| Definition | Mesoplasma florum L1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006055 |
| Length | 793,224 |
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The map label for this gene is 50365379
Identifier: 50365379
GI number: 50365379
Start: 653061
End: 655121
Strand: Reverse
Name: 50365379
Synonym: Mfl562
Alternate gene names: NA
Gene position: 655121-653061 (Counterclockwise)
Preceding gene: 50365380
Following gene: 50365378
Centisome position: 82.59
GC content: 25.96
Gene sequence:
>2061_bases ATGCAACCTGAAGCTACAAATGCAACAGAAAACATAGTTATAAAGACATCAGCTAGAACTAGTGTTTGAAGTGCGCTAGT TGGAGTTGCTATTTCTTTAACAAATACCATTATTCAAATTCTTATGATTTATTGAATTTTGAGTGCTTATGGTACTGAAT TTAATGGGTTCGTAAGAATATCAATGTCAATCGCTATTATTGGTGGTACATGTGAAGGTGCTTTAGGAATAACTACAGTT ATTTTAATGGCAAAACCAATCATGGAAAAAGATTGAATTACAGCAAATGAATCTTTTTCAACAGCAAAAAGAAAATATCG TAATAAATTATGAAGAGGATTAATTTTTGTAACTTTAATTTCAATTTTATATCCTCTTGAAATTGCTTTAGCTCCACATT TTTTACAAGGAGATCCAATTACAACAAGTATTACAGGACCAATTATTAAAGATGGAATGGATCCAATTACAATACATTTA TGAGAATTAGGATTTGTTTGTTTCTTTTTTGGGTTCAAGCAAGTTGTTAGTTCTTCTATTTTTGGTATTTATGAAAATGT CCTTGAAGCTGACAAACAAAACTATTTAAGAAGAGCAATTATTTTGTTTACTGATGTAATTGTATATATGTTAATTATTT CCTTACTAAGTTATATAAATTTTAAAGGAATACATATTAGTCCTGTTTTAGTTTTCTTACCCATTGTTATTTATCCTTTT ATTCGTGGATTTATGATTATGGTATATGTTAAAAGAAAATACCCATGAATTAAATTTTACTCAGATTTTAACGATCATAA TTTAGTGAGAAAATCATCAAAACTTTTCTTTTCTTCATTAGGAATAAATACTTTGATGAATGCTGACATTATTATTCTTC TTATTGTTTTAGGAGCTTCTGGTCTTAAAACAACATCTATGTTATCTATTTATATGATAGTAGGTATTAATATAAGAATT ATTATGTTAAATTTTATTGTTTCTTTTAGAGAGTTCTTTATATCTCAAATTTTAAGAGAAGGAAGAATAGAATGAAAAAC ATATACAAACTATGAACTTTATACATATATTGTTGCTGCATTTAGTTTTGTTATGATTTCGATCCTTACACCTTTTGTTG CAACCGGATTATTTGGAAACGTTATTGCAAAAGATTTTGATGGAACAGAAGCTAGCGCTATATATCAAGCAGAAGCATTA AAATATATATTTTCTGGACAAGAATTTTCAATATTATTTGGTTTATCTACAAGTGCCATTATTATAGTACAAGGTCAGTA TGTTTTAGTTCAAGCTAAAGGTATTGAGAAAAGAACAACTAAATGATTGAACTTGATTGCAACTTGATATGTAGTAACAG AAGCTATAACTTTAGTATTAATTTACTTTTTTGCTTTTAACTCAGGAGATAAACCTAATTGAATACCTAATATTATTAGA TACTTTTACATAATCAAATTAATATTTATGATGATTGCTTACTTCTTCTTGTGGTCATTTACTTGAACGCATATAACTTA TAATTCTTCATTAAAAAATGTAATACCAAACTTTATATTCTTATTAGTTCCAGTTATTTCAACATCTTTATTTATAAAAT ATGGATTAAGTCAATTTGCTTTAATAAAAATAAATATTGCAACTACTGAAGCTGGTACAATAAGTGTTATTGTGGATTCA ATTTCTATTCCAACAATTGTTAGTGTACTCGCCATTACAGGGATTACAAGTTTACCAATTTGTATTATATTGCCTTTAAT ATTCAGACCAAAAATTGGTTTAAATATTATTGTTAACTTACCGATTGTTAAACAAATTATTCAAAAAAATAGTAGTAAAT TAAAAATTGCTAGGTTCATTGATGCAGGTATTAATGCTGAAGAAGAATCAAATCAAAATGATCAAATAATGAAATCTTTA TACGATCAAATTGAAGAAAATAATGAAATAATTAATGATGAAAATTATTTTGAAAAAAGATATAAATATAAAAATACACC AAAAGTTTATACACTAAAACCTACTGAAACAACAGTTGCAAAAGTGAAAACTAAAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGCTAATAAATTAGTGTTCAATGGTTTTGAAGGAAATTTGGAAAATCTAAATGGTAAAATTATAGAAATAGAACCAACCT GATAAAAAGGAGGTGGAGAA
Downstream 100 bases:
>100_bases CATTAATTCTTAAAACTAAGCCCTTTAAAAATTGGGCTTTTTTTGCTATAATTTTAAAAGTTGATTATTTAACAAAAAAT ATAGATATTCAATCACAAGC
Product: transporter
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 686; Mature: 686
Protein sequence:
>686_residues MQPEATNATENIVIKTSARTSVWSALVGVAISLTNTIIQILMIYWILSAYGTEFNGFVRISMSIAIIGGTCEGALGITTV ILMAKPIMEKDWITANESFSTAKRKYRNKLWRGLIFVTLISILYPLEIALAPHFLQGDPITTSITGPIIKDGMDPITIHL WELGFVCFFFGFKQVVSSSIFGIYENVLEADKQNYLRRAIILFTDVIVYMLIISLLSYINFKGIHISPVLVFLPIVIYPF IRGFMIMVYVKRKYPWIKFYSDFNDHNLVRKSSKLFFSSLGINTLMNADIIILLIVLGASGLKTTSMLSIYMIVGINIRI IMLNFIVSFREFFISQILREGRIEWKTYTNYELYTYIVAAFSFVMISILTPFVATGLFGNVIAKDFDGTEASAIYQAEAL KYIFSGQEFSILFGLSTSAIIIVQGQYVLVQAKGIEKRTTKWLNLIATWYVVTEAITLVLIYFFAFNSGDKPNWIPNIIR YFYIIKLIFMMIAYFFLWSFTWTHITYNSSLKNVIPNFIFLLVPVISTSLFIKYGLSQFALIKINIATTEAGTISVIVDS ISIPTIVSVLAITGITSLPICIILPLIFRPKIGLNIIVNLPIVKQIIQKNSSKLKIARFIDAGINAEEESNQNDQIMKSL YDQIEENNEIINDENYFEKRYKYKNTPKVYTLKPTETTVAKVKTKK
Sequences:
>Translated_686_residues MQPEATNATENIVIKTSARTSV*SALVGVAISLTNTIIQILMIY*ILSAYGTEFNGFVRISMSIAIIGGTCEGALGITTV ILMAKPIMEKD*ITANESFSTAKRKYRNKL*RGLIFVTLISILYPLEIALAPHFLQGDPITTSITGPIIKDGMDPITIHL *ELGFVCFFFGFKQVVSSSIFGIYENVLEADKQNYLRRAIILFTDVIVYMLIISLLSYINFKGIHISPVLVFLPIVIYPF IRGFMIMVYVKRKYP*IKFYSDFNDHNLVRKSSKLFFSSLGINTLMNADIIILLIVLGASGLKTTSMLSIYMIVGINIRI IMLNFIVSFREFFISQILREGRIE*KTYTNYELYTYIVAAFSFVMISILTPFVATGLFGNVIAKDFDGTEASAIYQAEAL KYIFSGQEFSILFGLSTSAIIIVQGQYVLVQAKGIEKRTTK*LNLIAT*YVVTEAITLVLIYFFAFNSGDKPN*IPNIIR YFYIIKLIFMMIAYFFLWSFT*THITYNSSLKNVIPNFIFLLVPVISTSLFIKYGLSQFALIKINIATTEAGTISVIVDS ISIPTIVSVLAITGITSLPICIILPLIFRPKIGLNIIVNLPIVKQIIQKNSSKLKIARFIDAGINAEEESNQNDQIMKSL YDQIEENNEIINDENYFEKRYKYKNTPKVYTLKPTETTVAKVKTKK >Mature_686_residues MQPEATNATENIVIKTSARTSV*SALVGVAISLTNTIIQILMIY*ILSAYGTEFNGFVRISMSIAIIGGTCEGALGITTV ILMAKPIMEKD*ITANESFSTAKRKYRNKL*RGLIFVTLISILYPLEIALAPHFLQGDPITTSITGPIIKDGMDPITIHL *ELGFVCFFFGFKQVVSSSIFGIYENVLEADKQNYLRRAIILFTDVIVYMLIISLLSYINFKGIHISPVLVFLPIVIYPF IRGFMIMVYVKRKYP*IKFYSDFNDHNLVRKSSKLFFSSLGINTLMNADIIILLIVLGASGLKTTSMLSIYMIVGINIRI IMLNFIVSFREFFISQILREGRIE*KTYTNYELYTYIVAAFSFVMISILTPFVATGLFGNVIAKDFDGTEASAIYQAEAL KYIFSGQEFSILFGLSTSAIIIVQGQYVLVQAKGIEKRTTK*LNLIAT*YVVTEAITLVLIYFFAFNSGDKPN*IPNIIR YFYIIKLIFMMIAYFFLWSFT*THITYNSSLKNVIPNFIFLLVPVISTSLFIKYGLSQFALIKINIATTEAGTISVIVDS ISIPTIVSVLAITGITSLPICIILPLIFRPKIGLNIIVNLPIVKQIIQKNSSKLKIARFIDAGINAEEESNQNDQIMKSL YDQIEENNEIINDENYFEKRYKYKNTPKVYTLKPTETTVAKVKTKK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 75675; Mature: 75675
Theoretical pI: Translated: 9.65; Mature: 9.65
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQPEATNATENIVIKTSARTSVSALVGVAISLTNTIIQILMIYILSAYGTEFNGFVRISM CCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEE SIAIIGGTCEGALGITTVILMAKPIMEKDITANESFSTAKRKYRNKLRGLIFVTLISILY EEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLEIALAPHFLQGDPITTSITGPIIKDGMDPITIHLELGFVCFFFGFKQVVSSSIFGIYE HHHHHHCCCEECCCCCEECCCCCHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NVLEADKQNYLRRAIILFTDVIVYMLIISLLSYINFKGIHISPVLVFLPIVIYPFIRGFM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMVYVKRKYPIKFYSDFNDHNLVRKSSKLFFSSLGINTLMNADIIILLIVLGASGLKTTS HHHHHHCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHH MLSIYMIVGINIRIIMLNFIVSFREFFISQILREGRIEKTYTNYELYTYIVAAFSFVMIS HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH ILTPFVATGLFGNVIAKDFDGTEASAIYQAEALKYIFSGQEFSILFGLSTSAIIIVQGQY HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCE VLVQAKGIEKRTTKLNLIATYVVTEAITLVLIYFFAFNSGDKPNIPNIIRYFYIIKLIFM EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH MIAYFFLWSFTTHITYNSSLKNVIPNFIFLLVPVISTSLFIKYGLSQFALIKINIATTEA HHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEECCC GTISVIVDSISIPTIVSVLAITGITSLPICIILPLIFRPKIGLNIIVNLPIVKQIIQKNS CEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHHCCC SKLKIARFIDAGINAEEESNQNDQIMKSLYDQIEENNEIINDENYFEKRYKYKNTPKVYT CCEEHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEEEE LKPTETTVAKVKTKK ECCCCCCHHEEECCC >Mature Secondary Structure MQPEATNATENIVIKTSARTSVSALVGVAISLTNTIIQILMIYILSAYGTEFNGFVRISM CCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEE SIAIIGGTCEGALGITTVILMAKPIMEKDITANESFSTAKRKYRNKLRGLIFVTLISILY EEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLEIALAPHFLQGDPITTSITGPIIKDGMDPITIHLELGFVCFFFGFKQVVSSSIFGIYE HHHHHHCCCEECCCCCEECCCCCHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NVLEADKQNYLRRAIILFTDVIVYMLIISLLSYINFKGIHISPVLVFLPIVIYPFIRGFM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMVYVKRKYPIKFYSDFNDHNLVRKSSKLFFSSLGINTLMNADIIILLIVLGASGLKTTS HHHHHHCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHH MLSIYMIVGINIRIIMLNFIVSFREFFISQILREGRIEKTYTNYELYTYIVAAFSFVMIS HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH ILTPFVATGLFGNVIAKDFDGTEASAIYQAEALKYIFSGQEFSILFGLSTSAIIIVQGQY HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCE VLVQAKGIEKRTTKLNLIATYVVTEAITLVLIYFFAFNSGDKPNIPNIIRYFYIIKLIFM EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH MIAYFFLWSFTTHITYNSSLKNVIPNFIFLLVPVISTSLFIKYGLSQFALIKINIATTEA HHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEECCC GTISVIVDSISIPTIVSVLAITGITSLPICIILPLIFRPKIGLNIIVNLPIVKQIIQKNS CEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHHCCC SKLKIARFIDAGINAEEESNQNDQIMKSLYDQIEENNEIINDENYFEKRYKYKNTPKVYT CCEEHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEEEE LKPTETTVAKVKTKK ECCCCCCHHEEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA