Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yfiS [H]

Identifier: 49184621

GI number: 49184621

Start: 1625063

End: 1626331

Strand: Direct

Name: yfiS [H]

Synonym: BAS1607

Alternate gene names: 49184621

Gene position: 1625063-1626331 (Clockwise)

Preceding gene: 49184617

Following gene: 49184622

Centisome position: 31.08

GC content: 35.86

Gene sequence:

>1269_bases
ATGGAAGATGTAAGTATAGGTCAAACTGATTCAAGAATGAAGATTGCAACGAGAAATATTATTTTAATGATGATTGGAAA
AATGACGTCTTTATTAGGCGCAAGTATTTATACGTTCGCAATGGGGTTATACGTATTAAAGACAACGGGTTCTGGGATGG
GCTTTGCTACTACGCTCGTTTGCGGATCACTTCCAAGGATGATCTGTGGACCAATTGCTGGTGCTGTAGCTGACCGTGTG
AGTCGAAGATGGCTTGTCATCGGTACAGATTTATTAAGTAGTTTAACGATGCTTATTATGTTTATTCTTGCTACTATATT
TGGACCATCACTTCCTTTTATTTATATTTCAGCAGCATTATTATCAATTTGTGCAAGTTTTTATTCTGTTGCATTAACTT
CGTCTATTCCTAATTTAGTAGATGAGGGGCGTATTCAAAAAGCGAGTGCTTTAAATCAAACGGCAGCTTCTTTATCAAAT
ATTTTAGGGCCAATTATTGGCGGAGTTGTATTTGGTTTCCTTTCAATTCAGTCGTTCTTTTTGTTAAATAGTATTACGTT
CTTTTTAGCGGTTATTTTGCAATTGTTTATTGTATTTGATTTATATAAAAAAGAAGTGGCTGAGAGTAAAGAGCATTTCT
TGACGAGTATAAAAGAAGGTTTTTCATATGTAAAACGACAACATGAAATATATGGTTTAATGAAAATAGCATTGTGGGTA
AACTTTTTTGCTTGTGGGCTAACCGTTGCACTTCCGTACATTATTGTCCATACATTGCATTTATCTTCAAAGCAACTCGG
AACTGTAGAGGGAATGTTAGCAGTCGGAATGCTAATGGGTGCGATTACTTTATCAGTGCGTAAAGAAGTGAATAATCCGT
TTCGTTCTATTTATACTGGACTGTTTTTGTTTGCAGGTTTGAGTTTATGTACAGTATTCCCGTTGTTAGTTACCATTCCA
AAAGTAGCAAGTTTTATTTACTATATTGCTTTCATGATGTTAACTGGTATAGCAATTATGATTGTAAATATTCCAATGCA
AGTACATATGCAAAAGACCACAGATCCGAGCTACTTAGGGCGTGTGTTTGGCCTACTTGAAACAATTGCGACTGCAATCG
CACCGCTCGGTATGATTGTATATGGATTATTGTTAGATATGTTGCCAACTAGCATTGTTATGATGACAATAGGCGGAGGT
TTATTGTTAGTTGTATTAGTTGGAGTAAGGCAACATATGGCGAAAAAACAAGTGGATGTGTCGGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAAGTTAAATACAATTAAACTTTTTTGTTGTAATAATTGGAAAGCTGATTATATAATAAGTTTAACACAATTTAACT
TTTAAGGGGAGAGTGTCAGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATAAGAAAATAATAAAAATGACCAAATTAGTATTTTAGTTTTTGAAACTCTTTTTCATGTATGTTACAGTATAGTGAG
CAGGCAAAGAAAAGGAGACA

Product: permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 422; Mature: 422

Protein sequence:

>422_residues
MEDVSIGQTDSRMKIATRNIILMMIGKMTSLLGASIYTFAMGLYVLKTTGSGMGFATTLVCGSLPRMICGPIAGAVADRV
SRRWLVIGTDLLSSLTMLIMFILATIFGPSLPFIYISAALLSICASFYSVALTSSIPNLVDEGRIQKASALNQTAASLSN
ILGPIIGGVVFGFLSIQSFFLLNSITFFLAVILQLFIVFDLYKKEVAESKEHFLTSIKEGFSYVKRQHEIYGLMKIALWV
NFFACGLTVALPYIIVHTLHLSSKQLGTVEGMLAVGMLMGAITLSVRKEVNNPFRSIYTGLFLFAGLSLCTVFPLLVTIP
KVASFIYYIAFMMLTGIAIMIVNIPMQVHMQKTTDPSYLGRVFGLLETIATAIAPLGMIVYGLLLDMLPTSIVMMTIGGG
LLLVVLVGVRQHMAKKQVDVSA

Sequences:

>Translated_422_residues
MEDVSIGQTDSRMKIATRNIILMMIGKMTSLLGASIYTFAMGLYVLKTTGSGMGFATTLVCGSLPRMICGPIAGAVADRV
SRRWLVIGTDLLSSLTMLIMFILATIFGPSLPFIYISAALLSICASFYSVALTSSIPNLVDEGRIQKASALNQTAASLSN
ILGPIIGGVVFGFLSIQSFFLLNSITFFLAVILQLFIVFDLYKKEVAESKEHFLTSIKEGFSYVKRQHEIYGLMKIALWV
NFFACGLTVALPYIIVHTLHLSSKQLGTVEGMLAVGMLMGAITLSVRKEVNNPFRSIYTGLFLFAGLSLCTVFPLLVTIP
KVASFIYYIAFMMLTGIAIMIVNIPMQVHMQKTTDPSYLGRVFGLLETIATAIAPLGMIVYGLLLDMLPTSIVMMTIGGG
LLLVVLVGVRQHMAKKQVDVSA
>Mature_422_residues
MEDVSIGQTDSRMKIATRNIILMMIGKMTSLLGASIYTFAMGLYVLKTTGSGMGFATTLVCGSLPRMICGPIAGAVADRV
SRRWLVIGTDLLSSLTMLIMFILATIFGPSLPFIYISAALLSICASFYSVALTSSIPNLVDEGRIQKASALNQTAASLSN
ILGPIIGGVVFGFLSIQSFFLLNSITFFLAVILQLFIVFDLYKKEVAESKEHFLTSIKEGFSYVKRQHEIYGLMKIALWV
NFFACGLTVALPYIIVHTLHLSSKQLGTVEGMLAVGMLMGAITLSVRKEVNNPFRSIYTGLFLFAGLSLCTVFPLLVTIP
KVASFIYYIAFMMLTGIAIMIVNIPMQVHMQKTTDPSYLGRVFGLLETIATAIAPLGMIVYGLLLDMLPTSIVMMTIGGG
LLLVVLVGVRQHMAKKQVDVSA

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45790; Mature: 45790

Theoretical pI: Translated: 9.52; Mature: 9.52

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
5.7 %Met     (Translated Protein)
6.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
5.7 %Met     (Mature Protein)
6.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEDVSIGQTDSRMKIATRNIILMMIGKMTSLLGASIYTFAMGLYVLKTTGSGMGFATTLV
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHH
CGSLPRMICGPIAGAVADRVSRRWLVIGTDLLSSLTMLIMFILATIFGPSLPFIYISAAL
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
LSICASFYSVALTSSIPNLVDEGRIQKASALNQTAASLSNILGPIIGGVVFGFLSIQSFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLNSITFFLAVILQLFIVFDLYKKEVAESKEHFLTSIKEGFSYVKRQHEIYGLMKIALWV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NFFACGLTVALPYIIVHTLHLSSKQLGTVEGMLAVGMLMGAITLSVRKEVNNPFRSIYTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LFLFAGLSLCTVFPLLVTIPKVASFIYYIAFMMLTGIAIMIVNIPMQVHMQKTTDPSYLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEECCCCHHHHH
RVFGLLETIATAIAPLGMIVYGLLLDMLPTSIVMMTIGGGLLLVVLVGVRQHMAKKQVDV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SA
CC
>Mature Secondary Structure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CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]