| Definition | Acinetobacter sp. ADP1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005966 |
| Length | 3,598,621 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 50086177
Identifier: 50086177
GI number: 50086177
Start: 3105181
End: 3107250
Strand: Direct
Name: 50086177
Synonym: ACIAD3177
Alternate gene names: NA
Gene position: 3105181-3107250 (Clockwise)
Preceding gene: 50086174
Following gene: 50086178
Centisome position: 86.29
GC content: 44.11
Gene sequence:
>2070_bases ATGTTACTAAAAAGCCTCGTTTCATCGATTTCAAAAGTTACTCAAGATCTAGGTAACGTTATTTCAACTCAGTCTGCGCT TTCCTCGGAAGGCTCCTTACAGCTTTCACTTACTTTATCTGCAACAGCCAATTCACTCATTAATAATCTAACATCTTCAT CTTCAACAATAAAAACCATTATCGATGGCTTAACAGACAATTTACATAGCACCCCTTTAGAAACAGTCACAGACCTGTTG GGTGGACTCACTGGTGGTATCAGTACAGGAGATAATCCTCTTTCTGCCATTACCACACCCTTACAAACAGGTATTGATGT ATTGCAGGGGGTTGAATCATTAAAAACCGATGTAATTAACTCCGCAATCGACACACTGGCAGATGCAGGAATTAGCATCT TGCCTCAGGCCGAACATCAGATTTCAACGCTTGCTGATTTAGGTACCCTCACTTTTGAAACCTCTCGTGATACCGTCAAC GGTACACTTGATGCTGTTTCTGCTGTGGTTGATCTCAATCCTCAAGGGGTCAGTACCGCATTGACTGGTGTCGTGGGTAC ATTGGTTGAAAATGGTTCAACCGCTGCCAATCTATTGAGTGGTTTATCTGGTGGGCTCGAAGGTAATCCGCTTGAAACTG TCACCGATCTATTGGGTGGAATCACTGGTGGCGCCAATGGTAATCCACTTGAAGCAGTTACCGATCTACTCGGTGGAGTC ACTGGCGGTACAAATGGTAATCCAATTGAAACTATCACCGATCTACTGGGTGAACTCACCAGTGGCATTAATACAGGAGA TAATCCACTTGCTACAATTACTGCACCCTTACAATCAGGTATTGATGTATTGCAAGGGATTGAATCATTAAAAACTGATG TGATTAACTCCGCAATCGACACACTGGCAGATGCAGGAATTAGTATCTTGCCTCAGGCCGAACATCAGATTTCAACGCTT GCTGATTTAGGTACCCTCACTTTTGAAACCTCTCGTGATACCGTCAACGGTACACTTGATGCTGTTTCTGCTGTGGTTGA TCTCAATCCTCAAGGGGTCAGTACCGCATTGACGGGTGTCGTGGGTACATTGGTTGAAAATGGTTCAACCGCTGCCAATC TATTGAGTGGTTTATCTGGTGGGCTCGAAGGTAATCCGCTTGAAACTGTCACCGATCTATTGGGTGGAATCACTGGTGGC ACCAATGGTAATCCACTTGAAGCAGTTACCGATCTACTCGGTGGACTGACTGGCGGTACAAATGTTAATCCAATTGAAAC TATCACCGATCTACTTGGCGAACTCACCAGTGGCATTAATACAGGAGACAATCCACTTGCTGCAATTACTGCACCCTTAC AAACAGGTATTGATGTATTGCAAGGGGTTGAATCATTAAAAACCGATGTAATTAACTCCACAATCGACACACTGGCAGAT GCAGGAATTAGCATCTTGCCTCAGGCCGAACATCAGATTTCAACGCTTGCTGATTTAGGTACCCTCACTTTTGAAACCTC TCGTGATACCGTCAACGGTACACTTGATGCTGTTTCTGCTGTGGTTGATCTCAATCCTCAAGGGGTCAGTACCGCATTAA CTGGTGTCGTGGGTACATTGGTTGAAAATGGTTCAACCGCTGCCAATCTATTGAGTGGTTTATCTGGTGGGCTCGAAGGT AATCCGCTTGAAACTGTCACCGATCTACTCGGTGGACTGACTGGCAATGTTGATACAGGGCTTTTAGATGATTTAACCGG ATCATTTCATGGGCTGATCGATATTGGTGAAACACTGGTATTAGATAGTACAGAAATTGTTGCAGATGCATCACATGCTC TCCTCAATACCTTTGAAAGCGCAGCGGACAGTACAGTAAACCTCGTCTCGTCTTTGCTAGATAGCGTAACACTCTCTACA GAAGGTGCAAATAGCCAGCTTGGTGTTGTTAATGATCTGCTCAGCAATCTAACTTCATCGCTCAGCAATGTCAGCCATAC TTATCAAGTACCAATCTCTGTTCCAAACGTATTGGATCAGCTTCTCGAAAATCAGTTATCTACAGTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATAATCGAGATACCTATCTCAATAACCAGTTAAAACAAAATGAATCAAACATTTAATGAACAAACACGCAAAAAAATTC ACAAAAGGAAAATTTAAATC
Downstream 100 bases:
>100_bases ACTCACCCTAAACACAAACGCCGTCTATATGAATGTAGACGGCGTTTTATATGCTTAATTTTTTTAAAATCCAGATACAG ACTAAAATGTTTATTTAGAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 689; Mature: 689
Protein sequence:
>689_residues MLLKSLVSSISKVTQDLGNVISTQSALSSEGSLQLSLTLSATANSLINNLTSSSSTIKTIIDGLTDNLHSTPLETVTDLL GGLTGGISTGDNPLSAITTPLQTGIDVLQGVESLKTDVINSAIDTLADAGISILPQAEHQISTLADLGTLTFETSRDTVN GTLDAVSAVVDLNPQGVSTALTGVVGTLVENGSTAANLLSGLSGGLEGNPLETVTDLLGGITGGANGNPLEAVTDLLGGV TGGTNGNPIETITDLLGELTSGINTGDNPLATITAPLQSGIDVLQGIESLKTDVINSAIDTLADAGISILPQAEHQISTL ADLGTLTFETSRDTVNGTLDAVSAVVDLNPQGVSTALTGVVGTLVENGSTAANLLSGLSGGLEGNPLETVTDLLGGITGG TNGNPLEAVTDLLGGLTGGTNVNPIETITDLLGELTSGINTGDNPLAAITAPLQTGIDVLQGVESLKTDVINSTIDTLAD AGISILPQAEHQISTLADLGTLTFETSRDTVNGTLDAVSAVVDLNPQGVSTALTGVVGTLVENGSTAANLLSGLSGGLEG NPLETVTDLLGGLTGNVDTGLLDDLTGSFHGLIDIGETLVLDSTEIVADASHALLNTFESAADSTVNLVSSLLDSVTLST EGANSQLGVVNDLLSNLTSSLSNVSHTYQVPISVPNVLDQLLENQLSTV
Sequences:
>Translated_689_residues MLLKSLVSSISKVTQDLGNVISTQSALSSEGSLQLSLTLSATANSLINNLTSSSSTIKTIIDGLTDNLHSTPLETVTDLL GGLTGGISTGDNPLSAITTPLQTGIDVLQGVESLKTDVINSAIDTLADAGISILPQAEHQISTLADLGTLTFETSRDTVN GTLDAVSAVVDLNPQGVSTALTGVVGTLVENGSTAANLLSGLSGGLEGNPLETVTDLLGGITGGANGNPLEAVTDLLGGV TGGTNGNPIETITDLLGELTSGINTGDNPLATITAPLQSGIDVLQGIESLKTDVINSAIDTLADAGISILPQAEHQISTL ADLGTLTFETSRDTVNGTLDAVSAVVDLNPQGVSTALTGVVGTLVENGSTAANLLSGLSGGLEGNPLETVTDLLGGITGG TNGNPLEAVTDLLGGLTGGTNVNPIETITDLLGELTSGINTGDNPLAAITAPLQTGIDVLQGVESLKTDVINSTIDTLAD AGISILPQAEHQISTLADLGTLTFETSRDTVNGTLDAVSAVVDLNPQGVSTALTGVVGTLVENGSTAANLLSGLSGGLEG NPLETVTDLLGGLTGNVDTGLLDDLTGSFHGLIDIGETLVLDSTEIVADASHALLNTFESAADSTVNLVSSLLDSVTLST EGANSQLGVVNDLLSNLTSSLSNVSHTYQVPISVPNVLDQLLENQLSTV >Mature_689_residues MLLKSLVSSISKVTQDLGNVISTQSALSSEGSLQLSLTLSATANSLINNLTSSSSTIKTIIDGLTDNLHSTPLETVTDLL GGLTGGISTGDNPLSAITTPLQTGIDVLQGVESLKTDVINSAIDTLADAGISILPQAEHQISTLADLGTLTFETSRDTVN GTLDAVSAVVDLNPQGVSTALTGVVGTLVENGSTAANLLSGLSGGLEGNPLETVTDLLGGITGGANGNPLEAVTDLLGGV TGGTNGNPIETITDLLGELTSGINTGDNPLATITAPLQSGIDVLQGIESLKTDVINSAIDTLADAGISILPQAEHQISTL ADLGTLTFETSRDTVNGTLDAVSAVVDLNPQGVSTALTGVVGTLVENGSTAANLLSGLSGGLEGNPLETVTDLLGGITGG TNGNPLEAVTDLLGGLTGGTNVNPIETITDLLGELTSGINTGDNPLAAITAPLQTGIDVLQGVESLKTDVINSTIDTLAD AGISILPQAEHQISTLADLGTLTFETSRDTVNGTLDAVSAVVDLNPQGVSTALTGVVGTLVENGSTAANLLSGLSGGLEG NPLETVTDLLGGLTGNVDTGLLDDLTGSFHGLIDIGETLVLDSTEIVADASHALLNTFESAADSTVNLVSSLLDSVTLST EGANSQLGVVNDLLSNLTSSLSNVSHTYQVPISVPNVLDQLLENQLSTV
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69000; Mature: 69000
Theoretical pI: Translated: 3.40; Mature: 3.40
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 0.1 %Met (Translated Protein) 0.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.1 %Met (Mature Protein) 0.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLLKSLVSSISKVTQDLGNVISTQSALSSEGSLQLSLTLSATANSLINNLTSSSSTIKTI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH IDGLTDNLHSTPLETVTDLLGGLTGGISTGDNPLSAITTPLQTGIDVLQGVESLKTDVIN HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SAIDTLADAGISILPQAEHQISTLADLGTLTFETSRDTVNGTLDAVSAVVDLNPQGVSTA HHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH LTGVVGTLVENGSTAANLLSGLSGGLEGNPLETVTDLLGGITGGANGNPLEAVTDLLGGV HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC TGGTNGNPIETITDLLGELTSGINTGDNPLATITAPLQSGIDVLQGIESLKTDVINSAID CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLADAGISILPQAEHQISTLADLGTLTFETSRDTVNGTLDAVSAVVDLNPQGVSTALTGV HHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH VGTLVENGSTAANLLSGLSGGLEGNPLETVTDLLGGITGGTNGNPLEAVTDLLGGLTGGT HHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC NVNPIETITDLLGELTSGINTGDNPLAAITAPLQTGIDVLQGVESLKTDVINSTIDTLAD CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AGISILPQAEHQISTLADLGTLTFETSRDTVNGTLDAVSAVVDLNPQGVSTALTGVVGTL CCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH VENGSTAANLLSGLSGGLEGNPLETVTDLLGGLTGNVDTGLLDDLTGSFHGLIDIGETLV HCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHCCCCCE LDSTEIVADASHALLNTFESAADSTVNLVSSLLDSVTLSTEGANSQLGVVNDLLSNLTSS ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LSNVSHTYQVPISVPNVLDQLLENQLSTV HHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MLLKSLVSSISKVTQDLGNVISTQSALSSEGSLQLSLTLSATANSLINNLTSSSSTIKTI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH IDGLTDNLHSTPLETVTDLLGGLTGGISTGDNPLSAITTPLQTGIDVLQGVESLKTDVIN HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SAIDTLADAGISILPQAEHQISTLADLGTLTFETSRDTVNGTLDAVSAVVDLNPQGVSTA HHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH LTGVVGTLVENGSTAANLLSGLSGGLEGNPLETVTDLLGGITGGANGNPLEAVTDLLGGV HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC TGGTNGNPIETITDLLGELTSGINTGDNPLATITAPLQSGIDVLQGIESLKTDVINSAID CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLADAGISILPQAEHQISTLADLGTLTFETSRDTVNGTLDAVSAVVDLNPQGVSTALTGV HHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH VGTLVENGSTAANLLSGLSGGLEGNPLETVTDLLGGITGGTNGNPLEAVTDLLGGLTGGT HHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC NVNPIETITDLLGELTSGINTGDNPLAAITAPLQTGIDVLQGVESLKTDVINSTIDTLAD CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AGISILPQAEHQISTLADLGTLTFETSRDTVNGTLDAVSAVVDLNPQGVSTALTGVVGTL CCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH VENGSTAANLLSGLSGGLEGNPLETVTDLLGGLTGNVDTGLLDDLTGSFHGLIDIGETLV HCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHCCCCCE LDSTEIVADASHALLNTFESAADSTVNLVSSLLDSVTLSTEGANSQLGVVNDLLSNLTSS ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LSNVSHTYQVPISVPNVLDQLLENQLSTV HHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA