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The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 52140664

GI number: 52140664

Start: 4675997

End: 4677952

Strand: Direct

Name: yxdM [H]

Synonym: BCZK4590

Alternate gene names: 52140664

Gene position: 4675997-4677952 (Clockwise)

Preceding gene: 52140665

Following gene: 52140662

Centisome position: 88.21

GC content: 33.23

Gene sequence:

>1956_bases
ATGACATTTTGGCAGTTTGCATTTAAAAACGTCACACGGAACGCCAGAGCTTATTTCGCCTATTTTGTAAGCAGCGCGTT
TTCTATTGCAATTTTTTTCTCATTTGCAGTTTACTTATTTCATCCTAAATTGCATATGACCGACGTAAATTATGCTCTGA
ACATATTAATGACAATTTCAGAAGTTGTCATCGTATTCTTTTCATTTTTCTTTTTACTATATTCAATCGGTACTTTCCTA
AAAGTACGAAAAAAGCAATTTGGGATTTTAACAGTACTTGGCATCTCTCAAAAACAATTAAAACGACTCATATTTATAGA
AAATATGTTAATTGGTGTTCTTTCTATATTTTTTGGGATTCAACTTGGACTTGTCTTTTCACAGTTCTTTTTATTAGTTA
CCGCCAAAATTACACATGTACCTGGTTTATATTTATATTGGCCTACAAGCGCCATTATTTTAACTATCATCATCTTTCTC
GGACTCTTTATTCTCGTATCATCTTTTACACCGATGCTCATTCGTACGAGAAAAGCTGTACGTCTTTTAAAAGAAGGGAC
AAAACAAAAAGAAAGAAAAGCATCTGTGCTCATCTCTCTATTTGGTGCGATATGTTTAATATCTGGATATGCGTTAGCCG
CAAATCCATTATATTTTCTATCGCTAGGTGACATCATTGGGCTTTTATATGCCCTCTCTAGTATATTTGTCATCCCATCG
CTTATTGCAGCTGGGACGTATTTTTTCTTCTCACAAATTAGCTTTTTACTCATTCGTATATTAAAAGCGCGAAGAACGTT
TTATATGAAACGCATTAATATGCTTTGGATTTCTGATTTAGCATCGCGCATTCGAACGAATATTAATATGCTCTTTATTG
TGGCGATGCTATCAACGCTCGCCTTTACAATGATTACATTCCTATATGGTTTTGGGAAGTTCACAAAGTTTAATGAAATA
AGAAAAAACCCTTTTCCATTTACTTATTTATCACATACTGAAAACACGTTAAGTGATGAACATTTAAACTGGTTAGAACA
AAAATTTAATGAAGAACAATTTACTTATGAAAAATTTAAAACGGATATATACGAAGTATCTTTAGCTGAAGATAACACGC
AGCTCTATCATGCAATGAAACAAAGTGACTACAATGTACTCGCTAAAGTATTACGATGGGAACCTCTTACCGTTCATAAC
AATGAATCTTATATCCTTATGAAAGAAATAGATGATCATTTCATTGGAACATTTTACGATAAAGAAAAAAGAGATAGTCT
TACACTTACTCAAAACTCTTTACATTTGAAAGTGAAGGATTATAAAAGTACTAGTCCGTTTCCAAACTGGTTAGTACCGA
AGTTACTCATTTTATCTGATGAAAATGTAGAAGCCTTATCGACCGTTTCCAAGCAAATGAGTGTATATAACTTCAAAGTT
ACAGATTGGGAAAAAGCACATAATATCGGTTCATCGTTTATAACAAAAATCCATAATGACAATGCAGCAATTCAAGCAGA
GCACCCGCCTTTCCATGCAAGTGAAGCGAGCGATTCTCTATATAAAACAAAACTAAATGTCGCTTCATTTTTCTTAATTG
GTACTTTCTTAGGTGTTATTTTCTTTATCGGAGCTGGCAGTGTTCTTTACTTCCGGATGTATACAGATTTAACAAACGAG
CAAGAAAAATATATAACGATTACGAAAATTGGCTTAACGGAAACTGAAATGAAACGTTCAGCGACAATTCAGCTTGCGAT
TCTTTTCTTCGTGCCTTACATTATGGCATCCATCCATACGATGTTCGCGACAAAGATGTTACAAGAAGTTTTACATCTCT
CGTTCTTCGCTGAGATTACAGTCGTTCTTATGATTTTTGGAACAGTTGAAATTTTATTTTTCCTTTTAATTCGTTCCTTT
TATATGCAAAAATTATCACAACACATTAAGTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACTTTATATGCAAAAGCTATCACAATATACTAATACACATTAAAAAGGTGGGATTTCTTCCCTCCTTCTTCATGCCCATT
ATATTAGGAGGTTTAGGTGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATAGAAAGGTGATTATGATGGAAGAAGTATTACACATAAAAAACGTCTCAAAAGTGTATGAAGGAAAAGTCCCTCAT
ACCGCTTTAAAAAATATAAA

Product: ABC transporter, permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 651; Mature: 650

Protein sequence:

>651_residues
MTFWQFAFKNVTRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTISEVVIVFFSFFFLLYSIGTFL
KVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGIQLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIILTIIIFL
GLFILVSSFTPMLIRTRKAVRLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANPLYFLSLGDIIGLLYALSSIFVIPS
LIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTLAFTMITFLYGFGKFTKFNEI
RKNPFPFTYLSHTENTLSDEHLNWLEQKFNEEQFTYEKFKTDIYEVSLAEDNTQLYHAMKQSDYNVLAKVLRWEPLTVHN
NESYILMKEIDDHFIGTFYDKEKRDSLTLTQNSLHLKVKDYKSTSPFPNWLVPKLLILSDENVEALSTVSKQMSVYNFKV
TDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVIFFIGAGSVLYFRMYTDLTNE
QEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHTMFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSF
YMQKLSQHIKF

Sequences:

>Translated_651_residues
MTFWQFAFKNVTRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTISEVVIVFFSFFFLLYSIGTFL
KVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGIQLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIILTIIIFL
GLFILVSSFTPMLIRTRKAVRLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANPLYFLSLGDIIGLLYALSSIFVIPS
LIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTLAFTMITFLYGFGKFTKFNEI
RKNPFPFTYLSHTENTLSDEHLNWLEQKFNEEQFTYEKFKTDIYEVSLAEDNTQLYHAMKQSDYNVLAKVLRWEPLTVHN
NESYILMKEIDDHFIGTFYDKEKRDSLTLTQNSLHLKVKDYKSTSPFPNWLVPKLLILSDENVEALSTVSKQMSVYNFKV
TDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVIFFIGAGSVLYFRMYTDLTNE
QEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHTMFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSF
YMQKLSQHIKF
>Mature_650_residues
TFWQFAFKNVTRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTISEVVIVFFSFFFLLYSIGTFLK
VRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGIQLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIILTIIIFLG
LFILVSSFTPMLIRTRKAVRLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANPLYFLSLGDIIGLLYALSSIFVIPSL
IAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTLAFTMITFLYGFGKFTKFNEIR
KNPFPFTYLSHTENTLSDEHLNWLEQKFNEEQFTYEKFKTDIYEVSLAEDNTQLYHAMKQSDYNVLAKVLRWEPLTVHNN
ESYILMKEIDDHFIGTFYDKEKRDSLTLTQNSLHLKVKDYKSTSPFPNWLVPKLLILSDENVEALSTVSKQMSVYNFKVT
DWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVIFFIGAGSVLYFRMYTDLTNEQ
EKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHTMFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSFY
MQKLSQHIKF

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 75277; Mature: 75146

Theoretical pI: Translated: 9.84; Mature: 9.84

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTFWQFAFKNVTRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTIS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHH
EVVIVFFSFFFLLYSIGTFLKVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIILTIIIFLGLFILVSSFTPMLIRTRKAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
RLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANPLYFLSLGDIIGLLYALSSIFVIPS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
AFTMITFLYGFGKFTKFNEIRKNPFPFTYLSHTENTLSDEHLNWLEQKFNEEQFTYEKFK
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
TDIYEVSLAEDNTQLYHAMKQSDYNVLAKVLRWEPLTVHNNESYILMKEIDDHFIGTFYD
CHHEEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEEEEECCCHHHCCCCC
KEKRDSLTLTQNSLHLKVKDYKSTSPFPNWLVPKLLILSDENVEALSTVSKQMSVYNFKV
CCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEE
TDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVI
CCHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFIGAGSVLYFRMYTDLTNEQEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHT
HHHCCCHHEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSFYMQKLSQHIKF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TFWQFAFKNVTRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTIS
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHH
EVVIVFFSFFFLLYSIGTFLKVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIILTIIIFLGLFILVSSFTPMLIRTRKAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
RLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANPLYFLSLGDIIGLLYALSSIFVIPS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
AFTMITFLYGFGKFTKFNEIRKNPFPFTYLSHTENTLSDEHLNWLEQKFNEEQFTYEKFK
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
TDIYEVSLAEDNTQLYHAMKQSDYNVLAKVLRWEPLTVHNNESYILMKEIDDHFIGTFYD
CHHEEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEEEEECCCHHHCCCCC
KEKRDSLTLTQNSLHLKVKDYKSTSPFPNWLVPKLLILSDENVEALSTVSKQMSVYNFKV
CCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEE
TDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVI
CCHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFIGAGSVLYFRMYTDLTNEQEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHT
HHHCCCHHEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSFYMQKLSQHIKF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]