| Definition | Legionella pneumophila str. Lens, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006369 |
| Length | 3,345,687 |
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The map label for this gene is 54293087
Identifier: 54293087
GI number: 54293087
Start: 145792
End: 149100
Strand: Direct
Name: 54293087
Synonym: lpl0125
Alternate gene names: NA
Gene position: 145792-149100 (Clockwise)
Preceding gene: 54293086
Following gene: 54293092
Centisome position: 4.36
GC content: 36.57
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1102; Mature: 1101
Protein sequence:
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Sequences:
>Translated_1102_residues MTPLFPTQGPITIRQGIGGSCYLLSSLDCILNLGADGEQLIKSLFTQTEDGKVIVRIKRHEALKDNLQKNKMTGKYTHYV DELNNEDVFEISPERLKEIDNQYGGVKSNSLAIKILERLVSYYYAGDWSNTDPLASVVAHDIPDRIAGFTSTAFLGKFFG IQAEDIPYSKLDDIIKLKLMNPDEPVYISMSYGKVDSFGKFHGRHALRIDKIIPKGSGNYDFVLINPHDNSKTETYKLDD LNKRNCRFCLFNTSIHRASLTKKLLTLSNEEGKYVFSNSGLQKKLISLEEMNLLTDNKIISSCISLHKQIPYLEKLFLKL SVEEKKKLTTCIVNADGSKKEFLKLFLTYIPAMDLLELVLREETSQELLGEVLTELALSSPVEENKLSPKAGINFNGEAF LHLIVKSAIQQKINQLAYIPEKAKQEIESGLINFYFGGASSSLTRASGLRALFIANVFSKKSIEVLFPPKALFAKAIANY LVLKTLPDLLIEYLKSKDTLPIDEEFFDVVLASVTFKDPDEFFENLFRLSRINPEVAKALFVFASQKINVLFGISLEEYA KKIALKDSSEFKSWFESLSKPQPVIKIPEIDNVLRQQRVDDAKRVISDIVQQINSFPFSFEGFKTVEHVNLNAEELRGQL KKIVHSGELQNALQILDLPDGHPEVQRALERKLRMIDAAANQRSDFLRKYETDIDEHVRQIKNFPIDFNDADTIVAIESR RILLNKKLHTQVKAEDLLGEQFIDNPKIEMVYYAQIEKINLRAELLQKRLLDEAQKVIDSVEKRIDNFVIRFNDISSTSA VEWQRNNLLQQLDNLVKPNQALLSAEKVLDCTDLQPSIVRALQAKKQEINETADQLIIKINAEEVVKSYEKQIREFPISF SRCQTVEEVIARKQDLIQSVRYLVDNKPDLLKAQEQLQLSDEYHSDIKIALTDKNCEINRQADVMGKRITDQIAAIKETL NILAEIKFSDHLKTIESMVKTLETKAVGDENYKRAAPIARTFYNNLLRAEEHFKNSQLPKNVKCNDFHQACVRAINAVIP VLEVHRGWKQVFADLASALVTLCTLGGANLYAGRWRLFPVPTESEKIVKDFSLSMQPLAVRA >Mature_1101_residues TPLFPTQGPITIRQGIGGSCYLLSSLDCILNLGADGEQLIKSLFTQTEDGKVIVRIKRHEALKDNLQKNKMTGKYTHYVD ELNNEDVFEISPERLKEIDNQYGGVKSNSLAIKILERLVSYYYAGDWSNTDPLASVVAHDIPDRIAGFTSTAFLGKFFGI QAEDIPYSKLDDIIKLKLMNPDEPVYISMSYGKVDSFGKFHGRHALRIDKIIPKGSGNYDFVLINPHDNSKTETYKLDDL NKRNCRFCLFNTSIHRASLTKKLLTLSNEEGKYVFSNSGLQKKLISLEEMNLLTDNKIISSCISLHKQIPYLEKLFLKLS VEEKKKLTTCIVNADGSKKEFLKLFLTYIPAMDLLELVLREETSQELLGEVLTELALSSPVEENKLSPKAGINFNGEAFL HLIVKSAIQQKINQLAYIPEKAKQEIESGLINFYFGGASSSLTRASGLRALFIANVFSKKSIEVLFPPKALFAKAIANYL VLKTLPDLLIEYLKSKDTLPIDEEFFDVVLASVTFKDPDEFFENLFRLSRINPEVAKALFVFASQKINVLFGISLEEYAK KIALKDSSEFKSWFESLSKPQPVIKIPEIDNVLRQQRVDDAKRVISDIVQQINSFPFSFEGFKTVEHVNLNAEELRGQLK KIVHSGELQNALQILDLPDGHPEVQRALERKLRMIDAAANQRSDFLRKYETDIDEHVRQIKNFPIDFNDADTIVAIESRR ILLNKKLHTQVKAEDLLGEQFIDNPKIEMVYYAQIEKINLRAELLQKRLLDEAQKVIDSVEKRIDNFVIRFNDISSTSAV EWQRNNLLQQLDNLVKPNQALLSAEKVLDCTDLQPSIVRALQAKKQEINETADQLIIKINAEEVVKSYEKQIREFPISFS RCQTVEEVIARKQDLIQSVRYLVDNKPDLLKAQEQLQLSDEYHSDIKIALTDKNCEINRQADVMGKRITDQIAAIKETLN ILAEIKFSDHLKTIESMVKTLETKAVGDENYKRAAPIARTFYNNLLRAEEHFKNSQLPKNVKCNDFHQACVRAINAVIPV LEVHRGWKQVFADLASALVTLCTLGGANLYAGRWRLFPVPTESEKIVKDFSLSMQPLAVRA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 125252; Mature: 125120
Theoretical pI: Translated: 6.93; Mature: 6.93
Prosite motif: PS00139 THIOL_PROTEASE_CYS ; PS00878 ODR_DC_2_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 1.0 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTPLFPTQGPITIRQGIGGSCYLLSSLDCILNLGADGEQLIKSLFTQTEDGKVIVRIKRH CCCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHH EALKDNLQKNKMTGKYTHYVDELNNEDVFEISPERLKEIDNQYGGVKSNSLAIKILERLV HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH SYYYAGDWSNTDPLASVVAHDIPDRIAGFTSTAFLGKFFGIQAEDIPYSKLDDIIKLKLM HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHEEEEEE NPDEPVYISMSYGKVDSFGKFHGRHALRIDKIIPKGSGNYDFVLINPHDNSKTETYKLDD CCCCCEEEEEECCCCCCCHHHCCCCCEEEHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCEEECCC LNKRNCRFCLFNTSIHRASLTKKLLTLSNEEGKYVFSNSGLQKKLISLEEMNLLTDNKII CCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SSCISLHKQIPYLEKLFLKLSVEEKKKLTTCIVNADGSKKEFLKLFLTYIPAMDLLELVL HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHH REETSQELLGEVLTELALSSPVEENKLSPKAGINFNGEAFLHLIVKSAIQQKINQLAYIP HCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC EKAKQEIESGLINFYFGGASSSLTRASGLRALFIANVFSKKSIEVLFPPKALFAKAIANY HHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHH LVLKTLPDLLIEYLKSKDTLPIDEEFFDVVLASVTFKDPDEFFENLFRLSRINPEVAKAL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH FVFASQKINVLFGISLEEYAKKIALKDSSEFKSWFESLSKPQPVIKIPEIDNVLRQQRVD HHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHH DAKRVISDIVQQINSFPFSFEGFKTVEHVNLNAEELRGQLKKIVHSGELQNALQILDLPD HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCC GHPEVQRALERKLRMIDAAANQRSDFLRKYETDIDEHVRQIKNFPIDFNDADTIVAIESR CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECC RILLNKKLHTQVKAEDLLGEQFIDNPKIEMVYYAQIEKINLRAELLQKRLLDEAQKVIDS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VEKRIDNFVIRFNDISSTSAVEWQRNNLLQQLDNLVKPNQALLSAEKVLDCTDLQPSIVR HHHHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH ALQAKKQEINETADQLIIKINAEEVVKSYEKQIREFPISFSRCQTVEEVIARKQDLIQSV HHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RYLVDNKPDLLKAQEQLQLSDEYHSDIKIALTDKNCEINRQADVMGKRITDQIAAIKETL HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NILAEIKFSDHLKTIESMVKTLETKAVGDENYKRAAPIARTFYNNLLRAEEHFKNSQLPK HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC NVKCNDFHQACVRAINAVIPVLEVHRGWKQVFADLASALVTLCTLGGANLYAGRWRLFPV CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCEEEECC PTESEKIVKDFSLSMQPLAVRA CCCHHHHHHHHCCCCCCCEECC >Mature Secondary Structure TPLFPTQGPITIRQGIGGSCYLLSSLDCILNLGADGEQLIKSLFTQTEDGKVIVRIKRH CCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHH EALKDNLQKNKMTGKYTHYVDELNNEDVFEISPERLKEIDNQYGGVKSNSLAIKILERLV HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH SYYYAGDWSNTDPLASVVAHDIPDRIAGFTSTAFLGKFFGIQAEDIPYSKLDDIIKLKLM HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHEEEEEE NPDEPVYISMSYGKVDSFGKFHGRHALRIDKIIPKGSGNYDFVLINPHDNSKTETYKLDD CCCCCEEEEEECCCCCCCHHHCCCCCEEEHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCEEECCC LNKRNCRFCLFNTSIHRASLTKKLLTLSNEEGKYVFSNSGLQKKLISLEEMNLLTDNKII CCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SSCISLHKQIPYLEKLFLKLSVEEKKKLTTCIVNADGSKKEFLKLFLTYIPAMDLLELVL HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHH REETSQELLGEVLTELALSSPVEENKLSPKAGINFNGEAFLHLIVKSAIQQKINQLAYIP HCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC EKAKQEIESGLINFYFGGASSSLTRASGLRALFIANVFSKKSIEVLFPPKALFAKAIANY HHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHH LVLKTLPDLLIEYLKSKDTLPIDEEFFDVVLASVTFKDPDEFFENLFRLSRINPEVAKAL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH FVFASQKINVLFGISLEEYAKKIALKDSSEFKSWFESLSKPQPVIKIPEIDNVLRQQRVD HHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHH DAKRVISDIVQQINSFPFSFEGFKTVEHVNLNAEELRGQLKKIVHSGELQNALQILDLPD HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCC GHPEVQRALERKLRMIDAAANQRSDFLRKYETDIDEHVRQIKNFPIDFNDADTIVAIESR CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECC RILLNKKLHTQVKAEDLLGEQFIDNPKIEMVYYAQIEKINLRAELLQKRLLDEAQKVIDS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VEKRIDNFVIRFNDISSTSAVEWQRNNLLQQLDNLVKPNQALLSAEKVLDCTDLQPSIVR HHHHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH ALQAKKQEINETADQLIIKINAEEVVKSYEKQIREFPISFSRCQTVEEVIARKQDLIQSV HHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RYLVDNKPDLLKAQEQLQLSDEYHSDIKIALTDKNCEINRQADVMGKRITDQIAAIKETL HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NILAEIKFSDHLKTIESMVKTLETKAVGDENYKRAAPIARTFYNNLLRAEEHFKNSQLPK HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC NVKCNDFHQACVRAINAVIPVLEVHRGWKQVFADLASALVTLCTLGGANLYAGRWRLFPV CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCEEEECC PTESEKIVKDFSLSMQPLAVRA CCCHHHHHHHHCCCCCCCEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
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Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA