| Definition | Yersinia pseudotuberculosis IP 32953, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006155 |
| Length | 4,744,671 |
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The map label for this gene is 51597843
Identifier: 51597843
GI number: 51597843
Start: 4220555
End: 4224133
Strand: Direct
Name: 51597843
Synonym: YPTB3552
Alternate gene names: NA
Gene position: 4220555-4224133 (Clockwise)
Preceding gene: 51597842
Following gene: 51597844
Centisome position: 88.95
GC content: 41.97
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TAACGCCGTTACCTCAGTCAACAGGCCCCACAGAGGGCCTGATAGGAGAGCCCTTTATGGAAAACAGTAAACAGCAAGTG GCCGTTGCTCCCTTGTCGCT
Product: insecticidal toxin complex protein
Products: NA
Alternate protein names: Insecticidal xin Complex Protein; A Component Of Insecticidal xin Complex; Insecticidal xin Complex Protein TccB; Insecticidal xin Protein; Xin Subunit; Partially A Component Of Insecticidal xin Complex; Xin Complex Protein; Insecticidal xin Protein C-Terminal; Insecticidal xin Complex Protein TcaB; Virulence Plasmid
Number of amino acids: Translated: 1192; Mature: 1191
Protein sequence:
>1192_residues MPTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSPIAEAISSLQIYINRCVDGEEDDL HEKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAADYIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSKLTEQSVKSALQSYLI SYEKLTQLDTIQQLYVEEIETTFFLGRTRESPCQYYWRSGKKTADNGKNLIWSEWKKVECNINGTEEKLFIDISWYRHRL YINWLDNTHFKTDKSEDKLQYHFNRVYKNHENTWVESISNMKIGLPLNDDSDKIPIVYLHDGELYTNEDNKGFFLLSDTI IDKLIFSGVYLEGKLKVTFNDEELTFEVLEKFISPYSTSMEFTLNIHTTEKVNVKNKKDSKVSTKLTDNFTITTEAGGML ETSTLFHRVKFNSGIIIKTENDISLLPPDSLPLVEKLQTSVDELLSYSTQKDKIGLDAFNGSYGIYLWELFFHIPLLTSI RFLNEQRFDLAQHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNSLPLQQDTAWDNNTLIQATDDPDVIAMQDPMQYKLAIF MRTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQLLGPRPNLNRGHQWEDIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLLSYWDK LEIRLYNLRHNLNLDGQPLHLPLFATPVDPKALQRQYGAGNGINSGEQMATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSSVIQFGNSL QSVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQRRKHYKELLDNGISSDEQLAINIRIA SAALNGESLVPLGLSAVLDTAPNVFGLADGGSRWGAISQAVGWGMQSMAMALETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQKDQAD KDIEQLAHQYTSVQEQLNMAQKQLDLAELERGHADALYQMQSSRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLMAKAAL EKEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERTVSLAQHYQQLSDHKFNLAEIVTGYM AQDKDQKTGNEQDFVELKNSTLITSLSIKGLNLVEDYPETMHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGENTHLA KGCTALAISRGMNDSGQFLLDFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS
Sequences:
>Translated_1192_residues MPTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSPIAEAISSLQIYINRCVDGEEDDL HEKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAADYIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSKLTEQSVKSALQSYLI SYEKLTQLDTIQQLYVEEIETTFFLGRTRESPCQYYWRSGKKTADNGKNLIWSEWKKVECNINGTEEKLFIDISWYRHRL YINWLDNTHFKTDKSEDKLQYHFNRVYKNHENTWVESISNMKIGLPLNDDSDKIPIVYLHDGELYTNEDNKGFFLLSDTI IDKLIFSGVYLEGKLKVTFNDEELTFEVLEKFISPYSTSMEFTLNIHTTEKVNVKNKKDSKVSTKLTDNFTITTEAGGML ETSTLFHRVKFNSGIIIKTENDISLLPPDSLPLVEKLQTSVDELLSYSTQKDKIGLDAFNGSYGIYLWELFFHIPLLTSI RFLNEQRFDLAQHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNSLPLQQDTAWDNNTLIQATDDPDVIAMQDPMQYKLAIF MRTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQLLGPRPNLNRGHQWEDIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLLSYWDK LEIRLYNLRHNLNLDGQPLHLPLFATPVDPKALQRQYGAGNGINSGEQMATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSSVIQFGNSL QSVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQRRKHYKELLDNGISSDEQLAINIRIA SAALNGESLVPLGLSAVLDTAPNVFGLADGGSRWGAISQAVGWGMQSMAMALETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQKDQAD KDIEQLAHQYTSVQEQLNMAQKQLDLAELERGHADALYQMQSSRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLMAKAAL EKEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERTVSLAQHYQQLSDHKFNLAEIVTGYM AQDKDQKTGNEQDFVELKNSTLITSLSIKGLNLVEDYPETMHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGENTHLA KGCTALAISRGMNDSGQFLLDFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS >Mature_1191_residues PTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSPIAEAISSLQIYINRCVDGEEDDLH EKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAADYIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSKLTEQSVKSALQSYLIS YEKLTQLDTIQQLYVEEIETTFFLGRTRESPCQYYWRSGKKTADNGKNLIWSEWKKVECNINGTEEKLFIDISWYRHRLY INWLDNTHFKTDKSEDKLQYHFNRVYKNHENTWVESISNMKIGLPLNDDSDKIPIVYLHDGELYTNEDNKGFFLLSDTII DKLIFSGVYLEGKLKVTFNDEELTFEVLEKFISPYSTSMEFTLNIHTTEKVNVKNKKDSKVSTKLTDNFTITTEAGGMLE TSTLFHRVKFNSGIIIKTENDISLLPPDSLPLVEKLQTSVDELLSYSTQKDKIGLDAFNGSYGIYLWELFFHIPLLTSIR FLNEQRFDLAQHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNSLPLQQDTAWDNNTLIQATDDPDVIAMQDPMQYKLAIFM RTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQLLGPRPNLNRGHQWEDIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLLSYWDKL EIRLYNLRHNLNLDGQPLHLPLFATPVDPKALQRQYGAGNGINSGEQMATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSSVIQFGNSLQ SVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQRRKHYKELLDNGISSDEQLAINIRIAS AALNGESLVPLGLSAVLDTAPNVFGLADGGSRWGAISQAVGWGMQSMAMALETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQKDQADK DIEQLAHQYTSVQEQLNMAQKQLDLAELERGHADALYQMQSSRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLMAKAALE KEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERTVSLAQHYQQLSDHKFNLAEIVTGYMA QDKDQKTGNEQDFVELKNSTLITSLSIKGLNLVEDYPETMHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGENTHLAK GCTALAISRGMNDSGQFLLDFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 136333; Mature: 136202
Theoretical pI: Translated: 5.21; Mature: 5.21
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSPIAE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHH AISSLQIYINRCVDGEEDDLHEKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAAD HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEHH YIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSKLTEQSVKSALQSYLISYEKLTQLDTIQQLYVEEIE HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TTFFLGRTRESPCQYYWRSGKKTADNGKNLIWSEWKKVECNINGTEEKLFIDISWYRHRL HHHEECCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEEEE YINWLDNTHFKTDKSEDKLQYHFNRVYKNHENTWVESISNMKIGLPLNDDSDKIPIVYLH EEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCEEEEEEE DGELYTNEDNKGFFLLSDTIIDKLIFSGVYLEGKLKVTFNDEELTFEVLEKFISPYSTSM CCEEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCE EFTLNIHTTEKVNVKNKKDSKVSTKLTDNFTITTEAGGMLETSTLFHRVKFNSGIIIKTE EEEEEEECCEEEECCCCCCCCCEEEECCCEEEEECCCCCEEHHHHHHEEEECCCEEEEEC NDISLLPPDSLPLVEKLQTSVDELLSYSTQKDKIGLDAFNGSYGIYLWELFFHIPLLTSI CCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH RFLNEQRFDLAQHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNSLPLQQDTAWDNNTLIQA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEE TDDPDVIAMQDPMQYKLAIFMRTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQLLGPR CCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHCCCC PNLNRGHQWEDIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLLSYWDKLEIRLYNLRHNLNLDGQPLH CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCCCCCCEE LPLFATPVDPKALQRQYGAGNGINSGEQMATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSSVIQFGNSL EEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QSVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQRRKHYK HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELLDNGISSDEQLAINIRIASAALNGESLVPLGLSAVLDTAPNVFGLADGGSRWGAISQA HHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHHHHHH VGWGMQSMAMALETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQKDQADKDIEQLAHQYTSVQEQLNMA HHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QKQLDLAELERGHADALYQMQSSRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLMAKAAL HHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHH EKEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERTVSLAQ HHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH HYQQLSDHKFNLAEIVTGYMAQDKDQKTGNEQDFVELKNSTLITSLSIKGLNLVEDYPET HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEEEECCCHHHHHCCCH MHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGENTHLAKGCTALAISRGMNDSGQFLL HCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCHHHHHHHCCCCCCCCEEE DFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS EECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECC >Mature Secondary Structure PTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSPIAE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHH AISSLQIYINRCVDGEEDDLHEKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAAD HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEHH YIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSKLTEQSVKSALQSYLISYEKLTQLDTIQQLYVEEIE HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TTFFLGRTRESPCQYYWRSGKKTADNGKNLIWSEWKKVECNINGTEEKLFIDISWYRHRL HHHEECCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEEEE YINWLDNTHFKTDKSEDKLQYHFNRVYKNHENTWVESISNMKIGLPLNDDSDKIPIVYLH EEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCEEEEEEE DGELYTNEDNKGFFLLSDTIIDKLIFSGVYLEGKLKVTFNDEELTFEVLEKFISPYSTSM CCEEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCE EFTLNIHTTEKVNVKNKKDSKVSTKLTDNFTITTEAGGMLETSTLFHRVKFNSGIIIKTE EEEEEEECCEEEECCCCCCCCCEEEECCCEEEEECCCCCEEHHHHHHEEEECCCEEEEEC NDISLLPPDSLPLVEKLQTSVDELLSYSTQKDKIGLDAFNGSYGIYLWELFFHIPLLTSI CCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH RFLNEQRFDLAQHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNSLPLQQDTAWDNNTLIQA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEE TDDPDVIAMQDPMQYKLAIFMRTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQLLGPR CCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHCCCC PNLNRGHQWEDIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLLSYWDKLEIRLYNLRHNLNLDGQPLH CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCCCCCCEE LPLFATPVDPKALQRQYGAGNGINSGEQMATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSSVIQFGNSL EEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QSVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQRRKHYK HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELLDNGISSDEQLAINIRIASAALNGESLVPLGLSAVLDTAPNVFGLADGGSRWGAISQA HHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHHHHHH VGWGMQSMAMALETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQKDQADKDIEQLAHQYTSVQEQLNMA HHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QKQLDLAELERGHADALYQMQSSRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLMAKAAL HHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHH EKEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERTVSLAQ HHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH HYQQLSDHKFNLAEIVTGYMAQDKDQKTGNEQDFVELKNSTLITSLSIKGLNLVEDYPET HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEEEECCCHHHHHCCCH MHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGENTHLAKGCTALAISRGMNDSGQFLL HCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCHHHHHHHCCCCCCCCEEE DFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS EECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA