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The map label for this gene is 46447588

Identifier: 46447588

GI number: 46447588

Start: 2321877

End: 2323991

Strand: Reverse

Name: 46447588

Synonym: pc1954

Alternate gene names: NA

Gene position: 2323991-2321877 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46447589

Following gene: 46447587

Centisome position: 96.25

GC content: 39.15

Gene sequence:

>2115_bases
GTGGATGAAAATAATCCCTTAGACAATCCTTTGCCTAATCTAGAAGAAACTAGTGCGTCAACGATTCCAGCTCCCGCTCT
TTCACCTTCATCTGAAAAAATTCAACTAAGCTTTCAAGAGGGAACTTCTCTGACTATTACTCACTCTCAACTAGCTTTGT
TAAGGGAAAAATCACATTACTTTAAGAATCTATGGTCGGGGCAATTTCAAGAAACCTTGCAGCATCCTCTCGATTTAACA
CAAAAAGACTTTACGCTTTTATTCAATTGCCTGTTGGATGCTAACTTTAAAGTTCCTGTAGAAGAGATTACTTCTGCCAT
TCAACTCGCCGATTATTATGAACTGACAGAAGTAGTGAAAAACTTAGAAAAACAGTTAATTGATGGGTACAAATTACGGA
GATTTGAACCCTTTAATTCCACTGAAAAAAGTTTAATCGAATTAAAAGAGCTTTTAAATTTCGCTCGTCAATGTCGATTA
AATATGTTAAAGAACTATTTAGAATTCACCGTTGTGAGCGAATTATTAAACCAGGCTGTTCAGTTAGCGGAGTTTGAAAG
AATTATAATTCCTTTCTCAAAGGAGATAGAAGCTCTTAATTTTTCAAACAATGATTATTTGACCGATGCCCATCTTTTAA
CTTTAAGAAATTGTGAAAATTTAAAAGTGCTTCATTTAAATGCGTGTCAGGCTATTACGGACGATGGGTTAGCGCATTTA
ACACCCTTAACGGGTTTGCAGCATCTAGATATAAGGGTTTGTGAGTATCTCACTGATGATGGATTAGCGTATTTGACATC
CTTAACGGGTTTGCAGCATCTAAATCTGAGTGGGTGCTATCACCTCACTGATACAGGATTAGCCCATTTGACACCCTTAA
CGGGTTTGCAGCATCTAGATTTAAGGATTTGTGAGTATCTCACTGCTACTGGATTAGCCCATTTAAAGCCCTTGAAGGCT
TTGCAGCATCTAGATCTAAGCTACTGTAAAAATCTTACCAATGTCGGATTGTCGCATTTGGCGCCCTTGACAGCTTTGCA
GCATTTAGATCTAAGCTATTGCTGGCAACTCGCCGATGCTGGGTTAGTGTATTTGACACCCTTAACAGGCTTGCAGCATC
TAGATTTAAGCGGTTATCATAAACTCACCGATGCAGGATTGGCGCATTTAACACCCTTAACCGCTTTGCAGTGTCTAGAT
TTGAGCTACTGTGAGAATCTCACTGATGTAGGATTAGCCCATTTGATGCCTTTAAAGGCTTTGCAGCATCTAAATCTGAG
AAATTGCCGTAATCTCACAGATGATGGATTAGCCCATTTGGCACCCTTAACTGCTTTGCAGCATTTAGATTTAAGCTATT
GCTGGCAACTCACCGATGCTGGGTTAGCGCATTTAACACCTTTAACGGGTTTGCAGCGTCTAGATTTGAGCTACTGTGAA
AATCTCACTGATGTAGGATTAGCTCATTTGATACCTTTAAAGGCTTTGCAGCATCTAAATCTGAGAAATTGCCGTAATCT
CACGGATGATGGATTAGTCCATTTGGCACCCTTAACCGCTTTGCAACATCTCGATTTAAGCGATTGCAATAATCTCACCG
ATGCAGGATTAGCGCATTTGACACCTTTAACGGCTTTACAACATCTAGATTTAAAATATTGCATTAATCTCACCGGTGCT
GGATTAGCGCATTTAGCGTTCTTAACCGGTTTGCAGTATCTAGATTTAAGTTGGTGCAAAAATCTCATCGATGCAGGATT
AGTACATTTGAAACTCTTAACGGCTTTGCAGTATCTAGGTCTAAGCTACTGTGAGAATCTTACTGATGACGGATTAGCCC
ATTTGAGATCCTTAACAGCTTTGCAGCATCTAGCACTAATCCATTATAAGAATCTCACCGATGCGGGATTAGTCCATTTG
AGATCCTTAACATCTTTGCAGCACCTAGATCTACGCTACTGTCAGAATCTCACTGGTGATGGATTAGCCCATCTGAGAAC
TTTAACAGCTTTGCAGTATCTAGCATTAACCCAATATAAGAATCTCACCGATGATGGATTAGCACGTTTTAAAACTTTAG
CATCTTCAACTAATTTAAGGATAAAATTTCATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTCATTTTGAATATTTCTAATTTAGGATTTAGTCACAGTTACCTCGTCAATACAACGGATCCTTCTTACTATCCTCTTC
AAGACATTAATGACCCTCTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACTTTATTAATTCCCATCGAGACGCTTATCTAAGAAAAATATCCGCTCATTTTGAAGGCACTATACAAACAGTTCTATGC
TTGTAAATGCCAAAAAATAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 704; Mature: 704

Protein sequence:

>704_residues
MDENNPLDNPLPNLEETSASTIPAPALSPSSEKIQLSFQEGTSLTITHSQLALLREKSHYFKNLWSGQFQETLQHPLDLT
QKDFTLLFNCLLDANFKVPVEEITSAIQLADYYELTEVVKNLEKQLIDGYKLRRFEPFNSTEKSLIELKELLNFARQCRL
NMLKNYLEFTVVSELLNQAVQLAEFERIIIPFSKEIEALNFSNNDYLTDAHLLTLRNCENLKVLHLNACQAITDDGLAHL
TPLTGLQHLDIRVCEYLTDDGLAYLTSLTGLQHLNLSGCYHLTDTGLAHLTPLTGLQHLDLRICEYLTATGLAHLKPLKA
LQHLDLSYCKNLTNVGLSHLAPLTALQHLDLSYCWQLADAGLVYLTPLTGLQHLDLSGYHKLTDAGLAHLTPLTALQCLD
LSYCENLTDVGLAHLMPLKALQHLNLRNCRNLTDDGLAHLAPLTALQHLDLSYCWQLTDAGLAHLTPLTGLQRLDLSYCE
NLTDVGLAHLIPLKALQHLNLRNCRNLTDDGLVHLAPLTALQHLDLSDCNNLTDAGLAHLTPLTALQHLDLKYCINLTGA
GLAHLAFLTGLQYLDLSWCKNLIDAGLVHLKLLTALQYLGLSYCENLTDDGLAHLRSLTALQHLALIHYKNLTDAGLVHL
RSLTSLQHLDLRYCQNLTGDGLAHLRTLTALQYLALTQYKNLTDDGLARFKTLASSTNLRIKFH

Sequences:

>Translated_704_residues
MDENNPLDNPLPNLEETSASTIPAPALSPSSEKIQLSFQEGTSLTITHSQLALLREKSHYFKNLWSGQFQETLQHPLDLT
QKDFTLLFNCLLDANFKVPVEEITSAIQLADYYELTEVVKNLEKQLIDGYKLRRFEPFNSTEKSLIELKELLNFARQCRL
NMLKNYLEFTVVSELLNQAVQLAEFERIIIPFSKEIEALNFSNNDYLTDAHLLTLRNCENLKVLHLNACQAITDDGLAHL
TPLTGLQHLDIRVCEYLTDDGLAYLTSLTGLQHLNLSGCYHLTDTGLAHLTPLTGLQHLDLRICEYLTATGLAHLKPLKA
LQHLDLSYCKNLTNVGLSHLAPLTALQHLDLSYCWQLADAGLVYLTPLTGLQHLDLSGYHKLTDAGLAHLTPLTALQCLD
LSYCENLTDVGLAHLMPLKALQHLNLRNCRNLTDDGLAHLAPLTALQHLDLSYCWQLTDAGLAHLTPLTGLQRLDLSYCE
NLTDVGLAHLIPLKALQHLNLRNCRNLTDDGLVHLAPLTALQHLDLSDCNNLTDAGLAHLTPLTALQHLDLKYCINLTGA
GLAHLAFLTGLQYLDLSWCKNLIDAGLVHLKLLTALQYLGLSYCENLTDDGLAHLRSLTALQHLALIHYKNLTDAGLVHL
RSLTSLQHLDLRYCQNLTGDGLAHLRTLTALQYLALTQYKNLTDDGLARFKTLASSTNLRIKFH
>Mature_704_residues
MDENNPLDNPLPNLEETSASTIPAPALSPSSEKIQLSFQEGTSLTITHSQLALLREKSHYFKNLWSGQFQETLQHPLDLT
QKDFTLLFNCLLDANFKVPVEEITSAIQLADYYELTEVVKNLEKQLIDGYKLRRFEPFNSTEKSLIELKELLNFARQCRL
NMLKNYLEFTVVSELLNQAVQLAEFERIIIPFSKEIEALNFSNNDYLTDAHLLTLRNCENLKVLHLNACQAITDDGLAHL
TPLTGLQHLDIRVCEYLTDDGLAYLTSLTGLQHLNLSGCYHLTDTGLAHLTPLTGLQHLDLRICEYLTATGLAHLKPLKA
LQHLDLSYCKNLTNVGLSHLAPLTALQHLDLSYCWQLADAGLVYLTPLTGLQHLDLSGYHKLTDAGLAHLTPLTALQCLD
LSYCENLTDVGLAHLMPLKALQHLNLRNCRNLTDDGLAHLAPLTALQHLDLSYCWQLTDAGLAHLTPLTGLQRLDLSYCE
NLTDVGLAHLIPLKALQHLNLRNCRNLTDDGLVHLAPLTALQHLDLSDCNNLTDAGLAHLTPLTALQHLDLKYCINLTGA
GLAHLAFLTGLQYLDLSWCKNLIDAGLVHLKLLTALQYLGLSYCENLTDDGLAHLRSLTALQHLALIHYKNLTDAGLVHL
RSLTSLQHLDLRYCQNLTGDGLAHLRTLTALQYLALTQYKNLTDDGLARFKTLASSTNLRIKFH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI22748931, Length=325, Percent_Identity=36.9230769230769, Blast_Score=165, Evalue=1e-40,
Organism=Homo sapiens, GI161333852, Length=524, Percent_Identity=25.763358778626, Blast_Score=124, Evalue=3e-28,
Organism=Homo sapiens, GI284447308, Length=308, Percent_Identity=34.0909090909091, Blast_Score=118, Evalue=2e-26,
Organism=Homo sapiens, GI27734755, Length=334, Percent_Identity=33.5329341317365, Blast_Score=115, Evalue=1e-25,
Organism=Homo sapiens, GI296531375, Length=372, Percent_Identity=29.5698924731183, Blast_Score=112, Evalue=1e-24,
Organism=Homo sapiens, GI6912466, Length=283, Percent_Identity=32.8621908127208, Blast_Score=111, Evalue=2e-24,
Organism=Homo sapiens, GI161333854, Length=462, Percent_Identity=25.7575757575758, Blast_Score=108, Evalue=1e-23,
Organism=Homo sapiens, GI284447314, Length=255, Percent_Identity=33.3333333333333, Blast_Score=98, Evalue=3e-20,
Organism=Homo sapiens, GI289666746, Length=241, Percent_Identity=34.4398340248963, Blast_Score=90, Evalue=7e-18,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI25151694, Length=306, Percent_Identity=30.718954248366, Blast_Score=100, Evalue=2e-21,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI25151696, Length=306, Percent_Identity=30.718954248366, Blast_Score=100, Evalue=3e-21,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6322549, Length=371, Percent_Identity=28.0323450134771, Blast_Score=92, Evalue=3e-19,
Organism=Drosophila melanogaster, GI17647819, Length=302, Percent_Identity=36.0927152317881, Blast_Score=154, Evalue=2e-37,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24662818, Length=295, Percent_Identity=34.9152542372881, Blast_Score=98, Evalue=3e-20,
Organism=Drosophila melanogaster, GI21357913, Length=294, Percent_Identity=30.2721088435374, Blast_Score=92, Evalue=2e-18,
Organism=Drosophila melanogaster, GI161076549, Length=308, Percent_Identity=30.8441558441558, Blast_Score=89, Evalue=2e-17,
Organism=Drosophila melanogaster, GI161076547, Length=308, Percent_Identity=30.8441558441558, Blast_Score=88, Evalue=2e-17,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24652783, Length=308, Percent_Identity=30.8441558441558, Blast_Score=88, Evalue=2e-17,
Organism=Drosophila melanogaster, GI161076545, Length=313, Percent_Identity=30.6709265175719, Blast_Score=88, Evalue=2e-17,
Organism=Drosophila melanogaster, GI19921840, Length=553, Percent_Identity=25.497287522604, Blast_Score=77, Evalue=5e-14,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24646754, Length=263, Percent_Identity=29.277566539924, Blast_Score=73, Evalue=5e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 78563; Mature: 78563

Theoretical pI: Translated: 6.18; Mature: 6.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.8 %Cys     (Translated Protein)
0.4 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
2.8 %Cys     (Mature Protein)
0.4 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDENNPLDNPLPNLEETSASTIPAPALSPSSEKIQLSFQEGTSLTITHSQLALLREKSHY
CCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHH
FKNLWSGQFQETLQHPLDLTQKDFTLLFNCLLDANFKVPVEEITSAIQLADYYELTEVVK
HHHHHCHHHHHHHHCHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLEKQLIDGYKLRRFEPFNSTEKSLIELKELLNFARQCRLNMLKNYLEFTVVSELLNQAV
HHHHHHHCCHHHCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLAEFERIIIPFSKEIEALNFSNNDYLTDAHLLTLRNCENLKVLHLNACQAITDDGLAHL
HHHHHHHHEECCCCCCCEEECCCCCEECCHHEEEECCCCCEEEEEECHHHHHCCCCCHHH
TPLTGLQHLDIRVCEYLTDDGLAYLTSLTGLQHLNLSGCYHLTDTGLAHLTPLTGLQHLD
HHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHCHHCCHHHHH
LRICEYLTATGLAHLKPLKALQHLDLSYCKNLTNVGLSHLAPLTALQHLDLSYCWQLADA
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCC
GLVYLTPLTGLQHLDLSGYHKLTDAGLAHLTPLTALQCLDLSYCENLTDVGLAHLMPLKA
CEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
LQHLNLRNCRNLTDDGLAHLAPLTALQHLDLSYCWQLTDAGLAHLTPLTGLQRLDLSYCE
HHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHCHHHHHHHHCHHHHC
NLTDVGLAHLIPLKALQHLNLRNCRNLTDDGLVHLAPLTALQHLDLSDCNNLTDAGLAHL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHCCHHHH
TPLTALQHLDLKYCINLTGAGLAHLAFLTGLQYLDLSWCKNLIDAGLVHLKLLTALQYLG
HHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSYCENLTDDGLAHLRSLTALQHLALIHYKNLTDAGLVHLRSLTSLQHLDLRYCQNLTGD
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
GLAHLRTLTALQYLALTQYKNLTDDGLARFKTLASSTNLRIKFH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC
>Mature Secondary Structure
MDENNPLDNPLPNLEETSASTIPAPALSPSSEKIQLSFQEGTSLTITHSQLALLREKSHY
CCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHH
FKNLWSGQFQETLQHPLDLTQKDFTLLFNCLLDANFKVPVEEITSAIQLADYYELTEVVK
HHHHHCHHHHHHHHCHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLEKQLIDGYKLRRFEPFNSTEKSLIELKELLNFARQCRLNMLKNYLEFTVVSELLNQAV
HHHHHHHCCHHHCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLAEFERIIIPFSKEIEALNFSNNDYLTDAHLLTLRNCENLKVLHLNACQAITDDGLAHL
HHHHHHHHEECCCCCCCEEECCCCCEECCHHEEEECCCCCEEEEEECHHHHHCCCCCHHH
TPLTGLQHLDIRVCEYLTDDGLAYLTSLTGLQHLNLSGCYHLTDTGLAHLTPLTGLQHLD
HHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHCHHCCHHHHH
LRICEYLTATGLAHLKPLKALQHLDLSYCKNLTNVGLSHLAPLTALQHLDLSYCWQLADA
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCC
GLVYLTPLTGLQHLDLSGYHKLTDAGLAHLTPLTALQCLDLSYCENLTDVGLAHLMPLKA
CEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
LQHLNLRNCRNLTDDGLAHLAPLTALQHLDLSYCWQLTDAGLAHLTPLTGLQRLDLSYCE
HHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHCHHHHHHHHCHHHHC
NLTDVGLAHLIPLKALQHLNLRNCRNLTDDGLVHLAPLTALQHLDLSDCNNLTDAGLAHL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHCCHHHH
TPLTALQHLDLKYCINLTGAGLAHLAFLTGLQYLDLSWCKNLIDAGLVHLKLLTALQYLG
HHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSYCENLTDDGLAHLRSLTALQHLALIHYKNLTDAGLVHLRSLTSLQHLDLRYCQNLTGD
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
GLAHLRTLTALQYLALTQYKNLTDDGLARFKTLASSTNLRIKFH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA