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The map label for this gene is yfiS [H]

Identifier: 52143675

GI number: 52143675

Start: 1641223

End: 1642491

Strand: Direct

Name: yfiS [H]

Synonym: BCZK1559

Alternate gene names: 52143675

Gene position: 1641223-1642491 (Clockwise)

Preceding gene: 52143679

Following gene: 52143674

Centisome position: 30.96

GC content: 36.25

Gene sequence:

>1269_bases
ATGGAAGATGTAAGTATAGGTCAAACTGATTCAAGAATGAAGATTGCAACGAGAAATATCATTTTAATGATGATTGGAAA
AATGACGTCTTTATTAGGCGCAGGTATTTATACGTTCGCAATGGGGTTATACGTATTAAAGACAACGGGTTCAGGGATGG
GGTTTGCAACTACGCTCGTTTGCGGGTCACTTCCACGGATGATTTGTGGACCAATTGCTGGTGCTGTAGCTGACCGTGTG
AGTCGAAGATGGCTTGTCGTCGGTACAGATTTATTAAGTAGTTTAACGATGCTTATCATGTTTATTCTTGCTACTATATT
TGGACCATCACTTCTTTTTATTTATATTTCAGCAGCATTATTATCAATTTGTGCAAGTTTTTATTCTGTTGCATTAACTT
CGTCTATTCCTAATTTAGTAGATGAGGGGCGTATTCAAAAAGCGAGTGCTTTAAATCAAACGGCAGCTTCTTTATCAAAT
ATTTTAGGGCCAATTATTGGCGGAGTTGTATTTGGTTTCCTTTCAATTCAGTCGTTCTTTTTGTTAAATAGTATTACGTT
CTTTTTAGCGGTTATTTTGCAATTGTTTATTGTATTTGATTTATATAAAAAAGAAGTGGCTGAGAGTAAAGAGCATTTCT
TGACGAGTATCAAAGAAGGTTTTTCATATGTAAAACGACAACATGAAATATATGGTTTAATGAAAATAGCATTGTGGGTA
AACTTTTTTGCTTGTGGGCTAACCGTTGCACTTCCGTACATTATTGTCCATACATTGCATTTATCTTCAAAGCAACTCGG
AACTGTAGAGGGAATGTTAGCAGTCGGAATGCTAATGGGTGCGATTACTTTATCAGTGCGTAAAGAAGTGAATAATCCGT
TTCGTTCTATTTATACTGGACTGTTTTTGTTTGCAGGTTTGAGTTTATGTACAGTATTCCCGTTGTTAGTTACCATTCCA
AAAGTAGCAAGTTTTATTTACTATATTGCTTTCATGATGTTAACTGGTATAGCAATTATGATTGTAAATATTCCAATGCA
AGTACATATGCAAAAGACGACAGATCCGAGCTACTTAGGGCGTGTGTTTGGCCTACTTGAAACAATTGCGACTGCAATCG
CACCGCTCGGTATGATTGTATATGGATTATTGTTAGATATGTTGCCAACTAGCATTGTTATGATGACAATAGGCGGAGGT
TTATTGTTAGTTGTATTAGTTGGAGTAAGGCAACATATGGCGAAAAAACAAGTGGATGTGTCGGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAAGTTAAATATAATTAAACTTTTTTGTTGTAATAATTGGAAAGGTGATTATATAATAAGTTTAACACAATTTAACT
TTTAAGGGGAGAGTGTCAGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAACAAGAAAATAATAAAAATGACCAAATTAGTATTTTAGTTTTTGAAACTCTTTTTCATGTATGTTACAGTATAGTGAG
CAGGCAAAGAAAAGGAGACA

Product: multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 422; Mature: 422

Protein sequence:

>422_residues
MEDVSIGQTDSRMKIATRNIILMMIGKMTSLLGAGIYTFAMGLYVLKTTGSGMGFATTLVCGSLPRMICGPIAGAVADRV
SRRWLVVGTDLLSSLTMLIMFILATIFGPSLLFIYISAALLSICASFYSVALTSSIPNLVDEGRIQKASALNQTAASLSN
ILGPIIGGVVFGFLSIQSFFLLNSITFFLAVILQLFIVFDLYKKEVAESKEHFLTSIKEGFSYVKRQHEIYGLMKIALWV
NFFACGLTVALPYIIVHTLHLSSKQLGTVEGMLAVGMLMGAITLSVRKEVNNPFRSIYTGLFLFAGLSLCTVFPLLVTIP
KVASFIYYIAFMMLTGIAIMIVNIPMQVHMQKTTDPSYLGRVFGLLETIATAIAPLGMIVYGLLLDMLPTSIVMMTIGGG
LLLVVLVGVRQHMAKKQVDVSA

Sequences:

>Translated_422_residues
MEDVSIGQTDSRMKIATRNIILMMIGKMTSLLGAGIYTFAMGLYVLKTTGSGMGFATTLVCGSLPRMICGPIAGAVADRV
SRRWLVVGTDLLSSLTMLIMFILATIFGPSLLFIYISAALLSICASFYSVALTSSIPNLVDEGRIQKASALNQTAASLSN
ILGPIIGGVVFGFLSIQSFFLLNSITFFLAVILQLFIVFDLYKKEVAESKEHFLTSIKEGFSYVKRQHEIYGLMKIALWV
NFFACGLTVALPYIIVHTLHLSSKQLGTVEGMLAVGMLMGAITLSVRKEVNNPFRSIYTGLFLFAGLSLCTVFPLLVTIP
KVASFIYYIAFMMLTGIAIMIVNIPMQVHMQKTTDPSYLGRVFGLLETIATAIAPLGMIVYGLLLDMLPTSIVMMTIGGG
LLLVVLVGVRQHMAKKQVDVSA
>Mature_422_residues
MEDVSIGQTDSRMKIATRNIILMMIGKMTSLLGAGIYTFAMGLYVLKTTGSGMGFATTLVCGSLPRMICGPIAGAVADRV
SRRWLVVGTDLLSSLTMLIMFILATIFGPSLLFIYISAALLSICASFYSVALTSSIPNLVDEGRIQKASALNQTAASLSN
ILGPIIGGVVFGFLSIQSFFLLNSITFFLAVILQLFIVFDLYKKEVAESKEHFLTSIKEGFSYVKRQHEIYGLMKIALWV
NFFACGLTVALPYIIVHTLHLSSKQLGTVEGMLAVGMLMGAITLSVRKEVNNPFRSIYTGLFLFAGLSLCTVFPLLVTIP
KVASFIYYIAFMMLTGIAIMIVNIPMQVHMQKTTDPSYLGRVFGLLETIATAIAPLGMIVYGLLLDMLPTSIVMMTIGGG
LLLVVLVGVRQHMAKKQVDVSA

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45762; Mature: 45762

Theoretical pI: Translated: 9.52; Mature: 9.52

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
5.7 %Met     (Translated Protein)
6.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
5.7 %Met     (Mature Protein)
6.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CC
>Mature Secondary Structure
MEDVSIGQTDSRMKIATRNIILMMIGKMTSLLGAGIYTFAMGLYVLKTTGSGMGFATTLV
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
CGSLPRMICGPIAGAVADRVSRRWLVVGTDLLSSLTMLIMFILATIFGPSLLFIYISAAL
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSICASFYSVALTSSIPNLVDEGRIQKASALNQTAASLSNILGPIIGGVVFGFLSIQSFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLNSITFFLAVILQLFIVFDLYKKEVAESKEHFLTSIKEGFSYVKRQHEIYGLMKIALWV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NFFACGLTVALPYIIVHTLHLSSKQLGTVEGMLAVGMLMGAITLSVRKEVNNPFRSIYTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LFLFAGLSLCTVFPLLVTIPKVASFIYYIAFMMLTGIAIMIVNIPMQVHMQKTTDPSYLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEECCCCHHHHH
RVFGLLETIATAIAPLGMIVYGLLLDMLPTSIVMMTIGGGLLLVVLVGVRQHMAKKQVDV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SA
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]