| Definition | Bacillus cereus E33L, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006274 |
| Length | 5,300,915 |
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The map label for this gene is 52142191
Identifier: 52142191
GI number: 52142191
Start: 3179151
End: 3181640
Strand: Reverse
Name: 52142191
Synonym: BCZK3051
Alternate gene names: NA
Gene position: 3181640-3179151 (Counterclockwise)
Preceding gene: 52142189
Following gene: 52142193
Centisome position: 60.02
GC content: 29.6
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TTCATAATGGAGAAGTTGTTGATGATTATACGTGTTCTCATGGAGTAAATGATATGAATATTATTTTAGATAAATTCAAA AAATTAATGGAGAAATCAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGAGGTTAACCCAAGTTGCTATTCAGCTACTTTTGGGTCAATCTCTCTTTTTATTAAAAGTTGATTTTCATATTGGTGT ACTCATTCATAAATGTATAG
Product: ABC transporter, permease
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 829; Mature: 829
Protein sequence:
>829_residues MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMDLSVGFNPNQNKLMDKSLIQN IKEQENVEYMSKVLVNHLQVNRLNTAIYTVGVQNDSLSKSRYHFSKNISNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIEIENKSYVV KEVLPDIEAGGSAPDILILSEGAMKQHVYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDRELRIDIAEEDEFLKSNL ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSVINFFGGILGLLLAVISNRFL QSWLEHVFAFQINSMNFDYKIAIVTLIFSIFFIELFMLYPSYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSVF LTVLGGFVANTGDTQAIVILIGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHIQNIFKEISSVKGASTISTNSLAELKQGEKYIT FDYNLGDVKEMEKQGLLPEVSANLENSIIVTEELAGRYKLHVGDIVQLGLFSEQEQKVRPTGKVEVGLIVNELPNSPSVL MDWSNVTYKQDYTVFERAFISSNNERETLEQLKKLKGQYPQLKISSYTQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSITLGV CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGIVQIILTQVNLYVFIGIVLGAVIGALLTYMVSIIDRTPLFFDFKLIVTVIAGM FGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK
Sequences:
>Translated_829_residues MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMDLSVGFNPNQNKLMDKSLIQN IKEQENVEYMSKVLVNHLQVNRLNTAIYTVGVQNDSLSKSRYHFSKNISNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIEIENKSYVV KEVLPDIEAGGSAPDILILSEGAMKQHVYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDRELRIDIAEEDEFLKSNL ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSVINFFGGILGLLLAVISNRFL QSWLEHVFAFQINSMNFDYKIAIVTLIFSIFFIELFMLYPSYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSVF LTVLGGFVANTGDTQAIVILIGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHIQNIFKEISSVKGASTISTNSLAELKQGEKYIT FDYNLGDVKEMEKQGLLPEVSANLENSIIVTEELAGRYKLHVGDIVQLGLFSEQEQKVRPTGKVEVGLIVNELPNSPSVL MDWSNVTYKQDYTVFERAFISSNNERETLEQLKKLKGQYPQLKISSYTQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSITLGV CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGIVQIILTQVNLYVFIGIVLGAVIGALLTYMVSIIDRTPLFFDFKLIVTVIAGM FGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK >Mature_829_residues MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMDLSVGFNPNQNKLMDKSLIQN IKEQENVEYMSKVLVNHLQVNRLNTAIYTVGVQNDSLSKSRYHFSKNISNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIEIENKSYVV KEVLPDIEAGGSAPDILILSEGAMKQHVYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDRELRIDIAEEDEFLKSNL ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSVINFFGGILGLLLAVISNRFL QSWLEHVFAFQINSMNFDYKIAIVTLIFSIFFIELFMLYPSYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSVF LTVLGGFVANTGDTQAIVILIGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHIQNIFKEISSVKGASTISTNSLAELKQGEKYIT FDYNLGDVKEMEKQGLLPEVSANLENSIIVTEELAGRYKLHVGDIVQLGLFSEQEQKVRPTGKVEVGLIVNELPNSPSVL MDWSNVTYKQDYTVFERAFISSNNERETLEQLKKLKGQYPQLKISSYTQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSITLGV CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGIVQIILTQVNLYVFIGIVLGAVIGALLTYMVSIIDRTPLFFDFKLIVTVIAGM FGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK
Specific function: Unknown
COG id: COG0577
COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003838 [H]
Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 93735; Mature: 93735
Theoretical pI: Translated: 9.64; Mature: 9.64
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMD CCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LSVGFNPNQNKLMDKSLIQNIKEQENVEYMSKVLVNHLQVNRLNTAIYTVGVQNDSLSKS EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECEEEEEEEECCCCCCHH RYHFSKNISNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIEIENKSYVVKEVLPDIEAGGSAPDILILS HHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHEECCCEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEC EGAMKQHVYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDRELRIDIAEEDEFLKSNL CCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHH ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH INFFGGILGLLLAVISNRFLQSWLEHVFAFQINSMNFDYKIAIVTLIFSIFFIELFMLYP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSVFLTVLGGFVANTGDTQAIVIL CCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH IGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHH MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHIQNIFKEISSVKG HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCC ASTISTNSLAELKQGEKYITFDYNLGDVKEMEKQGLLPEVSANLENSIIVTEELAGRYKL CCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCEEEEHHHCCCEEE HVGDIVQLGLFSEQEQKVRPTGKVEVGLIVNELPNSPSVLMDWSNVTYKQDYTVFERAFI EHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHH SSNNERETLEQLKKLKGQYPQLKISSYTQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSITLGV CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGIVQIILTQVNLYVFIGIVLGAVIGALLTYMVSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDRTPLFFDFKLIVTVIAGMFGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMD CCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LSVGFNPNQNKLMDKSLIQNIKEQENVEYMSKVLVNHLQVNRLNTAIYTVGVQNDSLSKS EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECEEEEEEEECCCCCCHH RYHFSKNISNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIEIENKSYVVKEVLPDIEAGGSAPDILILS HHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHEECCCEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEC EGAMKQHVYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDRELRIDIAEEDEFLKSNL CCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHH ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH INFFGGILGLLLAVISNRFLQSWLEHVFAFQINSMNFDYKIAIVTLIFSIFFIELFMLYP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSVFLTVLGGFVANTGDTQAIVIL CCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH IGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHH MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHIQNIFKEISSVKG HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCC ASTISTNSLAELKQGEKYITFDYNLGDVKEMEKQGLLPEVSANLENSIIVTEELAGRYKL CCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCEEEEHHHCCCEEE HVGDIVQLGLFSEQEQKVRPTGKVEVGLIVNELPNSPSVLMDWSNVTYKQDYTVFERAFI EHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHH SSNNERETLEQLKKLKGQYPQLKISSYTQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSITLGV CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGIVQIILTQVNLYVFIGIVLGAVIGALLTYMVSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDRTPLFFDFKLIVTVIAGMFGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]