Definition Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome, complete genome.
Accession NC_002942
Length 3,397,754

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The map label for this gene is traI [H]

Identifier: 52842291

GI number: 52842291

Start: 2319208

End: 2325153

Strand: Reverse

Name: traI [H]

Synonym: lpg2077

Alternate gene names: 52842291

Gene position: 2325153-2319208 (Counterclockwise)

Preceding gene: 52842292

Following gene: 52842290

Centisome position: 68.43

GC content: 39.14

Gene sequence:

>5946_bases
ATGTTAAGTCTTCAGCCATTAGACAGTGCCGATGGAGCCGCAGCCTACTATCTAGATGTCGTCAATTATTATGAAAACGA
TTCTAAAAGTGTTCGTTGGTTAGGAGATGGAGCGAAAATTCTTGGGATCCACGGGCAAGCAGTAGAAAAAGAACAGATGA
TTGCCCTTCTGAAAGGCATATTACCTGATGGTACTCAACTCGGTCGAATCGATAAGGATGGTATTCATCATCGCCCCGGT
TTTGATATGACCCTTACTGCCCCAAAGTCTTTTTCAATTTTACTTGAAAGTGGTGCTGATCCAAGGCTTGGAGAGGTGTT
TGATAAGGCCGTAGAATGGTTCGTTGAAGAAATGGAAAAGGAGTTTGCACAAGCCAGGCAACTTGTTGACGGCAAAATTG
AATATATTGATACCAGAAATTTAGTCATTGCAGCATTTCGTCAACCAAGCTCTCGTGCCAATGATCCTAATTCACATACG
CACCTTGTAGTTCAAAATATGACCCACTGCCCAGATGGGAAGTGGCGCTCGCTTGCCAGTGACATGGATGGTCAAAAAGG
CGTGGTTGAACAAATCATGAAGCACCATATCTATGGCGGGCTTAAATTTCGTAACAAATTAGCGAATTTAACCAAAGAAC
TTGGCTATCAGCTGGCATCTGATGGTGATGGTTTGTGGGAAATCCAGGGTGCACCTGAGCAGGTATTAACTCATTTTTCA
AAAAGAAGGGAATCCATCGAAGCATTACTTGACGAAAAAGGCTGGAGTGGTGCTAAAGCATCCTCGATTGCGGCTCAAAA
AACAAAATTGGATAAAGAAATCATTGATTATGAGAAATGGAAAGAAGACATCATCAAAGAATGCCAGGAAATGGGCTTTG
ATCCACATCAACTAGTGGCTTCATCGTATAAGCCTCAGAAAAATCTCTTTCAAACTTTAAAGGAAAACATTGTTGAGCGC
TTTTATGGTAAGGATAACATCGAAATGACTCATGCCAGAGAGTCTGTGTATGTGGCCATTGAATCAATCAGTCAACAGCA
TGCGGTGTTTGAGGAAAGGGAACTTAAAAAAGAAGCGCTAAAATATGTAATCGCCAGCAATAAGATAATCGATGAAACCT
TAATTAATAAAGCCATTGATGAAAACATTGCAAATCAAAACCTGTATACGGCAAGACACCCCTTCACACAAAAGCCTTTA
TTGACAACGCCCTGGCAACTAACACTTGAGAGCGAGGCCATCCAGCGTATTGAAAATGGTAAAGGTGCTGTTTCTGCTAT
TTGTTCGAAACAAAAAGTCAGTGAGTTTATAAAAGCAAAAGAACAGGAGATGGCATTTGCTTTATCCCCTTCACAGAAAA
AAGCTATGACAACCTTCCTAACCTCAACAGACCGATTTATTGCCATTCAAGGGTATGCAGGAACTGGTAAAACCACGATG
CTACGTTTGACTCGTGAATTAGCATCTCTTCAGGGCTATGAAATTCGTGGTATTACCGCAGGCTCGGCAGCCGCCAATGA
ACTGCGCCATAAAGGAGGGTTAAATGCTTCTACCTTTGCAAGAGAGTTAGGGAGATTGCAAAATCAGAAACAGGACTTAA
GTAAAACCATATTTGTGGTGGACGAAGCCTCTATGTTATCTAATCCACAAGGACATAAAATCATCAAACTGGCAGAACAG
TTTAATACCCAGTTAAAGATCATTGGCGATAAAGCCCAGCTTCCTTCCCCATCCAGCGGGAAATTATTCTCTGTCATTCA
AGATTATGGGATTAAAACCGTTGCCATGACGGATAATCTTCGCCAGAAAGACTCAGAATTAAGGGAATCAGCAATTCATG
CTGGTAGAGGTGAAATCTATGATGCCGTTGATAAGTTAACTCATGTGGAAACGCTTGATACTTATTTAAAACGGGTTGAT
TATATTTCAAGTAAATGGTTGTCATTAACACCAGAAGAACGCCAAAACACACTATGCTTTGCCCCAACGCACAGAAATCG
CCAGGATATAACTCAGATTTTACGAAACGCTTTAATTCAAGAAGGGACACTAACCGGACAAGAGCATCTGCAACCCATAT
TAAAAGAACGCAATTTAACTGGAATTAAGCTCAGAAATGCAGCTTATTATAGTCAAAACGATATCATTCGTTTTAATCAT
ACTATTCAGCGGTATAACATCAAAGCAGGAGATTATTTAACTGTTGGGCAGGTCACTAACAAAAACAAGCATAATAATAC
ACTGATTCTTAAGCATGAAAATGGTCAAGCCATAAAATTTAAATTGTCCTCACTACCTGAATTTAGAACTGAAAACAAAG
ATTTGGAACGGCCTGTTGAAGTATATCGGCGAGAACAATTGAGTCTAATGGCCGGTGATCAAATTCAATGGAAACGTAAT
TCTGAACACAATGGTATTCGCAACTCTGAATTGGCAACCATCAGACAAATCAACAATGAGGGAATAACAATCATAACGGA
AGACAATCAAACCCTACACTTACCTCACGGAGCAAAAGAACTACGACATCTTGATCATGGCTATGTACTCACGACCTATG
CTACCCAGGGAAAAGATAAAAAAAGAGGTCTTGGCCTTATTGAAAGCCAAAACCGATTTGCATCAACCATCCAAAACTAT
TACGTGGAAACAACCCGTGGTATTTGGGAAATGATAGTAGTCACGGACGATAAAGATCATCTGGTTAAAGCCATTACCAC
CAATAACAGTGACAAGTACTCCTCAATGGATATGGTTGATTCAGATACTCTGAAAGCTCATGAAGCACGTTTTAAAGAGC
ACAAAAACAGCATAGTCTTACAAAATGCCATTGAAAAAAAATTATCGAAAGAACAGGACTGGAAGGGCTTGGAACAGACA
GTAGAAACCTATGTTCAATGCAAACAACAAGGGGAAGATCGAAAAGCGGCAAAATTAGCATTTGCCATTGTGAATGATCC
CAAATTGTATCGCCTTGCCAAAGAACGCTTGGGTTTTGGTGTTAGTACCTATCGGCGTGAAGCCCTGCGTTTCCAAACCT
CGAAGTTATTACATTCACTACCCAAATCAGAAAGGCAGGATTTTTCTACTGTCAGGCAGTACGTGTTTTTAAACCAACAA
ATCCTTAAACGAAGTCAGCATATCAATGCCCAATCGTTGGATAATGGAATTTCAAATCAGAATAAACAAGCTCTGCAACA
ACAGTCCGCTAAACGCAATGCAGTAGCTTTTGTAATTAGTAGGGATCTGGAGCGTTATAAACCTTATTTGCAGCATTTTT
CCATCGGAGAACTAAACCGAATTGGATTGCCACAGCATGAATATGGCAAGGAATTTAAAAAAGCACAGATGCGCCTGGAA
TCACTTGGCAAGCAGGCAACAAGGGACTTAATACGTACCAATATTTCGCTTTATTTAAACGCACAAGGCGAAGAGAAAGA
AAGGCTTGCAGTCCAAATTAAAAGAGAATCCAAGTTATCACATTCTTTTGTTTTAACCCATGCAAAAGAATTGAATCAAA
AGCCTGAATCATTATGGCAATCCATACATAAAGATGCGCGTTTGCATAGCGATAAATTGTTTCGAAATGGATTAAGTGCT
GAGGGAAGATTGGCGTTCGATAACATCAAAGCCTATAAAGCATTACAGCTTGAGCTTAGAGAAAATTGGTCAGCAAGTTT
AAAAGAAGCGGGAAACAGTGAAGGGAAGAGTAGTAATCCAAAATCTATTGAGTTACTCACCCGCCGCAATGAGTTAGCTC
ACGAATTGATGCAAAACAAAGCCATGCCTGAAATAGCCTCTTATTTCAAGCTGGATTTGGCAAAGTTAGCAGTACAAACA
GAAAAACAGCAGTATCGGGAAAACATCAAGCAATTTACGGCAAGTAAGTCTAATTTCAAAACACGTCTTGCAGTAATTAA
TGAGATTAAAAATGATATCACTGGCCATTATCCCTTTATTAAAGAAGCAAATATTGAATCTAAAACCCTTAGTAAATATC
TACGAGTTACCGACAGAAAGGAACGATTATCTAATATTTCTTCACCTGAGAAAAAAGACTATCAATGTTTCCTGACTTAC
AAAAAAGCCAGTATGCAAACTTACAGGCTTTGGCAGCAGGCGCACCTTAATAAAGCTGATGGCAATGTACAAAATAACAA
GCTGATATCAGCAGCAATCAGTCAGTCATCAAAACGTGATGCATTGGCTCATCAATTAAAAGGCTCAAAGTACCTTGATT
CAATTTTATCCTATGAAAAAGGCAACAAAGAAAAGCTGTTAGCCCAGGCTAGCAACCACCAAATAAAATTGCGTGAAATT
AAGGAGCTAAATGAAGTCGTACACACACTATCAATGCAGTTCCCTAGCGTCACAAACTCTAATTCTGCAAAAGAAATATC
AGCCTGGAAAAAGAACTGGTTATCTCTTTCCAGTCATATGAAGCAAATTGAAAAGGGCAGCGGTTATCAATTAGCTTTGC
AAGAATATCCATTGAATGTGTCATCTGTAAATACAATTAATAAGGAATTAGAAAATAACTACGATTTTAAGCCAGAAACG
ATCACCCAAAAATCATTGCAATCAACCAATCCGGTCTTACAAAAAATCCAACAATCTGCACAATTTTTGGATGCCAGAAT
TATTAATGAAGCTCTGATGGCCGACCCAGAAACTACCTATAAAACAATCTGGGGTGAGCCAAAAACACAAAACTCCAGAG
AGTTACGTTATTCTGGTGGCTTAATTGTAAGCTTGAAAGGCAAGGACAAAGGCTTATGGCATGATTTCAGTGACGGAATA
GGAGGCGCGCCGATTCAAGCGATTATTGCTAGAGATAAGCTGTCCTTTAAAGAAGCACTCTCTCAAGCTGCGTCCATGGT
AGGCATAAATCAATTAGAAAACCTTTCCATATTCATAAAAGCCCCCATTTCCAGTAAAAATGAATTACAAAAATTAAATG
ACCTTGAAAAGAAGAACAAAGTAATTTCTGCAAAAAGTATCTGGGATGGTTCTATTCTTGCAAAGGGAACATTGGCCGAA
AAATATTTAAAACAACATCGGGGCATAGAATCCATTGATAAAATGGATATACGTTTCTGGCCCACTGGATCTCAATGGAA
AAACTGCAATGAACAAGGATTATTGGAAGATAAAGTTAATAAAATCCCAGCATTAATCATTGCTGCAAGAAATGAAAAAA
ATGAACTAACAGGCGTTCAACGAATTTATCTGGACAAGCAAACAGCCAGTAAAAATAAATTCATGGACAACCCAAAGCTA
TCCAAAGGAATCATAGACGGCAGTTGTGGCGTTATTCAAAAAGGAATGCAAGGATCCCGCCTTTATATCGCCGAAGGTTT
TGAAACAGGTGCTTCCATCGCTCTCGCGGACAGCAAAGCCACAGTTTTATGCTCCTTTGGCGTTTCAAACATGAAGAACT
TAAGCCCAATCATCAAAAAATTCCATTCAAAAGAAGTTGTTATTGCAGGAGATAATGATGGAGAGTTCGCTAAATCACAA
CAAGCCATCGAAAAAACAATTAATGCCTTTAAACAAGATAACTTAAGTGCCAGAGCAGTATTTCCCGATGGGTTGCAGGG
AAAAGCAAAAACAGACTGGAACGATATTCATTTAAGCAAAGGGATTGCAGAAATCCAAAAGCAACTAATGAGAAAGGATA
TAGGAGCCATTTCCTCAATCGTTGATAAGCCAATTGAACTACCAAAAACAATTGCCGATTTTGTACAAATAAAGTCCATG
AAGTTAAGCGGCAGCCAAATCATTTCCATTAGAGACAATGCTGCAACCATTGACAATAAAAGAGACTTAAATCAATTAGT
CGCAGCTTACAACAAAAGTCAACAAGCATTAGAAAAATCTGGCTCCTTCACTCCTGAAAAAACACTGCCCACAAAAACAA
GGAGTGAAATAGAAATGGATCGTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAACAAAAAAAGATATCACAAAACCAATTGCAAGAGAAAAAAAGCTTGAGGAAGAAAAAGAGCTTGTTGAGTTTTTATAA
GAACAAATTGGGGGGTAAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATACACCAACCATAGCATAGCGTATGCTCACACTGAAAATATCTGCCATTGATACTAAATCAGGTGTTCATATTATTTTT
CTGTTTTAAACACATAATCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: DNA helicase I [H]

Number of amino acids: Translated: 1981; Mature: 1981

Protein sequence:

>1981_residues
MLSLQPLDSADGAAAYYLDVVNYYENDSKSVRWLGDGAKILGIHGQAVEKEQMIALLKGILPDGTQLGRIDKDGIHHRPG
FDMTLTAPKSFSILLESGADPRLGEVFDKAVEWFVEEMEKEFAQARQLVDGKIEYIDTRNLVIAAFRQPSSRANDPNSHT
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KLSGSQIISIRDNAATIDNKRDLNQLVAAYNKSQQALEKSGSFTPEKTLPTKTRSEIEMDR

Sequences:

>Translated_1981_residues
MLSLQPLDSADGAAAYYLDVVNYYENDSKSVRWLGDGAKILGIHGQAVEKEQMIALLKGILPDGTQLGRIDKDGIHHRPG
FDMTLTAPKSFSILLESGADPRLGEVFDKAVEWFVEEMEKEFAQARQLVDGKIEYIDTRNLVIAAFRQPSSRANDPNSHT
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>Mature_1981_residues
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KLSGSQIISIRDNAATIDNKRDLNQLVAAYNKSQQALEKSGSFTPEKTLPTKTRSEIEMDR

Specific function: TraI has been identified as DNA helicase I and it also has an additional activity of site-specific nicking at oriT. DNA helicase I is a potent DNA-dependent ATPase [H]

COG id: COG0507

COG function: function code L; ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To traI of plasmid IncFII R100 [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR014059
- InterPro:   IPR014129
- InterPro:   IPR009767
- InterPro:   IPR014862 [H]

Pfam domain/function: PF07057 TraI; PF08751 TrwC [H]

EC number: =3.6.4.12 [H]

Molecular weight: Translated: 224138; Mature: 224138

Theoretical pI: Translated: 9.79; Mature: 9.79

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLSLQPLDSADGAAAYYLDVVNYYENDSKSVRWLGDGAKILGIHGQAVEKEQMIALLKGI
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHC
LPDGTQLGRIDKDGIHHRPGFDMTLTAPKSFSILLESGADPRLGEVFDKAVEWFVEEMEK
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EFAQARQLVDGKIEYIDTRNLVIAAFRQPSSRANDPNSHTHLVVQNMTHCPDGKWRSLAS
HHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHH
DMDGQKGVVEQIMKHHIYGGLKFRNKLANLTKELGYQLASDGDGLWEIQGAPEQVLTHFS
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCEEEECCCHHHHHHHHH
KRRESIEALLDEKGWSGAKASSIAAQKTKLDKEIIDYEKWKEDIIKECQEMGFDPHQLVA
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
SSYKPQKNLFQTLKENIVERFYGKDNIEMTHARESVYVAIESISQQHAVFEERELKKEAL
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYVIASNKIIDETLINKAIDENIANQNLYTARHPFTQKPLLTTPWQLTLESEAIQRIENG
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHCC
KGAVSAICSKQKVSEFIKAKEQEMAFALSPSQKKAMTTFLTSTDRFIAIQGYAGTGKTTM
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHH
LRLTRELASLQGYEIRGITAGSAAANELRHKGGLNASTFARELGRLQNQKQDLSKTIFVV
HHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE
DEASMLSNPQGHKIIKLAEQFNTQLKIIGDKAQLPSPSSGKLFSVIQDYGIKTVAMTDNL
ECHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEECCCH
RQKDSELRESAIHAGRGEIYDAVDKLTHVETLDTYLKRVDYISSKWLSLTPEERQNTLCF
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCEEE
APTHRNRQDITQILRNALIQEGTLTGQEHLQPILKERNLTGIKLRNAAYYSQNDIIRFNH
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCEEECCCCEEEEEC
TIQRYNIKAGDYLTVGQVTNKNKHNNTLILKHENGQAIKFKLSSLPEFRTENKDLERPVE
EEEEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCHHCCCCCHHHHHH
VYRREQLSLMAGDQIQWKRNSEHNGIRNSELATIRQINNEGITIITEDNQTLHLPHGAKE
HHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEECCCCHHH
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HHHCCCCEEEEEEECCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCHHH
LVKAITTNNSDKYSSMDMVDSDTLKAHEARFKEHKNSIVLQNAIEKKLSKEQDWKGLEQT
EEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHCHHHHHHH
VETYVQCKQQGEDRKAAKLAFAIVNDPKLYRLAKERLGFGVSTYRREALRFQTSKLLHSL
HHHHHHHHHCCCCHHHHHEEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PKSERQDFSTVRQYVFLNQQILKRSQHINAQSLDNGISNQNKQALQQQSAKRNAVAFVIS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEHHHH
RDLERYKPYLQHFSIGELNRIGLPQHEYGKEFKKAQMRLESLGKQATRDLIRTNISLYLN
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEE
AQGEEKERLAVQIKRESKLSHSFVLTHAKELNQKPESLWQSIHKDARLHSDKLFRNGLSA
CCCCCCCHHEEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
EGRLAFDNIKAYKALQLELRENWSASLKEAGNSEGKSSNPKSIELLTRRNELAHELMQNK
CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
AMPEIASYFKLDLAKLAVQTEKQQYRENIKQFTASKSNFKTRLAVINEIKNDITGHYPFI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
KEANIESKTLSKYLRVTDRKERLSNISSPEKKDYQCFLTYKKASMQTYRLWQQAHLNKAD
CCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
GNVQNNKLISAAISQSSKRDALAHQLKGSKYLDSILSYEKGNKEKLLAQASNHQIKLREI
CCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHH
KELNEVVHTLSMQFPSVTNSNSAKEISAWKKNWLSLSSHMKQIEKGSGYQLALQEYPLNV
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCH
SSVNTINKELENNYDFKPETITQKSLQSTNPVLQKIQQSAQFLDARIINEALMADPETTY
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
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