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The map label for this gene is 54295789

Identifier: 54295789

GI number: 54295789

Start: 3285124

End: 3286263

Strand: Reverse

Name: 54295789

Synonym: lpl2879

Alternate gene names: NA

Gene position: 3286263-3285124 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54295791

Following gene: 54295788

Centisome position: 98.22

GC content: 31.67

Gene sequence:

>1140_bases
ATGAAAATTAATGCTACGCAATATGTTCAACAATGCGTAAAACCTCTACAGAGAATAGAAGCTCAATCGGAAGATAGATT
CCTCGGAATTGATCTGCTGCGATGTCTTTTAGCGCTGGGTGTGTTACTCTGGCATTATCAATTTTTTGCTCATAATAGTG
GTATACAATTTATTAAACATCAACAACCACTGTATTCAATTTTAGATATGTTCTACAGCCATGGGTGGCAATACCGGGTC
CAAACCTTTTGGTGCATTAGTGGTTTTATATTATTTTGGAAATATGGCGAGGGTATAGCAAATAAGTTAATAAGTGGTAA
AAAGTTCTTTATAGGGCGATTCTCAAGAATTTACCCGCTTCATTTAGTTACTCTTTTTTTAGTGGCATTTTTTAATTGGA
TTTATTTTTACAATAATCATTATTATTTTACCTATCAAAATAATGATCTTGGAAATTTCCTTCTCCATTTCTTTTTAGCA
AGTAGTTGGGTGGGAAAGGGCGCTCATAGTTTTAATGGACCTGTTTGGTCACTATCTGCAGAAATACCAGTCTATTTTAT
ATTTTTTATTTTTGTGCGCTTTTTAGGCTTGAAAGCTAGTGTAAATTATTTTTTTATTGGCTTTTATCTCCTTGCTAAAC
TGGCGAATTTTTCGTTTCCAATAATTGATTGTGTTGGATATTTTTACAGCGGGGGGTTGTTTGCAATTTATTTGCAACAA
TTTGAAAAACAGAACCGCAATAAATTTCTGAGTATTTATTTTGTTTATATACTTGCTATTGTGCTAATGGGAATGCATTT
ACTCAAATTAAATCAATTGACACCTGTTAAATATTTGTTACTTATCAATATGATGCTGGTTTGTTTCTACTATTTATCAA
GAATAATAAAAGCATGGCCTAGAGTTCAAAATCTGATTAAAACAATGAGTCACTTAACCTTTTCAAGTTATCTGATTCAT
TTTCCTATCCAAATTATACTTACCTTATTTTTGGGTTGGTTAAATCTAGCCATACCTTTTTATAGTATCAGCTTTTTAAC
ACTATTCATTGCCATTACCTGGGGAGTTTCTTATTTAAGCTATCATTATTTCGAAAAACCACTGCGAGTCCTTATTAGAA
ATAAATTCAAGTATTCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGAAGCAATTGCTGGATTTTTAAAAAATAATGAAATCACTTTGTTTTAAGTGTATTTTATTGCAGCTTAAAGTATTAAA
AAACGCAGTGTTTAGTCTGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATTTATATTTCTTGTATTTTCTTTTTAATGCATGGATCTTTCGTTTTTATGGTTATTTCTCTATTTTTACATTATATT
TATTGTGGGTGTTGGCTATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Acyltransferase; O-Acyltransferase Transmembrane

Number of amino acids: Translated: 379; Mature: 379

Protein sequence:

>379_residues
MKINATQYVQQCVKPLQRIEAQSEDRFLGIDLLRCLLALGVLLWHYQFFAHNSGIQFIKHQQPLYSILDMFYSHGWQYRV
QTFWCISGFILFWKYGEGIANKLISGKKFFIGRFSRIYPLHLVTLFLVAFFNWIYFYNNHYYFTYQNNDLGNFLLHFFLA
SSWVGKGAHSFNGPVWSLSAEIPVYFIFFIFVRFLGLKASVNYFFIGFYLLAKLANFSFPIIDCVGYFYSGGLFAIYLQQ
FEKQNRNKFLSIYFVYILAIVLMGMHLLKLNQLTPVKYLLLINMMLVCFYYLSRIIKAWPRVQNLIKTMSHLTFSSYLIH
FPIQIILTLFLGWLNLAIPFYSISFLTLFIAITWGVSYLSYHYFEKPLRVLIRNKFKYS

Sequences:

>Translated_379_residues
MKINATQYVQQCVKPLQRIEAQSEDRFLGIDLLRCLLALGVLLWHYQFFAHNSGIQFIKHQQPLYSILDMFYSHGWQYRV
QTFWCISGFILFWKYGEGIANKLISGKKFFIGRFSRIYPLHLVTLFLVAFFNWIYFYNNHYYFTYQNNDLGNFLLHFFLA
SSWVGKGAHSFNGPVWSLSAEIPVYFIFFIFVRFLGLKASVNYFFIGFYLLAKLANFSFPIIDCVGYFYSGGLFAIYLQQ
FEKQNRNKFLSIYFVYILAIVLMGMHLLKLNQLTPVKYLLLINMMLVCFYYLSRIIKAWPRVQNLIKTMSHLTFSSYLIH
FPIQIILTLFLGWLNLAIPFYSISFLTLFIAITWGVSYLSYHYFEKPLRVLIRNKFKYS
>Mature_379_residues
MKINATQYVQQCVKPLQRIEAQSEDRFLGIDLLRCLLALGVLLWHYQFFAHNSGIQFIKHQQPLYSILDMFYSHGWQYRV
QTFWCISGFILFWKYGEGIANKLISGKKFFIGRFSRIYPLHLVTLFLVAFFNWIYFYNNHYYFTYQNNDLGNFLLHFFLA
SSWVGKGAHSFNGPVWSLSAEIPVYFIFFIFVRFLGLKASVNYFFIGFYLLAKLANFSFPIIDCVGYFYSGGLFAIYLQQ
FEKQNRNKFLSIYFVYILAIVLMGMHLLKLNQLTPVKYLLLINMMLVCFYYLSRIIKAWPRVQNLIKTMSHLTFSSYLIH
FPIQIILTLFLGWLNLAIPFYSISFLTLFIAITWGVSYLSYHYFEKPLRVLIRNKFKYS

Specific function: Unknown

COG id: COG1835

COG function: function code I; Predicted acyltransferases

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45033; Mature: 45033

Theoretical pI: Translated: 9.94; Mature: 9.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKINATQYVQQCVKPLQRIEAQSEDRFLGIDLLRCLLALGVLLWHYQFFAHNSGIQFIKH
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHC
QQPLYSILDMFYSHGWQYRVQTFWCISGFILFWKYGEGIANKLISGKKFFIGRFSRIYPL
CCHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
HLVTLFLVAFFNWIYFYNNHYYFTYQNNDLGNFLLHFFLASSWVGKGAHSFNGPVWSLSA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEC
EIPVYFIFFIFVRFLGLKASVNYFFIGFYLLAKLANFSFPIIDCVGYFYSGGLFAIYLQQ
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
FEKQNRNKFLSIYFVYILAIVLMGMHLLKLNQLTPVKYLLLINMMLVCFYYLSRIIKAWP
HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RVQNLIKTMSHLTFSSYLIHFPIQIILTLFLGWLNLAIPFYSISFLTLFIAITWGVSYLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YHYFEKPLRVLIRNKFKYS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKINATQYVQQCVKPLQRIEAQSEDRFLGIDLLRCLLALGVLLWHYQFFAHNSGIQFIKH
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHC
QQPLYSILDMFYSHGWQYRVQTFWCISGFILFWKYGEGIANKLISGKKFFIGRFSRIYPL
CCHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
HLVTLFLVAFFNWIYFYNNHYYFTYQNNDLGNFLLHFFLASSWVGKGAHSFNGPVWSLSA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEC
EIPVYFIFFIFVRFLGLKASVNYFFIGFYLLAKLANFSFPIIDCVGYFYSGGLFAIYLQQ
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
FEKQNRNKFLSIYFVYILAIVLMGMHLLKLNQLTPVKYLLLINMMLVCFYYLSRIIKAWP
HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RVQNLIKTMSHLTFSSYLIHFPIQIILTLFLGWLNLAIPFYSISFLTLFIAITWGVSYLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YHYFEKPLRVLIRNKFKYS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA