| Definition | Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005957 |
| Length | 5,237,682 |
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The map label for this gene is 49481710
Identifier: 49481710
GI number: 49481710
Start: 3195444
End: 3197102
Strand: Reverse
Name: 49481710
Synonym: BT9727_3126
Alternate gene names: NA
Gene position: 3197102-3195444 (Counterclockwise)
Preceding gene: 49479016
Following gene: 49478183
Centisome position: 61.04
GC content: 32.43
Gene sequence:
>1659_bases ATGAGTAAAATTTGGACGTTAACGAAAGTATTATTGAAATTAAATTATGCAGATTTTATAACAGATAAGAAGAAGCGATG GGCGTATGTATTTTCATTTGCAGCTATTTTATTTGTCGGCTTTTTACTGTTTGGTTCTATCACGCATGCAATGTATGAGG GAATGATACATTTAGGGCAAGATCCAGGAATGATTATCGCAATGGGACTTGCGATTGCGAGTATATGGGTATTTTTAATG AGTATTACGAACATTTTAACTGTATTTTACTACAGCAATGATATTGAAATGTTATTACCATTACCATTAAAACCAGCGCA AATTATTTCAGCCAAATTTTTAACGGTATTAATTACACAATACGTAATGAGTTCATTTATTTTATTACCGATCTTTATTA CGTACGGTTTAAAAAGTGGCGCATTTATTACATATTACATATATATGATTTTCATTTACTTACTCTTCCCAATTGTGCCG TTAGTACTAGCTTCGTTACTGATGACAGTTATTATGAGGTATACAAATATAGCGAAAAATAAAGACCGAGGAAATATATT TATTGGAATCGTAAGTATACTATTTATTGTAGGAATTAACGTATTTTTGCAGTGGAAAAATAAAAGTTCGTTTTCTGAAG ATGCAATTGCGGATTACCTTGCAAACAACCAGTCTTCTCTTTTAGTACAAATGACAAACTATTTTCCAACTACATATTTT GGAGCAGTAGCATTAGTAGAAAATGCAAATTGGAAGGGTCCTTTATACGTAATAATCTTTGCAGTTATTTCATTTGTATT TTTTGTGTTGTTTTATTACATTGCAGAGCGTACATATTTAAAAGGGGTTATTGGACTTTCAACGAGTACAGCAAAAAAAG AAGTCATTTCAGCAGAAGGCTTACAGAAATCTACGGTACAAAGTTCACATTTGAAAGCATATGTGAAAAAAGAATTTAAA ACGTTATTCCGTACACCACAATTTTTCTTAAATTGTATCGTACAAACTTTCGTTATGCCGATTATGTTGTTCTTCATTTT ATTCGTGCAAGATGGGAATTTAAAATGGATCACGGGATATATTGATAACCCAAAATCAGCAGGGCTTGCAATTGGTGTTG GCCTTTGTGCCTCTCTATTTTTAATGGGAAGTAACGTCATCGCAACAACTTCATTCTCACGTGATGGAAGCTCTTGGTTT GTGAATCGTTATTTACCAGTAAAAGCTTCGGATATCTTTTTTGCGAAAGCGATCACTGCTTGGTTAATTAATGTAATTAT TTTAGCAGTGTTCGGTATTACGATGGCAGTTGTAGCGGGAATTTCTCCAGTATTTATGGTTCTTTGGTTCTTATTAAGCG CGAACGGTTTATTGTTAATTAATTTAATCGGCACACGCTGGGATGCACAAACTGCAGATATACATTGGGATACAGAGCAG AAATTATTTAAGAGCCGCTATACAACTTTGTGGAATTTTTTAGCTAATATTTTAATAGCTTTAGTTATTGTAGCGGGAGT AAGTCTATTATACTTCTTCCTTCATGTCGGACTGTGGGTTATGTTTATCGTTTTATTTGTAATGTTTACGATTGTAAATT ATATCTTTATTAAAATTTTAAAATTAGGTGCAGAACGTATATTGTCAAATATTGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATAAGGGAAACCTTCAGTTCAAAGGGAATTTAGATGAAATGAGAGATCATTTTAAATCCAATGAATCACTTGAAAAAAT GTTCTTGGAGATGACGGGCA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAGATAGATCCTCTGTATTCGTGCAGAGGATTTATCCATAGGTGGAGGAGAAAAGGTGAAGAAAATAGCAATTGTAACA GGGGCCACTCGTCTGAATGG
Product: ABC transporter permease
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 552; Mature: 551
Protein sequence:
>552_residues MSKIWTLTKVLLKLNYADFITDKKKRWAYVFSFAAILFVGFLLFGSITHAMYEGMIHLGQDPGMIIAMGLAIASIWVFLM SITNILTVFYYSNDIEMLLPLPLKPAQIISAKFLTVLITQYVMSSFILLPIFITYGLKSGAFITYYIYMIFIYLLFPIVP LVLASLLMTVIMRYTNIAKNKDRGNIFIGIVSILFIVGINVFLQWKNKSSFSEDAIADYLANNQSSLLVQMTNYFPTTYF GAVALVENANWKGPLYVIIFAVISFVFFVLFYYIAERTYLKGVIGLSTSTAKKEVISAEGLQKSTVQSSHLKAYVKKEFK TLFRTPQFFLNCIVQTFVMPIMLFFILFVQDGNLKWITGYIDNPKSAGLAIGVGLCASLFLMGSNVIATTSFSRDGSSWF VNRYLPVKASDIFFAKAITAWLINVIILAVFGITMAVVAGISPVFMVLWFLLSANGLLLINLIGTRWDAQTADIHWDTEQ KLFKSRYTTLWNFLANILIALVIVAGVSLLYFFLHVGLWVMFIVLFVMFTIVNYIFIKILKLGAERILSNIE
Sequences:
>Translated_552_residues MSKIWTLTKVLLKLNYADFITDKKKRWAYVFSFAAILFVGFLLFGSITHAMYEGMIHLGQDPGMIIAMGLAIASIWVFLM SITNILTVFYYSNDIEMLLPLPLKPAQIISAKFLTVLITQYVMSSFILLPIFITYGLKSGAFITYYIYMIFIYLLFPIVP LVLASLLMTVIMRYTNIAKNKDRGNIFIGIVSILFIVGINVFLQWKNKSSFSEDAIADYLANNQSSLLVQMTNYFPTTYF GAVALVENANWKGPLYVIIFAVISFVFFVLFYYIAERTYLKGVIGLSTSTAKKEVISAEGLQKSTVQSSHLKAYVKKEFK TLFRTPQFFLNCIVQTFVMPIMLFFILFVQDGNLKWITGYIDNPKSAGLAIGVGLCASLFLMGSNVIATTSFSRDGSSWF VNRYLPVKASDIFFAKAITAWLINVIILAVFGITMAVVAGISPVFMVLWFLLSANGLLLINLIGTRWDAQTADIHWDTEQ KLFKSRYTTLWNFLANILIALVIVAGVSLLYFFLHVGLWVMFIVLFVMFTIVNYIFIKILKLGAERILSNIE >Mature_551_residues SKIWTLTKVLLKLNYADFITDKKKRWAYVFSFAAILFVGFLLFGSITHAMYEGMIHLGQDPGMIIAMGLAIASIWVFLMS ITNILTVFYYSNDIEMLLPLPLKPAQIISAKFLTVLITQYVMSSFILLPIFITYGLKSGAFITYYIYMIFIYLLFPIVPL VLASLLMTVIMRYTNIAKNKDRGNIFIGIVSILFIVGINVFLQWKNKSSFSEDAIADYLANNQSSLLVQMTNYFPTTYFG AVALVENANWKGPLYVIIFAVISFVFFVLFYYIAERTYLKGVIGLSTSTAKKEVISAEGLQKSTVQSSHLKAYVKKEFKT LFRTPQFFLNCIVQTFVMPIMLFFILFVQDGNLKWITGYIDNPKSAGLAIGVGLCASLFLMGSNVIATTSFSRDGSSWFV NRYLPVKASDIFFAKAITAWLINVIILAVFGITMAVVAGISPVFMVLWFLLSANGLLLINLIGTRWDAQTADIHWDTEQK LFKSRYTTLWNFLANILIALVIVAGVSLLYFFLHVGLWVMFIVLFVMFTIVNYIFIKILKLGAERILSNIE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 62425; Mature: 62293
Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 3.4 %Met (Translated Protein) 3.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSKIWTLTKVLLKLNYADFITDKKKRWAYVFSFAAILFVGFLLFGSITHAMYEGMIHLGQ CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC DPGMIIAMGLAIASIWVFLMSITNILTVFYYSNDIEMLLPLPLKPAQIISAKFLTVLITQ CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH YVMSSFILLPIFITYGLKSGAFITYYIYMIFIYLLFPIVPLVLASLLMTVIMRYTNIAKN HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KDRGNIFIGIVSILFIVGINVFLQWKNKSSFSEDAIADYLANNQSSLLVQMTNYFPTTYF CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHCCCHHHH GAVALVENANWKGPLYVIIFAVISFVFFVLFYYIAERTYLKGVIGLSTSTAKKEVISAEG HHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCC LQKSTVQSSHLKAYVKKEFKTLFRTPQFFLNCIVQTFVMPIMLFFILFVQDGNLKWITGY CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEE IDNPKSAGLAIGVGLCASLFLMGSNVIATTSFSRDGSSWFVNRYLPVKASDIFFAKAITA CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH WLINVIILAVFGITMAVVAGISPVFMVLWFLLSANGLLLINLIGTRWDAQTADIHWDTEQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEECCHHH KLFKSRYTTLWNFLANILIALVIVAGVSLLYFFLHVGLWVMFIVLFVMFTIVNYIFIKIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KLGAERILSNIE HHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure SKIWTLTKVLLKLNYADFITDKKKRWAYVFSFAAILFVGFLLFGSITHAMYEGMIHLGQ CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC DPGMIIAMGLAIASIWVFLMSITNILTVFYYSNDIEMLLPLPLKPAQIISAKFLTVLITQ CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH YVMSSFILLPIFITYGLKSGAFITYYIYMIFIYLLFPIVPLVLASLLMTVIMRYTNIAKN HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KDRGNIFIGIVSILFIVGINVFLQWKNKSSFSEDAIADYLANNQSSLLVQMTNYFPTTYF CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHCCCHHHH GAVALVENANWKGPLYVIIFAVISFVFFVLFYYIAERTYLKGVIGLSTSTAKKEVISAEG HHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCC LQKSTVQSSHLKAYVKKEFKTLFRTPQFFLNCIVQTFVMPIMLFFILFVQDGNLKWITGY CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEE IDNPKSAGLAIGVGLCASLFLMGSNVIATTSFSRDGSSWFVNRYLPVKASDIFFAKAITA CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH WLINVIILAVFGITMAVVAGISPVFMVLWFLLSANGLLLINLIGTRWDAQTADIHWDTEQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEECCHHH KLFKSRYTTLWNFLANILIALVIVAGVSLLYFFLHVGLWVMFIVLFVMFTIVNYIFIKIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KLGAERILSNIE HHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA