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The map label for this gene is kefA [C]

Identifier: 54294396

GI number: 54294396

Start: 1632823

End: 1635084

Strand: Reverse

Name: kefA [C]

Synonym: lpl1465

Alternate gene names: 54294396

Gene position: 1635084-1632823 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54294397

Following gene: 54294395

Centisome position: 48.87

GC content: 32.89

Gene sequence:

>2262_bases
TTGAGAATTTTTGGCATGATTTTGCTTTTCTTTTTTAGTATTTCCCCTGGCTTGGGAGATACAACACTACCTGAGGTTTT
TGATGTCAAAAATGCAAACAAGCAATTTGATCGCATCAATCTTCAGCTGTCAGTACAAAATCTTAATTTAAATAATCTGA
ATAAGGCAGTAGAAACTTTAACTGAACTATCTGCGCAATCAGAAGAATGCATAGCGGATTTACAAAAGAAATTAAATGGG
GTGGATGTATTAATCAAACAAGCTACTGCTACAGGAAATGATAAAGGAGCAGATTTAGTTTATTTGAATAATCAAAAGCA
ACAGTTGGCTGAGTTACAATCACAATGCAGATTGTTTTCAATTCGAGCTCAGGAAGCGATAGACACTTATAAAGGTGCGA
TGTTACAGTTAAGACAAGAAAAAACACTGGCACGTACATCACCATTATGGGAATCGGTAAGTAAAATCCTTAACTCACCT
GACAATATCAAATGGATAAATGACTCCAAAGAAGGGTTTTTACTTCAGGATTTACCTGTTTATTTATGGTTTTGTATCGC
CATTATCAGTTTTTTTATCTCTATCCTTCTATTATCAAAACTAAGACAATCCAGTGTCATTCGCCGTTATGTGAAGTTTA
AAAAACTTCACCTGATTCATATCATGCTTTTCACTTTATACATTATGACAGTTTCACTATTGAGTTATGTGTCTTTATTT
ACCAGTGAAGAGCAGTTTACCAGCGCTCAATCTCTTTTAATAAAAGAATTTTTTTGGTTTCTTAGTGGAGTTTTATTAAT
TATTTGCTTATTTAAAGTAAAAAAAATCAAAGCTTTTTTTGATTGGTACGCGATGGATAGTGAATTTTTTGAAATTCTAA
GTATAGTTGTGCTTGCATTTTATTTCCTTGCAGTGTTAGAACAAAGATTATTTGATATCTTGAATGTCAATAAGCTTGTT
GTAGAATTAAGCCAGTCGACTTTTCTTCTTTTATTACTTGGTACTACGGCTTATTTTGCTCACTATTTTTGTCGTTCACA
TCTGCATATTTCCTTTGTAAAAAAGCATTATAATTTTATTCGGTACTTTATTTTTGCACTGCTTTTAGGTTGCGCTGTCC
TTAATATCATTGGTTTTTATACTTTAGCCATGCAGCTTGCTCTCTCGGGTATTTTTACTTTCTTTATCTTGTACATTACA
ATTTTAATCGAACAAGGTATTAGTAAATTCTATGCTTCTTTAAGTTACTCACAAGGAAAATTTAATGTCATTCGTTTGTT
TGGATACAAAAACGATCAGTTGCTTACTGAATTTTATATTCTTAAAATTACATTAAAACTTGTTATTATTCTCCTAAGTA
TCTATCTAATAGGGATATCATGGGGTTTTGCTACAGATTTTATTGATACAATTTATAAGAAATTATTGTATGGCTTTACC
TTAGCAAATATTACAATTTACCCAACACGTGTCCTTTTCGGAATCATCATTTTTTGCTTTTTATATTTGGTGTCCCGAGC
TATTTCAACTTCAATCAGTCGTCACCAGCAGTTTGAAAACGAAGAAGAAACTCAGGTAGCTATTGCTTCCATTTTGACTT
ATGTTGGATTCAGTATTGCTGTTATTTCAGGCTTACTCGTCGCGGGCTTTAATTTTACTGGGCTTGCGATTATCGCTGGA
GCACTTTCAGTAGGAATTGGTCTTGGACTGCAAAGCATAGTTAACAATTTTGTATCGGGTATAATTTTGCTTATTGAGAA
ACCAATAAGACCTGGAGATCGAATTAACATTGATGGTGTCGAAGGATTTGTAAAAAAAATCAGAGTCAGATCAACTCAAA
TTATTAGCCCTATAAATGAGGATATTATTATTCCAAATTCTGATTTAATTACTCGTCGCGTTGTCAACTATATGCTTACT
GATAATTATTGGAGAGTAAGTTGTGAGGTTGGTGTTGCTTATGGGACTAACCTCAATCTTGTTAAAGAAATTCTTTTAGA
GGTTGCTAATAAACACGATGATGTTATCAAGAGTGGTAGAAATAAGCCTGGAGTACTTTTTACCAGTTTTGCTGATAGCG
CATTAATTTTTCAACTCTGGTGCATGATAAAAGATGTTAATAAAAAGTGGAGTATAAAAAGCGAATTAAACTTTGCTATT
AACGAAGCTTTTCGCAAGCATGGTATTTCAATTGCATATCCACAACGCGATATTCATATTAAGCTGGAAGATTTAGCCCA
TCTGACTAGCCCGGAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAAATTTAATCCTAGTGATATTTTAAATTTCCTTCTTGAGATTCAATCCATAAGCAAGTAGAGTTAATAGTTTGTTAAT
TGGCAAGGAAGAGAATGGCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCCAAGAATTATTTTTCCCATCGACAATTAAGGCATGGATTTAATGTCAATTAATGATAGGATCTATATAAAATGCCTA
ACTATTTACCGAGTTAAAGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 753; Mature: 753

Protein sequence:

>753_residues
MRIFGMILLFFFSISPGLGDTTLPEVFDVKNANKQFDRINLQLSVQNLNLNNLNKAVETLTELSAQSEECIADLQKKLNG
VDVLIKQATATGNDKGADLVYLNNQKQQLAELQSQCRLFSIRAQEAIDTYKGAMLQLRQEKTLARTSPLWESVSKILNSP
DNIKWINDSKEGFLLQDLPVYLWFCIAIISFFISILLLSKLRQSSVIRRYVKFKKLHLIHIMLFTLYIMTVSLLSYVSLF
TSEEQFTSAQSLLIKEFFWFLSGVLLIICLFKVKKIKAFFDWYAMDSEFFEILSIVVLAFYFLAVLEQRLFDILNVNKLV
VELSQSTFLLLLLGTTAYFAHYFCRSHLHISFVKKHYNFIRYFIFALLLGCAVLNIIGFYTLAMQLALSGIFTFFILYIT
ILIEQGISKFYASLSYSQGKFNVIRLFGYKNDQLLTEFYILKITLKLVIILLSIYLIGISWGFATDFIDTIYKKLLYGFT
LANITIYPTRVLFGIIIFCFLYLVSRAISTSISRHQQFENEEETQVAIASILTYVGFSIAVISGLLVAGFNFTGLAIIAG
ALSVGIGLGLQSIVNNFVSGIILLIEKPIRPGDRINIDGVEGFVKKIRVRSTQIISPINEDIIIPNSDLITRRVVNYMLT
DNYWRVSCEVGVAYGTNLNLVKEILLEVANKHDDVIKSGRNKPGVLFTSFADSALIFQLWCMIKDVNKKWSIKSELNFAI
NEAFRKHGISIAYPQRDIHIKLEDLAHLTSPEK

Sequences:

>Translated_753_residues
MRIFGMILLFFFSISPGLGDTTLPEVFDVKNANKQFDRINLQLSVQNLNLNNLNKAVETLTELSAQSEECIADLQKKLNG
VDVLIKQATATGNDKGADLVYLNNQKQQLAELQSQCRLFSIRAQEAIDTYKGAMLQLRQEKTLARTSPLWESVSKILNSP
DNIKWINDSKEGFLLQDLPVYLWFCIAIISFFISILLLSKLRQSSVIRRYVKFKKLHLIHIMLFTLYIMTVSLLSYVSLF
TSEEQFTSAQSLLIKEFFWFLSGVLLIICLFKVKKIKAFFDWYAMDSEFFEILSIVVLAFYFLAVLEQRLFDILNVNKLV
VELSQSTFLLLLLGTTAYFAHYFCRSHLHISFVKKHYNFIRYFIFALLLGCAVLNIIGFYTLAMQLALSGIFTFFILYIT
ILIEQGISKFYASLSYSQGKFNVIRLFGYKNDQLLTEFYILKITLKLVIILLSIYLIGISWGFATDFIDTIYKKLLYGFT
LANITIYPTRVLFGIIIFCFLYLVSRAISTSISRHQQFENEEETQVAIASILTYVGFSIAVISGLLVAGFNFTGLAIIAG
ALSVGIGLGLQSIVNNFVSGIILLIEKPIRPGDRINIDGVEGFVKKIRVRSTQIISPINEDIIIPNSDLITRRVVNYMLT
DNYWRVSCEVGVAYGTNLNLVKEILLEVANKHDDVIKSGRNKPGVLFTSFADSALIFQLWCMIKDVNKKWSIKSELNFAI
NEAFRKHGISIAYPQRDIHIKLEDLAHLTSPEK
>Mature_753_residues
MRIFGMILLFFFSISPGLGDTTLPEVFDVKNANKQFDRINLQLSVQNLNLNNLNKAVETLTELSAQSEECIADLQKKLNG
VDVLIKQATATGNDKGADLVYLNNQKQQLAELQSQCRLFSIRAQEAIDTYKGAMLQLRQEKTLARTSPLWESVSKILNSP
DNIKWINDSKEGFLLQDLPVYLWFCIAIISFFISILLLSKLRQSSVIRRYVKFKKLHLIHIMLFTLYIMTVSLLSYVSLF
TSEEQFTSAQSLLIKEFFWFLSGVLLIICLFKVKKIKAFFDWYAMDSEFFEILSIVVLAFYFLAVLEQRLFDILNVNKLV
VELSQSTFLLLLLGTTAYFAHYFCRSHLHISFVKKHYNFIRYFIFALLLGCAVLNIIGFYTLAMQLALSGIFTFFILYIT
ILIEQGISKFYASLSYSQGKFNVIRLFGYKNDQLLTEFYILKITLKLVIILLSIYLIGISWGFATDFIDTIYKKLLYGFT
LANITIYPTRVLFGIIIFCFLYLVSRAISTSISRHQQFENEEETQVAIASILTYVGFSIAVISGLLVAGFNFTGLAIIAG
ALSVGIGLGLQSIVNNFVSGIILLIEKPIRPGDRINIDGVEGFVKKIRVRSTQIISPINEDIIIPNSDLITRRVVNYMLT
DNYWRVSCEVGVAYGTNLNLVKEILLEVANKHDDVIKSGRNKPGVLFTSFADSALIFQLWCMIKDVNKKWSIKSELNFAI
NEAFRKHGISIAYPQRDIHIKLEDLAHLTSPEK

Specific function: Unknown

COG id: COG3264

COG function: function code M; Small-conductance mechanosensitive channel

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mscS (TC 1.A.23) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786670, Length=227, Percent_Identity=36.1233480176211, Blast_Score=155, Evalue=1e-38,
Organism=Escherichia coli, GI2367355, Length=257, Percent_Identity=31.1284046692607, Blast_Score=116, Evalue=6e-27,
Organism=Escherichia coli, GI1789291, Length=259, Percent_Identity=25.0965250965251, Blast_Score=86, Evalue=9e-18,
Organism=Escherichia coli, GI1787591, Length=211, Percent_Identity=26.5402843601896, Blast_Score=72, Evalue=9e-14,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010920
- InterPro:   IPR011066
- InterPro:   IPR006685
- InterPro:   IPR006686
- InterPro:   IPR011014 [H]

Pfam domain/function: PF00924 MS_channel [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 85785; Mature: 85785

Theoretical pI: Translated: 9.07; Mature: 9.07

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRIFGMILLFFFSISPGLGDTTLPEVFDVKNANKQFDRINLQLSVQNLNLNNLNKAVETL
CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHH
TELSAQSEECIADLQKKLNGVDVLIKQATATGNDKGADLVYLNNQKQQLAELQSQCRLFS
HHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
IRAQEAIDTYKGAMLQLRQEKTLARTSPLWESVSKILNSPDNIKWINDSKEGFLLQDLPV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHH
YLWFCIAIISFFISILLLSKLRQSSVIRRYVKFKKLHLIHIMLFTLYIMTVSLLSYVSLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TSEEQFTSAQSLLIKEFFWFLSGVLLIICLFKVKKIKAFFDWYAMDSEFFEILSIVVLAF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
YFLAVLEQRLFDILNVNKLVVELSQSTFLLLLLGTTAYFAHYFCRSHLHISFVKKHYNFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
RYFIFALLLGCAVLNIIGFYTLAMQLALSGIFTFFILYITILIEQGISKFYASLSYSQGK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
FNVIRLFGYKNDQLLTEFYILKITLKLVIILLSIYLIGISWGFATDFIDTIYKKLLYGFT
EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LANITIYPTRVLFGIIIFCFLYLVSRAISTSISRHQQFENEEETQVAIASILTYVGFSIA
HHCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VISGLLVAGFNFTGLAIIAGALSVGIGLGLQSIVNNFVSGIILLIEKPIRPGDRINIDGV
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHH
EGFVKKIRVRSTQIISPINEDIIIPNSDLITRRVVNYMLTDNYWRVSCEVGVAYGTNLNL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCHHH
VKEILLEVANKHDDVIKSGRNKPGVLFTSFADSALIFQLWCMIKDVNKKWSIKSELNFAI
HHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
NEAFRKHGISIAYPQRDIHIKLEDLAHLTSPEK
HHHHHHCCCEEEECCCCEEEEHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MRIFGMILLFFFSISPGLGDTTLPEVFDVKNANKQFDRINLQLSVQNLNLNNLNKAVETL
CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHH
TELSAQSEECIADLQKKLNGVDVLIKQATATGNDKGADLVYLNNQKQQLAELQSQCRLFS
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IRAQEAIDTYKGAMLQLRQEKTLARTSPLWESVSKILNSPDNIKWINDSKEGFLLQDLPV
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YLWFCIAIISFFISILLLSKLRQSSVIRRYVKFKKLHLIHIMLFTLYIMTVSLLSYVSLF
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TSEEQFTSAQSLLIKEFFWFLSGVLLIICLFKVKKIKAFFDWYAMDSEFFEILSIVVLAF
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LANITIYPTRVLFGIIIFCFLYLVSRAISTSISRHQQFENEEETQVAIASILTYVGFSIA
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VKEILLEVANKHDDVIKSGRNKPGVLFTSFADSALIFQLWCMIKDVNKKWSIKSELNFAI
HHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
NEAFRKHGISIAYPQRDIHIKLEDLAHLTSPEK
HHHHHHCCCEEEECCCCEEEEHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800; 10675023 [H]