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The map label for this gene is 54293357

Identifier: 54293357

GI number: 54293357

Start: 453613

End: 456303

Strand: Reverse

Name: 54293357

Synonym: lpl0406

Alternate gene names: NA

Gene position: 456303-453613 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54293358

Following gene: 54293356

Centisome position: 13.64

GC content: 34.97

Gene sequence:

>2691_bases
GTGGTTGATTTTGATAAACCTGTCTCAGAAAATGATATTCTTGCCAGCTTATTACTTATCGCAGATTTAAGTAGACCATC
TCTAAATCAAACTCTTTCCTGGGAGAAAGCTCTAAAATCATTTTTATCGCTTGATGATCCACTGATTAAAACGGAAATAT
TTATAAAATGGTTCAGTCAATTAAATTCTGATCAACTTCAATCGTCCCCAGAGATAGTCCTCCTTTTGAAACACATTGTC
GAGCAAAAGCTGCTCCCCTACACCCTCAAAAAAATATTGATTCAGCATGAAAACTTCACCACCTCACAAATCAATTGGCT
TTGCAATCATTGTCTTATAGTTGCACCAGATCAAACGACTTTACCTGATATTATTAAACTCGGCTCATGGAGCTGGCTGG
AGAATCATATGAAAAGAAATGAACTATTAAATTTTGATTTGTTAAAAATAGCCATCTTAAATAAGGATTATTTAGCCAGC
ATCAACAATAGTAAAGAAAGTCAGCTCGATTTTATCTATGCGTTAAACGCTAATAAATTTAACTACCAACAAATACTTGA
ATTAATTGCTTTAGCGCAGGATAGCCAGATTAAATCATTATTAATTACCTGTCTATTAAGCAAAAAGGAGTACCTGGACA
ATTTAAAAGAAAAATCATTTCTAGCCCATTTAAATCAAAGTGAATTTCACTCACCACCTCGACTTAATGCACTAATTCAC
CAATTAAACCTGAGCTGTTTGACTGTGGCACAAATAGAACTTCTACAACCTGAAGCATGTGTTACTTTACTCTGTTCGAT
CCCTCATTTTCATCAATTGTCAGAAAAACAGGTTGAAAAAATACTACTTAAATATCCAAAGCCTGATATGATTGCCTATT
GGCTAAATCATTACTCATCCAGGCCAAATGCGCATTTTATTTTAGCCCATTTGATGAACCTGGTAGATGTTCATGTTGTT
GACGAACTTAATAAAATGGATTCCACAAAAAAGGAAACCATTATTATGAATATGGTAGAACATCTCGAATTATTTGATCC
CACTCATCCTCTTTTGATCAACCAAAATGAAGAAAAACGATTAATTACCGCTATTCAACGTTATCTCTATGGCCAACATC
ATGACGCATATGTGACTTACATCAAGTTATTGGTTTATAAATTATTAAACCGTAATTACCAATTCTCACCTCAAGCGATG
CAACTCCTGATTTGTTTAAATAATATGGAAGAGTTTAAAGAGTTAAATAATAAAATCGCCTATCTGACCAATTACTACTT
GCGAGCATCAGCACAATCCGGTGATTCGAGCTTATTTTATAATGATTCACGCATAAACATCACGAGCATGACACAACTGG
TCCAGCTAGCCCCAAAAATTCCAACTAAACCAAAAGAAAAAAGTCTTTTAAGCAGCCTCTTCTGCGGCATCAAAATTAAC
GAAAGCTCTGTAATGACACCGACCAATGATATACCTGAACACCCTTTAATTAATAAATTAATAAAAAGCAAGAGAACGGT
TAAATCGATAGATTATTTTTTAATGCATTATAAAGGCGACAAGCAAGTGCTTTCCAAAATCATCAATGATTATTTAAGTT
ACTATATTCAAGAAGGGTGCACTGAAATACATCGGCGTTCGATATATCATTTAATTGTTCTCATGTCTTTAAGCGATATA
TCAGCTTCTGTTAGAGAAGCTATATTCACAGCGTTTCTAAACTATCCTGAATTACATGATGAGCAAATTAATTTTTCTTT
ATTTGTCTATGATGCGAAAAGAACTATCCGGCATTTTGGGGCACAAGCTAGCGAAGACAGTTATGCCAGAGTTATTGATT
TATGCGAGGGAGCTCTAAAAAAATTAAATCCAAATAAACACAAGGAAATTATCAGTATAGCGACTCAAGCTTTAACTGAA
GCAAAAATCGAGTTAAGTTTTGGTGAAAATACCGGATTTATCGCTCAACTGATTTCACGATTGAAACGATGTTGGTATTA
TGGCTGGACTGGTTTTTTTTCCCCCAATCCACCTACCTTTGTTGCAGCAATTGACTCGCCAATAAAGCCAAGCGAAAAAA
AAACCTCCCCTCTTCTTCAACAAAGAAAATATTTCACTACCAAACTTGAAACAAATCTGTCGATTATCCTCGATGACATA
AAATCAGGTTACACCCAACAAAAACTTAATGAATTAATCGAAGCATTGAGTATATTTTCATTGCAATCCAATCCAAAAAA
CGAGCTTAAAATTCGTCAAAAACTCCATCGCTTATTTCACTATCTGTTACTAGAAAGTAAAAATGACTTAACATTGGATG
CCTGGCTTATAAAAAATCAGCAACTTTTAATCGCGAATCGTTTTCGTTTGCTAGAAATGCAACTAATGAAAGGGGCTCGC
AATGAGGTTGAATCTTTACTCAAGGAATTCGATGAAGACTCTGCTCATTTCAGCCCTATCAGCAAAGAGTTTACTCATTC
TTTACCCGAACAAAATCCGTATAAGTGTGAATCTGTTTCTTCAAATCAAACTCCAGGCGCAACGATCCTGGATTCAGCAA
CTGAGTTAGCTACTAGCCTAAAAAGCACTTTAGGCAACTTGGGAGTATTTTTTAGCAACAACATCATGTCAGCTATTTAT
CCAAATAATAAATCCACTCCCCAATCGACATCAACAATGACTTCACCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCGGGAGAATTTGTGAATATTATATTCCGTGACTTAACATGAACGAAATGGGTATTAAAGTTGATAGAGTAGTTTTGACA
TTTCGGTCAAGGAGGATCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAATCTTCCGGCTGCGCATCTACAGCCGGATTGATTATAATAACCTGAAAGAAACAGCTGTTCTAAAAGTTGGATCTTT
CCTATTTAATCAGCAGATAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 896; Mature: 896

Protein sequence:

>896_residues
MVDFDKPVSENDILASLLLIADLSRPSLNQTLSWEKALKSFLSLDDPLIKTEIFIKWFSQLNSDQLQSSPEIVLLLKHIV
EQKLLPYTLKKILIQHENFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTTLPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLAS
INNSKESQLDFIYALNANKFNYQQILELIALAQDSQIKSLLITCLLSKKEYLDNLKEKSFLAHLNQSEFHSPPRLNALIH
QLNLSCLTVAQIELLQPEACVTLLCSIPHFHQLSEKQVEKILLKYPKPDMIAYWLNHYSSRPNAHFILAHLMNLVDVHVV
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QLLICLNNMEEFKELNNKIAYLTNYYLRASAQSGDSSLFYNDSRINITSMTQLVQLAPKIPTKPKEKSLLSSLFCGIKIN
ESSVMTPTNDIPEHPLINKLIKSKRTVKSIDYFLMHYKGDKQVLSKIINDYLSYYIQEGCTEIHRRSIYHLIVLMSLSDI
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AKIELSFGENTGFIAQLISRLKRCWYYGWTGFFSPNPPTFVAAIDSPIKPSEKKTSPLLQQRKYFTTKLETNLSIILDDI
KSGYTQQKLNELIEALSIFSLQSNPKNELKIRQKLHRLFHYLLLESKNDLTLDAWLIKNQQLLIANRFRLLEMQLMKGAR
NEVESLLKEFDEDSAHFSPISKEFTHSLPEQNPYKCESVSSNQTPGATILDSATELATSLKSTLGNLGVFFSNNIMSAIY
PNNKSTPQSTSTMTSP

Sequences:

>Translated_896_residues
MVDFDKPVSENDILASLLLIADLSRPSLNQTLSWEKALKSFLSLDDPLIKTEIFIKWFSQLNSDQLQSSPEIVLLLKHIV
EQKLLPYTLKKILIQHENFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTTLPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLAS
INNSKESQLDFIYALNANKFNYQQILELIALAQDSQIKSLLITCLLSKKEYLDNLKEKSFLAHLNQSEFHSPPRLNALIH
QLNLSCLTVAQIELLQPEACVTLLCSIPHFHQLSEKQVEKILLKYPKPDMIAYWLNHYSSRPNAHFILAHLMNLVDVHVV
DELNKMDSTKKETIIMNMVEHLELFDPTHPLLINQNEEKRLITAIQRYLYGQHHDAYVTYIKLLVYKLLNRNYQFSPQAM
QLLICLNNMEEFKELNNKIAYLTNYYLRASAQSGDSSLFYNDSRINITSMTQLVQLAPKIPTKPKEKSLLSSLFCGIKIN
ESSVMTPTNDIPEHPLINKLIKSKRTVKSIDYFLMHYKGDKQVLSKIINDYLSYYIQEGCTEIHRRSIYHLIVLMSLSDI
SASVREAIFTAFLNYPELHDEQINFSLFVYDAKRTIRHFGAQASEDSYARVIDLCEGALKKLNPNKHKEIISIATQALTE
AKIELSFGENTGFIAQLISRLKRCWYYGWTGFFSPNPPTFVAAIDSPIKPSEKKTSPLLQQRKYFTTKLETNLSIILDDI
KSGYTQQKLNELIEALSIFSLQSNPKNELKIRQKLHRLFHYLLLESKNDLTLDAWLIKNQQLLIANRFRLLEMQLMKGAR
NEVESLLKEFDEDSAHFSPISKEFTHSLPEQNPYKCESVSSNQTPGATILDSATELATSLKSTLGNLGVFFSNNIMSAIY
PNNKSTPQSTSTMTSP
>Mature_896_residues
MVDFDKPVSENDILASLLLIADLSRPSLNQTLSWEKALKSFLSLDDPLIKTEIFIKWFSQLNSDQLQSSPEIVLLLKHIV
EQKLLPYTLKKILIQHENFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTTLPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLAS
INNSKESQLDFIYALNANKFNYQQILELIALAQDSQIKSLLITCLLSKKEYLDNLKEKSFLAHLNQSEFHSPPRLNALIH
QLNLSCLTVAQIELLQPEACVTLLCSIPHFHQLSEKQVEKILLKYPKPDMIAYWLNHYSSRPNAHFILAHLMNLVDVHVV
DELNKMDSTKKETIIMNMVEHLELFDPTHPLLINQNEEKRLITAIQRYLYGQHHDAYVTYIKLLVYKLLNRNYQFSPQAM
QLLICLNNMEEFKELNNKIAYLTNYYLRASAQSGDSSLFYNDSRINITSMTQLVQLAPKIPTKPKEKSLLSSLFCGIKIN
ESSVMTPTNDIPEHPLINKLIKSKRTVKSIDYFLMHYKGDKQVLSKIINDYLSYYIQEGCTEIHRRSIYHLIVLMSLSDI
SASVREAIFTAFLNYPELHDEQINFSLFVYDAKRTIRHFGAQASEDSYARVIDLCEGALKKLNPNKHKEIISIATQALTE
AKIELSFGENTGFIAQLISRLKRCWYYGWTGFFSPNPPTFVAAIDSPIKPSEKKTSPLLQQRKYFTTKLETNLSIILDDI
KSGYTQQKLNELIEALSIFSLQSNPKNELKIRQKLHRLFHYLLLESKNDLTLDAWLIKNQQLLIANRFRLLEMQLMKGAR
NEVESLLKEFDEDSAHFSPISKEFTHSLPEQNPYKCESVSSNQTPGATILDSATELATSLKSTLGNLGVFFSNNIMSAIY
PNNKSTPQSTSTMTSP

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 102996; Mature: 102996

Theoretical pI: Translated: 7.54; Mature: 7.54

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVDFDKPVSENDILASLLLIADLSRPSLNQTLSWEKALKSFLSLDDPLIKTEIFIKWFSQ
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LNSDQLQSSPEIVLLLKHIVEQKLLPYTLKKILIQHENFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTT
CCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCCCC
LPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLASINNSKESQLDFIYALNANKF
CHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEECCHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCC
NYQQILELIALAQDSQIKSLLITCLLSKKEYLDNLKEKSFLAHLNQSEFHSPPRLNALIH
CHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHH
QLNLSCLTVAQIELLQPEACVTLLCSIPHFHQLSEKQVEKILLKYPKPDMIAYWLNHYSS
HHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCC
RPNAHFILAHLMNLVDVHVVDELNKMDSTKKETIIMNMVEHLELFDPTHPLLINQNEEKR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHH
LITAIQRYLYGQHHDAYVTYIKLLVYKLLNRNYQFSPQAMQLLICLNNMEEFKELNNKIA
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCHHH
YLTNYYLRASAQSGDSSLFYNDSRINITSMTQLVQLAPKIPTKPKEKSLLSSLFCGIKIN
HHHHHHHEEECCCCCCCEEECCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEC
ESSVMTPTNDIPEHPLINKLIKSKRTVKSIDYFLMHYKGDKQVLSKIINDYLSYYIQEGC
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TEIHRRSIYHLIVLMSLSDISASVREAIFTAFLNYPELHDEQINFSLFVYDAKRTIRHFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHC
AQASEDSYARVIDLCEGALKKLNPNKHKEIISIATQALTEAKIELSFGENTGFIAQLISR
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHH
LKRCWYYGWTGFFSPNPPTFVAAIDSPIKPSEKKTSPLLQQRKYFTTKLETNLSIILDDI
HHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
KSGYTQQKLNELIEALSIFSLQSNPKNELKIRQKLHRLFHYLLLESKNDLTLDAWLIKNQ
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EEEHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
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CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MVDFDKPVSENDILASLLLIADLSRPSLNQTLSWEKALKSFLSLDDPLIKTEIFIKWFSQ
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LNSDQLQSSPEIVLLLKHIVEQKLLPYTLKKILIQHENFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTT
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LPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLASINNSKESQLDFIYALNANKF
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LITAIQRYLYGQHHDAYVTYIKLLVYKLLNRNYQFSPQAMQLLICLNNMEEFKELNNKIA
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SNQTPGATILDSATELATSLKSTLGNLGVFFSNNIMSAIYPNNKSTPQSTSTMTSP
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA