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The map label for this gene is dnaG

Identifier: 54020012

GI number: 54020012

Start: 72301

End: 74145

Strand: Direct

Name: dnaG

Synonym: mhp062

Alternate gene names: 54020012

Gene position: 72301-74145 (Clockwise)

Preceding gene: 54020011

Following gene: 161936260

Centisome position: 8.1

GC content: 27.32

Gene sequence:

>1845_bases
ATGAATAGACAAGAAATTATAACACATATAATAAAAAATACCGATATTTACGACCTAATTTCAAAAAAAATAAATTTAAA
ACCAAAAGGTCGAGATTCTTTTGTCGGTCTTTGCCCATTTCATGAAGATACAAATCCGTCGTTGTCAGTTTCTTTAAAAA
AACAAATTTTTAAATGTTTTTCGTGCCAAAAATCCGGTAACATTATAAATTTTGTAATGTTGGTACAAAATTTAAATTTT
TTAGAAGCCCTGCAATTCCTTGATAAGGAATATAATTTAAAACTTAAGCTAAATTATACCACAAAACTTGAAAAAAATTA
TTCAAAAGATGAGCTTCAAGCATTACGAGCCTTTGAAAATGCGGTTTCTATTTATTTAGTTGAACTTATCAAGATTTTCT
CTTTAGGCCAGCAGAATTTGATTATCGAAAATCCTATTTTTTCCCAGTTATTTAACTTCCTTAAATCACGCGGGATTACA
AGGGAAATTATCGAAAAATTTAAAATCGGATTTGTGCCCACAAACTCAATTTTAAAAAAATTTTTAATTGATTCAAAATT
TTTTGATGGCGAGGTTTTGATGAATTATTCACTTCTAACTGTTAATGGAAATGATTTTTTTCAAAAAAGACTTGTTTTTC
CGATTGAAAATTTTGAAGGAAAAGTGGTTGGATTCTCTGGTCGCTGTTTAGATGATAAAATATGTCAACCAAAATATTTG
AATTCATCCTCGAATAGTTTGTTTTCAAAGACTGAAATTCTTTATAATTATGCAAACGCAATAAAGCAAAAACCAAAAGA
AATCATTATTACAGAAGGATTTTTTGATGTAATTGCTTTTTATAAGGCGGGAATTCAAAATGCAGTTGCGCTGATGGGAA
CAACTTTGACAAAAAAACACTGTGAAATGCTTAATAATTTTACAGTTCTACTCGCGCTCGATAGTGATAAAGCTGGAGTG
GAAGCTAGTCTAAAATCAGGACTTATTCTGGGACAAAACCGGATAAATACTTATATTTTAACAGGTTTTGAAGGCAAAGA
TCCAGATGAATATTTCAATACTTTTGGTTCAGAAGCACTTGTTAATAAACTAAGTAATCGAATAAATAGCTTTGATTTCG
CTTATGATTTTTATAAGAATTCTATAAAAAATAATTCAAGTGAGGAGATAAAAATTTTCATTGAAAAATTTAGTCCCTTT
TTAGAAATATTATATCACCAAAATCTGCAATTAGCGCAAATTTTTTTCAAAAAAATTAAGGAAGATTTTGGTGTTTCCCA
GGATAGCTTTAAATTTAGACCTTCAGTTCAACATTATAATGAATTAGAAAATACCTTAAAAGAAAATGAGGACCAAATTA
AAAGTATTCACATAAAAAAAACAACTAATTTATTATGTCTAGCAAAACCGATTTCAACCGAAATTCAAGAACTTAAAATT
TTAAGTCAAGTTTTAGATAATATTTTATACGATGACGGTGAAAAATATAATCGTTTTAAAGGAAAGCAATTTAAATTTCT
AAATCCATTAAATAATAAATTAATGGAAGAAATTAATATTTTTGGGTATAAAAGTCCAAAAATGCGGGAAAAGATAAAAA
CAAAATTAAAGGAAGTAAATGCTGAATTAGAAAATTTAATATTTAAAGGTCGCATAGAAAAACTCATAAACGAGGATTTA
AATTGAAAAAAAGAGAAAAATGCCGATGATTTAGACAATTTAATGGAATTAATACAAAAAACAAGAGGCAGAAAAGATGC
CGATAATATTCGTAAACTTCAACTTGATAAAGAAATGAATAATGAGTTTGTGGACAAGTTCTTTAAAAAAATTAGAGGTC
TATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTGAAAATAGCATTGTAACACTAAGATTTCGCGATACAACCGAGCAAAAAACACTAAAAATTGACGAAATAACTAAATT
TATCAAGGAAAATTTTGTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAGAAAAAGGTGGGTGTTTATGCTAAAAAAACAGTTAAAATTCCCAAAACAAGAGAGTTTTATTGATTTTTCGTTGCTA
GAAAAAACGCAGAAAACAAA

Product: DNA primase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 614; Mature: 614

Protein sequence:

>614_residues
MNRQEIITHIIKNTDIYDLISKKINLKPKGRDSFVGLCPFHEDTNPSLSVSLKKQIFKCFSCQKSGNIINFVMLVQNLNF
LEALQFLDKEYNLKLKLNYTTKLEKNYSKDELQALRAFENAVSIYLVELIKIFSLGQQNLIIENPIFSQLFNFLKSRGIT
REIIEKFKIGFVPTNSILKKFLIDSKFFDGEVLMNYSLLTVNGNDFFQKRLVFPIENFEGKVVGFSGRCLDDKICQPKYL
NSSSNSLFSKTEILYNYANAIKQKPKEIIITEGFFDVIAFYKAGIQNAVALMGTTLTKKHCEMLNNFTVLLALDSDKAGV
EASLKSGLILGQNRINTYILTGFEGKDPDEYFNTFGSEALVNKLSNRINSFDFAYDFYKNSIKNNSSEEIKIFIEKFSPF
LEILYHQNLQLAQIFFKKIKEDFGVSQDSFKFRPSVQHYNELENTLKENEDQIKSIHIKKTTNLLCLAKPISTEIQELKI
LSQVLDNILYDDGEKYNRFKGKQFKFLNPLNNKLMEEINIFGYKSPKMREKIKTKLKEVNAELENLIFKGRIEKLINEDL
NWKKEKNADDLDNLMELIQKTRGRKDADNIRKLQLDKEMNNEFVDKFFKKIRGL

Sequences:

>Translated_614_residues
MNRQEIITHIIKNTDIYDLISKKINLKPKGRDSFVGLCPFHEDTNPSLSVSLKKQIFKCFSCQKSGNIINFVMLVQNLNF
LEALQFLDKEYNLKLKLNYTTKLEKNYSKDELQALRAFENAVSIYLVELIKIFSLGQQNLIIENPIFSQLFNFLKSRGIT
REIIEKFKIGFVPTNSILKKFLIDSKFFDGEVLMNYSLLTVNGNDFFQKRLVFPIENFEGKVVGFSGRCLDDKICQPKYL
NSSSNSLFSKTEILYNYANAIKQKPKEIIITEGFFDVIAFYKAGIQNAVALMGTTLTKKHCEMLNNFTVLLALDSDKAGV
EASLKSGLILGQNRINTYILTGFEGKDPDEYFNTFGSEALVNKLSNRINSFDFAYDFYKNSIKNNSSEEIKIFIEKFSPF
LEILYHQNLQLAQIFFKKIKEDFGVSQDSFKFRPSVQHYNELENTLKENEDQIKSIHIKKTTNLLCLAKPISTEIQELKI
LSQVLDNILYDDGEKYNRFKGKQFKFLNPLNNKLMEEINIFGYKSPKMREKIKTKLKEVNAELENLIFKGRIEKLINEDL
N*KKEKNADDLDNLMELIQKTRGRKDADNIRKLQLDKEMNNEFVDKFFKKIRGL
>Mature_614_residues
MNRQEIITHIIKNTDIYDLISKKINLKPKGRDSFVGLCPFHEDTNPSLSVSLKKQIFKCFSCQKSGNIINFVMLVQNLNF
LEALQFLDKEYNLKLKLNYTTKLEKNYSKDELQALRAFENAVSIYLVELIKIFSLGQQNLIIENPIFSQLFNFLKSRGIT
REIIEKFKIGFVPTNSILKKFLIDSKFFDGEVLMNYSLLTVNGNDFFQKRLVFPIENFEGKVVGFSGRCLDDKICQPKYL
NSSSNSLFSKTEILYNYANAIKQKPKEIIITEGFFDVIAFYKAGIQNAVALMGTTLTKKHCEMLNNFTVLLALDSDKAGV
EASLKSGLILGQNRINTYILTGFEGKDPDEYFNTFGSEALVNKLSNRINSFDFAYDFYKNSIKNNSSEEIKIFIEKFSPF
LEILYHQNLQLAQIFFKKIKEDFGVSQDSFKFRPSVQHYNELENTLKENEDQIKSIHIKKTTNLLCLAKPISTEIQELKI
LSQVLDNILYDDGEKYNRFKGKQFKFLNPLNNKLMEEINIFGYKSPKMREKIKTKLKEVNAELENLIFKGRIEKLINEDL
N*KKEKNADDLDNLMELIQKTRGRKDADNIRKLQLDKEMNNEFVDKFFKKIRGL

Specific function: DNA primase is the polymerase that synthesizes small RNA primers for the Okazaki fragments on both template strands at replication forks during chromosomal DNA synthesis [H]

COG id: COG0358

COG function: function code L; DNA primase (bacterial type)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 Toprim domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789447, Length=371, Percent_Identity=30.188679245283, Blast_Score=179, Evalue=4e-46,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR007693
- InterPro:   IPR016136
- InterPro:   IPR013264
- InterPro:   IPR006295
- InterPro:   IPR006171
- InterPro:   IPR002694 [H]

Pfam domain/function: PF00772 DnaB; PF01751 Toprim; PF08275 Toprim_N; PF01807 zf-CHC2 [H]

EC number: 2.7.7.-

Molecular weight: Translated: 71128; Mature: 71128

Theoretical pI: Translated: 9.39; Mature: 9.39

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNRQEIITHIIKNTDIYDLISKKINLKPKGRDSFVGLCPFHEDTNPSLSVSLKKQIFKCF
CCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHH
SCQKSGNIINFVMLVQNLNFLEALQFLDKEYNLKLKLNYTTKLEKNYSKDELQALRAFEN
HCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
AVSIYLVELIKIFSLGQQNLIIENPIFSQLFNFLKSRGITREIIEKFKIGFVPTNSILKK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
FLIDSKFFDGEVLMNYSLLTVNGNDFFQKRLVFPIENFEGKVVGFSGRCLDDKICQPKYL
HHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHCCEEECCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCC
NSSSNSLFSKTEILYNYANAIKQKPKEIIITEGFFDVIAFYKAGIQNAVALMGTTLTKKH
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CEMLNNFTVLLALDSDKAGVEASLKSGLILGQNRINTYILTGFEGKDPDEYFNTFGSEAL
HHHHCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHCCEEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHCCHHHH
VNKLSNRINSFDFAYDFYKNSIKNNSSEEIKIFIEKFSPFLEILYHQNLQLAQIFFKKIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
EDFGVSQDSFKFRPSVQHYNELENTLKENEDQIKSIHIKKTTNLLCLAKPISTEIQELKI
HHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEEEEEECCCEEEEECCHHHHHHHHHH
LSQVLDNILYDDGEKYNRFKGKQFKFLNPLNNKLMEEINIFGYKSPKMREKIKTKLKEVN
HHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
AELENLIFKGRIEKLINEDLNKKEKNADDLDNLMELIQKTRGRKDADNIRKLQLDKEMNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCH
EFVDKFFKKIRGL
HHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNRQEIITHIIKNTDIYDLISKKINLKPKGRDSFVGLCPFHEDTNPSLSVSLKKQIFKCF
CCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHH
SCQKSGNIINFVMLVQNLNFLEALQFLDKEYNLKLKLNYTTKLEKNYSKDELQALRAFEN
HCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
AVSIYLVELIKIFSLGQQNLIIENPIFSQLFNFLKSRGITREIIEKFKIGFVPTNSILKK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
FLIDSKFFDGEVLMNYSLLTVNGNDFFQKRLVFPIENFEGKVVGFSGRCLDDKICQPKYL
HHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHCCEEECCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCC
NSSSNSLFSKTEILYNYANAIKQKPKEIIITEGFFDVIAFYKAGIQNAVALMGTTLTKKH
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CEMLNNFTVLLALDSDKAGVEASLKSGLILGQNRINTYILTGFEGKDPDEYFNTFGSEAL
HHHHCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHCCEEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHCCHHHH
VNKLSNRINSFDFAYDFYKNSIKNNSSEEIKIFIEKFSPFLEILYHQNLQLAQIFFKKIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
EDFGVSQDSFKFRPSVQHYNELENTLKENEDQIKSIHIKKTTNLLCLAKPISTEIQELKI
HHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEEEEEECCCEEEEECCHHHHHHHHHH
LSQVLDNILYDDGEKYNRFKGKQFKFLNPLNNKLMEEINIFGYKSPKMREKIKTKLKEVN
HHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
AELENLIFKGRIEKLINEDLNKKEKNADDLDNLMELIQKTRGRKDADNIRKLQLDKEMNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCH
EFVDKFFKKIRGL
HHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: Transferring phosphorus-containing groups; Nucleotidyltransferases [C]

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA