Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 57237047

Identifier: 57237047

GI number: 57237047

Start: 48472

End: 50928

Strand: Direct

Name: 57237047

Synonym: CJE0032

Alternate gene names: NA

Gene position: 48472-50928 (Clockwise)

Preceding gene: 57237046

Following gene: 57237050

Centisome position: 2.73

GC content: 23.08

Gene sequence:

>2457_bases
ATGGATTTGGTAAGTAGTTTTTTATCTAAAAAAAATATCAATAATGAAGAAGATATAAAATTTGAAAATTATATAAAAGG
TGAAGCAAAGTTAAATAGTGAAAAACAATATATTATAGAAAGTAGTTGTTGTTTTGATGGAAATAAAGATAATTTTAAGC
GACATTATGACGAAAATAAGATTTTAGAAATACATTTAAATAATATGCTTTTTGAGCAAGATTTAGTTTTTGATAATGTG
AAAAAACTATCTTTGATAATTAATGATAATGTCAAATTTAATAAATTGTTTATTAATAACTGTAATGAATTATATTTGCA
ATTTAATGGGAGAGTTGAAGTTATTGATAAAATTAGCATTAATGACTGCAAATTTAAACAAATATCTATCAATAATCATA
TAGATGGAAATATCGAATTTCAAAAATGTGAATTTAATGATTTTAATTTATATGGCTTTTCTAATGCTACTATAAAAGGT
ACTTTTACGTTTGATTTTTGTGAAATAAAAGAAAAAGTTAATTTTATGAACTTTGAATTTGAAAATAAAGTTAGTTTTAA
AATGTCTAAATTTAAAGATAATGTTTATTTTAATAATTCTCATTTTAAAGATTATGTCGACTTTCACGAATGCGAATTTG
AAAAAATAGCTTGTTTTTATGGAGTGAAGTTTTATAAAACTCCGAATTTTAGCGCTTGTTATTTTAAAGAACCAAAAGCT
GTAAATTTAATCAATGTCGATATAGATAAGCTAGATTTTAAATCAGTGGAGAAATATATAGAAGATAACTATCAAGATGA
AAGTTATAAAAACGAACATAAATTAAGATATGCTAAAAATTTAAAAGATTCTTTCAGGGTTATAAAAGATGTTTTAATCA
CTCAAAATAATACCTTAGAAGCTCAAGAGTGGCACAAGTTAGAGCTTTATGCGAAAGAGAAAGAGTTAGAAATTCAACTA
GGTGGTGATAATAAAGATAGTATTAAAAATATTCAAAAAATAAAAAAATCAGTAATAAAAAAACCAAGCAACAATCCAAG
CAATATACTTGCAAAGATTCAAAGTTTAAGTGACAAGTATATAAAAATTTGCGATTTTGTTGTTTGTTTTATAATGCTTA
TAGGAAGATCAATCTTTGGTTTTTTATTATCAATTATTGAGATATTTTGCAATGTTATAAAAAGTATATGCAAAATAATA
CAAATTATTTTATCTTGCATATTTTGTATAGCTTCAATCGACAGAATTTTAAAGCTTGAGTATTTAAAATTCTATAGAAA
AATTAGTAGTCTTGGAAAAACAATGCTAGATTTTACTTTATGGTTTGATTGTGTTTTGTTACAAGTTTATAGGAATACTA
GCAATCACCATACAAATTTCTTAAAAATTTTAAATTTTACGATTTTAATGATTTCATCATATGCTATTTTTGGCTTATTA
TTTTTAAATAATATGGATTTTATATTATCTTTTGGTCCAATGACAATAGCTGCAATGAATTATATCGTTTTATTAATGTT
ATTAATTATTTTTATTAGCCTTACAAGGCAATTATATCAACATGGTGCTATTTTATTATTTCTTATTTATGGTCTTTTTA
TAATCAGCATAGTATCATTTTTATCACCAATATACATTCCAGCTTTTTATTTTTTAATTTATTTTGTAGGTATATTAATT
TCCTATCTTTTATTTATCTGTAAAATTAAACTTTTTGTTTTTATTTCGAGATTGTTTGCCTATATTTGTCTAATTGGGGT
TGTTATTTTAAAACCTCAACTTATCAATCCTTTTGTAGGAATTTTTTCATCAGATAAACTTTATGAAAGTAAATTTGAAA
AAAGGTTAAATGATTTAAATACGAGTGCTATTGTAAATCTAGCAAGCATATTGCAAAATGATTTTAATCTCCATTTAAAA
GATCAAAATATTTCTTTTACAGAGTTAAATTCAGCTAAAGCTTTGATAATAGCAAATAAAGAAAAATTAAAAGAAATTTT
ATCTAAAGTGTATAATGATAAATATGTAAGTGATTATAAAAAGGTTTTAAATGAACTAGAAAATAACACATCAAATGTAA
AAAATATCATAGAAGAGATAGACAATAAAAACAACAATAGCGTTGTATCTGCTCAACTTAATAAATTTTTAAAATTAAAT
TTTAATCAAGAAATAGATATTTTATATGCGATAAAAAGTAATTTTTCTATATCTGAAAAACTATCACCTGAGCAAATGGC
TCTTTTTGATCAAAAAGACAGTCAAGATAAATTAAAAAGTGTCTTGGCTCTTTTGAAATTTAAATCAAGTTTTGAAGGGA
TTTTAAAGATTATAAATCAAGACGAGATTACAGAAAACACCATAAAATCCACTGGTGTTTTATATGGCATTATACTTTTG
CTTTGTATATTCTCACTCCAAAAAACCGCACGAAAAAATTCCATAGTGCCAAGCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAACGCAAATACCCAAGAACTAGAAAATAAAATCAATTCTTTGACTTATAAACTTTACAATCTCACCGAAGAAGAAATA
AAAATCATAGAAGGGAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCCTTAAAGCTTAGCTTGAAATTTTATCATCAGTCTTTTAAGTAGTATTCTATAGTAGAAACCACTCTTATAGTTTTGAT
ATAAGGGGTGTTTTTATCTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 818; Mature: 818

Protein sequence:

>818_residues
MDLVSSFLSKKNINNEEDIKFENYIKGEAKLNSEKQYIIESSCCFDGNKDNFKRHYDENKILEIHLNNMLFEQDLVFDNV
KKLSLIINDNVKFNKLFINNCNELYLQFNGRVEVIDKISINDCKFKQISINNHIDGNIEFQKCEFNDFNLYGFSNATIKG
TFTFDFCEIKEKVNFMNFEFENKVSFKMSKFKDNVYFNNSHFKDYVDFHECEFEKIACFYGVKFYKTPNFSACYFKEPKA
VNLINVDIDKLDFKSVEKYIEDNYQDESYKNEHKLRYAKNLKDSFRVIKDVLITQNNTLEAQEWHKLELYAKEKELEIQL
GGDNKDSIKNIQKIKKSVIKKPSNNPSNILAKIQSLSDKYIKICDFVVCFIMLIGRSIFGFLLSIIEIFCNVIKSICKII
QIILSCIFCIASIDRILKLEYLKFYRKISSLGKTMLDFTLWFDCVLLQVYRNTSNHHTNFLKILNFTILMISSYAIFGLL
FLNNMDFILSFGPMTIAAMNYIVLLMLLIIFISLTRQLYQHGAILLFLIYGLFIISIVSFLSPIYIPAFYFLIYFVGILI
SYLLFICKIKLFVFISRLFAYICLIGVVILKPQLINPFVGIFSSDKLYESKFEKRLNDLNTSAIVNLASILQNDFNLHLK
DQNISFTELNSAKALIIANKEKLKEILSKVYNDKYVSDYKKVLNELENNTSNVKNIIEEIDNKNNNSVVSAQLNKFLKLN
FNQEIDILYAIKSNFSISEKLSPEQMALFDQKDSQDKLKSVLALLKFKSSFEGILKIINQDEITENTIKSTGVLYGIILL
LCIFSLQKTARKNSIVPS

Sequences:

>Translated_818_residues
MDLVSSFLSKKNINNEEDIKFENYIKGEAKLNSEKQYIIESSCCFDGNKDNFKRHYDENKILEIHLNNMLFEQDLVFDNV
KKLSLIINDNVKFNKLFINNCNELYLQFNGRVEVIDKISINDCKFKQISINNHIDGNIEFQKCEFNDFNLYGFSNATIKG
TFTFDFCEIKEKVNFMNFEFENKVSFKMSKFKDNVYFNNSHFKDYVDFHECEFEKIACFYGVKFYKTPNFSACYFKEPKA
VNLINVDIDKLDFKSVEKYIEDNYQDESYKNEHKLRYAKNLKDSFRVIKDVLITQNNTLEAQEWHKLELYAKEKELEIQL
GGDNKDSIKNIQKIKKSVIKKPSNNPSNILAKIQSLSDKYIKICDFVVCFIMLIGRSIFGFLLSIIEIFCNVIKSICKII
QIILSCIFCIASIDRILKLEYLKFYRKISSLGKTMLDFTLWFDCVLLQVYRNTSNHHTNFLKILNFTILMISSYAIFGLL
FLNNMDFILSFGPMTIAAMNYIVLLMLLIIFISLTRQLYQHGAILLFLIYGLFIISIVSFLSPIYIPAFYFLIYFVGILI
SYLLFICKIKLFVFISRLFAYICLIGVVILKPQLINPFVGIFSSDKLYESKFEKRLNDLNTSAIVNLASILQNDFNLHLK
DQNISFTELNSAKALIIANKEKLKEILSKVYNDKYVSDYKKVLNELENNTSNVKNIIEEIDNKNNNSVVSAQLNKFLKLN
FNQEIDILYAIKSNFSISEKLSPEQMALFDQKDSQDKLKSVLALLKFKSSFEGILKIINQDEITENTIKSTGVLYGIILL
LCIFSLQKTARKNSIVPS
>Mature_818_residues
MDLVSSFLSKKNINNEEDIKFENYIKGEAKLNSEKQYIIESSCCFDGNKDNFKRHYDENKILEIHLNNMLFEQDLVFDNV
KKLSLIINDNVKFNKLFINNCNELYLQFNGRVEVIDKISINDCKFKQISINNHIDGNIEFQKCEFNDFNLYGFSNATIKG
TFTFDFCEIKEKVNFMNFEFENKVSFKMSKFKDNVYFNNSHFKDYVDFHECEFEKIACFYGVKFYKTPNFSACYFKEPKA
VNLINVDIDKLDFKSVEKYIEDNYQDESYKNEHKLRYAKNLKDSFRVIKDVLITQNNTLEAQEWHKLELYAKEKELEIQL
GGDNKDSIKNIQKIKKSVIKKPSNNPSNILAKIQSLSDKYIKICDFVVCFIMLIGRSIFGFLLSIIEIFCNVIKSICKII
QIILSCIFCIASIDRILKLEYLKFYRKISSLGKTMLDFTLWFDCVLLQVYRNTSNHHTNFLKILNFTILMISSYAIFGLL
FLNNMDFILSFGPMTIAAMNYIVLLMLLIIFISLTRQLYQHGAILLFLIYGLFIISIVSFLSPIYIPAFYFLIYFVGILI
SYLLFICKIKLFVFISRLFAYICLIGVVILKPQLINPFVGIFSSDKLYESKFEKRLNDLNTSAIVNLASILQNDFNLHLK
DQNISFTELNSAKALIIANKEKLKEILSKVYNDKYVSDYKKVLNELENNTSNVKNIIEEIDNKNNNSVVSAQLNKFLKLN
FNQEIDILYAIKSNFSISEKLSPEQMALFDQKDSQDKLKSVLALLKFKSSFEGILKIINQDEITENTIKSTGVLYGIILL
LCIFSLQKTARKNSIVPS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 95273; Mature: 95273

Theoretical pI: Translated: 8.35; Mature: 8.35

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.3 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
2.3 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDLVSSFLSKKNINNEEDIKFENYIKGEAKLNSEKQYIIESSCCFDGNKDNFKRHYDENK
CCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCCCC
ILEIHLNNMLFEQDLVFDNVKKLSLIINDNVKFNKLFINNCNELYLQFNGRVEVIDKISI
EEEEEECCHHHHHHHHHHCHHHEEEEEECCCEEEEEEECCCCEEEEEECCEEEEEEEECC
NDCKFKQISINNHIDGNIEFQKCEFNDFNLYGFSNATIKGTFTFDFCEIKEKVNFMNFEF
CCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECCCCEEEEEEEEHHHHHHHHCCCCCEEE
ENKVSFKMSKFKDNVYFNNSHFKDYVDFHECEFEKIACFYGVKFYKTPNFSACYFKEPKA
CCCHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHCEEEEECCCCCEEEECCCCE
VNLINVDIDKLDFKSVEKYIEDNYQDESYKNEHKLRYAKNLKDSFRVIKDVLITQNNTLE
EEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
AQEWHKLELYAKEKELEIQLGGDNKDSIKNIQKIKKSVIKKPSNNPSNILAKIQSLSDKY
HHHHHHEEEEEECCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IKICDFVVCFIMLIGRSIFGFLLSIIEIFCNVIKSICKIIQIILSCIFCIASIDRILKLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLKFYRKISSLGKTMLDFTLWFDCVLLQVYRNTSNHHTNFLKILNFTILMISSYAIFGLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLNNMDFILSFGPMTIAAMNYIVLLMLLIIFISLTRQLYQHGAILLFLIYGLFIISIVSF
HHCCCHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSPIYIPAFYFLIYFVGILISYLLFICKIKLFVFISRLFAYICLIGVVILKPQLINPFVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCHHHH
IFSSDKLYESKFEKRLNDLNTSAIVNLASILQNDFNLHLKDQNISFTELNSAKALIIANK
HCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEECCCCCEEEEECH
EKLKEILSKVYNDKYVSDYKKVLNELENNTSNVKNIIEEIDNKNNNSVVSAQLNKFLKLN
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHEEC
FNQEIDILYAIKSNFSISEKLSPEQMALFDQKDSQDKLKSVLALLKFKSSFEGILKIINQ
CCCCEEEEEEEECCCCCHHCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
DEITENTIKSTGVLYGIILLLCIFSLQKTARKNSIVPS
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDLVSSFLSKKNINNEEDIKFENYIKGEAKLNSEKQYIIESSCCFDGNKDNFKRHYDENK
CCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCCCC
ILEIHLNNMLFEQDLVFDNVKKLSLIINDNVKFNKLFINNCNELYLQFNGRVEVIDKISI
EEEEEECCHHHHHHHHHHCHHHEEEEEECCCEEEEEEECCCCEEEEEECCEEEEEEEECC
NDCKFKQISINNHIDGNIEFQKCEFNDFNLYGFSNATIKGTFTFDFCEIKEKVNFMNFEF
CCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECCCCEEEEEEEEHHHHHHHHCCCCCEEE
ENKVSFKMSKFKDNVYFNNSHFKDYVDFHECEFEKIACFYGVKFYKTPNFSACYFKEPKA
CCCHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHCEEEEECCCCCEEEECCCCE
VNLINVDIDKLDFKSVEKYIEDNYQDESYKNEHKLRYAKNLKDSFRVIKDVLITQNNTLE
EEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
AQEWHKLELYAKEKELEIQLGGDNKDSIKNIQKIKKSVIKKPSNNPSNILAKIQSLSDKY
HHHHHHEEEEEECCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IKICDFVVCFIMLIGRSIFGFLLSIIEIFCNVIKSICKIIQIILSCIFCIASIDRILKLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLKFYRKISSLGKTMLDFTLWFDCVLLQVYRNTSNHHTNFLKILNFTILMISSYAIFGLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLNNMDFILSFGPMTIAAMNYIVLLMLLIIFISLTRQLYQHGAILLFLIYGLFIISIVSF
HHCCCHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSPIYIPAFYFLIYFVGILISYLLFICKIKLFVFISRLFAYICLIGVVILKPQLINPFVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCHHHH
IFSSDKLYESKFEKRLNDLNTSAIVNLASILQNDFNLHLKDQNISFTELNSAKALIIANK
HCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEECCCCCEEEEECH
EKLKEILSKVYNDKYVSDYKKVLNELENNTSNVKNIIEEIDNKNNNSVVSAQLNKFLKLN
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHEEC
FNQEIDILYAIKSNFSISEKLSPEQMALFDQKDSQDKLKSVLALLKFKSSFEGILKIINQ
CCCCEEEEEEEECCCCCHHCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
DEITENTIKSTGVLYGIILLLCIFSLQKTARKNSIVPS
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA