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The map label for this gene is yqjV [H]

Identifier: 52784054

GI number: 52784054

Start: 206152

End: 207378

Strand: Direct

Name: yqjV [H]

Synonym: BLi00228

Alternate gene names: 52784054

Gene position: 206152-207378 (Clockwise)

Preceding gene: 52784053

Following gene: 52784055

Centisome position: 4.88

GC content: 43.19

Gene sequence:

>1227_bases
ATGTTTGCGCAATTTAAAGCATTCAGCCGCCTTCATCCGTTGATCCGATTTTTGCTGATAGGCACGCTTGTCACGAAGGC
GGCTAAGTCGATGACAACCCCGTTTTTGGCGCTCTATCTCCATATGAAAACGGGAGCCGATTTTGGAACCATCGGGCTTG
TCATCGGTTTAGGCTATTTTTCAAGCACTGTAGGAGGGGTAGTCGGAGGAGCGCTTTCAGATAAAATCGGCAGAAAAAAA
GTGATGCTTTCATCCATTTTCATCTGGAGCTTTGTATTCATTCTTTTTGGACTTGTTCATGATTTCATGTGGTTTTTATT
GCTGAATATTTTAAGCTGGCTTTGCCATTCGTGTTTTGAACCTGTGTCAAAGGCTTTGATGGCTGAGTTATCAGAACGGG
AGATGAGATTCCGCATTTTCTCTTTGCGGTATTTGGCCATCAATGTTGGAGCTGCTGTCGGCCCTTTACTGGGCGCTTAT
TTTGGTCTTGCCAAAACCGGAACGCCGTTTATCATCACAGGGCTGGTCTATTTTGGCTATGCCATACTTTTGAGCTTGAT
GATGATTCGGCTGACCACGGTGAAAGAGACAAAAATCGCTCCTGAAAAAGTCCAGGCAGGTTCAGTTTTGAAGACGTTAA
AGCAAGACAAGGCTCTTCGATTATACATAGCCGGCGGCATCCTTTTTTTGTTCAGCTATTCGCAAATGGAAAGCACTTTG
CTGCAGTATTTAAATAACGACTTTGCAAACGGAGTTAAAATATTTTCGACTTTAATCACGTTAAACGCGGTGACGGTCAT
CCTTTTACAAGTGCCGCTCACCCGTTTATTTGAGAGGTATAAATCCTTAACAACAATATCAATTGGAACCGTTTTTTGCA
TTTTGGGGAATATCGGTTTTTCTATCGCAAATGGCTGGATTGTTTTTATGCTTTCGATGTTTGTTCTGACAATCGGCGAA
ATTTTATGTTTTCCTTCAATGAATGTCCTTTTGGACGAGCTGGCTCCGGATCATATGAAGGGCGCGTATTACGGCATGCA
AAACTTATACAACATCGGTGAGTTTTTAGGGCCTTGGCTGGGGGGAATGATGCTTGCCTTGTACGGGGGAAAAGCCGTCT
TTCTTATTGCTGCGTGTTCAGTCTTTTTGGCTTTAGGCGCTTACCATGTGGGAAGGAGAAAGTTTTTATCTGCACAGCAT
TATGGTGTATCGCCTTTTTCTTATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGCTGTTTAATTATCGGACGCACAGAAGCCGAATTGAGAGGCCGTATCAGCCGGCTTGCAACGTGGTTCCATGATCATAC
CGTATGGGAAAAGAATTCGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATTTAGGCCGCTTATGCATGAATCATTAAGAATTACCCAACCTAAAAGGTAAAAAAGGAGTATGAATCATGGACACAA
CATTGGGCTACCTCCGTGAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 408; Mature: 408

Protein sequence:

>408_residues
MFAQFKAFSRLHPLIRFLLIGTLVTKAAKSMTTPFLALYLHMKTGADFGTIGLVIGLGYFSSTVGGVVGGALSDKIGRKK
VMLSSIFIWSFVFILFGLVHDFMWFLLLNILSWLCHSCFEPVSKALMAELSEREMRFRIFSLRYLAINVGAAVGPLLGAY
FGLAKTGTPFIITGLVYFGYAILLSLMMIRLTTVKETKIAPEKVQAGSVLKTLKQDKALRLYIAGGILFLFSYSQMESTL
LQYLNNDFANGVKIFSTLITLNAVTVILLQVPLTRLFERYKSLTTISIGTVFCILGNIGFSIANGWIVFMLSMFVLTIGE
ILCFPSMNVLLDELAPDHMKGAYYGMQNLYNIGEFLGPWLGGMMLALYGGKAVFLIAACSVFLALGAYHVGRRKFLSAQH
YGVSPFSY

Sequences:

>Translated_408_residues
MFAQFKAFSRLHPLIRFLLIGTLVTKAAKSMTTPFLALYLHMKTGADFGTIGLVIGLGYFSSTVGGVVGGALSDKIGRKK
VMLSSIFIWSFVFILFGLVHDFMWFLLLNILSWLCHSCFEPVSKALMAELSEREMRFRIFSLRYLAINVGAAVGPLLGAY
FGLAKTGTPFIITGLVYFGYAILLSLMMIRLTTVKETKIAPEKVQAGSVLKTLKQDKALRLYIAGGILFLFSYSQMESTL
LQYLNNDFANGVKIFSTLITLNAVTVILLQVPLTRLFERYKSLTTISIGTVFCILGNIGFSIANGWIVFMLSMFVLTIGE
ILCFPSMNVLLDELAPDHMKGAYYGMQNLYNIGEFLGPWLGGMMLALYGGKAVFLIAACSVFLALGAYHVGRRKFLSAQH
YGVSPFSY
>Mature_408_residues
MFAQFKAFSRLHPLIRFLLIGTLVTKAAKSMTTPFLALYLHMKTGADFGTIGLVIGLGYFSSTVGGVVGGALSDKIGRKK
VMLSSIFIWSFVFILFGLVHDFMWFLLLNILSWLCHSCFEPVSKALMAELSEREMRFRIFSLRYLAINVGAAVGPLLGAY
FGLAKTGTPFIITGLVYFGYAILLSLMMIRLTTVKETKIAPEKVQAGSVLKTLKQDKALRLYIAGGILFLFSYSQMESTL
LQYLNNDFANGVKIFSTLITLNAVTVILLQVPLTRLFERYKSLTTISIGTVFCILGNIGFSIANGWIVFMLSMFVLTIGE
ILCFPSMNVLLDELAPDHMKGAYYGMQNLYNIGEFLGPWLGGMMLALYGGKAVFLIAACSVFLALGAYHVGRRKFLSAQH
YGVSPFSY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787815, Length=361, Percent_Identity=26.5927977839335, Blast_Score=118, Evalue=9e-28,
Organism=Escherichia coli, GI87081828, Length=342, Percent_Identity=23.9766081871345, Blast_Score=67, Evalue=2e-12,
Organism=Escherichia coli, GI1787291, Length=390, Percent_Identity=24.3589743589744, Blast_Score=63, Evalue=4e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196
- InterPro:   IPR005829
- InterPro:   IPR001958 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45108; Mature: 45108

Theoretical pI: Translated: 9.93; Mature: 9.93

Prosite motif: PS50850 MFS ; PS00216 SUGAR_TRANSPORT_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
5.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
5.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969508; 9384377 [H]