Definition Yersinia pseudotuberculosis IP 32953, complete genome.
Accession NC_006155
Length 4,744,671

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The map label for this gene is 51596726

Identifier: 51596726

GI number: 51596726

Start: 2835709

End: 2838528

Strand: Reverse

Name: 51596726

Synonym: YPTB2403

Alternate gene names: NA

Gene position: 2838528-2835709 (Counterclockwise)

Preceding gene: 51596727

Following gene: 229310103

Centisome position: 59.83

GC content: 50.96

Gene sequence:

>2820_bases
ATGGAGTATTGGCTGTTAATTTTTTTACTTATTTTCTTGTTTGTTATCTATATGCAAATAAGTGCGTTATCCAACTCGGT
AAAATATATACGAGAAGAGATAGGCAGGCTGCGCAATGAGCTTGCTCCACGCTTGCCTGAACCTACCGTGGCCACTGTTG
AGGAAGAGAGCACGCCAACGCATTTGGCAGATGAAGTGGCCGTGTCCAAGGTATGGACCCCTGATTACGCAACCTATCAA
AATTATCTACTCACCAAAAAGCAAAGCCAGATTAAAGAGAAGGCTTTTGCCGATTCAGTAAAAAAAGAACCCGCCCCGCC
AATAGAATATAGGATTGCTGACCGTCTGGTGGTGCTTAAGCCACAGGATGAGGCCCCTCAAGAATCGCCGAAAATGGATG
CAGGCCCTGCCAGTGGTCATCCACAGAAACCAGACGTGTGGACAAAATTGGAAAATGTCCTGTTTTCCTTAAAATCACCG
GAGAGTTTCTGGAAACGCCTCGAGCAAGAGTTTGCCGCACGTTGGATGGTGTGGATCGGCGGTGTGATCATGGCACTGGG
TGTCATTTTCCTGCTGAAAGCAGGCAGCGAACAGGGTCTGTTCGGGCCAACCTTGCGGATTGGTACCGCCATTGTGCTGA
GTGTGCTGATGGTTGTTGGGGGAGAGTGGCTCAGGCGTTCACGTTTTCAGTTGCCCTTGGTCAATGCCGGTTATATCCCG
GCGGCGCTGAGTGGGGCCGGTATTCTCGGTCTATTTGCCTCAATGCTGGCGGCTAAATATCTCTACGACATGTTCCCGAT
GCCCGTTCTCATGCTATTGCTCAGCCTGATTTCTCTGTTGGCGATGGTGCTGGCATTGTGGCAGGGGCCATTTATGGCGG
CCTTGGGGCTGCTTGGCGCCTATACCGTCCCGTTATTTGTTTCGACGGGCAGCGGTAATGTCACCGGGCTGTTGGCCTAC
CTGTTCCTGGTTAGTTTGGCGTCTATCGGCCTGATGAGCCGTGTCTATCGGCACTGGCTATGGCTGGGGGCGATGGTCGG
AAACTATCTATGGCTTTTGGTTTCTTTATTCATAGCAACGTCCGAACACCAGTTAGCGCGTTCACTATTCCTGCTAGCAA
CCACATACGGCTTCCTAGCCTGGCCACATCTGGGGTGGGCGCTAAAAAGCAAAATACGTTTTCGCCATAATGACTGGAAA
AACTGGCCCCCGGCTTTGCTGGATCCGTTATTAACTGGGTTGATTGCCGGGCTTTCGCTATTAGCCTTAACGTTAAGCGC
AAATCATTCGATCCTGGTCTGGAGCACGTTGGTATTCTCCTGTATTAGCCTGTTACTGATTGCCAGACGCTCACCTTCAT
TGGATTTATTTGTTCCACTGGCCGCGATATTAGCCATTTCTCCCTTTATTAATGCAGGAACGCTGTTTGAGCCAGAAACC
GTCTGGACGAGTCTGCTTGCGCTCAGCACATTAGCGCTATTCTGCGGGATATATGGTAGCTACCAGGTCACCCGGCCGGT
TTACCGCAAGCTGTGGTGGGCGTTATTGTCGGTGCTGGTGCCAATGTATCTCGTTGTAAGTACCTATTATGCCTGTCGCG
ATAATTTTGAGCTGGCTCCAGTTAAATACACACTGCTGGCGGTTTGTCTGGCTATGTATATCGCGTGGAATGCATTCAGT
GATGGGTATCGCCGTGGCTCAGCGCTGTTGCGGACGATCTATCAGGTCGCCGCCCAACTGACGTTGACCTTTGCATTATT
TATGGCTTTCAGCCAGGTTACGCTAACCCTGCTGCTCGCGGGTCAGCTTTTAGTTTTGGTACTCTGGCAACGTTGGCGAC
AGGTTTCGTTACTGTCTTGGATTTTGAAACTGCATGCGATCATACTGCTGGTTCGCCTGTCAATGAACCCGTATATCCTT
GGATATTCCTCGCCGTTGCACATTGGTTCGGTCGTTATTCCTTGGACGCTATACGGTTTTGGGATTCCGATTCTCTGCCT
GTGGCTAAGTTCACGCTGGTTACCTGCGCGTCGCGGTGAGCAGACCGCCAATTGGTTAGCGGCCAATGCTATTTATCTGT
TGGCCTTGTGGATCAACGTTGAATTACGTCACCTGCTGCATGGCAGCTATCATCTGTCGCTGGATTTCGCTTCTCTTACC
GATTGTGCGTTGCATGGGGTGACCTTCGGGCTGATGGCGCTGGCCTACGGCTATCGTGAACAGTTTGCAGATTCGCTACA
ACGGATATACCGCCTGGCGGCTAAAACCAGTGCCATTCTGATGCTCACCCTAACGTTGCTCTGCCTGGTTGTCTTTAACC
CCATCTGGTCAGCACAACAGGTTGGCGACCTACCGCTGCTGAATATGGTGACCGTTGCCTATGCGATCCCGATGGTGTTC
ATGGTGGTAGCACTAAGATACTGGCCAGATCACTGGCTAGATATCCGTCTGAAGCCCTACGTTATCGGTGCGATTGCGCT
ACTGGGAATGGTGTTCATTACCTTGACGGTCCGCCAGCTCTGGCATGGTGACCGGTTGGATAATGATATCGTGTACAGCG
GCGAACAATACTCTTACTCCTTAGCGTGGATGTTAACTGCCATTGGCATGATGTACAGCGCAATACACTGGCCTAACTAT
AAAGTGCGCCGCGCCTCCCTGGGGTTGTTGGCGCTCACGATCGTCAAACTGTTCCTGTGGGATATGTCTGGTCTTGAAGG
GCTATATCGTTCGGTCTCATTCCTCGGTCTGGGGCTGTGTCTGGTAGCGATTGGTTGGTTCTACCAGAAGTTTGTCGTTA
TGAAGGAAGTCATTGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGAAAAATACCTGTCAGATACTGTTTCATGCTATCCGATGAATGGATAGGGTTATCTCATAGAGAATTTTTTACTTAATA
AACGCTGAGTTGGATACATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACAAGGATCAGCCGACAGCGGACGTGGTACAAAGCGGGCAATAATCGCCATTTGTCTTACCGGAGCGTGCATCGACTGA
TGTGGGAAAATCAATATACA

Product: integral membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: MSF Permease

Number of amino acids: Translated: 939; Mature: 939

Protein sequence:

>939_residues
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEESTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ
NYLLTKKQSQIKEKAFADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP
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NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET
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DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL
GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT
DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGDLPLLNMVTVAYAIPMVF
MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY
KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIE

Sequences:

>Translated_939_residues
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEESTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ
NYLLTKKQSQIKEKAFADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP
ESFWKRLEQEFAARWMVWIGGVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP
AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAY
LFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWK
NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET
VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFS
DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL
GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT
DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGDLPLLNMVTVAYAIPMVF
MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY
KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIE
>Mature_939_residues
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEESTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ
NYLLTKKQSQIKEKAFADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP
ESFWKRLEQEFAARWMVWIGGVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP
AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAY
LFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWK
NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET
VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFS
DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL
GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT
DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGDLPLLNMVTVAYAIPMVF
MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY
KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIE

Specific function: Unknown

COG id: COG5373

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 105594; Mature: 105594

Theoretical pI: Translated: 9.39; Mature: 9.39

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEESTPT
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCH
HLADEVAVSKVWTPDYATYQNYLLTKKQSQIKEKAFADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLK
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEECCEEEEEC
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CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
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HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
YTVPLFVSTGSGNVTGLLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIAT
HHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
VKYTLLAVCLAMYIAWNAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
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CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLW
HCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEESTPT
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCH
HLADEVAVSKVWTPDYATYQNYLLTKKQSQIKEKAFADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLK
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEECCEEEEEC
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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
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CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLW
HCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA