| Definition | Legionella pneumophila str. Paris, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006368 |
| Length | 3,503,610 |
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The map label for this gene is yejM [H]
Identifier: 54297227
GI number: 54297227
Start: 1410481
End: 1412394
Strand: Direct
Name: yejM [H]
Synonym: lpp1272
Alternate gene names: 54297227
Gene position: 1410481-1412394 (Clockwise)
Preceding gene: 54297226
Following gene: 54297228
Centisome position: 40.26
GC content: 33.65
Gene sequence:
>1914_bases ATGAATATAAAAACATATCTAAAAAAAAATGATTTAACCTTACGATTTGTTGGATGGTTCTTTTTAATAAACTCATTCAT ATTTTGGCTTGTTGGCTTGGGGTATTTAAAGTCCATTTTATTAAATGCCTCTCTGTTTAAAAATTATATCGCCGATTATT CAAGTCTATCAGGAAAAATTCTCATTCTGGTTTTCTCAGTTTTAAATTATTTTACTTATATGATGTTTTTAGCTTTTGTC CCTGCAATACCAATCATAATAATGGCATTTTTTTTACCTTATAAACGAATAATTTGGATTATCAGTGTTGTTGCTGCTAC CACAAGTCTTATTTTTTTATTTGTTGATAGTCAAATTTTTTCAATGTTTAAGTTTCATCTTAATAAAACAATATTATCGT TTGTTTTTAATTCAGATTGGAGTGTCATTTTCACTTTTTCCAGATATGAACTGATTTTGTCTTTTTTTATGGTTGTCTTT ATACTCTTTCTGGAGTCTATTGTTGGCTGGTTGGTATGGAAAAAAATAGTTTTAAAAGAACGTTTGAAAATTGGTAAAAC TATTTCATTATTTTGGCTTGGTGGGGCGTTAATAAGTTATTTTATATTGCTCTTATCGATAGCTCAAAATAATAATTTAT TTGCTCAGCAAATACCTAATTTGCCCCTTTATAATCAACTCATTGCCTATACTATCCCTGATAAAAATGCTGATGATATA TTACGCCGCTACAGTGAGCACCATTTTACACAGCCTCTTTTTCCGAATTATCCATTGCATTATCCCTTACATCCAATGCA ATGTAAGATGCCTGAAAAACCTTATAACATTATCCTCATAATGGTAGATTCACTTCGCTATGATTCCCTAAGTGCAAAAT ATATGCCGAATACGGCACAATTTGCAAAAAGAAGTTGGCAGTTTTCTCAGCATATGAGTGCTGGAAATGCCACACAACCA GGATTGTTTTCTTTATTTTATTCGATTCCCAGCAACTACTCGACGGCAGTCCTGGAGCAAAAAAAATCACCAATTTTAAT TGATTTATTATTACAACATGGTTATCAGACAAAAATTATTTGGTCTGGCTCTATGGCTCCACTGCCATTAGATCAGACTA TTTATAAAAAAATTGCCAATCTTAATACTAATGGAGCGCCAATAGATGATACCGGAGACAAGGACAGATATTCCACCAGA GAAGCTATCCAATTTTTAACAGATCCTAAAACAAATAACCCATTCTTTCTCCATATTTTTTATAATGCGCCACATGACTA TTGTAGATATCAAAGTTTTCCGCAGTTATACAAACCCGCAATAGAAGAATGTGTACGAATTGGAATGACAAATCATGTTG ATCCGGTACCTTACTACAATCGTTATTTGAATACAGTCACATTTATTGACCAGGAAATTTCGAAAGTATTAGGGGTTATC GAAAAAAAAGGTTATTTAAAAAACAGCATCATTATAATTACCTCAGATCATGGCCAAGAATTTAATGATAATCGTCAAAA TTATTGGGGACATACCAGTAATTTTACCCCTATTCAACTACACGTTCCCTTGATCATTCATTGGCCAGGGGAGTTAGCTC GTCGTTTTAATTATCTCACCAGCAGCTATGATATTGTCCCTACAATATTACAGCGTTTATTTGCTTGCAAAAATCCTGTT TCTGACTACAGCATCGGGTATAACTTGCTAATTGAGGGCAATCGAGCCCCATTTCTATTGGTAGGAAGTTATATTAATAT GGGAATTTTTGAAGCAGATCGCGCCACAGCATTAGAAACCTCCGGAAGAATTACAATTACTGGTATGAAGGCAGAGCCTC TTGACGATGCGGTACCCAGAATGGATGTTATTACCCAGGCATTGGATTTGATGCGCAAGTATTATGGGAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTTTTCAGAAATTTTAAAACAGGTATATTGGCTAGATTAATTGCTATTTATTGAAGAGGTTGTTCATTAAGATAAATTCG AAATTACATTTGAATTCGTA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGATTGTCTTTAAAAATAAATTGGCAATTAACCTTTTTATTCTCAATTTAGACTATACAGCGGATATCTTTAAATTTTT AGGCAAAAATATGGCTATAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 637; Mature: 637
Protein sequence:
>637_residues MNIKTYLKKNDLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSGKILILVFSVLNYFTYMMFLAFV PAIPIIIMAFFLPYKRIIWIISVVAATTSLIFLFVDSQIFSMFKFHLNKTILSFVFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMVVF ILFLESIVGWLVWKKIVLKERLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNADDI LRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLSAKYMPNTAQFAKRSWQFSQHMSAGNATQP GLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPILIDLLLQHGYQTKIIWSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYSTR EAIQFLTDPKTNNPFFLHIFYNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPVPYYNRYLNTVTFIDQEISKVLGVI EKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNYLTSSYDIVPTILQRLFACKNPV SDYSIGYNLLIEGNRAPFLLVGSYINMGIFEADRATALETSGRITITGMKAEPLDDAVPRMDVITQALDLMRKYYGK
Sequences:
>Translated_637_residues MNIKTYLKKNDLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSGKILILVFSVLNYFTYMMFLAFV PAIPIIIMAFFLPYKRIIWIISVVAATTSLIFLFVDSQIFSMFKFHLNKTILSFVFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMVVF ILFLESIVGWLVWKKIVLKERLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNADDI LRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLSAKYMPNTAQFAKRSWQFSQHMSAGNATQP GLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPILIDLLLQHGYQTKIIWSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYSTR EAIQFLTDPKTNNPFFLHIFYNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPVPYYNRYLNTVTFIDQEISKVLGVI EKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNYLTSSYDIVPTILQRLFACKNPV SDYSIGYNLLIEGNRAPFLLVGSYINMGIFEADRATALETSGRITITGMKAEPLDDAVPRMDVITQALDLMRKYYGK >Mature_637_residues MNIKTYLKKNDLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSGKILILVFSVLNYFTYMMFLAFV PAIPIIIMAFFLPYKRIIWIISVVAATTSLIFLFVDSQIFSMFKFHLNKTILSFVFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMVVF ILFLESIVGWLVWKKIVLKERLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNADDI LRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLSAKYMPNTAQFAKRSWQFSQHMSAGNATQP GLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPILIDLLLQHGYQTKIIWSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYSTR EAIQFLTDPKTNNPFFLHIFYNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPVPYYNRYLNTVTFIDQEISKVLGVI EKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNYLTSSYDIVPTILQRLFACKNPV SDYSIGYNLLIEGNRAPFLLVGSYINMGIFEADRATALETSGRITITGMKAEPLDDAVPRMDVITQALDLMRKYYGK
Specific function: Unknown
COG id: COG3083
COG function: function code R; Predicted hydrolase of alkaline phosphatase superfamily
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To H.influenzae HI_0842 [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788515, Length=636, Percent_Identity=25.4716981132075, Blast_Score=204, Evalue=1e-53,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR017849 - InterPro: IPR017850 - InterPro: IPR012159 - InterPro: IPR000917 [H]
Pfam domain/function: PF00884 Sulfatase [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 73696; Mature: 73696
Theoretical pI: Translated: 9.40; Mature: 9.40
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNIKTYLKKNDLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSGKI CCCHHHEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH LILVFSVLNYFTYMMFLAFVPAIPIIIMAFFLPYKRIIWIISVVAATTSLIFLFVDSQIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SMFKFHLNKTILSFVFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMVVFILFLESIVGWLVWKKIVLKE HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNADDI HHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCHHEEEEECCCCCHHHH LRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLSAKYMPNTAQ HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHH FAKRSWQFSQHMSAGNATQPGLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPILIDLLLQHGYQTKII HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEE WSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYSTREAIQFLTDPKTNNPFFLHIF ECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEE YNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPVPYYNRYLNTVTFIDQEISKVLGVI ECCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNYLT HHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHH SSYDIVPTILQRLFACKNPVSDYSIGYNLLIEGNRAPFLLVGSYINMGIFEADRATALET CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECHHCCCEEECCCCCEEEC SGRITITGMKAEPLDDAVPRMDVITQALDLMRKYYGK CCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MNIKTYLKKNDLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSGKI CCCHHHEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH LILVFSVLNYFTYMMFLAFVPAIPIIIMAFFLPYKRIIWIISVVAATTSLIFLFVDSQIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SMFKFHLNKTILSFVFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMVVFILFLESIVGWLVWKKIVLKE HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNADDI HHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCHHEEEEECCCCCHHHH LRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLSAKYMPNTAQ HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHH FAKRSWQFSQHMSAGNATQPGLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPILIDLLLQHGYQTKII HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEE WSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYSTREAIQFLTDPKTNNPFFLHIF ECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEE YNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPVPYYNRYLNTVTFIDQEISKVLGVI ECCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNYLT HHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHH SSYDIVPTILQRLFACKNPVSDYSIGYNLLIEGNRAPFLLVGSYINMGIFEADRATALET CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECHHCCCEEECCCCCEEEC SGRITITGMKAEPLDDAVPRMDVITQALDLMRKYYGK CCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11206551; 11258796 [H]