| Definition | Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002942 |
| Length | 3,397,754 |
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The map label for this gene is legC1
Identifier: 52841543
GI number: 52841543
Start: 1440709
End: 1444116
Strand: Direct
Name: legC1
Synonym: lpg1312
Alternate gene names: NA
Gene position: 1440709-1444116 (Clockwise)
Preceding gene: 52841542
Following gene: 52841549
Centisome position: 42.4
GC content: 31.63
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CCTCAGCTCGACATATTTTTATAATGTGTAGTAGTTCAAACTTGATCTGACAGTTACCGGTTTTTCAAGTAGTTGTGTCA GATTAAGTTGAAACTCATTC
Product: coiled-coil-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1135; Mature: 1135
Protein sequence:
>1135_residues MILEFFEVVLIMKSIEYFRNELNELFKSKKNGYKFKQEEKSPEQNTESDEYVLSFDTLPEEGIDRDNNTFYYTTSVDEIC YEIKTSSGCLRTGSFHSNNHNNLEERIFLNAAEKGFVENLEVLKNLATIERLIKELEKKGTEHEIKKYSSELNDEISLYN DNLRKISNIFPDIDKKILKKLEINNSILPLPCPFDTRAVQVASHVPNQEGTYRRSQSSNEYHHTNKRGNVITYKNFNELK NNDPNLGEIFLGTDNNSLYVKCKFKKSEPAKLLPISLYSETKNNIINKLNSNRKLTNNELLAIISAIQSKDTLILKNQLN KFGCNVEGVIAGNGEAYNIGGNATRVDKIIEYQSNGISYKRGNQLTLKLKDRVLEHKTNVVETLVRHLKDENFKCLKVDS NQLKAKYPCLIVTFKYDEYRSKPENIPEGYSEFVTHMMIAQINLKLKEKNLSPLIDRRQSFGFLTPTLTDVHTGVRLSLG LTPNKQWIECVEEGIKQTDKSLAKFTLKDKDDLLNLFRAGEFCGDGHKYLYDLYKTGEKTQEEVNKFLQESKVKSECKDI YFSTKDITRIDKDKLKKGVLKRFYYFDSKNGAITLYDNQHQHGSSLKVNADVIHYFLLKNFSSKDLIKLTEVQECWLKEA IDDAQRNNPFQYIDRKYLSLYRKITRLYAQILGVEQNRGEEKDLAKLTRDLINLQNGVVTSLLKTMPLITDDTSDDEHAN KYAQKNFYSPAGMSALFAPLYAAAKVFSYNNEMPISYGSDPYAYFELLLSWNKTLDESQFVRSEVVKEKLENRAFKMLLE NFANESNKTGLVKMGRSEVTICFKNIYTEIYSNQIERKKLDVDSIINSNLTAIKNALEINTENDRGAIQFNEEKLRLILK QGINIIQQSFPKYMEHVNSLENNPTVYFADNNPCVNKDHLEVRTAIEVLKDLCTKDLCPKVFVLDTTSATEAQIEDFLNV FNQQDKIPILVTAASMVKHSEFGLDLWQGGINKAYLSEKSEKNENSQNEFARFITELKNVTKGTEPGFTRFARRHVREAM NNINEAIKDSQDNSEPQDATCKDDVQNIPTNPISEESNRKEEGQIINRELDEYVPLLTKKGFFAVQIEKVPEKNVNQNNK QKSLEEGEPPCCTII
Sequences:
>Translated_1135_residues MILEFFEVVLIMKSIEYFRNELNELFKSKKNGYKFKQEEKSPEQNTESDEYVLSFDTLPEEGIDRDNNTFYYTTSVDEIC YEIKTSSGCLRTGSFHSNNHNNLEERIFLNAAEKGFVENLEVLKNLATIERLIKELEKKGTEHEIKKYSSELNDEISLYN DNLRKISNIFPDIDKKILKKLEINNSILPLPCPFDTRAVQVASHVPNQEGTYRRSQSSNEYHHTNKRGNVITYKNFNELK NNDPNLGEIFLGTDNNSLYVKCKFKKSEPAKLLPISLYSETKNNIINKLNSNRKLTNNELLAIISAIQSKDTLILKNQLN KFGCNVEGVIAGNGEAYNIGGNATRVDKIIEYQSNGISYKRGNQLTLKLKDRVLEHKTNVVETLVRHLKDENFKCLKVDS NQLKAKYPCLIVTFKYDEYRSKPENIPEGYSEFVTHMMIAQINLKLKEKNLSPLIDRRQSFGFLTPTLTDVHTGVRLSLG LTPNKQWIECVEEGIKQTDKSLAKFTLKDKDDLLNLFRAGEFCGDGHKYLYDLYKTGEKTQEEVNKFLQESKVKSECKDI YFSTKDITRIDKDKLKKGVLKRFYYFDSKNGAITLYDNQHQHGSSLKVNADVIHYFLLKNFSSKDLIKLTEVQECWLKEA IDDAQRNNPFQYIDRKYLSLYRKITRLYAQILGVEQNRGEEKDLAKLTRDLINLQNGVVTSLLKTMPLITDDTSDDEHAN KYAQKNFYSPAGMSALFAPLYAAAKVFSYNNEMPISYGSDPYAYFELLLSWNKTLDESQFVRSEVVKEKLENRAFKMLLE NFANESNKTGLVKMGRSEVTICFKNIYTEIYSNQIERKKLDVDSIINSNLTAIKNALEINTENDRGAIQFNEEKLRLILK QGINIIQQSFPKYMEHVNSLENNPTVYFADNNPCVNKDHLEVRTAIEVLKDLCTKDLCPKVFVLDTTSATEAQIEDFLNV FNQQDKIPILVTAASMVKHSEFGLDLWQGGINKAYLSEKSEKNENSQNEFARFITELKNVTKGTEPGFTRFARRHVREAM NNINEAIKDSQDNSEPQDATCKDDVQNIPTNPISEESNRKEEGQIINRELDEYVPLLTKKGFFAVQIEKVPEKNVNQNNK QKSLEEGEPPCCTII >Mature_1135_residues MILEFFEVVLIMKSIEYFRNELNELFKSKKNGYKFKQEEKSPEQNTESDEYVLSFDTLPEEGIDRDNNTFYYTTSVDEIC YEIKTSSGCLRTGSFHSNNHNNLEERIFLNAAEKGFVENLEVLKNLATIERLIKELEKKGTEHEIKKYSSELNDEISLYN DNLRKISNIFPDIDKKILKKLEINNSILPLPCPFDTRAVQVASHVPNQEGTYRRSQSSNEYHHTNKRGNVITYKNFNELK NNDPNLGEIFLGTDNNSLYVKCKFKKSEPAKLLPISLYSETKNNIINKLNSNRKLTNNELLAIISAIQSKDTLILKNQLN KFGCNVEGVIAGNGEAYNIGGNATRVDKIIEYQSNGISYKRGNQLTLKLKDRVLEHKTNVVETLVRHLKDENFKCLKVDS NQLKAKYPCLIVTFKYDEYRSKPENIPEGYSEFVTHMMIAQINLKLKEKNLSPLIDRRQSFGFLTPTLTDVHTGVRLSLG LTPNKQWIECVEEGIKQTDKSLAKFTLKDKDDLLNLFRAGEFCGDGHKYLYDLYKTGEKTQEEVNKFLQESKVKSECKDI YFSTKDITRIDKDKLKKGVLKRFYYFDSKNGAITLYDNQHQHGSSLKVNADVIHYFLLKNFSSKDLIKLTEVQECWLKEA IDDAQRNNPFQYIDRKYLSLYRKITRLYAQILGVEQNRGEEKDLAKLTRDLINLQNGVVTSLLKTMPLITDDTSDDEHAN KYAQKNFYSPAGMSALFAPLYAAAKVFSYNNEMPISYGSDPYAYFELLLSWNKTLDESQFVRSEVVKEKLENRAFKMLLE NFANESNKTGLVKMGRSEVTICFKNIYTEIYSNQIERKKLDVDSIINSNLTAIKNALEINTENDRGAIQFNEEKLRLILK QGINIIQQSFPKYMEHVNSLENNPTVYFADNNPCVNKDHLEVRTAIEVLKDLCTKDLCPKVFVLDTTSATEAQIEDFLNV FNQQDKIPILVTAASMVKHSEFGLDLWQGGINKAYLSEKSEKNENSQNEFARFITELKNVTKGTEPGFTRFARRHVREAM NNINEAIKDSQDNSEPQDATCKDDVQNIPTNPISEESNRKEEGQIINRELDEYVPLLTKKGFFAVQIEKVPEKNVNQNNK QKSLEEGEPPCCTII
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 130644; Mature: 130644
Theoretical pI: Translated: 6.65; Mature: 6.65
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MILEFFEVVLIMKSIEYFRNELNELFKSKKNGYKFKQEEKSPEQNTESDEYVLSFDTLPE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCC EGIDRDNNTFYYTTSVDEICYEIKTSSGCLRTGSFHSNNHNNLEERIFLNAAEKGFVENL CCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH EVLKNLATIERLIKELEKKGTEHEIKKYSSELNDEISLYNDNLRKISNIFPDIDKKILKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH LEINNSILPLPCPFDTRAVQVASHVPNQEGTYRRSQSSNEYHHTNKRGNVITYKNFNELK HHCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHC NNDPNLGEIFLGTDNNSLYVKCKFKKSEPAKLLPISLYSETKNNIINKLNSNRKLTNNEL CCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH LAIISAIQSKDTLILKNQLNKFGCNVEGVIAGNGEAYNIGGNATRVDKIIEYQSNGISYK HHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC RGNQLTLKLKDRVLEHKTNVVETLVRHLKDENFKCLKVDSNQLKAKYPCLIVTFKYDEYR CCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECHHHC SKPENIPEGYSEFVTHMMIAQINLKLKEKNLSPLIDRRQSFGFLTPTLTDVHTGVRLSLG CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCEEEEEC LTPNKQWIECVEEGIKQTDKSLAKFTLKDKDDLLNLFRAGEFCGDGHKYLYDLYKTGEKT CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHH QEEVNKFLQESKVKSECKDIYFSTKDITRIDKDKLKKGVLKRFYYFDSKNGAITLYDNQH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEECCCC QHGSSLKVNADVIHYFLLKNFSSKDLIKLTEVQECWLKEAIDDAQRNNPFQYIDRKYLSL CCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH YRKITRLYAQILGVEQNRGEEKDLAKLTRDLINLQNGVVTSLLKTMPLITDDTSDDEHAN HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH KYAQKNFYSPAGMSALFAPLYAAAKVFSYNNEMPISYGSDPYAYFELLLSWNKTLDESQF HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH VRSEVVKEKLENRAFKMLLENFANESNKTGLVKMGRSEVTICFKNIYTEIYSNQIERKKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC DVDSIINSNLTAIKNALEINTENDRGAIQFNEEKLRLILKQGINIIQQSFPKYMEHVNSL CHHHHHCCCHHHHHHHHEECCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC ENNPTVYFADNNPCVNKDHLEVRTAIEVLKDLCTKDLCPKVFVLDTTSATEAQIEDFLNV CCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHH FNQQDKIPILVTAASMVKHSEFGLDLWQGGINKAYLSEKSEKNENSQNEFARFITELKNV HCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH TKGTEPGFTRFARRHVREAMNNINEAIKDSQDNSEPQDATCKDDVQNIPTNPISEESNRK CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCC EEGQIINRELDEYVPLLTKKGFFAVQIEKVPEKNVNQNNKQKSLEEGEPPCCTII HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEECC >Mature Secondary Structure MILEFFEVVLIMKSIEYFRNELNELFKSKKNGYKFKQEEKSPEQNTESDEYVLSFDTLPE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCC EGIDRDNNTFYYTTSVDEICYEIKTSSGCLRTGSFHSNNHNNLEERIFLNAAEKGFVENL CCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH EVLKNLATIERLIKELEKKGTEHEIKKYSSELNDEISLYNDNLRKISNIFPDIDKKILKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH LEINNSILPLPCPFDTRAVQVASHVPNQEGTYRRSQSSNEYHHTNKRGNVITYKNFNELK HHCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHC NNDPNLGEIFLGTDNNSLYVKCKFKKSEPAKLLPISLYSETKNNIINKLNSNRKLTNNEL CCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH LAIISAIQSKDTLILKNQLNKFGCNVEGVIAGNGEAYNIGGNATRVDKIIEYQSNGISYK HHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC RGNQLTLKLKDRVLEHKTNVVETLVRHLKDENFKCLKVDSNQLKAKYPCLIVTFKYDEYR CCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECHHHC SKPENIPEGYSEFVTHMMIAQINLKLKEKNLSPLIDRRQSFGFLTPTLTDVHTGVRLSLG CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCEEEEEC LTPNKQWIECVEEGIKQTDKSLAKFTLKDKDDLLNLFRAGEFCGDGHKYLYDLYKTGEKT CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHH QEEVNKFLQESKVKSECKDIYFSTKDITRIDKDKLKKGVLKRFYYFDSKNGAITLYDNQH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEECCCC QHGSSLKVNADVIHYFLLKNFSSKDLIKLTEVQECWLKEAIDDAQRNNPFQYIDRKYLSL CCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH YRKITRLYAQILGVEQNRGEEKDLAKLTRDLINLQNGVVTSLLKTMPLITDDTSDDEHAN HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH KYAQKNFYSPAGMSALFAPLYAAAKVFSYNNEMPISYGSDPYAYFELLLSWNKTLDESQF HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH VRSEVVKEKLENRAFKMLLENFANESNKTGLVKMGRSEVTICFKNIYTEIYSNQIERKKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC DVDSIINSNLTAIKNALEINTENDRGAIQFNEEKLRLILKQGINIIQQSFPKYMEHVNSL CHHHHHCCCHHHHHHHHEECCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC ENNPTVYFADNNPCVNKDHLEVRTAIEVLKDLCTKDLCPKVFVLDTTSATEAQIEDFLNV CCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHH FNQQDKIPILVTAASMVKHSEFGLDLWQGGINKAYLSEKSEKNENSQNEFARFITELKNV HCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH TKGTEPGFTRFARRHVREAMNNINEAIKDSQDNSEPQDATCKDDVQNIPTNPISEESNRK CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCC EEGQIINRELDEYVPLLTKKGFFAVQIEKVPEKNVNQNNKQKSLEEGEPPCCTII HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA