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The map label for this gene is norB [H]

Identifier: 54295082

GI number: 54295082

Start: 2470377

End: 2472719

Strand: Direct

Name: norB [H]

Synonym: lpl2162

Alternate gene names: 54295082

Gene position: 2470377-2472719 (Clockwise)

Preceding gene: 54295081

Following gene: 54295085

Centisome position: 73.84

GC content: 41.83

Gene sequence:

>2343_bases
ATGCATACTATTGCAAATGAAACACCTGTTCAAAAGGATCACTCATTTGACCCAATAACTAATGTTTTAAAATGGGTTTT
ACTAGTGACTGCCATTCTTTGTTTTCTAATCCTCATCTGGGGCACTGTTAAAACCTATCAATTGGTACCTCCTTTACCAG
ACCGTTTTGTGACCTCTACAGGCGAAACGGTGATGACATCACAAGACATCGTGGAAGGAAAAGCAGGTTTTCAACGCGCT
GACTTAATGGACTATGGCAGTTTATACGGTATGGGATCCTATTTTGGTGAGGACTACACGGCAAAGTATCTGGTGCGTTT
GGGAGAATTGGTTCAGGAAGAATTGGCAAAAATTCGTTTTAATAAAGCCTATTCCGAATTAACAGAAAGTGAACAATTCG
TTATTAATAAAGAAATGCAGAACTCACTGCAACGCCTTGATCTCAATAAAAAAACGAGCATCCTGACACCGGCAATTGCC
ACCTCAATACGGCAATTACAGGCTGAAATCAGTCAATCGTTACTGAATCATAATTTTATGGCAGGTTATACCCAGGCCTA
TAGCTTAAATCCTGATACTGCGCTTCAAACCGCAAACTTTCTTATTTATTCCTCTTTAACAACAATAGCTCGCCGCCCAA
ACCAAAACATATCTTACACCAATAATTGGCCATACGAACCAAGTGTTGGTAATACCCCCTCATCAGGGACGTTTTATTGG
ACCTGGATTTCATTTTGCTTTGTGTTTATGGGATTTGGTGCGGTTATCTACATTTATCATCGCTATTTAAGTGATGTTGA
TCATGGACCCATGGAACCTATTTTTTCAGGTTTCAAACCCCTGACTCAAAGCCAACGTAAAGTAGGTCAATATTTCCTTG
TAGCCGCATTGTTTCTTTTACTTCAAATCGCGGTAGGAGCCATCATGGCTCATTATTATGCTGAGCGCGAAAGCTTCTAT
GGTATTAATGTCAATACGTGGCTGCCTTTTAATTTCCTTCGAGACGTCCATATCCAAACTCCCATTATCTGGATCGGGCT
TTCATGGATAAGTGCAGGCATATTTATGGCACCCATCATTAGCGGTAAGGAAGCCAAAGGACAAGGCTTTTTAGTTGACT
TTCTGTTTTATGTCACCTTGCTCGTAGTGGGTGGAGCCATCCTTGGCAATTACCTGGGGATTATGGGGTATATTGATAAG
GCCTGGTTTTGGCTAGGCAATCAAGGCTTGTCTTACATACAATTAGGAAGACTGTGGCAAATCGGGTTTTGCATTGGATT
GTTTCTTTGGAGTTTTATTGTTTTCCGCGGTATGTGGCCTACGTGGGATGGATTAAAAAAAGCCACCATTGAGTTCTGGA
CAGGTCGCATCAAGCTTGAAAACCTGTTCTGGGCCAGCACTATCAATGTTGCTGTTTTATATTGCTTTGGGATGATCCCC
TTAACAGGGATTGAAAAATCGTTCACCATAACGGATTTCTGGCGCTGGTGGGTTGTGCATCTGTGGGTTGAACAATCCTT
TGAGTTTTTCGCCGCCTGTGCTACTGCTTATTTGCTCATGGGAACTGGTTTGGTTTCGAGAAAAGCGGCAGAGAGAACGG
TATATTTTGAATCCATTTTAATTTTCCTGGGTGGAGTAATTGGTACTGGCCATCATTGGTACTGGACTGGGACTCCTGAA
ATGTGGATTCCGTTAGGCTCCATGTTTTCCTTTATCGAAGTCTTGCCTCTGGTTCTTCTTATTATTGATGCGATTGAGCA
CCGACAATTGATTAAAAAGCAGGGAACGTTTACCTACAATCTCGCTTATCTCTACATATTGGGAGCCGCATTCTGGAATT
TTGTTGGTGCCGGTGTATTTGGAGGAGGTACACTGAATGCACCACTGATTAATTACTATGAGCATGGAACATTCTTGACT
TTAAATCATGCTCATACTGCTTTATTTGGCGCATTTGGGCTTCTTGCTCTCGGGTTAATCTATTTTTGCCTGAGATATGC
TGCTGGTGAAAGTAAGGCATGGAGTGATAGATTGGGTGTATATGCCTTTTGGTTATATAATGTAGGGCTCTTTTTATGGA
TTGTCCTGAATTTTTTCCCAATTGGCTGGTCGCAGTTAATGGCAGTATATGAACATGGACTATCCTATGCCCGAAGCCTT
GAATTCTATAACACCACCTTATTATGGCAATGGCTTCGTTTTCCAGGGGATGTCGTATTTGCCTTGGGGGCTCTTCTTAT
GGCTTATGATTTTATTGTCAAGATTGGACCTTTTTTCCCGAAATTTGCCCGTAATCGTCGCTTTATAGCTGGCCCTCCAA
AAGCAACAGATCCAAGCTTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTTTCTAAGAATCAGTTTTGTAGTTAACATGAATTGTTTCTTGTAAAGATTCTCTTTATAATCAATGCCGAATTGAACC
ATTCCGCTAAGGATAGCCTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCAATGATAGCAAAGACAAAGCCAGTGTATTTTTTTGAAAAATTATTTTGAGAACCCGTGTTTAGAAGTGAATGCCGACA
TCCAGATGATGGGTGTCGGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NOR large subunit; Nitric oxide reductase cytochrome b subunit [H]

Number of amino acids: Translated: 780; Mature: 780

Protein sequence:

>780_residues
MHTIANETPVQKDHSFDPITNVLKWVLLVTAILCFLILIWGTVKTYQLVPPLPDRFVTSTGETVMTSQDIVEGKAGFQRA
DLMDYGSLYGMGSYFGEDYTAKYLVRLGELVQEELAKIRFNKAYSELTESEQFVINKEMQNSLQRLDLNKKTSILTPAIA
TSIRQLQAEISQSLLNHNFMAGYTQAYSLNPDTALQTANFLIYSSLTTIARRPNQNISYTNNWPYEPSVGNTPSSGTFYW
TWISFCFVFMGFGAVIYIYHRYLSDVDHGPMEPIFSGFKPLTQSQRKVGQYFLVAALFLLLQIAVGAIMAHYYAERESFY
GINVNTWLPFNFLRDVHIQTPIIWIGLSWISAGIFMAPIISGKEAKGQGFLVDFLFYVTLLVVGGAILGNYLGIMGYIDK
AWFWLGNQGLSYIQLGRLWQIGFCIGLFLWSFIVFRGMWPTWDGLKKATIEFWTGRIKLENLFWASTINVAVLYCFGMIP
LTGIEKSFTITDFWRWWVVHLWVEQSFEFFAACATAYLLMGTGLVSRKAAERTVYFESILIFLGGVIGTGHHWYWTGTPE
MWIPLGSMFSFIEVLPLVLLIIDAIEHRQLIKKQGTFTYNLAYLYILGAAFWNFVGAGVFGGGTLNAPLINYYEHGTFLT
LNHAHTALFGAFGLLALGLIYFCLRYAAGESKAWSDRLGVYAFWLYNVGLFLWIVLNFFPIGWSQLMAVYEHGLSYARSL
EFYNTTLLWQWLRFPGDVVFALGALLMAYDFIVKIGPFFPKFARNRRFIAGPPKATDPSL

Sequences:

>Translated_780_residues
MHTIANETPVQKDHSFDPITNVLKWVLLVTAILCFLILIWGTVKTYQLVPPLPDRFVTSTGETVMTSQDIVEGKAGFQRA
DLMDYGSLYGMGSYFGEDYTAKYLVRLGELVQEELAKIRFNKAYSELTESEQFVINKEMQNSLQRLDLNKKTSILTPAIA
TSIRQLQAEISQSLLNHNFMAGYTQAYSLNPDTALQTANFLIYSSLTTIARRPNQNISYTNNWPYEPSVGNTPSSGTFYW
TWISFCFVFMGFGAVIYIYHRYLSDVDHGPMEPIFSGFKPLTQSQRKVGQYFLVAALFLLLQIAVGAIMAHYYAERESFY
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AWFWLGNQGLSYIQLGRLWQIGFCIGLFLWSFIVFRGMWPTWDGLKKATIEFWTGRIKLENLFWASTINVAVLYCFGMIP
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EFYNTTLLWQWLRFPGDVVFALGALLMAYDFIVKIGPFFPKFARNRRFIAGPPKATDPSL
>Mature_780_residues
MHTIANETPVQKDHSFDPITNVLKWVLLVTAILCFLILIWGTVKTYQLVPPLPDRFVTSTGETVMTSQDIVEGKAGFQRA
DLMDYGSLYGMGSYFGEDYTAKYLVRLGELVQEELAKIRFNKAYSELTESEQFVINKEMQNSLQRLDLNKKTSILTPAIA
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TWISFCFVFMGFGAVIYIYHRYLSDVDHGPMEPIFSGFKPLTQSQRKVGQYFLVAALFLLLQIAVGAIMAHYYAERESFY
GINVNTWLPFNFLRDVHIQTPIIWIGLSWISAGIFMAPIISGKEAKGQGFLVDFLFYVTLLVVGGAILGNYLGIMGYIDK
AWFWLGNQGLSYIQLGRLWQIGFCIGLFLWSFIVFRGMWPTWDGLKKATIEFWTGRIKLENLFWASTINVAVLYCFGMIP
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MWIPLGSMFSFIEVLPLVLLIIDAIEHRQLIKKQGTFTYNLAYLYILGAAFWNFVGAGVFGGGTLNAPLINYYEHGTFLT
LNHAHTALFGAFGLLALGLIYFCLRYAAGESKAWSDRLGVYAFWLYNVGLFLWIVLNFFPIGWSQLMAVYEHGLSYARSL
EFYNTTLLWQWLRFPGDVVFALGALLMAYDFIVKIGPFFPKFARNRRFIAGPPKATDPSL

Specific function: Component of the anaerobic respiratory chain that transforms nitrate to dinitrogen (denitrification). NorB is the catalytic subunit of the enzyme complex. Shows proton pump activity across the membrane in denitrifying bacterial cells. The mononitrogen red

COG id: COG3256

COG function: function code P; Nitric oxide reductase large subunit

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the heme-copper respiratory oxidase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000883 [H]

Pfam domain/function: PF00115 COX1 [H]

EC number: =1.7.99.7 [H]

Molecular weight: Translated: 88741; Mature: 88741

Theoretical pI: Translated: 7.65; Mature: 7.65

Prosite motif: PS50855 COX1 ; PS00077 COX1_CUB

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHTIANETPVQKDHSFDPITNVLKWVLLVTAILCFLILIWGTVKTYQLVPPLPDRFVTST
CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCHHHHCCC
GETVMTSQDIVEGKAGFQRADLMDYGSLYGMGSYFGEDYTAKYLVRLGELVQEELAKIRF
CCEEECHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NKAYSELTESEQFVINKEMQNSLQRLDLNKKTSILTPAIATSIRQLQAEISQSLLNHNFM
HHHHHHHHCCHHHEECHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
AGYTQAYSLNPDTALQTANFLIYSSLTTIARRPNQNISYTNNWPYEPSVGNTPSSGTFYW
CCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEH
TWISFCFVFMGFGAVIYIYHRYLSDVDHGPMEPIFSGFKPLTQSQRKVGQYFLVAALFLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQIAVGAIMAHYYAERESFYGINVNTWLPFNFLRDVHIQTPIIWIGLSWISAGIFMAPII
HHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHC
SGKEAKGQGFLVDFLFYVTLLVVGGAILGNYLGIMGYIDKAWFWLGNQGLSYIQLGRLWQ
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
IGFCIGLFLWSFIVFRGMWPTWDGLKKATIEFWTGRIKLENLFWASTINVAVLYCFGMIP
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCEEHHHHHHHHHHHHHHCCC
LTGIEKSFTITDFWRWWVVHLWVEQSFEFFAACATAYLLMGTGLVSRKAAERTVYFESIL
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFLGGVIGTGHHWYWTGTPEMWIPLGSMFSFIEVLPLVLLIIDAIEHRQLIKKQGTFTYN
HHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEH
LAYLYILGAAFWNFVGAGVFGGGTLNAPLINYYEHGTFLTLNHAHTALFGAFGLLALGLI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFCLRYAAGESKAWSDRLGVYAFWLYNVGLFLWIVLNFFPIGWSQLMAVYEHGLSYARSL
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EFYNTTLLWQWLRFPGDVVFALGALLMAYDFIVKIGPFFPKFARNRRFIAGPPKATDPSL
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCEECCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MHTIANETPVQKDHSFDPITNVLKWVLLVTAILCFLILIWGTVKTYQLVPPLPDRFVTST
CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCHHHHCCC
GETVMTSQDIVEGKAGFQRADLMDYGSLYGMGSYFGEDYTAKYLVRLGELVQEELAKIRF
CCEEECHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NKAYSELTESEQFVINKEMQNSLQRLDLNKKTSILTPAIATSIRQLQAEISQSLLNHNFM
HHHHHHHHCCHHHEECHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
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CCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEH
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LQIAVGAIMAHYYAERESFYGINVNTWLPFNFLRDVHIQTPIIWIGLSWISAGIFMAPII
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SGKEAKGQGFLVDFLFYVTLLVVGGAILGNYLGIMGYIDKAWFWLGNQGLSYIQLGRLWQ
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HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCEECCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7508388; 2542222; 9521721 [H]