Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46447552

Identifier: 46447552

GI number: 46447552

Start: 2281953

End: 2283611

Strand: Reverse

Name: 46447552

Synonym: pc1918

Alternate gene names: NA

Gene position: 2283611-2281953 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46447553

Following gene: 46447551

Centisome position: 94.58

GC content: 37.73

Gene sequence:

>1659_bases
ATGGATGAGAATAATGGCTTAGACAATCCTTTGGCTAATACAGAGAAAACTAGTGCGTCAACGATTCAATCTTCCGCTCC
TTCACCTACATCTGAAGAACTTCAACTGAGCTTTCACGAGGGAACTTCTCTAACCATTTCTCACTCTCAGTTAGCTTTGT
TAAGGGAAAAATCCCTTTATTTTAAATCTCTTTGGTCAGGAAATTTTCAAGAAACCCTGCAACATCCTCTCGCTTTAACA
CAAAAAGACTTTACGCTTTTGCTTAATTACTTAGAGAATTCTAAGGAAATTCCCTTGGAAGAGATTACTTCTGCCATTCA
GCTAGCCGATTCTTATGAATTGACAGAAGTGGTGAAACATTTAGAAGAACAGCTGATAGATGGGTACAAGTCACAAAGAT
TTGAACCCTTTAACTCCACTGAAGAGAGTTTAGTCGAATTCAAAGAACTTTTAAATTTTGCACATCGCTACCAATTAAAT
ATTTTGAAGAATTATTTAGAGTTCACCGTTGTGAGCGCCTTATTAAACCAGACTATTCAGTTAGCGGAGTTTGAAAAAAT
TATAAACCATTTCTCAAATGAGATAGAAGCTCTTAATTTTTCAAACAATGCCCATTTGACCGATGCTCATCTTTTAACAT
TAAAAAATTGTGAAAATTTAAAAGTACTTCATTTAGAGGCGTGTCAGGCTATTACGGACGATGGATTAGCGCATTTGGCA
CCCTTAACAGCTTTGCAGCATCTCAATCTAAACGGGTGCTATAAACTTACCGATGCAGGATTAGTCCATTTGAAATCCTT
AACGGCTTTGCAAACTTTAGATTTAAGCTACTGTAAAAATCTTAAGGACGCAGGATTAGTCCATTTGAAACCCTTAACGG
CTTTGCAGAATCTAGCTCTAACTAGCTGCAAAAATCTCACCGATAGAGGATTATCCCATTTAAAATCCTTAACGGCTTTG
CAAACTTTAGATTTAAGCTACTGTAAAAATTTTAAGGATGCAGGATTAGCCCATTTGCCACCCTTAACGGCTTTGCAAAC
TTTAGATTTAAGTTATTGTAAAGATCTCACCGATAGAGGGTTATCCCATTTAAAATCCTTAACGGCTTTGCAAACTTTAA
ATTTAAGCTACTGTAAAAAACTTAAGGATGCAGGATTAGCGCATTTGAAACCCTTAACGGCTCTGCAGTATCTAGCTCTA
AATAGCTGTAAAAATCTCACCGATAGAGGATTATCCCATTTAAAATCCTTAATGGCTTTGCAGCACCTAGTTCTAAGCGG
GTGCGATAATCTCACGGATGCAGGATTAGCGCACTTGAAACCCTTAACGGCTTTGCAAACTCTAGGTCTAAGACGGTGCC
AGAATCTCACTGGTGATGGATTAGCCCATTTGGCACCCTTAACGGCTTTGCAAACTTTAGATTTAAGCTACTGTAAAAAA
CTTAAGGATGCAGGATTAGCGCATTTGAAACCCTTAACGGCTTTGCAAACTCTAGGTCTAAAATGGTGCAGCAATCTCAC
GGATGCTGGATTAGCCCATTTGAAACCCTTAGCGGCTTTGCAGCATCTAGATTTAAGTTATTGTAATAATCTCACCCGTG
CAGGATTAGCAAATTTTAAAATTTTAGGAGCTTCACTCAATTTAGAAATTGTTAGGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTCATTTTGAATATTTCTAATTTTGGGTTTAATCCTAGTCATCTTGCCAATACAACGACTCCTTCTTACCCTCAATCTC
AAGTAATCAATAACCCTCTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAACTTAATAAAAAAGAAGGAATTTTAGTGCCAAAAACCAAGGGTAATTTGTTTTAAGATAAAGAATAAAATTTCATT
TTAAAACGGATTAAGCATGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 552; Mature: 552

Protein sequence:

>552_residues
MDENNGLDNPLANTEKTSASTIQSSAPSPTSEELQLSFHEGTSLTISHSQLALLREKSLYFKSLWSGNFQETLQHPLALT
QKDFTLLLNYLENSKEIPLEEITSAIQLADSYELTEVVKHLEEQLIDGYKSQRFEPFNSTEESLVEFKELLNFAHRYQLN
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PLTALQHLNLNGCYKLTDAGLVHLKSLTALQTLDLSYCKNLKDAGLVHLKPLTALQNLALTSCKNLTDRGLSHLKSLTAL
QTLDLSYCKNFKDAGLAHLPPLTALQTLDLSYCKDLTDRGLSHLKSLTALQTLNLSYCKKLKDAGLAHLKPLTALQYLAL
NSCKNLTDRGLSHLKSLMALQHLVLSGCDNLTDAGLAHLKPLTALQTLGLRRCQNLTGDGLAHLAPLTALQTLDLSYCKK
LKDAGLAHLKPLTALQTLGLKWCSNLTDAGLAHLKPLAALQHLDLSYCNNLTRAGLANFKILGASLNLEIVR

Sequences:

>Translated_552_residues
MDENNGLDNPLANTEKTSASTIQSSAPSPTSEELQLSFHEGTSLTISHSQLALLREKSLYFKSLWSGNFQETLQHPLALT
QKDFTLLLNYLENSKEIPLEEITSAIQLADSYELTEVVKHLEEQLIDGYKSQRFEPFNSTEESLVEFKELLNFAHRYQLN
ILKNYLEFTVVSALLNQTIQLAEFEKIINHFSNEIEALNFSNNAHLTDAHLLTLKNCENLKVLHLEACQAITDDGLAHLA
PLTALQHLNLNGCYKLTDAGLVHLKSLTALQTLDLSYCKNLKDAGLVHLKPLTALQNLALTSCKNLTDRGLSHLKSLTAL
QTLDLSYCKNFKDAGLAHLPPLTALQTLDLSYCKDLTDRGLSHLKSLTALQTLNLSYCKKLKDAGLAHLKPLTALQYLAL
NSCKNLTDRGLSHLKSLMALQHLVLSGCDNLTDAGLAHLKPLTALQTLGLRRCQNLTGDGLAHLAPLTALQTLDLSYCKK
LKDAGLAHLKPLTALQTLGLKWCSNLTDAGLAHLKPLAALQHLDLSYCNNLTRAGLANFKILGASLNLEIVR
>Mature_552_residues
MDENNGLDNPLANTEKTSASTIQSSAPSPTSEELQLSFHEGTSLTISHSQLALLREKSLYFKSLWSGNFQETLQHPLALT
QKDFTLLLNYLENSKEIPLEEITSAIQLADSYELTEVVKHLEEQLIDGYKSQRFEPFNSTEESLVEFKELLNFAHRYQLN
ILKNYLEFTVVSALLNQTIQLAEFEKIINHFSNEIEALNFSNNAHLTDAHLLTLKNCENLKVLHLEACQAITDDGLAHLA
PLTALQHLNLNGCYKLTDAGLVHLKSLTALQTLDLSYCKNLKDAGLVHLKPLTALQNLALTSCKNLTDRGLSHLKSLTAL
QTLDLSYCKNFKDAGLAHLPPLTALQTLDLSYCKDLTDRGLSHLKSLTALQTLNLSYCKKLKDAGLAHLKPLTALQYLAL
NSCKNLTDRGLSHLKSLMALQHLVLSGCDNLTDAGLAHLKPLTALQTLGLRRCQNLTGDGLAHLAPLTALQTLDLSYCKK
LKDAGLAHLKPLTALQTLGLKWCSNLTDAGLAHLKPLAALQHLDLSYCNNLTRAGLANFKILGASLNLEIVR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI22748931, Length=339, Percent_Identity=33.6283185840708, Blast_Score=152, Evalue=1e-36,
Organism=Homo sapiens, GI284447308, Length=333, Percent_Identity=31.8318318318318, Blast_Score=114, Evalue=2e-25,
Organism=Homo sapiens, GI27734755, Length=443, Percent_Identity=27.9909706546275, Blast_Score=112, Evalue=1e-24,
Organism=Homo sapiens, GI161333852, Length=381, Percent_Identity=28.8713910761155, Blast_Score=105, Evalue=9e-23,
Organism=Homo sapiens, GI296531375, Length=405, Percent_Identity=27.6543209876543, Blast_Score=102, Evalue=1e-21,
Organism=Homo sapiens, GI284447314, Length=241, Percent_Identity=32.7800829875519, Blast_Score=99, Evalue=1e-20,
Organism=Homo sapiens, GI6912466, Length=302, Percent_Identity=28.476821192053, Blast_Score=99, Evalue=2e-20,
Organism=Homo sapiens, GI161333854, Length=353, Percent_Identity=28.328611898017, Blast_Score=96, Evalue=1e-19,
Organism=Homo sapiens, GI289666746, Length=381, Percent_Identity=27.5590551181102, Blast_Score=85, Evalue=2e-16,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI25151694, Length=307, Percent_Identity=31.2703583061889, Blast_Score=109, Evalue=4e-24,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI25151696, Length=307, Percent_Identity=31.2703583061889, Blast_Score=108, Evalue=7e-24,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6322549, Length=374, Percent_Identity=26.4705882352941, Blast_Score=90, Evalue=8e-19,
Organism=Drosophila melanogaster, GI17647819, Length=302, Percent_Identity=35.0993377483444, Blast_Score=140, Evalue=2e-33,
Organism=Drosophila melanogaster, GI161076545, Length=389, Percent_Identity=26.2210796915167, Blast_Score=94, Evalue=2e-19,
Organism=Drosophila melanogaster, GI161076547, Length=386, Percent_Identity=26.1658031088083, Blast_Score=94, Evalue=3e-19,
Organism=Drosophila melanogaster, GI161076549, Length=386, Percent_Identity=26.1658031088083, Blast_Score=93, Evalue=4e-19,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24652783, Length=386, Percent_Identity=25.9067357512953, Blast_Score=93, Evalue=4e-19,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24662818, Length=396, Percent_Identity=28.7878787878788, Blast_Score=91, Evalue=2e-18,
Organism=Drosophila melanogaster, GI21357913, Length=301, Percent_Identity=29.9003322259136, Blast_Score=86, Evalue=1e-16,
Organism=Drosophila melanogaster, GI19921840, Length=359, Percent_Identity=26.1838440111421, Blast_Score=76, Evalue=5e-14,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24646754, Length=316, Percent_Identity=28.1645569620253, Blast_Score=72, Evalue=7e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 60887; Mature: 60887

Theoretical pI: Translated: 6.86; Mature: 6.86

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.5 %Cys     (Translated Protein)
0.4 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
2.5 %Cys     (Mature Protein)
0.4 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDENNGLDNPLANTEKTSASTIQSSAPSPTSEELQLSFHEGTSLTISHSQLALLREKSLY
CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHH
FKSLWSGNFQETLQHPLALTQKDFTLLLNYLENSKEIPLEEITSAIQLADSYELTEVVKH
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
LEEQLIDGYKSQRFEPFNSTEESLVEFKELLNFAHRYQLNILKNYLEFTVVSALLNQTIQ
HHHHHHCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAEFEKIINHFSNEIEALNFSNNAHLTDAHLLTLKNCENLKVLHLEACQAITDDGLAHLA
HHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEECHHHEEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCHHHHH
PLTALQHLNLNGCYKLTDAGLVHLKSLTALQTLDLSYCKNLKDAGLVHLKPLTALQNLAL
HHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHH
TSCKNLTDRGLSHLKSLTALQTLDLSYCKNFKDAGLAHLPPLTALQTLDLSYCKDLTDRG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSHLKSLTALQTLNLSYCKKLKDAGLAHLKPLTALQYLALNSCKNLTDRGLSHLKSLMAL
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QHLVLSGCDNLTDAGLAHLKPLTALQTLGLRRCQNLTGDGLAHLAPLTALQTLDLSYCKK
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKDAGLAHLKPLTALQTLGLKWCSNLTDAGLAHLKPLAALQHLDLSYCNNLTRAGLANFK
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHCCCCEE
ILGASLNLEIVR
EEECCCCEEEEC
>Mature Secondary Structure
MDENNGLDNPLANTEKTSASTIQSSAPSPTSEELQLSFHEGTSLTISHSQLALLREKSLY
CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHH
FKSLWSGNFQETLQHPLALTQKDFTLLLNYLENSKEIPLEEITSAIQLADSYELTEVVKH
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
LEEQLIDGYKSQRFEPFNSTEESLVEFKELLNFAHRYQLNILKNYLEFTVVSALLNQTIQ
HHHHHHCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAEFEKIINHFSNEIEALNFSNNAHLTDAHLLTLKNCENLKVLHLEACQAITDDGLAHLA
HHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEECHHHEEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCHHHHH
PLTALQHLNLNGCYKLTDAGLVHLKSLTALQTLDLSYCKNLKDAGLVHLKPLTALQNLAL
HHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHH
TSCKNLTDRGLSHLKSLTALQTLDLSYCKNFKDAGLAHLPPLTALQTLDLSYCKDLTDRG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSHLKSLTALQTLNLSYCKKLKDAGLAHLKPLTALQYLALNSCKNLTDRGLSHLKSLMAL
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QHLVLSGCDNLTDAGLAHLKPLTALQTLGLRRCQNLTGDGLAHLAPLTALQTLDLSYCKK
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKDAGLAHLKPLTALQTLGLKWCSNLTDAGLAHLKPLAALQHLDLSYCNNLTRAGLANFK
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHCCCCEE
ILGASLNLEIVR
EEECCCCEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA