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The map label for this gene is pepF

Identifier: 54020563

GI number: 54020563

Start: 652104

End: 653927

Strand: Reverse

Name: pepF

Synonym: mhp520

Alternate gene names: 54020563

Gene position: 653927-652104 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54020564

Following gene: 54020562

Centisome position: 73.25

GC content: 28.07

Gene sequence:

>1824_bases
ATGCAATATAAAAAATATTCTGAAATTCCTGAGAAATACCGTTTTGATTTAGATGTGCTACTTGAAGGTAAGACTATTGA
GGAAAATTTTTCTAGTATTCAAGAAATTTCTAATGATTTAATATCAAAAAAAGATCAACAATTTGAAAATGTTGAAAATT
TTCTTGAATATAAGGAACTAGAAGCTAATTTTGGGATAAAATACAATAAAATTCTTAATTATATTTCAAACAATATCAGC
GTCAATGTAATTGATCCTATTTTTAGTCAAATTAATGAACGTTTTAGTTTCTTGATGTCTGAATTTGAGTCAAAATTAGG
CTCAATTGATGTTATTTTTTATAAAAATGAGGATAAAATTCGTTCTTGAATCAACGATTTAAGAGTAAAACCTTATCAAA
AAGAGCTAAATTATCGACTTGATAATAAAAAACATAAACTTGCAGATGAGGTTGAAAGTTATCTTACAAAGTCATCTTTT
GGTGAAATTTCGGTTTATAAAATTTTCTCAATTCTTTCAAATTCAGAAACAAAATTTCAGGATGTTCTAAACGAAGAAAA
TAAGAAATTACCTCTTAATTCAACAAACTATTATAATTATTTAAAAACAGGGTCTCCTTTAGTGCGAAAAAATGCATATA
TAAACTATCATAAAGCTTATCTTGAACATAAAAACACATTTGCAAATTTGTTGTATCAGCATATTAAGTCAAGTTCTGTG
GATGCAAGAATGCGAAATTATCAATCACTGCTAGAGGCAAGTCTTAGTTCTGATCGTTTTCCAGTTACAAGTTTAGAAAA
ATTATTTCAATTTGTCGCTAATTCAGCGCCTATTTTTGAAAAATTCAAAAAAGCAAAAGAAAAATTTTATCAAGCAAAAT
TTGGAACTAAGATGAATAGTTGAGACCGTTTAGTTCCATTAGTTGAGACAAAAAATAATTATTCTGTTGAGGATTCACAA
AAAATAGTGCTTGAGGCAATCAAACCATTAGGTCAAGAATATAAAGATGTTGTAGAAAAAGCATTTAGCCAAAGATGAAT
TGACTATCATTATGTTGATTCAAAAAGATCTGGAGCTTATTCAATTGGGGGTTCATATGGGCTTGAAAAAAAATATATTT
TAATGAATTATGACTTTACTATAAACGCAGTTCATACTTTAGCACATGAATTAGGTCATTCGCTCCATTCTTATTATTCT
GATAAAAACCAGAATTATCATAATAGCTCATATCCAATTTTTCTTGCAGAAATTGCCTCAATTTTTAATGAGTTAATGCT
CGATGACTACCTTTTGGAAAAACAAGGTGATGAAAATTTCAAATTTGAAATATTATCTCAACAAATTTCAAATTTTATTG
CGACTGTCCAACGTCAGGTAATTTGAGCGAATTATGAAGCAGTTTTATATAATAAAATTGACAAGGGTGAACCAATTAGT
TCTTATGAAGCTTTTGTGGGAATTTATAAGCAAATTCTACAAAAATATAATCCAAATGACCCACTTGATGATGAAAAACC
GCTTGTTTATAGTGTAATTGTCCCACATTATTATTATGGATATTATGTTTATAAATATGCAATTGGCTATCTTGTTGCTA
ATGCTTTCTTTCAAAAATATAAAAAAGAAGGTAAAAAAGCCCTTGACAATTACATTGAAAACTTCCTTTCAAAAGGTGGT
TCTGATTGACCAAGTAAAATTCTGGAAAAAGCCGGGATTGACCTTCGGGATTCTTTAATTTATACAGAGGCATTTTCACT
TCTTGAAACCCAAATTGATGAATATATTCGGCTTGGTAAGAAAATTTTTAAAATTAATTTCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTAAAATGTTTAAAGAATTTTAATCGTTTTATTTTACCGAGAAAAAATTATACCATAAATACTAAAAAATTATTTTCTA
TTTTTGAGAAGGTAAATAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATGCAATAATTTTATATTAATTTACATCAAAAAAATATGAAAATCAATTTATTATTTCAAGATTTTTTAATTTCAACTA
AATTTAGACGACTAAAAAAT

Product: oligoendopeptidase F

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 607; Mature: 607

Protein sequence:

>607_residues
MQYKKYSEIPEKYRFDLDVLLEGKTIEENFSSIQEISNDLISKKDQQFENVENFLEYKELEANFGIKYNKILNYISNNIS
VNVIDPIFSQINERFSFLMSEFESKLGSIDVIFYKNEDKIRSWINDLRVKPYQKELNYRLDNKKHKLADEVESYLTKSSF
GEISVYKIFSILSNSETKFQDVLNEENKKLPLNSTNYYNYLKTGSPLVRKNAYINYHKAYLEHKNTFANLLYQHIKSSSV
DARMRNYQSLLEASLSSDRFPVTSLEKLFQFVANSAPIFEKFKKAKEKFYQAKFGTKMNSWDRLVPLVETKNNYSVEDSQ
KIVLEAIKPLGQEYKDVVEKAFSQRWIDYHYVDSKRSGAYSIGGSYGLEKKYILMNYDFTINAVHTLAHELGHSLHSYYS
DKNQNYHNSSYPIFLAEIASIFNELMLDDYLLEKQGDENFKFEILSQQISNFIATVQRQVIWANYEAVLYNKIDKGEPIS
SYEAFVGIYKQILQKYNPNDPLDDEKPLVYSVIVPHYYYGYYVYKYAIGYLVANAFFQKYKKEGKKALDNYIENFLSKGG
SDWPSKILEKAGIDLRDSLIYTEAFSLLETQIDEYIRLGKKIFKINF

Sequences:

>Translated_607_residues
MQYKKYSEIPEKYRFDLDVLLEGKTIEENFSSIQEISNDLISKKDQQFENVENFLEYKELEANFGIKYNKILNYISNNIS
VNVIDPIFSQINERFSFLMSEFESKLGSIDVIFYKNEDKIRS*INDLRVKPYQKELNYRLDNKKHKLADEVESYLTKSSF
GEISVYKIFSILSNSETKFQDVLNEENKKLPLNSTNYYNYLKTGSPLVRKNAYINYHKAYLEHKNTFANLLYQHIKSSSV
DARMRNYQSLLEASLSSDRFPVTSLEKLFQFVANSAPIFEKFKKAKEKFYQAKFGTKMNS*DRLVPLVETKNNYSVEDSQ
KIVLEAIKPLGQEYKDVVEKAFSQR*IDYHYVDSKRSGAYSIGGSYGLEKKYILMNYDFTINAVHTLAHELGHSLHSYYS
DKNQNYHNSSYPIFLAEIASIFNELMLDDYLLEKQGDENFKFEILSQQISNFIATVQRQVI*ANYEAVLYNKIDKGEPIS
SYEAFVGIYKQILQKYNPNDPLDDEKPLVYSVIVPHYYYGYYVYKYAIGYLVANAFFQKYKKEGKKALDNYIENFLSKGG
SD*PSKILEKAGIDLRDSLIYTEAFSLLETQIDEYIRLGKKIFKINF
>Mature_607_residues
MQYKKYSEIPEKYRFDLDVLLEGKTIEENFSSIQEISNDLISKKDQQFENVENFLEYKELEANFGIKYNKILNYISNNIS
VNVIDPIFSQINERFSFLMSEFESKLGSIDVIFYKNEDKIRS*INDLRVKPYQKELNYRLDNKKHKLADEVESYLTKSSF
GEISVYKIFSILSNSETKFQDVLNEENKKLPLNSTNYYNYLKTGSPLVRKNAYINYHKAYLEHKNTFANLLYQHIKSSSV
DARMRNYQSLLEASLSSDRFPVTSLEKLFQFVANSAPIFEKFKKAKEKFYQAKFGTKMNS*DRLVPLVETKNNYSVEDSQ
KIVLEAIKPLGQEYKDVVEKAFSQR*IDYHYVDSKRSGAYSIGGSYGLEKKYILMNYDFTINAVHTLAHELGHSLHSYYS
DKNQNYHNSSYPIFLAEIASIFNELMLDDYLLEKQGDENFKFEILSQQISNFIATVQRQVI*ANYEAVLYNKIDKGEPIS
SYEAFVGIYKQILQKYNPNDPLDDEKPLVYSVIVPHYYYGYYVYKYAIGYLVANAFFQKYKKEGKKALDNYIENFLSKGG
SD*PSKILEKAGIDLRDSLIYTEAFSLLETQIDEYIRLGKKIFKINF

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70308; Mature: 70308

Theoretical pI: Translated: 6.93; Mature: 6.93

Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
1.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
1.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQYKKYSEIPEKYRFDLDVLLEGKTIEENFSSIQEISNDLISKKDQQFENVENFLEYKEL
CCCCCHHCCHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
EANFGIKYNKILNYISNNISVNVIDPIFSQINERFSFLMSEFESKLGSIDVIFYKNEDKI
HHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHH
RSINDLRVKPYQKELNYRLDNKKHKLADEVESYLTKSSFGEISVYKIFSILSNSETKFQD
HCCHHCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
VLNEENKKLPLNSTNYYNYLKTGSPLVRKNAYINYHKAYLEHKNTFANLLYQHIKSSSVD
HHCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
ARMRNYQSLLEASLSSDRFPVTSLEKLFQFVANSAPIFEKFKKAKEKFYQAKFGTKMNSD
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
RLVPLVETKNNYSVEDSQKIVLEAIKPLGQEYKDVVEKAFSQRIDYHYVDSKRSGAYSIG
CCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCEECC
GSYGLEKKYILMNYDFTINAVHTLAHELGHSLHSYYSDKNQNYHNSSYPIFLAEIASIFN
CCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
ELMLDDYLLEKQGDENFKFEILSQQISNFIATVQRQVIANYEAVLYNKIDKGEPISSYEA
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
FVGIYKQILQKYNPNDPLDDEKPLVYSVIVPHYYYGYYVYKYAIGYLVANAFFQKYKKEG
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKALDNYIENFLSKGGSDPSKILEKAGIDLRDSLIYTEAFSLLETQIDEYIRLGKKIFKI
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NF
CC
>Mature Secondary Structure
MQYKKYSEIPEKYRFDLDVLLEGKTIEENFSSIQEISNDLISKKDQQFENVENFLEYKEL
CCCCCHHCCHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
EANFGIKYNKILNYISNNISVNVIDPIFSQINERFSFLMSEFESKLGSIDVIFYKNEDKI
HHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHH
RSINDLRVKPYQKELNYRLDNKKHKLADEVESYLTKSSFGEISVYKIFSILSNSETKFQD
HCCHHCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
VLNEENKKLPLNSTNYYNYLKTGSPLVRKNAYINYHKAYLEHKNTFANLLYQHIKSSSVD
HHCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
ARMRNYQSLLEASLSSDRFPVTSLEKLFQFVANSAPIFEKFKKAKEKFYQAKFGTKMNSD
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
RLVPLVETKNNYSVEDSQKIVLEAIKPLGQEYKDVVEKAFSQRIDYHYVDSKRSGAYSIG
CCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCEECC
GSYGLEKKYILMNYDFTINAVHTLAHELGHSLHSYYSDKNQNYHNSSYPIFLAEIASIFN
CCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
ELMLDDYLLEKQGDENFKFEILSQQISNFIATVQRQVIANYEAVLYNKIDKGEPISSYEA
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
FVGIYKQILQKYNPNDPLDDEKPLVYSVIVPHYYYGYYVYKYAIGYLVANAFFQKYKKEG
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKALDNYIENFLSKGGSDPSKILEKAGIDLRDSLIYTEAFSLLETQIDEYIRLGKKIFKI
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NF
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11353084 [H]