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The map label for this gene is kefA [H]

Identifier: 52841791

GI number: 52841791

Start: 1724886

End: 1727105

Strand: Direct

Name: kefA [H]

Synonym: lpg1561

Alternate gene names: 52841791

Gene position: 1724886-1727105 (Clockwise)

Preceding gene: 52841790

Following gene: 52841792

Centisome position: 50.77

GC content: 33.29

Gene sequence:

>2220_bases
TTGGCAAGGAAGAGAATGGCCATGAGAATTTTTGTCATGATTTTGCTTTTCTTTTTTAGTATTTCCCCGACCTTGGGGGA
TAGCACTTTGCCTGCAATTTTTGATGTCAAAAATGCAAATAAACAATTTGATCAAATCAATCTCCAGTTGTCAGTACAAA
ATCTTAATTTAAATAACCTGAATAAGGCAGTAGAAACTCTCGGTGAACTGTCCGCGCAATCCGATGAATGTATAGCTGAT
ATACAGAAAAAAATAAATGGAGTGGATGTATTAATCAAACAAGCTACCTCTACAGGGAATGATAAAGGAGCTGATTTAGT
CTATCTGAATAATCAAAAGCATCAGTTAGCTGAGTTACAATCTCAATGTCGATTATTCTCAATTCGAGCTCAGGAAGCAA
TAGAAGCTTATAAAAGTGCTATTTTGCAATTAAGGCAAGAAAAGACTTTGGCGCGTACCTTACCATTATGGCAATTAGCA
AGTAAAATTATTAATTCATCTGATAATACCAAATGGATAAATCATACTAAAGAGAAATTTTTACTTCAGGATTTGCCTGT
ATATCTATGGTTTTGTATTGTTGCAGGAAGCTTTTTTATCTCTATCCTGATCTTGTCAAAATTACGGCAATCCAATGTTA
TACGCCGTTATGTGAAATTAAAAAAAATTCGCTGGTCTCATATTACACTTTTGGCTTTGTTTATGATGACGGGTTCATTT
TATGGCTACATTTCCCTATTTACTGCTGAAGAGCAGCTAATCAATTCTCAATTCCTTTTAATAAAGGAGCTTTTTTGGTT
TCTTTGCGGCACATTATTCATTGTTTGTTTATTCAAAGTCAAAAAAATCAAAGCTTTTTTTGATTGGTATGCTATGGATA
GTGAATTTTTTGAAATACTAAGCATTGTGATTGTTGCATTTTATTTCCTCGCATTATCAGAACAGAGATTATTTGATATT
TGGGAAGTCAATAAGATTATTGTGGAGTTAACTCGCTCCATCTTTCTTTTTTTATTGCTTGGTACAACCGCTTATTTTAC
TCACTATTTCTGCCGTTCTCATCTGCATATTTCTTTTGTAAAAAGACATTATAATTTTATTCGGTACTTTATTTTTGCAC
TGCTTTCAGGGTGCGCAATTCTTAATATTAATGGCTTTTATACTTTAGCCATGCAGCTTACTCTATCTGGGATTTTCACA
TTTTTTATCTTGTATATCACTATTTTAATAGGACAGAGTATTAATAAATTTTATGCTTCATTAAGTTACTCACAAGGTAA
ATTGAATGTTATACGAATATTCGGATATAAAAAGGATCAGATGCTTACTGAGTTTTATATTCTTAAAGTTACCTTAAAAC
TTGTTATTGTACTCCTAAGTGTCTATCTTATAGGGATATCCTGGGGTTTTGCTACTGATTTTATTGATACTGTTTATAAG
AAATTATTGTATGGCTTTACTCTGGCAAATATTACAATTTATCCAACGCGCATTCTCTTCGGAATCATAATTTTTTGTTT
TTTATATTTGGTGTCTCGCGCCATTTCAACTTCAATCAGTCGTCACCAACAGTTCGAAAACGAAGAAGAAACTCAGGTAG
CTATTGCTTCCATTTTGACTTATGTTGGATTCAGTATTGCTGTTATTTCAGGCTTACTCGTCGCGGGCTTTAATTTTACT
GGACTTGCCATTATCGCTGGAGCACTTTCTGTAGGAATTGGTCTTGGACTGCAAAGCATAGTTAATAATTTTGTATCAGG
TATAATTTTGCTTATTGAGAAACCAATAAGACCTGGAGATCGAATTAATATCGATGGTGTTGAAGGATTTGTAAAAAAAA
TCAGAGTCAGATCAACACAAATTCTCACTCCGGTAAATGAAGATATTATTATTCCAAACTCTGATTTAATTACACGCCGT
GTTGTCAATTATATGCTGACAGATAATTATTGGCGTGTTAATTGTGAGGTTAGCGTTGCTTTCGGGACAAACCTGAATCT
TGTTAAAGACATCCTTTTGGAGATCGCTAATAAGCATGATGATGTTGTAAAAAGTGGCAGAAACAAACCTGTTGTGTTAT
TTACCAGTTTTGCCGACAGTGCATTAACTTTTCAACTCTGGTGTATGATTAAAGATGTAAATAAAAAATCGACAGTCAAA
AGTGAATTAAATTTCTCTATTGAGGAGGCTTTTCGCAAGCATGACATTTCAATAACATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCTATATAAATTTAAATGCGAAAAATTTAATCCTAGTGATATTTTAAATTTCCTTCTTGAGATTCAATCCATAAGCAAG
TAGAGTTTATAGTTTGTTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTTAATGTGATTTTCATATTTGAATTGGAGATTAAATACTTTCCCTACTCTGGAAAATAATGCTTGGTATCATTAAACC
CTATCGATAATTAAGATATG

Product: potassium efflux system KefA

Products: NA

Alternate protein names: Protein AefA [H]

Number of amino acids: Translated: 739; Mature: 738

Protein sequence:

>739_residues
MARKRMAMRIFVMILLFFFSISPTLGDSTLPAIFDVKNANKQFDQINLQLSVQNLNLNNLNKAVETLGELSAQSDECIAD
IQKKINGVDVLIKQATSTGNDKGADLVYLNNQKHQLAELQSQCRLFSIRAQEAIEAYKSAILQLRQEKTLARTLPLWQLA
SKIINSSDNTKWINHTKEKFLLQDLPVYLWFCIVAGSFFISILILSKLRQSNVIRRYVKLKKIRWSHITLLALFMMTGSF
YGYISLFTAEEQLINSQFLLIKELFWFLCGTLFIVCLFKVKKIKAFFDWYAMDSEFFEILSIVIVAFYFLALSEQRLFDI
WEVNKIIVELTRSIFLFLLLGTTAYFTHYFCRSHLHISFVKRHYNFIRYFIFALLSGCAILNINGFYTLAMQLTLSGIFT
FFILYITILIGQSINKFYASLSYSQGKLNVIRIFGYKKDQMLTEFYILKVTLKLVIVLLSVYLIGISWGFATDFIDTVYK
KLLYGFTLANITIYPTRILFGIIIFCFLYLVSRAISTSISRHQQFENEEETQVAIASILTYVGFSIAVISGLLVAGFNFT
GLAIIAGALSVGIGLGLQSIVNNFVSGIILLIEKPIRPGDRINIDGVEGFVKKIRVRSTQILTPVNEDIIIPNSDLITRR
VVNYMLTDNYWRVNCEVSVAFGTNLNLVKDILLEIANKHDDVVKSGRNKPVVLFTSFADSALTFQLWCMIKDVNKKSTVK
SELNFSIEEAFRKHDISIT

Sequences:

>Translated_739_residues
MARKRMAMRIFVMILLFFFSISPTLGDSTLPAIFDVKNANKQFDQINLQLSVQNLNLNNLNKAVETLGELSAQSDECIAD
IQKKINGVDVLIKQATSTGNDKGADLVYLNNQKHQLAELQSQCRLFSIRAQEAIEAYKSAILQLRQEKTLARTLPLWQLA
SKIINSSDNTKWINHTKEKFLLQDLPVYLWFCIVAGSFFISILILSKLRQSNVIRRYVKLKKIRWSHITLLALFMMTGSF
YGYISLFTAEEQLINSQFLLIKELFWFLCGTLFIVCLFKVKKIKAFFDWYAMDSEFFEILSIVIVAFYFLALSEQRLFDI
WEVNKIIVELTRSIFLFLLLGTTAYFTHYFCRSHLHISFVKRHYNFIRYFIFALLSGCAILNINGFYTLAMQLTLSGIFT
FFILYITILIGQSINKFYASLSYSQGKLNVIRIFGYKKDQMLTEFYILKVTLKLVIVLLSVYLIGISWGFATDFIDTVYK
KLLYGFTLANITIYPTRILFGIIIFCFLYLVSRAISTSISRHQQFENEEETQVAIASILTYVGFSIAVISGLLVAGFNFT
GLAIIAGALSVGIGLGLQSIVNNFVSGIILLIEKPIRPGDRINIDGVEGFVKKIRVRSTQILTPVNEDIIIPNSDLITRR
VVNYMLTDNYWRVNCEVSVAFGTNLNLVKDILLEIANKHDDVVKSGRNKPVVLFTSFADSALTFQLWCMIKDVNKKSTVK
SELNFSIEEAFRKHDISIT
>Mature_738_residues
ARKRMAMRIFVMILLFFFSISPTLGDSTLPAIFDVKNANKQFDQINLQLSVQNLNLNNLNKAVETLGELSAQSDECIADI
QKKINGVDVLIKQATSTGNDKGADLVYLNNQKHQLAELQSQCRLFSIRAQEAIEAYKSAILQLRQEKTLARTLPLWQLAS
KIINSSDNTKWINHTKEKFLLQDLPVYLWFCIVAGSFFISILILSKLRQSNVIRRYVKLKKIRWSHITLLALFMMTGSFY
GYISLFTAEEQLINSQFLLIKELFWFLCGTLFIVCLFKVKKIKAFFDWYAMDSEFFEILSIVIVAFYFLALSEQRLFDIW
EVNKIIVELTRSIFLFLLLGTTAYFTHYFCRSHLHISFVKRHYNFIRYFIFALLSGCAILNINGFYTLAMQLTLSGIFTF
FILYITILIGQSINKFYASLSYSQGKLNVIRIFGYKKDQMLTEFYILKVTLKLVIVLLSVYLIGISWGFATDFIDTVYKK
LLYGFTLANITIYPTRILFGIIIFCFLYLVSRAISTSISRHQQFENEEETQVAIASILTYVGFSIAVISGLLVAGFNFTG
LAIIAGALSVGIGLGLQSIVNNFVSGIILLIEKPIRPGDRINIDGVEGFVKKIRVRSTQILTPVNEDIIIPNSDLITRRV
VNYMLTDNYWRVNCEVSVAFGTNLNLVKDILLEIANKHDDVVKSGRNKPVVLFTSFADSALTFQLWCMIKDVNKKSTVKS
ELNFSIEEAFRKHDISIT

Specific function: Mechanosensitive channel that opens in response to stretch forces in the membrane lipid bilayer. May participate in the regulation of osmotic pressure changes within the cell, although it does not appear to have a major role in osmolarity regulation. Form

COG id: COG3264

COG function: function code M; Small-conductance mechanosensitive channel

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mscS (TC 1.A.23) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786670, Length=205, Percent_Identity=37.5609756097561, Blast_Score=145, Evalue=6e-36,
Organism=Escherichia coli, GI2367355, Length=209, Percent_Identity=31.5789473684211, Blast_Score=101, Evalue=2e-22,
Organism=Escherichia coli, GI1789291, Length=222, Percent_Identity=24.3243243243243, Blast_Score=71, Evalue=3e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010920
- InterPro:   IPR011066
- InterPro:   IPR006685
- InterPro:   IPR006686
- InterPro:   IPR011014 [H]

Pfam domain/function: PF00924 MS_channel [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 84481; Mature: 84349

Theoretical pI: Translated: 9.59; Mature: 9.59

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MARKRMAMRIFVMILLFFFSISPTLGDSTLPAIFDVKNANKQFDQINLQLSVQNLNLNNL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHEECCCCCCCHHEEEEEEEEEECCCHHH
NKAVETLGELSAQSDECIADIQKKINGVDVLIKQATSTGNDKGADLVYLNNQKHQLAELQ
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHH
SQCRLFSIRAQEAIEAYKSAILQLRQEKTLARTLPLWQLASKIINSSDNTKWINHTKEKF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
LLQDLPVYLWFCIVAGSFFISILILSKLRQSNVIRRYVKLKKIRWSHITLLALFMMTGSF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
YGYISLFTAEEQLINSQFLLIKELFWFLCGTLFIVCLFKVKKIKAFFDWYAMDSEFFEIL
HHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
SIVIVAFYFLALSEQRLFDIWEVNKIIVELTRSIFLFLLLGTTAYFTHYFCRSHLHISFV
HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH
KRHYNFIRYFIFALLSGCAILNINGFYTLAMQLTLSGIFTFFILYITILIGQSINKFYAS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH
LSYSQGKLNVIRIFGYKKDQMLTEFYILKVTLKLVIVLLSVYLIGISWGFATDFIDTVYK
CCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLLYGFTLANITIYPTRILFGIIIFCFLYLVSRAISTSISRHQQFENEEETQVAIASILT
HHHHHHHHHCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
YVGFSIAVISGLLVAGFNFTGLAIIAGALSVGIGLGLQSIVNNFVSGIILLIEKPIRPGD
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
RINIDGVEGFVKKIRVRSTQILTPVNEDIIIPNSDLITRRVVNYMLTDNYWRVNCEVSVA
EEECCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEE
FGTNLNLVKDILLEIANKHDDVVKSGRNKPVVLFTSFADSALTFQLWCMIKDVNKKSTVK
ECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
SELNFSIEEAFRKHDISIT
HHHCCCHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
ARKRMAMRIFVMILLFFFSISPTLGDSTLPAIFDVKNANKQFDQINLQLSVQNLNLNNL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHEECCCCCCCHHEEEEEEEEEECCCHHH
NKAVETLGELSAQSDECIADIQKKINGVDVLIKQATSTGNDKGADLVYLNNQKHQLAELQ
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHH
SQCRLFSIRAQEAIEAYKSAILQLRQEKTLARTLPLWQLASKIINSSDNTKWINHTKEKF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
LLQDLPVYLWFCIVAGSFFISILILSKLRQSNVIRRYVKLKKIRWSHITLLALFMMTGSF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
YGYISLFTAEEQLINSQFLLIKELFWFLCGTLFIVCLFKVKKIKAFFDWYAMDSEFFEIL
HHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
SIVIVAFYFLALSEQRLFDIWEVNKIIVELTRSIFLFLLLGTTAYFTHYFCRSHLHISFV
HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH
KRHYNFIRYFIFALLSGCAILNINGFYTLAMQLTLSGIFTFFILYITILIGQSINKFYAS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH
LSYSQGKLNVIRIFGYKKDQMLTEFYILKVTLKLVIVLLSVYLIGISWGFATDFIDTVYK
CCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLLYGFTLANITIYPTRILFGIIIFCFLYLVSRAISTSISRHQQFENEEETQVAIASILT
HHHHHHHHHCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
YVGFSIAVISGLLVAGFNFTGLAIIAGALSVGIGLGLQSIVNNFVSGIILLIEKPIRPGD
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
RINIDGVEGFVKKIRVRSTQILTPVNEDIIIPNSDLITRRVVNYMLTDNYWRVNCEVSVA
EEECCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEE
FGTNLNLVKDILLEIANKHDDVVKSGRNKPVVLFTSFADSALTFQLWCMIKDVNKKSTVK
ECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
SELNFSIEEAFRKHDISIT
HHHCCCHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9278503; 10202137 [H]