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The map label for this gene is 54297336

Identifier: 54297336

GI number: 54297336

Start: 1538766

End: 1541417

Strand: Direct

Name: 54297336

Synonym: lpp1381

Alternate gene names: NA

Gene position: 1538766-1541417 (Clockwise)

Preceding gene: 54297335

Following gene: 54297337

Centisome position: 43.92

GC content: 34.92

Gene sequence:

>2652_bases
ATGACCCCACAGCACGTCATAAGTCAACTGCTGGAATCTGATACCAAATACCCTCAGAATTTAGATTTATTAAAAAAAAT
AATCATATCAGCTTATCTGGGACGCCTCAGAATTAATGGATTACCTCCAGATAACAAGATTGCACTTGGAAATTATTTAT
TTGATGATGAACGTATGATTTTTGATTTCACTCGATTGAGCGATTCAAAAAGAGCTTTATTTATTGAATGGTTGCTTGAG
CCTCATCAAAAAGATAAAGAGCATGGTTTTTTAAGTGGCGTTTACGTGAATGAATATCGAGGTTTCACTGCGGAGGTTGC
TTTAAGTTGGTGGGGTATCTTAAAAAACTGGTTATTTAATAATAAATCTGAGCATTGGAAAATAACGGATTTGGGACTTT
CTGTCAATTATCAGTTGACTGGTATTGAAATGTGTCAAGGAAAGCAGGGTATCTTAATTGGATTTAACCAGTTTTTAGTA
CCACCTTCAGGTACAAAATACAGAGATCCTAATGATAACCAAAGTGAGCCATTAGGTAATGTTAAAAGAGTATTCATTAC
TGATAAACTGGTTGATGAACTTGTTGGACTCAATTATAAAAATCTTAATTATGAGTCTGTCTGTAAAAGCCCTCATCCGC
AATCTATTGATGTAACTGATCCAGAAGCTCGTCATAAAGACATGTATGATTATAGAAAAATGCAACGTTTCAATGGTGTG
AGGCCTTGGTATATCAGACTTTGGAGATGGATATCTAAACTATTTTTTGGCGATACATACGACGCTAAAAAAACAAGCAC
TGCAGACGACAATTTGGAATTACTTTATAAAACTAAAACTGTTAAAATTTATCAGCGCTCCAAATCAAAAGAGATCTTGG
TCACAGAGAAGCGACCTGATATTACTAATTTGGTTTTTTGTGGAGGTGGGGCAAAAATTTTTGCTCACGTGGGGGTTTGG
AAGGCTCTCAATGAAGCAGGAATGAAGCCAACCAAATTTGCAGGAAGCTCTGCCGGTGCAATCATGTCTTTGATGTGCTA
CCTAGGTTATACTGCTGATGAAATTAGTGAACTTTTCAAGCATTTCAAACAAGAGCATTTAGTTCAATTTGATATAGACA
GAAATGGATTATCGGATACCCATTCCTTAAAGACGGCGCTGGATTATGCTATCGCAAATAAAGTAAGGCAAATAGTAAAT
AAATATAAAATTCCATATCCTAAGGGAAAAATAACTTTTAGTACTTTAGCTTCTCTAAGAGAGCAATTTCCAGATTGTGG
AATAGGCAAAGAATTAATTGTTACAGCAACAAATAAACGCTCAGGAAAAACTATTTATTTATCAGCAAATCGTTACCCAT
TATTGGAGGTCAGTGAAGCAGTTAAAATTTCTGCGAGCTTTCCAGTTTTGTATAGAGATACTCTGCTGGATGGTGAAGAG
CATAATGATGGTGGAATATTAAGTAATTTTCCAACCGAAGTTTTTTTTGATGACCACTCAACGCTGTTGGAGTCTGAATT
TGGTAATAATTTAAAAGTATTGGCAGTTCAATTTGATAATGGGATTGAAAGAAATGTTATTGATAGAATAATGGACAAAG
TTTATCGAGAGAATTTCGTTCTTAACTGGATTTATAGCTTACTGACTGGAGTGAGTGATCCTGCAAGTGGATGGGAAAGA
GACCGCCTTAAATTAAGACAATATGCTCTTCAAACTATAATTCCTGAAACAGGGAAAGTATCAACAACAGGATTTAATGT
AGAGAGGCAGAGCCAGGAGGAATTGATCCAAAATGGTTATCAATCAACTCTGGATTATCTTAATGTAAGATATACTAGAA
AAAACAACAGCTATGTTAACAAGGAAATAATGTATTCTACTTTCAATTCTTTGGGAGATTTGCTTGCTTACTGTTGTTAC
AGGGGAGATGAACAATGGTTTAATGTTGTTAATAATCTAATTGTGCAATCTACCTTACCTAATCGTACTGCTTTAATGAA
GCAATCCCTTGAACTTAGAAAACTTTATTTTAATACGTATCTACCTTCTAGTCCTGAAAAGAATAGAACAGCTTGTAATG
AAAGCAATACTTTAACTTTTTTTGGTAATGCGGTTTGTCAGCATCATAATCACAGCCAGGAGCTTGAAAATGGAAACCAT
GATGTCTTACTGGCGCTCTATCCAATTTTTTTAAAACTAACTACTGATTTATTAATAAATAAAATTGATAAGAACCTATT
AGACCGTGCACGTCATTCACTAAATATACACTCTCCCTTTGATTGTCTTGAGCATTTTAATAAAATTTCAGGAAATGCTC
ATGTTATGATTCATATCATCGTTAAATTAATTAAAGAGCTCAAAGAAAGAACATGCCAACAAATTTATGATGTATTAAAA
GAGGTTAGGCATTTATTGTATAGCGATATTAATCTTATGAAAGCAAATTATTTTGGCAAATGGGATTTAAGTCTCCCTCA
ATGTATACGGATCTTGAATTTGTTAAAACAGGAAAAGCATGACGATGTATCTCGGCAATTGGATTGCCTACGTAACCAAA
TGGAGCCTGTGCAAACAGTAAAAGGAGGAGTGCATCATGATGACCTTAATAACGGGGGCCACGAGAGGTATAGGCTTGGC
CTTGGCGTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATGATAATTGTTATAAAGATGATTAATAAATATTTAAAAATAATCAATATTATTTCAGATATTTATTCTATGGACTAC
CTAGGCGTAAGGATTTACTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTTGCATCACATGGCCATGATTTAATACTTATTGGTAGAGACTCTGAACAGCTGGAGCACATTTCAAAGCAATTAAATA
CACAATATCAAGTTAATGTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Patatin; Esterase; Alpha-Beta Hydrolase Superfamily Esterase; Esterase Of Alpha/Beta Hydrolase Superfamily Protein; Phospholipase Patatin Family; Phospholipase

Number of amino acids: Translated: 883; Mature: 882

Protein sequence:

>883_residues
MTPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMIFDFTRLSDSKRALFIEWLLE
PHQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFNNKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCQGKQGILIGFNQFLV
PPSGTKYRDPNDNQSEPLGNVKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGV
RPWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTADDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPDITNLVFCGGGAKIFAHVGVW
KALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFKHFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVN
KYKIPYPKGKITFSTLASLREQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEE
HNDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFVLNWIYSLLTGVSDPASGWER
DRLKLRQYALQTIIPETGKVSTTGFNVERQSQEELIQNGYQSTLDYLNVRYTRKNNSYVNKEIMYSTFNSLGDLLAYCCY
RGDEQWFNVVNNLIVQSTLPNRTALMKQSLELRKLYFNTYLPSSPEKNRTACNESNTLTFFGNAVCQHHNHSQELENGNH
DVLLALYPIFLKLTTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHIIVKLIKELKERTCQQIYDVLK
EVRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKHDDVSRQLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLG
LGV

Sequences:

>Translated_883_residues
MTPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMIFDFTRLSDSKRALFIEWLLE
PHQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFNNKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCQGKQGILIGFNQFLV
PPSGTKYRDPNDNQSEPLGNVKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGV
RPWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTADDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPDITNLVFCGGGAKIFAHVGVW
KALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFKHFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVN
KYKIPYPKGKITFSTLASLREQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEE
HNDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFVLNWIYSLLTGVSDPASGWER
DRLKLRQYALQTIIPETGKVSTTGFNVERQSQEELIQNGYQSTLDYLNVRYTRKNNSYVNKEIMYSTFNSLGDLLAYCCY
RGDEQWFNVVNNLIVQSTLPNRTALMKQSLELRKLYFNTYLPSSPEKNRTACNESNTLTFFGNAVCQHHNHSQELENGNH
DVLLALYPIFLKLTTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHIIVKLIKELKERTCQQIYDVLK
EVRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKHDDVSRQLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLG
LGV
>Mature_882_residues
TPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMIFDFTRLSDSKRALFIEWLLEP
HQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFNNKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCQGKQGILIGFNQFLVP
PSGTKYRDPNDNQSEPLGNVKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGVR
PWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTADDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPDITNLVFCGGGAKIFAHVGVWK
ALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFKHFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVNK
YKIPYPKGKITFSTLASLREQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEEH
NDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFVLNWIYSLLTGVSDPASGWERD
RLKLRQYALQTIIPETGKVSTTGFNVERQSQEELIQNGYQSTLDYLNVRYTRKNNSYVNKEIMYSTFNSLGDLLAYCCYR
GDEQWFNVVNNLIVQSTLPNRTALMKQSLELRKLYFNTYLPSSPEKNRTACNESNTLTFFGNAVCQHHNHSQELENGNHD
VLLALYPIFLKLTTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHIIVKLIKELKERTCQQIYDVLKE
VRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKHDDVSRQLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLGL
GV

Specific function: Unknown

COG id: COG1752

COG function: function code R; Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 101720; Mature: 101589

Theoretical pI: Translated: 8.22; Mature: 8.22

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMI
CCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEEECCEEECCCCEE
FDFTRLSDSKRALFIEWLLEPHQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFN
EEEHHCCCCCCEEEHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCQGKQGILIGFNQFLVPPSGTKYRDPNDNQSEPLGN
CCCCCEEEEEEEEEEEEEEEEEHCCCCCCCEEEECCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
VKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGV
HHEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
RPWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTADDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPD
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCC
ITNLVFCGGGAKIFAHVGVWKALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFK
CCEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
HFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVNKYKIPYPKGKITFSTLASLR
HHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHH
EQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEE
HHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCEECCCHHEEECCCCEEEHHHHCCCCC
HNDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFV
CCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNWIYSLLTGVSDPASGWERDRLKLRQYALQTIIPETGKVSTTGFNVERQSQEELIQNGY
HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHCHH
QSTLDYLNVRYTRKNNSYVNKEIMYSTFNSLGDLLAYCCYRGDEQWFNVVNNLIVQSTLP
HHHHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
NRTALMKQSLELRKLYFNTYLPSSPEKNRTACNESNTLTFFGNAVCQHHNHSQELENGNH
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHCCCCHHHHCCCCC
DVLLALYPIFLKLTTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHII
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VKLIKELKERTCQQIYDVLKEVRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHC
DDVSRQLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLGLGV
CHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCC
>Mature Secondary Structure 
TPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMI
CHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEEECCEEECCCCEE
FDFTRLSDSKRALFIEWLLEPHQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFN
EEEHHCCCCCCEEEHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCQGKQGILIGFNQFLVPPSGTKYRDPNDNQSEPLGN
CCCCCEEEEEEEEEEEEEEEEEHCCCCCCCEEEECCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
VKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGV
HHEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
RPWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTADDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPD
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCC
ITNLVFCGGGAKIFAHVGVWKALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFK
CCEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
HFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVNKYKIPYPKGKITFSTLASLR
HHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHH
EQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEE
HHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCEECCCHHEEECCCCEEEHHHHCCCCC
HNDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFV
CCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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NRTALMKQSLELRKLYFNTYLPSSPEKNRTACNESNTLTFFGNAVCQHHNHSQELENGNH
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DVLLALYPIFLKLTTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHII
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VKLIKELKERTCQQIYDVLKEVRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHC
DDVSRQLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLGLGV
CHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA