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The map label for this gene is 54297102

Identifier: 54297102

GI number: 54297102

Start: 1272563

End: 1274872

Strand: Direct

Name: 54297102

Synonym: lpp1147

Alternate gene names: NA

Gene position: 1272563-1274872 (Clockwise)

Preceding gene: 54297092

Following gene: 54297103

Centisome position: 36.32

GC content: 36.23

Gene sequence:

>2310_bases
TTGGCTGATTCCAGATCATCGATTCAAAGTATTTTGGAAGTCGATAAACGATTTGATGAAAAATATTATAATTATTTGGT
TGATGATAATTATTTAATTCCAGCTGAGGCTGCAGTCATAGCCAATGGATTAGCAATATTCAAAGAAGAGTTTGAGCGTG
GAAACTTATTTAAACAGAGAAAAGACAATCATGACTCTTTCACTCATGAACAAATCCTTCAGTATTATTTGGAGTTGGCT
CTTACTTGTGGGCGTCTTGAGATCATTAAGTACCTTATCGATGAGCTTCATGTTTCTTTATCCGAGGAAAAACTGTTGCA
CTTTCTATTTTTGCACAGTCCGTATGAAGGAAATAAATATTTTGAAAACATCGTAGAAATTTATAATTATTTGGAAAAGA
AGAAGGAAATTGGAAGTAATAAGCAGTTGATAGAGGAGATCTTTTTAAAGGAAGCTAAAAAAGGTCACTTTAACGCGGTC
AAAGCGATTATAGAACTTAAGATTATACCAGATATGAATGTTACCGACCCCGATGGCCATACAGCATTTTTTTACTGTAT
TTTGGAAAGCAAGAAAAAGAGATTTTCCTTTAATCCTCAAGAATTGGGAGCAGTGGATGTTATTTTATCAGTTCGGGATA
AAGAAATTCTTGAATTGATAGAGCTGGTTGATGCAACCATTTTAGCAATGGAAGATAAAAATGAAGAAAAACTGGTTAAA
TTAAGGAAAGTGTTTACTGACTCTATAGATAAAATTCCTGAGGCGTTGATAGAAGACTGTTTGTCGCGAGCAATTGAGTT
GAATGATGTCAAGATGATTCAACTTCTGTTACCTGTTTGTAATCCTGATCTAAAATTCTTGATGCTCGGTAAGGTCAATT
CCGTTGAAGCCGGTATGCTACTAATAGAGCATTTTATAAGTACTGGATTTGTTATACCCGAAGCGAGGAGTTTGGAGGGT
TATGCGCACAGGTTGGGGTTAAACGAATACACTGCTGGTGCCGAACAGGCGAATAGATTTTTGTTACATGCAGTCGCTGG
ATTTGTCAATCGGACGGACAATAGTAAAGACTTCAAAACTATTTTAAGGGCGCTACAAAAGACAGTGCTATTAAACAGCA
TAGCGAATGTGGAGGTGGCGCGGAAAATTTTATATCAAACGTATTTGGAAGGCGAACCTCTGTTGCTTACGGTGGGATGG
ACGCAACATGGTGTTGGTTTATCCATATTATGGGATAAAGAGTCCAATAAAACTTATCTTGTATTTTCTAACCGAGGGCA
AGGAGGAATTGCTTCATGTCTTAATGCTAAGGGTTTAATTAGGAAGGAGGAGCCGAAAGCAGGTTCAGTTATCTATGAGA
TAGATGGTAAGTTGGACGAGGGCTTTTTCTCTCATTTTGAGATAGGGGAAAATAAATTGGGTCTTTTTAGATATGGGAAG
AAAGCATTTGAAAAAGACATCAGGACATGTCTTAAAGATGCCCGAGTATTACCCCACTTTATTTTTGCTGCAGCACAGAA
TTATGCCACCTGTGGCTACGTCAACACAAAACAATCCATACGCGGTTTATTATTTGTTTTTGCTATGACAAGAGGCGATT
CTTTAAGTGAAGAGTTAATCGATAGAATGAGTCGTCAATACAAAGAATTTACAGCTCATGATAGAAATGTTGCTTGTTCC
GAGTTAATTGAAGATTTTCAGAGGAAAATTAAGTTTGATTCCAAGCATATTCAGAAGGAGTATCAAGATTTCATAGTCAA
ATTGATTTTATCGCATTGTACATCGGATAAACCAGAAGATATTGAGCGAACCCAACGATTATTTGTAGTGTTACCAGAAG
AGATACAGGAAAAACTGGCTCATCTGATACCTTGCCATATAGTAGCACGGAAAGAAGATAAGTCATCAACCCTTCAAAAT
CTGAGTCTCTTCAAACATCAGGAAGAACCCTCCTCCCAAAATGACTATTTTTTGCATAGGCCGATCGGAGTAATCCCTGA
TTCTGTGGATAATTTACTAAATAAATATCATGAGATGAATACACTACTTAAATTTTTAGAATCCCATGGTTATACAGAAA
AAGATATTCCGAAAATTGTTTTGGAAAATAATTCAGTCCGAATTCACACTAAGTCGGATAGAGATTTTAAGTATAAAGTA
AAAGATCTTTTTCCCAAAGATATCCAGATTGTTAATGTTCAGGGAAGATATGAGTTTATTCTCAAGGATCTGACGGAAGT
GAGTTATGTATTAAATAAATTAAAGGGCCAGACTCCAGAGAACAATAGCGATCCGGATTTTGGTCTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCTTCAAATGGTTGCATAGTTGCATGAAAAAAACCAAAAATCTCTGACTGGTTATTTTTTGATTATACTTAAAGATAAC
CATCAAGAGGAGATAAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATTTTTTCATGAGTCAGTTTTTAAATTTCATGAAAGGATTTTAACTATGTTATTCTGTATGTGGTGCTTTGAAAGCTGT
CAGATCTGAGTGGAACCCAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 769; Mature: 768

Protein sequence:

>769_residues
MADSRSSIQSILEVDKRFDEKYYNYLVDDNYLIPAEAAVIANGLAIFKEEFERGNLFKQRKDNHDSFTHEQILQYYLELA
LTCGRLEIIKYLIDELHVSLSEEKLLHFLFLHSPYEGNKYFENIVEIYNYLEKKKEIGSNKQLIEEIFLKEAKKGHFNAV
KAIIELKIIPDMNVTDPDGHTAFFYCILESKKKRFSFNPQELGAVDVILSVRDKEILELIELVDATILAMEDKNEEKLVK
LRKVFTDSIDKIPEALIEDCLSRAIELNDVKMIQLLLPVCNPDLKFLMLGKVNSVEAGMLLIEHFISTGFVIPEARSLEG
YAHRLGLNEYTAGAEQANRFLLHAVAGFVNRTDNSKDFKTILRALQKTVLLNSIANVEVARKILYQTYLEGEPLLLTVGW
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LSLFKHQEEPSSQNDYFLHRPIGVIPDSVDNLLNKYHEMNTLLKFLESHGYTEKDIPKIVLENNSVRIHTKSDRDFKYKV
KDLFPKDIQIVNVQGRYEFILKDLTEVSYVLNKLKGQTPENNSDPDFGL

Sequences:

>Translated_769_residues
MADSRSSIQSILEVDKRFDEKYYNYLVDDNYLIPAEAAVIANGLAIFKEEFERGNLFKQRKDNHDSFTHEQILQYYLELA
LTCGRLEIIKYLIDELHVSLSEEKLLHFLFLHSPYEGNKYFENIVEIYNYLEKKKEIGSNKQLIEEIFLKEAKKGHFNAV
KAIIELKIIPDMNVTDPDGHTAFFYCILESKKKRFSFNPQELGAVDVILSVRDKEILELIELVDATILAMEDKNEEKLVK
LRKVFTDSIDKIPEALIEDCLSRAIELNDVKMIQLLLPVCNPDLKFLMLGKVNSVEAGMLLIEHFISTGFVIPEARSLEG
YAHRLGLNEYTAGAEQANRFLLHAVAGFVNRTDNSKDFKTILRALQKTVLLNSIANVEVARKILYQTYLEGEPLLLTVGW
TQHGVGLSILWDKESNKTYLVFSNRGQGGIASCLNAKGLIRKEEPKAGSVIYEIDGKLDEGFFSHFEIGENKLGLFRYGK
KAFEKDIRTCLKDARVLPHFIFAAAQNYATCGYVNTKQSIRGLLFVFAMTRGDSLSEELIDRMSRQYKEFTAHDRNVACS
ELIEDFQRKIKFDSKHIQKEYQDFIVKLILSHCTSDKPEDIERTQRLFVVLPEEIQEKLAHLIPCHIVARKEDKSSTLQN
LSLFKHQEEPSSQNDYFLHRPIGVIPDSVDNLLNKYHEMNTLLKFLESHGYTEKDIPKIVLENNSVRIHTKSDRDFKYKV
KDLFPKDIQIVNVQGRYEFILKDLTEVSYVLNKLKGQTPENNSDPDFGL
>Mature_768_residues
ADSRSSIQSILEVDKRFDEKYYNYLVDDNYLIPAEAAVIANGLAIFKEEFERGNLFKQRKDNHDSFTHEQILQYYLELAL
TCGRLEIIKYLIDELHVSLSEEKLLHFLFLHSPYEGNKYFENIVEIYNYLEKKKEIGSNKQLIEEIFLKEAKKGHFNAVK
AIIELKIIPDMNVTDPDGHTAFFYCILESKKKRFSFNPQELGAVDVILSVRDKEILELIELVDATILAMEDKNEEKLVKL
RKVFTDSIDKIPEALIEDCLSRAIELNDVKMIQLLLPVCNPDLKFLMLGKVNSVEAGMLLIEHFISTGFVIPEARSLEGY
AHRLGLNEYTAGAEQANRFLLHAVAGFVNRTDNSKDFKTILRALQKTVLLNSIANVEVARKILYQTYLEGEPLLLTVGWT
QHGVGLSILWDKESNKTYLVFSNRGQGGIASCLNAKGLIRKEEPKAGSVIYEIDGKLDEGFFSHFEIGENKLGLFRYGKK
AFEKDIRTCLKDARVLPHFIFAAAQNYATCGYVNTKQSIRGLLFVFAMTRGDSLSEELIDRMSRQYKEFTAHDRNVACSE
LIEDFQRKIKFDSKHIQKEYQDFIVKLILSHCTSDKPEDIERTQRLFVVLPEEIQEKLAHLIPCHIVARKEDKSSTLQNL
SLFKHQEEPSSQNDYFLHRPIGVIPDSVDNLLNKYHEMNTLLKFLESHGYTEKDIPKIVLENNSVRIHTKSDRDFKYKVK
DLFPKDIQIVNVQGRYEFILKDLTEVSYVLNKLKGQTPENNSDPDFGL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 88531; Mature: 88400

Theoretical pI: Translated: 6.20; Mature: 6.20

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MADSRSSIQSILEVDKRFDEKYYNYLVDDNYLIPAEAAVIANGLAIFKEEFERGNLFKQR
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
KDNHDSFTHEQILQYYLELALTCGRLEIIKYLIDELHVSLSEEKLLHFLFLHSPYEGNKY
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
FENIVEIYNYLEKKKEIGSNKQLIEEIFLKEAKKGHFNAVKAIIELKIIPDMNVTDPDGH
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCC
TAFFYCILESKKKRFSFNPQELGAVDVILSVRDKEILELIELVDATILAMEDKNEEKLVK
EEEEEEEEHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHH
LRKVFTDSIDKIPEALIEDCLSRAIELNDVKMIQLLLPVCNPDLKFLMLGKVNSVEAGML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHH
LIEHFISTGFVIPEARSLEGYAHRLGLNEYTAGAEQANRFLLHAVAGFVNRTDNSKDFKT
HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
ILRALQKTVLLNSIANVEVARKILYQTYLEGEPLLLTVGWTQHGVGLSILWDKESNKTYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCEEE
VFSNRGQGGIASCLNAKGLIRKEEPKAGSVIYEIDGKLDEGFFSHFEIGENKLGLFRYGK
EEECCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
KAFEKDIRTCLKDARVLPHFIFAAAQNYATCGYVNTKQSIRGLLFVFAMTRGDSLSEELI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
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PIGVIPDSVDNLLNKYHEMNTLLKFLESHGYTEKDIPKIVLENNSVRIHTKSDRDFKYKV
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCCEEHH
KDLFPKDIQIVNVQGRYEFILKDLTEVSYVLNKLKGQTPENNSDPDFGL
HHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
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HHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA