| Definition | Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006360 |
| Length | 892,758 |
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The map label for this gene is 54020043
Identifier: 54020043
GI number: 54020043
Start: 126796
End: 129828
Strand: Direct
Name: 54020043
Synonym: mhp108
Alternate gene names: NA
Gene position: 126796-129828 (Clockwise)
Preceding gene: 54020042
Following gene: 54020044
Centisome position: 14.2
GC content: 26.87
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AATTTTTTCAAAAATTTATGAACTAATAACTTTGCTTTGTTAGACAAAATTATTAGTTCTATTTTTATAATTCTAATTTA AAAAACACTTGTTTTTATAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1010; Mature: 1010
Protein sequence:
>1010_residues MKKIPNFKGFFNKPAKIVTSILLLSGIITISTAIPLGIWSYNRAYYQKLNEKSQNLSISQTENPFENNLGKFFDNLFISN QFKELSASTAFELAKSKIYNLDLLTLINLDKLYQKNYQISYDLSNATASGTAIKNIVFFIRTSDQRQIFSKAVEIKGFSD KNIEKNLAKFEIDEKKSSISIKPQNFLSFAEFSKELQNQFIKTSKTQKQTFIAFEEALIQLGGSYNLVNSLGLPTFIHKG QILEPKIFDNNLNFTNQGNKNYLNFIFTNEGKKTEIPLEINGITPDLEIKNEIIKWIKAELEEKIKLKESIQAELIRENL SLAKSFYVDKNNNPLISTTKNFENLFDYVQSEHLINTNKIKNYITNINFKIKKNSEIPALELNNLLKDDKIRLEINVDIS KWVQQKLIKILNFKFDWDLKPDLNQYARIFAQNLPEPKSEVFLLKKDENSAAWTSKKLVNIINKIKEFNNELDPENPDIK LVSQLYLLDFGKIGDEIAIENYKRELIITAKILKNQLVKVQEFSDDQVNKAQNNEKSLGKAIWKVLNIQRNLINDDISSD FILDNKEGDFTIEFSLISNKNKQKLATRKIKISNIVSSEMSAFDDAAKFYPTFFLDGKSSFSKSDNKKGYEIIDLSDNNI HFEDDLDSKNQLTQEGFKLTNPIKFQQNQSKTKENIARTVNISSPSFKSAPFSRLDSGLIYLAFKPKNINDYKKHYLLAD SDGNGLFIQKIKNFKFINKNTTIQGIAGLKTEKTTQNSDITFIKPENLDQKNKDETQQKQVDGYFIGLDFKQIKNFKSFQ SYLYQNKKSLYSLANLFPPELIDKQAVILGPNSWKPIKNFSAEINQNLDNLAIVELANRIGENRFYRQELRNSSPFSLEK SKEIIEEDQDIVLEIIKTPWSVEISAFSSSNYQLNSKTSLNLNGKTIYNINPVSQKWSPFPNYLNLDWAQIGPNPKKTTD KNGSNNEKINKNSSIILKGIAVYNDPELTTKTRNFARDQIRNAFIKAYIK
Sequences:
>Translated_1010_residues MKKIPNFKGFFNKPAKIVTSILLLSGIITISTAIPLGIWSYNRAYYQKLNEKSQNLSISQTENPFENNLGKFFDNLFISN QFKELSASTAFELAKSKIYNLDLLTLINLDKLYQKNYQISYDLSNATASGTAIKNIVFFIRTSDQRQIFSKAVEIKGFSD KNIEKNLAKFEIDEKKSSISIKPQNFLSFAEFSKELQNQFIKTSKTQKQTFIAFEEALIQLGGSYNLVNSLGLPTFIHKG QILEPKIFDNNLNFTNQGNKNYLNFIFTNEGKKTEIPLEINGITPDLEIKNEIIK*IKAELEEKIKLKESIQAELIRENL SLAKSFYVDKNNNPLISTTKNFENLFDYVQSEHLINTNKIKNYITNINFKIKKNSEIPALELNNLLKDDKIRLEINVDIS K*VQQKLIKILNFKFDWDLKPDLNQYARIFAQNLPEPKSEVFLLKKDENSAA*TSKKLVNIINKIKEFNNELDPENPDIK LVSQLYLLDFGKIGDEIAIENYKRELIITAKILKNQLVKVQEFSDDQVNKAQNNEKSLGKAI*KVLNIQRNLINDDISSD FILDNKEGDFTIEFSLISNKNKQKLATRKIKISNIVSSEMSAFDDAAKFYPTFFLDGKSSFSKSDNKKGYEIIDLSDNNI HFEDDLDSKNQLTQEGFKLTNPIKFQQNQSKTKENIARTVNISSPSFKSAPFSRLDSGLIYLAFKPKNINDYKKHYLLAD SDGNGLFIQKIKNFKFINKNTTIQGIAGLKTEKTTQNSDITFIKPENLDQKNKDETQQKQVDGYFIGLDFKQIKNFKSFQ SYLYQNKKSLYSLANLFPPELIDKQAVILGPNS*KPIKNFSAEINQNLDNLAIVELANRIGENRFYRQELRNSSPFSLEK SKEIIEEDQDIVLEIIKTP*SVEISAFSSSNYQLNSKTSLNLNGKTIYNINPVSQKWSPFPNYLNLDWAQIGPNPKKTTD KNGSNNEKINKNSSIILKGIAVYNDPELTTKTRNFARDQIRNAFIKAYIK >Mature_1010_residues MKKIPNFKGFFNKPAKIVTSILLLSGIITISTAIPLGIWSYNRAYYQKLNEKSQNLSISQTENPFENNLGKFFDNLFISN QFKELSASTAFELAKSKIYNLDLLTLINLDKLYQKNYQISYDLSNATASGTAIKNIVFFIRTSDQRQIFSKAVEIKGFSD KNIEKNLAKFEIDEKKSSISIKPQNFLSFAEFSKELQNQFIKTSKTQKQTFIAFEEALIQLGGSYNLVNSLGLPTFIHKG QILEPKIFDNNLNFTNQGNKNYLNFIFTNEGKKTEIPLEINGITPDLEIKNEIIK*IKAELEEKIKLKESIQAELIRENL SLAKSFYVDKNNNPLISTTKNFENLFDYVQSEHLINTNKIKNYITNINFKIKKNSEIPALELNNLLKDDKIRLEINVDIS K*VQQKLIKILNFKFDWDLKPDLNQYARIFAQNLPEPKSEVFLLKKDENSAA*TSKKLVNIINKIKEFNNELDPENPDIK LVSQLYLLDFGKIGDEIAIENYKRELIITAKILKNQLVKVQEFSDDQVNKAQNNEKSLGKAI*KVLNIQRNLINDDISSD FILDNKEGDFTIEFSLISNKNKQKLATRKIKISNIVSSEMSAFDDAAKFYPTFFLDGKSSFSKSDNKKGYEIIDLSDNNI HFEDDLDSKNQLTQEGFKLTNPIKFQQNQSKTKENIARTVNISSPSFKSAPFSRLDSGLIYLAFKPKNINDYKKHYLLAD SDGNGLFIQKIKNFKFINKNTTIQGIAGLKTEKTTQNSDITFIKPENLDQKNKDETQQKQVDGYFIGLDFKQIKNFKSFQ SYLYQNKKSLYSLANLFPPELIDKQAVILGPNS*KPIKNFSAEINQNLDNLAIVELANRIGENRFYRQELRNSSPFSLEK SKEIIEEDQDIVLEIIKTP*SVEISAFSSSNYQLNSKTSLNLNGKTIYNINPVSQKWSPFPNYLNLDWAQIGPNPKKTTD KNGSNNEKINKNSSIILKGIAVYNDPELTTKTRNFARDQIRNAFIKAYIK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 114949; Mature: 114949
Theoretical pI: Translated: 9.80; Mature: 9.80
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 0.2 %Met (Translated Protein) 0.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.2 %Met (Mature Protein) 0.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKIPNFKGFFNKPAKIVTSILLLSGIITISTAIPLGIWSYNRAYYQKLNEKSQNLSISQ CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC TENPFENNLGKFFDNLFISNQFKELSASTAFELAKSKIYNLDLLTLINLDKLYQKNYQIS CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHCHHHHHHCCCEEE YDLSNATASGTAIKNIVFFIRTSDQRQIFSKAVEIKGFSDKNIEKNLAKFEIDEKKSSIS EECCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHEEECCCCCCEE IKPQNFLSFAEFSKELQNQFIKTSKTQKQTFIAFEEALIQLGGSYNLVNSLGLPTFIHKG ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHCCCC QILEPKIFDNNLNFTNQGNKNYLNFIFTNEGKKTEIPLEINGITPDLEIKNEIIKIKAEL CEECCEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEECCEEECCCCCCCHHCCHHEEEHHHH EEKIKLKESIQAELIRENLSLAKSFYVDKNNNPLISTTKNFENLFDYVQSEHLINTNKIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH NYITNINFKIKKNSEIPALELNNLLKDDKIRLEINVDISKVQQKLIKILNFKFDWDLKPD HHHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC LNQYARIFAQNLPEPKSEVFLLKKDENSAATSKKLVNIINKIKEFNNELDPENPDIKLVS HHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH QLYLLDFGKIGDEIAIENYKRELIITAKILKNQLVKVQEFSDDQVNKAQNNEKSLGKAIK HHHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHEEHHCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHH VLNIQRNLINDDISSDFILDNKEGDFTIEFSLISNKNKQKLATRKIKISNIVSSEMSAFD HHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHH DAAKFYPTFFLDGKSSFSKSDNKKGYEIIDLSDNNIHFEDDLDSKNQLTQEGFKLTNPIK HHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEE FQQNQSKTKENIARTVNISSPSFKSAPFSRLDSGLIYLAFKPKNINDYKKHYLLADSDGN ECCCHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHEEEEEECCCC GLFIQKIKNFKFINKNTTIQGIAGLKTEKTTQNSDITFIKPENLDQKNKDETQQKQVDGY EEEEEEECCEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCCE FIGLDFKQIKNFKSFQSYLYQNKKSLYSLANLFPPELIDKQAVILGPNSKPIKNFSAEIN EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHH QNLDNLAIVELANRIGENRFYRQELRNSSPFSLEKSKEIIEEDQDIVLEIIKTPSVEISA CCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEEEE FSSSNYQLNSKTSLNLNGKTIYNINPVSQKWSPFPNYLNLDWAQIGPNPKKTTDKNGSNN ECCCCEEECCCEEEEECCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCC EKINKNSSIILKGIAVYNDPELTTKTRNFARDQIRNAFIKAYIK CCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MKKIPNFKGFFNKPAKIVTSILLLSGIITISTAIPLGIWSYNRAYYQKLNEKSQNLSISQ CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC TENPFENNLGKFFDNLFISNQFKELSASTAFELAKSKIYNLDLLTLINLDKLYQKNYQIS CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHCHHHHHHCCCEEE YDLSNATASGTAIKNIVFFIRTSDQRQIFSKAVEIKGFSDKNIEKNLAKFEIDEKKSSIS EECCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHEEECCCCCCEE IKPQNFLSFAEFSKELQNQFIKTSKTQKQTFIAFEEALIQLGGSYNLVNSLGLPTFIHKG ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHCCCC QILEPKIFDNNLNFTNQGNKNYLNFIFTNEGKKTEIPLEINGITPDLEIKNEIIKIKAEL CEECCEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEECCEEECCCCCCCHHCCHHEEEHHHH EEKIKLKESIQAELIRENLSLAKSFYVDKNNNPLISTTKNFENLFDYVQSEHLINTNKIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH NYITNINFKIKKNSEIPALELNNLLKDDKIRLEINVDISKVQQKLIKILNFKFDWDLKPD HHHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC LNQYARIFAQNLPEPKSEVFLLKKDENSAATSKKLVNIINKIKEFNNELDPENPDIKLVS HHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH QLYLLDFGKIGDEIAIENYKRELIITAKILKNQLVKVQEFSDDQVNKAQNNEKSLGKAIK HHHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHEEHHCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHH VLNIQRNLINDDISSDFILDNKEGDFTIEFSLISNKNKQKLATRKIKISNIVSSEMSAFD HHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHH DAAKFYPTFFLDGKSSFSKSDNKKGYEIIDLSDNNIHFEDDLDSKNQLTQEGFKLTNPIK HHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEE FQQNQSKTKENIARTVNISSPSFKSAPFSRLDSGLIYLAFKPKNINDYKKHYLLADSDGN ECCCHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHEEEEEECCCC GLFIQKIKNFKFINKNTTIQGIAGLKTEKTTQNSDITFIKPENLDQKNKDETQQKQVDGY EEEEEEECCEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCCE FIGLDFKQIKNFKSFQSYLYQNKKSLYSLANLFPPELIDKQAVILGPNSKPIKNFSAEIN EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHH QNLDNLAIVELANRIGENRFYRQELRNSSPFSLEKSKEIIEEDQDIVLEIIKTPSVEISA CCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEEEE FSSSNYQLNSKTSLNLNGKTIYNINPVSQKWSPFPNYLNLDWAQIGPNPKKTTDKNGSNN ECCCCEEECCCEEEEECCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCC EKINKNSSIILKGIAVYNDPELTTKTRNFARDQIRNAFIKAYIK CCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA