| Definition | Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002942 |
| Length | 3,397,754 |
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The map label for this gene is 52842367
Identifier: 52842367
GI number: 52842367
Start: 2401678
End: 2406279
Strand: Direct
Name: 52842367
Synonym: lpg2153
Alternate gene names: NA
Gene position: 2401678-2406279 (Clockwise)
Preceding gene: 52842366
Following gene: 52842368
Centisome position: 70.68
GC content: 40.37
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TTAAAACTATTATCCTATAATTAAGTATACAAAGTGTGAATATTCGTATCCATTAGAATCAGTATTTGCATGTACAAACA TCAGTTTGGGAGAAAGTAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases GGAGTATTTTTTAAGTGTTTGTTCAATTGTTAAATGAAGTAATGAATAGTACAAAGCTGTGGCAGATGAGAAGGCAAAAC ATCATATTATTTGTTTCTCA
Product: Sid related protein-like
Products: NA
Alternate protein names: Sid Related Protein-Like; Sid -Like Protein; SdeC Protein; Sid Proteins; SdeA Protein; SidE Protein
Number of amino acids: Translated: 1533; Mature: 1532
Protein sequence:
>1533_residues MPKYVEGVELTQEGMHAIFARMGHGDITSGSIYNGVPTIDTEALNRQGFMPVLTGVGPRRDSGHWIMLIKGPGNQYFLFD PLGKTSGEGYKNTLLAQLPIASTLSVIPNEPGLNKGLCGYWVASVGLKARSELSKDNPPNLETLGQITTDAMKDELTDNG YLKITGWLKAVADKFPEGDPQPDAKALRQTTEKDLHIEIPSPVSPIKDTAPKEVSTKPTAPQVAPKHSLDSKLLENDDDV LDTIKYVHKEYLGKPYPGPLKNPKAPEEGRLPPNEGPDRGPHGLAHTVRTMACAEVMIEEARKAQLRGETLGKAKNGQTL ADVTPEELKKILIAQAFFVVGRDDERSGYDDVHKRNFYAEYHEKSEQAFRKYVEDNKLIGKIFKDQKEVDFYAAIILDKN HEWDATPAHILINQGHMVDLMRTKAPAEVALERTYNTLKGTVGSKGAEVVLKAHRDFFFATGAVVPLVNPEAIDDPSRGG PYENPYSGEKFVIVDDKVPASKKDLPKAVNRDYKLKDNERFLTIKEYYAFPDVQQTYPGYKTRLEASSYYFPTPFAGECE QNPAKCLGAIQKARSKLQTDAIKNGFQSSSEKERRQPNMDEIAAARIIQQIMANPDCIHDDHVLINGQKLEEKFFRDLLA KCDMAVVGSLLNDTDIKNIDTLMRHEKNTEFHSTDPKAVPVKIGDAWENRIRTKGGDVTQMKHDLIFLMQNDAWYFSRVN AIAQNRDKGSNFKEVLFTTLMTPLTNKSLIDTSHVPAPKKLYRGLNLPQEFTNKLINQSNAIIANTENTLFTDLSAEAFK QIKLNDFSQMSGKTCASTTKNMKLLTDIWGSNVIFEMLDPDGLLHPKQVGTHMAGSEDEFSVYLPEDVALVPTKVTLEGK TDTGEDRYIFTLVAVKSPDFIPRHESGYAVEPFMKMQKEKVTQALDAIEKDKDSYNIDEQLKSLRTEMVRQAKLPLREGV FDRLSHRLSLETSDNKISPERRDFLNQHVIPVLQECHIALRANDMDMMQKALAKFPTDKQWSAFKSGEAVRAKAQMDVLK QQIEKKIMLQTQIIPALTECGEALDKQNVTEALQALNKLPAEKEIGKVKTIGQELRGQIVGVKQELTGNLEPLQRATTTP IVQDAEKIKVRYETLLTDVTKRVTDFEKIKPANLDGYNKAIADLNNIQQELNLLRNEKIRMHTDKDKAVDFSDIEALDKR LQDVQSKLPTQLLEQTSKDVAKLAKMPEKITFNDIKSMTSKMNNYLETLELIRNDRIKKHAGSTDPLDMSDLDGLKGQLQ TYNQSMADILLRAAKSSLDKIKDPATFEKESPYIKQCFDHLAELEKTLDDSDKGRKQKEDFTAYKSALMDKQEKAYPEML QLQYKSEALIMQLRDICKIHHDNLAEARRVRLQQLDSQGGGLLGGLWAVTNTIGLTTDNVNIEKMQIRMKEQTLRAFKTE LTNDKLNTDQVIAFLAKGSPSELQEALGISKENAEQLHGLLKQLEIKTASTDKLQEIEKLIDEVSTKIGKEPVKQDHTIT IDEEESDDIRYGF
Sequences:
>Translated_1533_residues MPKYVEGVELTQEGMHAIFARMGHGDITSGSIYNGVPTIDTEALNRQGFMPVLTGVGPRRDSGHWIMLIKGPGNQYFLFD PLGKTSGEGYKNTLLAQLPIASTLSVIPNEPGLNKGLCGYWVASVGLKARSELSKDNPPNLETLGQITTDAMKDELTDNG YLKITGWLKAVADKFPEGDPQPDAKALRQTTEKDLHIEIPSPVSPIKDTAPKEVSTKPTAPQVAPKHSLDSKLLENDDDV LDTIKYVHKEYLGKPYPGPLKNPKAPEEGRLPPNEGPDRGPHGLAHTVRTMACAEVMIEEARKAQLRGETLGKAKNGQTL ADVTPEELKKILIAQAFFVVGRDDERSGYDDVHKRNFYAEYHEKSEQAFRKYVEDNKLIGKIFKDQKEVDFYAAIILDKN HEWDATPAHILINQGHMVDLMRTKAPAEVALERTYNTLKGTVGSKGAEVVLKAHRDFFFATGAVVPLVNPEAIDDPSRGG PYENPYSGEKFVIVDDKVPASKKDLPKAVNRDYKLKDNERFLTIKEYYAFPDVQQTYPGYKTRLEASSYYFPTPFAGECE QNPAKCLGAIQKARSKLQTDAIKNGFQSSSEKERRQPNMDEIAAARIIQQIMANPDCIHDDHVLINGQKLEEKFFRDLLA KCDMAVVGSLLNDTDIKNIDTLMRHEKNTEFHSTDPKAVPVKIGDAWENRIRTKGGDVTQMKHDLIFLMQNDAWYFSRVN AIAQNRDKGSNFKEVLFTTLMTPLTNKSLIDTSHVPAPKKLYRGLNLPQEFTNKLINQSNAIIANTENTLFTDLSAEAFK QIKLNDFSQMSGKTCASTTKNMKLLTDIWGSNVIFEMLDPDGLLHPKQVGTHMAGSEDEFSVYLPEDVALVPTKVTLEGK TDTGEDRYIFTLVAVKSPDFIPRHESGYAVEPFMKMQKEKVTQALDAIEKDKDSYNIDEQLKSLRTEMVRQAKLPLREGV FDRLSHRLSLETSDNKISPERRDFLNQHVIPVLQECHIALRANDMDMMQKALAKFPTDKQWSAFKSGEAVRAKAQMDVLK QQIEKKIMLQTQIIPALTECGEALDKQNVTEALQALNKLPAEKEIGKVKTIGQELRGQIVGVKQELTGNLEPLQRATTTP IVQDAEKIKVRYETLLTDVTKRVTDFEKIKPANLDGYNKAIADLNNIQQELNLLRNEKIRMHTDKDKAVDFSDIEALDKR LQDVQSKLPTQLLEQTSKDVAKLAKMPEKITFNDIKSMTSKMNNYLETLELIRNDRIKKHAGSTDPLDMSDLDGLKGQLQ TYNQSMADILLRAAKSSLDKIKDPATFEKESPYIKQCFDHLAELEKTLDDSDKGRKQKEDFTAYKSALMDKQEKAYPEML QLQYKSEALIMQLRDICKIHHDNLAEARRVRLQQLDSQGGGLLGGLWAVTNTIGLTTDNVNIEKMQIRMKEQTLRAFKTE LTNDKLNTDQVIAFLAKGSPSELQEALGISKENAEQLHGLLKQLEIKTASTDKLQEIEKLIDEVSTKIGKEPVKQDHTIT IDEEESDDIRYGF >Mature_1532_residues PKYVEGVELTQEGMHAIFARMGHGDITSGSIYNGVPTIDTEALNRQGFMPVLTGVGPRRDSGHWIMLIKGPGNQYFLFDP LGKTSGEGYKNTLLAQLPIASTLSVIPNEPGLNKGLCGYWVASVGLKARSELSKDNPPNLETLGQITTDAMKDELTDNGY LKITGWLKAVADKFPEGDPQPDAKALRQTTEKDLHIEIPSPVSPIKDTAPKEVSTKPTAPQVAPKHSLDSKLLENDDDVL DTIKYVHKEYLGKPYPGPLKNPKAPEEGRLPPNEGPDRGPHGLAHTVRTMACAEVMIEEARKAQLRGETLGKAKNGQTLA DVTPEELKKILIAQAFFVVGRDDERSGYDDVHKRNFYAEYHEKSEQAFRKYVEDNKLIGKIFKDQKEVDFYAAIILDKNH EWDATPAHILINQGHMVDLMRTKAPAEVALERTYNTLKGTVGSKGAEVVLKAHRDFFFATGAVVPLVNPEAIDDPSRGGP YENPYSGEKFVIVDDKVPASKKDLPKAVNRDYKLKDNERFLTIKEYYAFPDVQQTYPGYKTRLEASSYYFPTPFAGECEQ NPAKCLGAIQKARSKLQTDAIKNGFQSSSEKERRQPNMDEIAAARIIQQIMANPDCIHDDHVLINGQKLEEKFFRDLLAK CDMAVVGSLLNDTDIKNIDTLMRHEKNTEFHSTDPKAVPVKIGDAWENRIRTKGGDVTQMKHDLIFLMQNDAWYFSRVNA IAQNRDKGSNFKEVLFTTLMTPLTNKSLIDTSHVPAPKKLYRGLNLPQEFTNKLINQSNAIIANTENTLFTDLSAEAFKQ IKLNDFSQMSGKTCASTTKNMKLLTDIWGSNVIFEMLDPDGLLHPKQVGTHMAGSEDEFSVYLPEDVALVPTKVTLEGKT DTGEDRYIFTLVAVKSPDFIPRHESGYAVEPFMKMQKEKVTQALDAIEKDKDSYNIDEQLKSLRTEMVRQAKLPLREGVF DRLSHRLSLETSDNKISPERRDFLNQHVIPVLQECHIALRANDMDMMQKALAKFPTDKQWSAFKSGEAVRAKAQMDVLKQ QIEKKIMLQTQIIPALTECGEALDKQNVTEALQALNKLPAEKEIGKVKTIGQELRGQIVGVKQELTGNLEPLQRATTTPI VQDAEKIKVRYETLLTDVTKRVTDFEKIKPANLDGYNKAIADLNNIQQELNLLRNEKIRMHTDKDKAVDFSDIEALDKRL QDVQSKLPTQLLEQTSKDVAKLAKMPEKITFNDIKSMTSKMNNYLETLELIRNDRIKKHAGSTDPLDMSDLDGLKGQLQT YNQSMADILLRAAKSSLDKIKDPATFEKESPYIKQCFDHLAELEKTLDDSDKGRKQKEDFTAYKSALMDKQEKAYPEMLQ LQYKSEALIMQLRDICKIHHDNLAEARRVRLQQLDSQGGGLLGGLWAVTNTIGLTTDNVNIEKMQIRMKEQTLRAFKTEL TNDKLNTDQVIAFLAKGSPSELQEALGISKENAEQLHGLLKQLEIKTASTDKLQEIEKLIDEVSTKIGKEPVKQDHTITI DEEESDDIRYGF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 172371; Mature: 172240
Theoretical pI: Translated: 6.27; Mature: 6.27
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPKYVEGVELTQEGMHAIFARMGHGDITSGSIYNGVPTIDTEALNRQGFMPVLTGVGPRR CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHCCCCCC DSGHWIMLIKGPGNQYFLFDPLGKTSGEGYKNTLLAQLPIASTLSVIPNEPGLNKGLCGY CCCCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHH WVASVGLKARSELSKDNPPNLETLGQITTDAMKDELTDNGYLKITGWLKAVADKFPEGDP HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCCC QPDAKALRQTTEKDLHIEIPSPVSPIKDTAPKEVSTKPTAPQVAPKHSLDSKLLENDDDV CCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCHHH LDTIKYVHKEYLGKPYPGPLKNPKAPEEGRLPPNEGPDRGPHGLAHTVRTMACAEVMIEE HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH ARKAQLRGETLGKAKNGQTLADVTPEELKKILIAQAFFVVGRDDERSGYDDVHKRNFYAE HHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHH YHEKSEQAFRKYVEDNKLIGKIFKDQKEVDFYAAIILDKNHEWDATPAHILINQGHMVDL HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEECCCCEEHH MRTKAPAEVALERTYNTLKGTVGSKGAEVVLKAHRDFFFATGAVVPLVNPEAIDDPSRGG 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA