCCEEEEEEEEHHHHHHHHCCCCCEEE ENKVSFKMSKFKDNVYFNNSHFKDYVDFHECEFEKIACFYGVKFYKTPNFSACYFKEPKA CCCHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHCEEEEECCCCCEEEECCCCE VNLINVDIDKLDFKSVEKYIEDNYQDESYKNEHKLRYAKNLKDSFRVIKDVLITQNNTLE EEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC AQEWHKLELYAKEKELEIQLGGDNKDSIKNIQKIKKSVIKKPSNNPSNILAKIQSLSDKY HHHHHHEEEEEECCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH IKICDFVVCFIMLIGRSIFGFLLSIIEIFCNVIKSICKIIQIILSCIFCIASIDRILKLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLKFYRKISSLGKTMLDFTLWFDCVLLQVYRNTSNHHTNFLKILNFTILMISSYAIFGLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLNNMDFILSFGPMTIAAMNYIVLLMLLIIFISLTRQLYQHGAILLFLIYGLFIISIVSF HHCCCHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSPIYIPAFYFLIYFVGILISYLLFICKIKLFVFISRLFAYICLIGVVILKPQLINPFVG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCHHHH IFSSDKLYESKFEKRLNDLNTSAIVNLASILQNDFNLHLKDQNISFTELNSAKALIIANK HCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEECCCCCEEEEECH EKLKEILSKVYNDKYVSDYKKVLNELENNTSNVKNIIEEIDNKNNNSVVSAQLNKFLKLN HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHEEC FNQEIDILYAIKSNFSISEKLSPEQMALFDQKDSQDKLKSVLALLKFKSSFEGILKIINQ CCCCEEEEEEEECCCCCHHCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC DEITENTIKSTGVLYGIILLLCIFSLQKTARKNSIVPS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA