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The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 52140663

GI number: 52140663

Start: 4678722

End: 4680701

Strand: Direct

Name: yxdM [H]

Synonym: BCZK4592

Alternate gene names: 52140663

Gene position: 4678722-4680701 (Clockwise)

Preceding gene: 52140662

Following gene: 52140653

Centisome position: 88.26

GC content: 31.41

Gene sequence:

>1980_bases
ATGACATTTTGGCAATTTGCATTTAAAAATGTCTCGCGTAATTCGAAAGCATATTTCGCTTATTTTGTGAGTAGCGCGTT
TTCTATCATGGTTTTCTTTTCATTTACTGTATACGCGTATCATCCACGCTTACAAATTATGAATAAATTACAGGAACAAG
ATCCATTGATGAACTTAGCCGGCATGGCACAGTTTGTTATCGTTTTGTTCTCGTTCTTCTTTCTCTTATATTCTATTGGG
ACATTTTTAAATGTACGGAAGCAACAATTTGGCGTTTTAACTGTTCTCGGTATATCTCAAAAACAATTAAAACGTCTTTT
GTTTACTGAAAATATGATCATTGGAATGCTTGCTATCTTTGCAGGTATTCAAGGCGGTCTCGTGTTCTCTAACTTTTTCT
TACTCGTTACTTCTAAATTAACAAACGCAAAAGGCCTCTATTTATATTGGCCAACAGAAGCTATTATCGTTACAACAATA
ACTTTTATTATTTTATTTTTTATCGTCTCTACATTTACACCGATGTTCATTCGTACTCGGAAAACAACTCGATTACTTAA
AAATAATAAAAAAGAAAAAAGCGAAAAAAGACCGTCTATACTCATTTCATTATTTGCTTTAATTTGTTTAGGGCTATGCT
ATTATATCGCTGGTTATCCGCAAGGCTATATAACAGAAAAAAACGTACAAAATGGATCTGTATTCTTAATTATGCTATCT
ATTTTACCGCTCGTAGTGGTGGGAACATATTTATTCTTTTCACAAACGTTTCTTCTCTTTATCTTTATTTTGAAAAAGCG
GAGAAAGTTTTATATGAAGCAAATAAATATGTTATGGATTTCAGATTTAGCTAACCGGACTCGTAGTAATATTAATGTAC
TCTTTATCGTTTCTATGCTATCTGCACTTGCATTTACAATTATTATCGCGCTATTTGCTATCAATAATAATACGAAAGCA
ATGATATTAGAACGTTTTCCTATCCCCTTCACATATACATCTAAAGGGGAAAATTCACTTGAACAAAAACATATTGCTAC
AATTGAAACAGAGCTTACAAATGCTAATTTTCAATACAGCAAGCATCAGTCTACATTGTTAAAAGATACCGCTTTAAAAG
AAGACATTACTCTTATGAAAATGAGTGATTATAACACGCTTGCGAAACAATTAAGGAGACCAGAAATAAATCTTGATTCT
ACACAAGTTTATATTATTTCTCGTTACTCACCAGAGCTCTTAAATCTTGTATCAAATCCATTCGCAAAACGAAATACAAT
TACAATCGGATCTAATAAAAAAGAATTTCACATTAAAGGATTTATTAATAAATCCATTGAACCCGCCTTCGCATTCCCTT
ATTTAATGGTTGTACAAGATGATGTATTCAATAATATGATTCCTCATATTGAAACAACCATAGTGTATAATTACTTCGTT
GAAAACTGGGAAAATGCGATTGCTCCTACGAAAAATATATTAAAACATATTAGAAATGATACAGATAACTTCTATGAGGC
ACACAAAGATGTGGAAGGTAATTTTCAACCCCCATTTAATATTTATACAGCTGCCGATGATCTGAAATACAGCAAAGGAA
ATTCAATTGCTACTTTCTTTATTTGGGCATTTCTCGGTTTTATTTTCTTTATCGGTGCGGCTAGTGTTTTATACTTCCGT
ATGTATAACGACTTAACAAATGAAAAACAAAAATATATTACGATTACAAAACTTGGTTTAACAGAATCAGAAATGTTTCG
CTCTGCAACGATTCAATTAGGAATTTTATTTTTCGTTCCTTATATCGTTGCTGGTATTCACACATTATTTGCGGTTAAGT
TTTTACAAAGCATACTCGCTTTTTCTTTACTAAAAGAGTTATTAATTGTACTCACTCTCTTTGGGATTATCGAGATTATT
TTCTTCTTCTTAATCCGATCTCTGTACATTAATAAATTATCACAGCACATAAAAATATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGATGGGGAGCTTTACAACGAACTGCACCGAGGATTGTATCGTGAGAAGTTTTATCAAGAAATATTAGATGTTTTAGCA
TTACTAGGAGGAAGACGTGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAAAATGGCCTTGTGCAATACGCACAAGGCCATTTTCAATAGTTTTTAATTAGCAGCAATATCCACCGTAGCCGCCAGC
ATAACCGCCGTAACCACCAT

Product: ABC transporter, permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 659; Mature: 658

Protein sequence:

>659_residues
MTFWQFAFKNVSRNSKAYFAYFVSSAFSIMVFFSFTVYAYHPRLQIMNKLQEQDPLMNLAGMAQFVIVLFSFFFLLYSIG
TFLNVRKQQFGVLTVLGISQKQLKRLLFTENMIIGMLAIFAGIQGGLVFSNFFLLVTSKLTNAKGLYLYWPTEAIIVTTI
TFIILFFIVSTFTPMFIRTRKTTRLLKNNKKEKSEKRPSILISLFALICLGLCYYIAGYPQGYITEKNVQNGSVFLIMLS
ILPLVVVGTYLFFSQTFLLFIFILKKRRKFYMKQINMLWISDLANRTRSNINVLFIVSMLSALAFTIIIALFAINNNTKA
MILERFPIPFTYTSKGENSLEQKHIATIETELTNANFQYSKHQSTLLKDTALKEDITLMKMSDYNTLAKQLRRPEINLDS
TQVYIISRYSPELLNLVSNPFAKRNTITIGSNKKEFHIKGFINKSIEPAFAFPYLMVVQDDVFNNMIPHIETTIVYNYFV
ENWENAIAPTKNILKHIRNDTDNFYEAHKDVEGNFQPPFNIYTAADDLKYSKGNSIATFFIWAFLGFIFFIGAASVLYFR
MYNDLTNEKQKYITITKLGLTESEMFRSATIQLGILFFVPYIVAGIHTLFAVKFLQSILAFSLLKELLIVLTLFGIIEII
FFFLIRSLYINKLSQHIKI

Sequences:

>Translated_659_residues
MTFWQFAFKNVSRNSKAYFAYFVSSAFSIMVFFSFTVYAYHPRLQIMNKLQEQDPLMNLAGMAQFVIVLFSFFFLLYSIG
TFLNVRKQQFGVLTVLGISQKQLKRLLFTENMIIGMLAIFAGIQGGLVFSNFFLLVTSKLTNAKGLYLYWPTEAIIVTTI
TFIILFFIVSTFTPMFIRTRKTTRLLKNNKKEKSEKRPSILISLFALICLGLCYYIAGYPQGYITEKNVQNGSVFLIMLS
ILPLVVVGTYLFFSQTFLLFIFILKKRRKFYMKQINMLWISDLANRTRSNINVLFIVSMLSALAFTIIIALFAINNNTKA
MILERFPIPFTYTSKGENSLEQKHIATIETELTNANFQYSKHQSTLLKDTALKEDITLMKMSDYNTLAKQLRRPEINLDS
TQVYIISRYSPELLNLVSNPFAKRNTITIGSNKKEFHIKGFINKSIEPAFAFPYLMVVQDDVFNNMIPHIETTIVYNYFV
ENWENAIAPTKNILKHIRNDTDNFYEAHKDVEGNFQPPFNIYTAADDLKYSKGNSIATFFIWAFLGFIFFIGAASVLYFR
MYNDLTNEKQKYITITKLGLTESEMFRSATIQLGILFFVPYIVAGIHTLFAVKFLQSILAFSLLKELLIVLTLFGIIEII
FFFLIRSLYINKLSQHIKI
>Mature_658_residues
TFWQFAFKNVSRNSKAYFAYFVSSAFSIMVFFSFTVYAYHPRLQIMNKLQEQDPLMNLAGMAQFVIVLFSFFFLLYSIGT
FLNVRKQQFGVLTVLGISQKQLKRLLFTENMIIGMLAIFAGIQGGLVFSNFFLLVTSKLTNAKGLYLYWPTEAIIVTTIT
FIILFFIVSTFTPMFIRTRKTTRLLKNNKKEKSEKRPSILISLFALICLGLCYYIAGYPQGYITEKNVQNGSVFLIMLSI
LPLVVVGTYLFFSQTFLLFIFILKKRRKFYMKQINMLWISDLANRTRSNINVLFIVSMLSALAFTIIIALFAINNNTKAM
ILERFPIPFTYTSKGENSLEQKHIATIETELTNANFQYSKHQSTLLKDTALKEDITLMKMSDYNTLAKQLRRPEINLDST
QVYIISRYSPELLNLVSNPFAKRNTITIGSNKKEFHIKGFINKSIEPAFAFPYLMVVQDDVFNNMIPHIETTIVYNYFVE
NWENAIAPTKNILKHIRNDTDNFYEAHKDVEGNFQPPFNIYTAADDLKYSKGNSIATFFIWAFLGFIFFIGAASVLYFRM
YNDLTNEKQKYITITKLGLTESEMFRSATIQLGILFFVPYIVAGIHTLFAVKFLQSILAFSLLKELLIVLTLFGIIEIIF
FFLIRSLYINKLSQHIKI

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76172; Mature: 76041

Theoretical pI: Translated: 10.11; Mature: 10.11

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTFWQFAFKNVSRNSKAYFAYFVSSAFSIMVFFSFTVYAYHPRLQIMNKLQEQDPLMNLA
CCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHH
GMAQFVIVLFSFFFLLYSIGTFLNVRKQQFGVLTVLGISQKQLKRLLFTENMIIGMLAIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGIQGGLVFSNFFLLVTSKLTNAKGLYLYWPTEAIIVTTITFIILFFIVSTFTPMFIRTR
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
KTTRLLKNNKKEKSEKRPSILISLFALICLGLCYYIAGYPQGYITEKNVQNGSVFLIMLS
HHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHH
ILPLVVVGTYLFFSQTFLLFIFILKKRRKFYMKQINMLWISDLANRTRSNINVLFIVSML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHH
SALAFTIIIALFAINNNTKAMILERFPIPFTYTSKGENSLEQKHIATIETELTNANFQYS
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEC
KHQSTLLKDTALKEDITLMKMSDYNTLAKQLRRPEINLDSTQVYIISRYSPELLNLVSNP
HHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHCCC
FAKRNTITIGSNKKEFHIKGFINKSIEPAFAFPYLMVVQDDVFNNMIPHIETTIVYNYFV
CCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHCCCCEEEEHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
ENWENAIAPTKNILKHIRNDTDNFYEAHKDVEGNFQPPFNIYTAADDLKYSKGNSIATFF
HHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEECCCCCHHHHH
IWAFLGFIFFIGAASVLYFRMYNDLTNEKQKYITITKLGLTESEMFRSATIQLGILFFVP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YIVAGIHTLFAVKFLQSILAFSLLKELLIVLTLFGIIEIIFFFLIRSLYINKLSQHIKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TFWQFAFKNVSRNSKAYFAYFVSSAFSIMVFFSFTVYAYHPRLQIMNKLQEQDPLMNLA
CHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHH
GMAQFVIVLFSFFFLLYSIGTFLNVRKQQFGVLTVLGISQKQLKRLLFTENMIIGMLAIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGIQGGLVFSNFFLLVTSKLTNAKGLYLYWPTEAIIVTTITFIILFFIVSTFTPMFIRTR
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
KTTRLLKNNKKEKSEKRPSILISLFALICLGLCYYIAGYPQGYITEKNVQNGSVFLIMLS
HHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHH
ILPLVVVGTYLFFSQTFLLFIFILKKRRKFYMKQINMLWISDLANRTRSNINVLFIVSML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHH
SALAFTIIIALFAINNNTKAMILERFPIPFTYTSKGENSLEQKHIATIETELTNANFQYS
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEC
KHQSTLLKDTALKEDITLMKMSDYNTLAKQLRRPEINLDSTQVYIISRYSPELLNLVSNP
HHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHCCC
FAKRNTITIGSNKKEFHIKGFINKSIEPAFAFPYLMVVQDDVFNNMIPHIETTIVYNYFV
CCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHCCCCEEEEHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
ENWENAIAPTKNILKHIRNDTDNFYEAHKDVEGNFQPPFNIYTAADDLKYSKGNSIATFF
HHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEECCCCCHHHHH
IWAFLGFIFFIGAASVLYFRMYNDLTNEKQKYITITKLGLTESEMFRSATIQLGILFFVP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YIVAGIHTLFAVKFLQSILAFSLLKELLIVLTLFGIIEIIFFFLIRSLYINKLSQHIKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]