| Definition | Yersinia pseudotuberculosis IP 32953, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006155 |
| Length | 4,744,671 |
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The map label for this gene is 51596726
Identifier: 51596726
GI number: 51596726
Start: 2835709
End: 2838528
Strand: Reverse
Name: 51596726
Synonym: YPTB2403
Alternate gene names: NA
Gene position: 2838528-2835709 (Counterclockwise)
Preceding gene: 51596727
Following gene: 229310103
Centisome position: 59.83
GC content: 50.96
Gene sequence:
>2820_bases ATGGAGTATTGGCTGTTAATTTTTTTACTTATTTTCTTGTTTGTTATCTATATGCAAATAAGTGCGTTATCCAACTCGGT AAAATATATACGAGAAGAGATAGGCAGGCTGCGCAATGAGCTTGCTCCACGCTTGCCTGAACCTACCGTGGCCACTGTTG AGGAAGAGAGCACGCCAACGCATTTGGCAGATGAAGTGGCCGTGTCCAAGGTATGGACCCCTGATTACGCAACCTATCAA AATTATCTACTCACCAAAAAGCAAAGCCAGATTAAAGAGAAGGCTTTTGCCGATTCAGTAAAAAAAGAACCCGCCCCGCC AATAGAATATAGGATTGCTGACCGTCTGGTGGTGCTTAAGCCACAGGATGAGGCCCCTCAAGAATCGCCGAAAATGGATG CAGGCCCTGCCAGTGGTCATCCACAGAAACCAGACGTGTGGACAAAATTGGAAAATGTCCTGTTTTCCTTAAAATCACCG GAGAGTTTCTGGAAACGCCTCGAGCAAGAGTTTGCCGCACGTTGGATGGTGTGGATCGGCGGTGTGATCATGGCACTGGG TGTCATTTTCCTGCTGAAAGCAGGCAGCGAACAGGGTCTGTTCGGGCCAACCTTGCGGATTGGTACCGCCATTGTGCTGA GTGTGCTGATGGTTGTTGGGGGAGAGTGGCTCAGGCGTTCACGTTTTCAGTTGCCCTTGGTCAATGCCGGTTATATCCCG GCGGCGCTGAGTGGGGCCGGTATTCTCGGTCTATTTGCCTCAATGCTGGCGGCTAAATATCTCTACGACATGTTCCCGAT GCCCGTTCTCATGCTATTGCTCAGCCTGATTTCTCTGTTGGCGATGGTGCTGGCATTGTGGCAGGGGCCATTTATGGCGG CCTTGGGGCTGCTTGGCGCCTATACCGTCCCGTTATTTGTTTCGACGGGCAGCGGTAATGTCACCGGGCTGTTGGCCTAC CTGTTCCTGGTTAGTTTGGCGTCTATCGGCCTGATGAGCCGTGTCTATCGGCACTGGCTATGGCTGGGGGCGATGGTCGG AAACTATCTATGGCTTTTGGTTTCTTTATTCATAGCAACGTCCGAACACCAGTTAGCGCGTTCACTATTCCTGCTAGCAA CCACATACGGCTTCCTAGCCTGGCCACATCTGGGGTGGGCGCTAAAAAGCAAAATACGTTTTCGCCATAATGACTGGAAA AACTGGCCCCCGGCTTTGCTGGATCCGTTATTAACTGGGTTGATTGCCGGGCTTTCGCTATTAGCCTTAACGTTAAGCGC AAATCATTCGATCCTGGTCTGGAGCACGTTGGTATTCTCCTGTATTAGCCTGTTACTGATTGCCAGACGCTCACCTTCAT TGGATTTATTTGTTCCACTGGCCGCGATATTAGCCATTTCTCCCTTTATTAATGCAGGAACGCTGTTTGAGCCAGAAACC GTCTGGACGAGTCTGCTTGCGCTCAGCACATTAGCGCTATTCTGCGGGATATATGGTAGCTACCAGGTCACCCGGCCGGT TTACCGCAAGCTGTGGTGGGCGTTATTGTCGGTGCTGGTGCCAATGTATCTCGTTGTAAGTACCTATTATGCCTGTCGCG ATAATTTTGAGCTGGCTCCAGTTAAATACACACTGCTGGCGGTTTGTCTGGCTATGTATATCGCGTGGAATGCATTCAGT GATGGGTATCGCCGTGGCTCAGCGCTGTTGCGGACGATCTATCAGGTCGCCGCCCAACTGACGTTGACCTTTGCATTATT TATGGCTTTCAGCCAGGTTACGCTAACCCTGCTGCTCGCGGGTCAGCTTTTAGTTTTGGTACTCTGGCAACGTTGGCGAC AGGTTTCGTTACTGTCTTGGATTTTGAAACTGCATGCGATCATACTGCTGGTTCGCCTGTCAATGAACCCGTATATCCTT GGATATTCCTCGCCGTTGCACATTGGTTCGGTCGTTATTCCTTGGACGCTATACGGTTTTGGGATTCCGATTCTCTGCCT GTGGCTAAGTTCACGCTGGTTACCTGCGCGTCGCGGTGAGCAGACCGCCAATTGGTTAGCGGCCAATGCTATTTATCTGT TGGCCTTGTGGATCAACGTTGAATTACGTCACCTGCTGCATGGCAGCTATCATCTGTCGCTGGATTTCGCTTCTCTTACC GATTGTGCGTTGCATGGGGTGACCTTCGGGCTGATGGCGCTGGCCTACGGCTATCGTGAACAGTTTGCAGATTCGCTACA ACGGATATACCGCCTGGCGGCTAAAACCAGTGCCATTCTGATGCTCACCCTAACGTTGCTCTGCCTGGTTGTCTTTAACC CCATCTGGTCAGCACAACAGGTTGGCGACCTACCGCTGCTGAATATGGTGACCGTTGCCTATGCGATCCCGATGGTGTTC ATGGTGGTAGCACTAAGATACTGGCCAGATCACTGGCTAGATATCCGTCTGAAGCCCTACGTTATCGGTGCGATTGCGCT ACTGGGAATGGTGTTCATTACCTTGACGGTCCGCCAGCTCTGGCATGGTGACCGGTTGGATAATGATATCGTGTACAGCG GCGAACAATACTCTTACTCCTTAGCGTGGATGTTAACTGCCATTGGCATGATGTACAGCGCAATACACTGGCCTAACTAT AAAGTGCGCCGCGCCTCCCTGGGGTTGTTGGCGCTCACGATCGTCAAACTGTTCCTGTGGGATATGTCTGGTCTTGAAGG GCTATATCGTTCGGTCTCATTCCTCGGTCTGGGGCTGTGTCTGGTAGCGATTGGTTGGTTCTACCAGAAGTTTGTCGTTA TGAAGGAAGTCATTGAGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGAAAAATACCTGTCAGATACTGTTTCATGCTATCCGATGAATGGATAGGGTTATCTCATAGAGAATTTTTTACTTAATA AACGCTGAGTTGGATACATA
Downstream 100 bases:
>100_bases AACAAGGATCAGCCGACAGCGGACGTGGTACAAAGCGGGCAATAATCGCCATTTGTCTTACCGGAGCGTGCATCGACTGA TGTGGGAAAATCAATATACA
Product: integral membrane protein
Products: NA
Alternate protein names: MSF Permease
Number of amino acids: Translated: 939; Mature: 939
Protein sequence:
>939_residues MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEESTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ NYLLTKKQSQIKEKAFADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP ESFWKRLEQEFAARWMVWIGGVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAY LFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWK NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFS DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGDLPLLNMVTVAYAIPMVF MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIE
Sequences:
>Translated_939_residues MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEESTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ NYLLTKKQSQIKEKAFADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP ESFWKRLEQEFAARWMVWIGGVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAY LFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWK NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFS DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGDLPLLNMVTVAYAIPMVF MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIE >Mature_939_residues MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEESTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ NYLLTKKQSQIKEKAFADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP ESFWKRLEQEFAARWMVWIGGVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAY LFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWK NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFS DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGDLPLLNMVTVAYAIPMVF MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIE
Specific function: Unknown
COG id: COG5373
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 105594; Mature: 105594
Theoretical pI: Translated: 9.39; Mature: 9.39
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEESTPT CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCH HLADEVAVSKVWTPDYATYQNYLLTKKQSQIKEKAFADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLK HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEECCEEEEEC PQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSPESFWKRLEQEFAARWMVWIG CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGA HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH YTVPLFVSTGSGNVTGLLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIAT HHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAP HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH VKYTLLAVCLAMYIAWNAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYILGYSSPLHIGSVVIPWTLYGF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH GIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHH DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH VGDLPLLNMVTVAYAIPMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLW HCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH DMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >Mature Secondary Structure MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEESTPT CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCH HLADEVAVSKVWTPDYATYQNYLLTKKQSQIKEKAFADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLK HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEECCEEEEEC PQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSPESFWKRLEQEFAARWMVWIG CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGA HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH YTVPLFVSTGSGNVTGLLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIAT HHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAP HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH VKYTLLAVCLAMYIAWNAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYILGYSSPLHIGSVVIPWTLYGF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH GIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHH DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH VGDLPLLNMVTVAYAIPMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLW HCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH DMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA