| Definition | Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002942 |
| Length | 3,397,754 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 52840610
Identifier: 52840610
GI number: 52840610
Start: 404662
End: 407352
Strand: Reverse
Name: 52840610
Synonym: lpg0365
Alternate gene names: NA
Gene position: 407352-404662 (Counterclockwise)
Preceding gene: 52840611
Following gene: 52840609
Centisome position: 11.99
GC content: 35.08
Gene sequence:
>2691_bases GTGGTTGATTTTGATAAACCTGTCTCAAAAAATGATATTCTTGCCAGCTTATTACTTATCGCAGATTTAAATAGACCATC TCTAAATCAAACTCTTTCCTGGGAGCAAGCTCTAAAATCATTTTTATCGCTTAATGATCCGCTGATTAAAACGGAAATAT TTATAAAATGGCTCAGTCAATTAAATCCTGATCAACTTCAATCGTCCCCAGAGATAGTCCTCCTTTTGAAACACATTGTC GAGCAAAAGCTGCTCCCCTACACCCTCAAAAAAATATTGATTCAGCGTGAAAACTTCACCACCTCACAAATCAATTGGCT TTGCAATCATTGTCTTATAGTTGCACCTGATCAAACGACTTTACCTGATATTATTAAACTCGGCTCATGGAGCTGGCTGG AGAATCATATGAAAAGAAATGAACTATTAAATTTTGATTTGTTAAAAATAGCCATCTTAAATAAGGATTATTTAGCCAGC ATCAACAATAGTAAAGAAAGTCAGCTCGATTTTATCTATGCGTTAAACGCTAATAAATTTAACTACCAACAAATACTTGA ATTAATTGCTTTAGCGCAGGATAGCCAGATTAAATCATTATTAATTACCTGTCTATTAAGCAAAAAGGAGTACCTGGACA ATTTAAAAGAAAAATCATTTCTAGCCCATTTAAATCAAAGTGAATTTCACTCACCACCTCGGCTTAATCCACTAATCCAC CAATTAAACCTGAGCTGTTTGACTGTGGCACAAATAGAACTTCTACAACCTGAAGCATGTGTTACTTTACTCTGTTCAAT CCCTCATTTTCATCAGTTGTCAGAAAAACAGGTTGAAAAAATACTACTTAAATATCCAAAGCCTGACATGATTGCCTATT GGCTAAATCATTACTCATCCAGGCCAAATGCGCATTTTATTTTAGCCCATTTGATGAACCTGGTAGATGTTCATGTTGTT GACGAACTTAATAAAATGGATTCCACAAAAAAGGAAACCATTATTATGAATATGGTAGAACATCTCGAATTATTTGATCC GACTCATCCTCTTTTGATCAACCAAAATGAAGAAAAACGACTAATTACCGCTATTCAACGCTATCTCTATGGCCAACATC ATGACGCGTATGTAACTTACATCAAGTTATTGGTTTATAAATTATTAAACCGTAATTACCAATTCTCACCTCAAGCGATG CAACTCCTGATTTGTTTAAATAATCTGGAAGAGTTTAAAGAGTTAAATAATAAAATCGCCTATCTGACCAATTACTACTT GCGAGCATCAGCACAATCCGGTGATTCGAGCTTATTTTATAATGATTCACGCATAAACATCACGAGCATGACACAACTGG TCCAGCTAGCCCCAAAAATTCCAACTAAATCAAAAGAAAAAAGTCTTTTAAGCAGCATCTTCTGCGGCATCAAAATTAGC GAAAGCTCTGTAATGACACCGACCAATGATATTCCTGAACATCCTTTAATTAATAAATTAATAAAAAACAAGAGAACAGT GAAATCGATAGATTATTTTTTAATGCATTATAAAGGCGATAAGCAAGTACTTTCCAAAATCATCAATGATTATTTAAGTT ACTATGTTCAAGAAGGATGCACTGAAATACATCGGCGTTCGATATATCATTTAATTGTTCTCATGTCTTTAAGCGATATA TCAGCTTCTGTTAGAGAGGCTATATTCACAGCGTTTCTAAACTATCCTGAATTACATGATGAGCAAATTAATTTTTCTTT ATTTGTCTATGATGCGAAAAGAACTATCCGGCATTTTGGGGCACAAGCTAGCGAAGACAGCTATGCCAGAGTTATTGATT TATGCGAGGGAGCTCTAAAAAAATTAAATCCAAATAAACACAAGGAAATTATCAGTATAGCGACTCAAGCTTTAACTGAA GCAAAAATCGAGTTAAGTTTTGGTGAAAATACCGGATTTATCGCTCAACTGATTTCACGATTGAAACGATGTTGGTATTA TGGCTGGACTGGTTTTTTTTCCCCCAACCCACCTACCTTTGTTGCAGCAATTGACTCGCCAATAAAGCCAAGCGAAAAAA AAACCTCCCCTCTTCTTCAACAAAGAAAATATTTCACTACCAAACTTGAAACAAATCTGTCGATTATCCTCGATGACATA AAATCAGGTTACACCCAACAAAAACTTAATGAATTAATCGAAGCATTGAGTATATTTTCATTGCAATCCAATCCAAAAAA CGAGCTTAAAATTCGTCAAAAACTCCATCGCTTATTTCACTATCTGTTACTAGAAAGCAAAAATGACTTAACATTGGATG CCTGGCTTATAAAAAATCAGCAACTTTTAATCGCGAATCGTTTTCGTTTGCTAGAAATGCAACTAATGAAAGGAGCTCGC AATGAGGTTGAATCTTTACTCAAGGAATTCGATGAAGACTCTGCTCATTTCAGCCCTATCAGCAAAGAATTTACTCATTC TTTACCCGAACAAAATCCGTATAAGTGTGAATCTGTTTCTTCAAATCAAACTCCAGGCGCAACTATCCTGGATTCAGCAA CTGAGTTAGCTACTAGCCTAAAAAGCACATTAGGCAACTTGGGAGTATTTTTTAGCAACAACATCATGTCAGCTATTTAT CCAAATAATAAATCCACTCCCCAATCGACATCAACAATGATTTCACCTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCGAGAGAATTTGTGAATATTATATTCCGTGGCTTAACATGAACGAAATGGGTATTAAAGTTGATAGAGTAGTTTTGACA TTTCGGTCAAGGAGGATCAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAATCTTCCGGCTGCGCATCTACAGCCGGATTGATTTATAATAACCTGAAACAAACAACCGTTCTAAAATTTGGATCCT TCCTATTTAATTAGCAGATA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 896; Mature: 896
Protein sequence:
>896_residues MVDFDKPVSKNDILASLLLIADLNRPSLNQTLSWEQALKSFLSLNDPLIKTEIFIKWLSQLNPDQLQSSPEIVLLLKHIV EQKLLPYTLKKILIQRENFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTTLPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLAS INNSKESQLDFIYALNANKFNYQQILELIALAQDSQIKSLLITCLLSKKEYLDNLKEKSFLAHLNQSEFHSPPRLNPLIH QLNLSCLTVAQIELLQPEACVTLLCSIPHFHQLSEKQVEKILLKYPKPDMIAYWLNHYSSRPNAHFILAHLMNLVDVHVV DELNKMDSTKKETIIMNMVEHLELFDPTHPLLINQNEEKRLITAIQRYLYGQHHDAYVTYIKLLVYKLLNRNYQFSPQAM QLLICLNNLEEFKELNNKIAYLTNYYLRASAQSGDSSLFYNDSRINITSMTQLVQLAPKIPTKSKEKSLLSSIFCGIKIS ESSVMTPTNDIPEHPLINKLIKNKRTVKSIDYFLMHYKGDKQVLSKIINDYLSYYVQEGCTEIHRRSIYHLIVLMSLSDI SASVREAIFTAFLNYPELHDEQINFSLFVYDAKRTIRHFGAQASEDSYARVIDLCEGALKKLNPNKHKEIISIATQALTE AKIELSFGENTGFIAQLISRLKRCWYYGWTGFFSPNPPTFVAAIDSPIKPSEKKTSPLLQQRKYFTTKLETNLSIILDDI KSGYTQQKLNELIEALSIFSLQSNPKNELKIRQKLHRLFHYLLLESKNDLTLDAWLIKNQQLLIANRFRLLEMQLMKGAR NEVESLLKEFDEDSAHFSPISKEFTHSLPEQNPYKCESVSSNQTPGATILDSATELATSLKSTLGNLGVFFSNNIMSAIY PNNKSTPQSTSTMISP
Sequences:
>Translated_896_residues MVDFDKPVSKNDILASLLLIADLNRPSLNQTLSWEQALKSFLSLNDPLIKTEIFIKWLSQLNPDQLQSSPEIVLLLKHIV EQKLLPYTLKKILIQRENFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTTLPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLAS INNSKESQLDFIYALNANKFNYQQILELIALAQDSQIKSLLITCLLSKKEYLDNLKEKSFLAHLNQSEFHSPPRLNPLIH QLNLSCLTVAQIELLQPEACVTLLCSIPHFHQLSEKQVEKILLKYPKPDMIAYWLNHYSSRPNAHFILAHLMNLVDVHVV DELNKMDSTKKETIIMNMVEHLELFDPTHPLLINQNEEKRLITAIQRYLYGQHHDAYVTYIKLLVYKLLNRNYQFSPQAM QLLICLNNLEEFKELNNKIAYLTNYYLRASAQSGDSSLFYNDSRINITSMTQLVQLAPKIPTKSKEKSLLSSIFCGIKIS ESSVMTPTNDIPEHPLINKLIKNKRTVKSIDYFLMHYKGDKQVLSKIINDYLSYYVQEGCTEIHRRSIYHLIVLMSLSDI SASVREAIFTAFLNYPELHDEQINFSLFVYDAKRTIRHFGAQASEDSYARVIDLCEGALKKLNPNKHKEIISIATQALTE AKIELSFGENTGFIAQLISRLKRCWYYGWTGFFSPNPPTFVAAIDSPIKPSEKKTSPLLQQRKYFTTKLETNLSIILDDI KSGYTQQKLNELIEALSIFSLQSNPKNELKIRQKLHRLFHYLLLESKNDLTLDAWLIKNQQLLIANRFRLLEMQLMKGAR NEVESLLKEFDEDSAHFSPISKEFTHSLPEQNPYKCESVSSNQTPGATILDSATELATSLKSTLGNLGVFFSNNIMSAIY PNNKSTPQSTSTMISP >Mature_896_residues MVDFDKPVSKNDILASLLLIADLNRPSLNQTLSWEQALKSFLSLNDPLIKTEIFIKWLSQLNPDQLQSSPEIVLLLKHIV EQKLLPYTLKKILIQRENFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTTLPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLAS INNSKESQLDFIYALNANKFNYQQILELIALAQDSQIKSLLITCLLSKKEYLDNLKEKSFLAHLNQSEFHSPPRLNPLIH QLNLSCLTVAQIELLQPEACVTLLCSIPHFHQLSEKQVEKILLKYPKPDMIAYWLNHYSSRPNAHFILAHLMNLVDVHVV DELNKMDSTKKETIIMNMVEHLELFDPTHPLLINQNEEKRLITAIQRYLYGQHHDAYVTYIKLLVYKLLNRNYQFSPQAM QLLICLNNLEEFKELNNKIAYLTNYYLRASAQSGDSSLFYNDSRINITSMTQLVQLAPKIPTKSKEKSLLSSIFCGIKIS ESSVMTPTNDIPEHPLINKLIKNKRTVKSIDYFLMHYKGDKQVLSKIINDYLSYYVQEGCTEIHRRSIYHLIVLMSLSDI SASVREAIFTAFLNYPELHDEQINFSLFVYDAKRTIRHFGAQASEDSYARVIDLCEGALKKLNPNKHKEIISIATQALTE AKIELSFGENTGFIAQLISRLKRCWYYGWTGFFSPNPPTFVAAIDSPIKPSEKKTSPLLQQRKYFTTKLETNLSIILDDI KSGYTQQKLNELIEALSIFSLQSNPKNELKIRQKLHRLFHYLLLESKNDLTLDAWLIKNQQLLIANRFRLLEMQLMKGAR NEVESLLKEFDEDSAHFSPISKEFTHSLPEQNPYKCESVSSNQTPGATILDSATELATSLKSTLGNLGVFFSNNIMSAIY PNNKSTPQSTSTMISP
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 103012; Mature: 103012
Theoretical pI: Translated: 7.92; Mature: 7.92
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVDFDKPVSKNDILASLLLIADLNRPSLNQTLSWEQALKSFLSLNDPLIKTEIFIKWLSQ CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH LNPDQLQSSPEIVLLLKHIVEQKLLPYTLKKILIQRENFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTT CCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCCCC LPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLASINNSKESQLDFIYALNANKF CHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEECCHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCC NYQQILELIALAQDSQIKSLLITCLLSKKEYLDNLKEKSFLAHLNQSEFHSPPRLNPLIH CHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCHHHH QLNLSCLTVAQIELLQPEACVTLLCSIPHFHQLSEKQVEKILLKYPKPDMIAYWLNHYSS HHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCC RPNAHFILAHLMNLVDVHVVDELNKMDSTKKETIIMNMVEHLELFDPTHPLLINQNEEKR CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHH LITAIQRYLYGQHHDAYVTYIKLLVYKLLNRNYQFSPQAMQLLICLNNLEEFKELNNKIA HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH YLTNYYLRASAQSGDSSLFYNDSRINITSMTQLVQLAPKIPTKSKEKSLLSSIFCGIKIS HHHHHHHEEECCCCCCCEEECCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEC ESSVMTPTNDIPEHPLINKLIKNKRTVKSIDYFLMHYKGDKQVLSKIINDYLSYYVQEGC CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TEIHRRSIYHLIVLMSLSDISASVREAIFTAFLNYPELHDEQINFSLFVYDAKRTIRHFG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHC AQASEDSYARVIDLCEGALKKLNPNKHKEIISIATQALTEAKIELSFGENTGFIAQLISR CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHH LKRCWYYGWTGFFSPNPPTFVAAIDSPIKPSEKKTSPLLQQRKYFTTKLETNLSIILDDI HHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH KSGYTQQKLNELIEALSIFSLQSNPKNELKIRQKLHRLFHYLLLESKNDLTLDAWLIKNQ HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCC QLLIANRFRLLEMQLMKGARNEVESLLKEFDEDSAHFSPISKEFTHSLPEQNPYKCESVS EEEHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC SNQTPGATILDSATELATSLKSTLGNLGVFFSNNIMSAIYPNNKSTPQSTSTMISP CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MVDFDKPVSKNDILASLLLIADLNRPSLNQTLSWEQALKSFLSLNDPLIKTEIFIKWLSQ CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH LNPDQLQSSPEIVLLLKHIVEQKLLPYTLKKILIQRENFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTT CCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCCCC LPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLASINNSKESQLDFIYALNANKF CHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEECCHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCC NYQQILELIALAQDSQIKSLLITCLLSKKEYLDNLKEKSFLAHLNQSEFHSPPRLNPLIH CHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCHHHH QLNLSCLTVAQIELLQPEACVTLLCSIPHFHQLSEKQVEKILLKYPKPDMIAYWLNHYSS HHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCC RPNAHFILAHLMNLVDVHVVDELNKMDSTKKETIIMNMVEHLELFDPTHPLLINQNEEKR CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHH LITAIQRYLYGQHHDAYVTYIKLLVYKLLNRNYQFSPQAMQLLICLNNLEEFKELNNKIA HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH YLTNYYLRASAQSGDSSLFYNDSRINITSMTQLVQLAPKIPTKSKEKSLLSSIFCGIKIS HHHHHHHEEECCCCCCCEEECCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEC ESSVMTPTNDIPEHPLINKLIKNKRTVKSIDYFLMHYKGDKQVLSKIINDYLSYYVQEGC CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TEIHRRSIYHLIVLMSLSDISASVREAIFTAFLNYPELHDEQINFSLFVYDAKRTIRHFG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHC AQASEDSYARVIDLCEGALKKLNPNKHKEIISIATQALTEAKIELSFGENTGFIAQLISR CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHH LKRCWYYGWTGFFSPNPPTFVAAIDSPIKPSEKKTSPLLQQRKYFTTKLETNLSIILDDI HHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH KSGYTQQKLNELIEALSIFSLQSNPKNELKIRQKLHRLFHYLLLESKNDLTLDAWLIKNQ HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCC QLLIANRFRLLEMQLMKGARNEVESLLKEFDEDSAHFSPISKEFTHSLPEQNPYKCESVS EEEHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC SNQTPGATILDSATELATSLKSTLGNLGVFFSNNIMSAIYPNNKSTPQSTSTMISP CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA