| Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005861 |
| Length | 2,414,465 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 46447552
Identifier: 46447552
GI number: 46447552
Start: 2281953
End: 2283611
Strand: Reverse
Name: 46447552
Synonym: pc1918
Alternate gene names: NA
Gene position: 2283611-2281953 (Counterclockwise)
Preceding gene: 46447553
Following gene: 46447551
Centisome position: 94.58
GC content: 37.73
Gene sequence:
>1659_bases ATGGATGAGAATAATGGCTTAGACAATCCTTTGGCTAATACAGAGAAAACTAGTGCGTCAACGATTCAATCTTCCGCTCC TTCACCTACATCTGAAGAACTTCAACTGAGCTTTCACGAGGGAACTTCTCTAACCATTTCTCACTCTCAGTTAGCTTTGT TAAGGGAAAAATCCCTTTATTTTAAATCTCTTTGGTCAGGAAATTTTCAAGAAACCCTGCAACATCCTCTCGCTTTAACA CAAAAAGACTTTACGCTTTTGCTTAATTACTTAGAGAATTCTAAGGAAATTCCCTTGGAAGAGATTACTTCTGCCATTCA GCTAGCCGATTCTTATGAATTGACAGAAGTGGTGAAACATTTAGAAGAACAGCTGATAGATGGGTACAAGTCACAAAGAT TTGAACCCTTTAACTCCACTGAAGAGAGTTTAGTCGAATTCAAAGAACTTTTAAATTTTGCACATCGCTACCAATTAAAT ATTTTGAAGAATTATTTAGAGTTCACCGTTGTGAGCGCCTTATTAAACCAGACTATTCAGTTAGCGGAGTTTGAAAAAAT TATAAACCATTTCTCAAATGAGATAGAAGCTCTTAATTTTTCAAACAATGCCCATTTGACCGATGCTCATCTTTTAACAT TAAAAAATTGTGAAAATTTAAAAGTACTTCATTTAGAGGCGTGTCAGGCTATTACGGACGATGGATTAGCGCATTTGGCA CCCTTAACAGCTTTGCAGCATCTCAATCTAAACGGGTGCTATAAACTTACCGATGCAGGATTAGTCCATTTGAAATCCTT AACGGCTTTGCAAACTTTAGATTTAAGCTACTGTAAAAATCTTAAGGACGCAGGATTAGTCCATTTGAAACCCTTAACGG CTTTGCAGAATCTAGCTCTAACTAGCTGCAAAAATCTCACCGATAGAGGATTATCCCATTTAAAATCCTTAACGGCTTTG CAAACTTTAGATTTAAGCTACTGTAAAAATTTTAAGGATGCAGGATTAGCCCATTTGCCACCCTTAACGGCTTTGCAAAC TTTAGATTTAAGTTATTGTAAAGATCTCACCGATAGAGGGTTATCCCATTTAAAATCCTTAACGGCTTTGCAAACTTTAA ATTTAAGCTACTGTAAAAAACTTAAGGATGCAGGATTAGCGCATTTGAAACCCTTAACGGCTCTGCAGTATCTAGCTCTA AATAGCTGTAAAAATCTCACCGATAGAGGATTATCCCATTTAAAATCCTTAATGGCTTTGCAGCACCTAGTTCTAAGCGG GTGCGATAATCTCACGGATGCAGGATTAGCGCACTTGAAACCCTTAACGGCTTTGCAAACTCTAGGTCTAAGACGGTGCC AGAATCTCACTGGTGATGGATTAGCCCATTTGGCACCCTTAACGGCTTTGCAAACTTTAGATTTAAGCTACTGTAAAAAA CTTAAGGATGCAGGATTAGCGCATTTGAAACCCTTAACGGCTTTGCAAACTCTAGGTCTAAAATGGTGCAGCAATCTCAC GGATGCTGGATTAGCCCATTTGAAACCCTTAGCGGCTTTGCAGCATCTAGATTTAAGTTATTGTAATAATCTCACCCGTG CAGGATTAGCAAATTTTAAAATTTTAGGAGCTTCACTCAATTTAGAAATTGTTAGGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GGTCATTTTGAATATTTCTAATTTTGGGTTTAATCCTAGTCATCTTGCCAATACAACGACTCCTTCTTACCCTCAATCTC AAGTAATCAATAACCCTCTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAACTTAATAAAAAAGAAGGAATTTTAGTGCCAAAAACCAAGGGTAATTTGTTTTAAGATAAAGAATAAAATTTCATT TTAAAACGGATTAAGCATGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 552; Mature: 552
Protein sequence:
>552_residues MDENNGLDNPLANTEKTSASTIQSSAPSPTSEELQLSFHEGTSLTISHSQLALLREKSLYFKSLWSGNFQETLQHPLALT QKDFTLLLNYLENSKEIPLEEITSAIQLADSYELTEVVKHLEEQLIDGYKSQRFEPFNSTEESLVEFKELLNFAHRYQLN ILKNYLEFTVVSALLNQTIQLAEFEKIINHFSNEIEALNFSNNAHLTDAHLLTLKNCENLKVLHLEACQAITDDGLAHLA PLTALQHLNLNGCYKLTDAGLVHLKSLTALQTLDLSYCKNLKDAGLVHLKPLTALQNLALTSCKNLTDRGLSHLKSLTAL QTLDLSYCKNFKDAGLAHLPPLTALQTLDLSYCKDLTDRGLSHLKSLTALQTLNLSYCKKLKDAGLAHLKPLTALQYLAL NSCKNLTDRGLSHLKSLMALQHLVLSGCDNLTDAGLAHLKPLTALQTLGLRRCQNLTGDGLAHLAPLTALQTLDLSYCKK LKDAGLAHLKPLTALQTLGLKWCSNLTDAGLAHLKPLAALQHLDLSYCNNLTRAGLANFKILGASLNLEIVR
Sequences:
>Translated_552_residues MDENNGLDNPLANTEKTSASTIQSSAPSPTSEELQLSFHEGTSLTISHSQLALLREKSLYFKSLWSGNFQETLQHPLALT QKDFTLLLNYLENSKEIPLEEITSAIQLADSYELTEVVKHLEEQLIDGYKSQRFEPFNSTEESLVEFKELLNFAHRYQLN ILKNYLEFTVVSALLNQTIQLAEFEKIINHFSNEIEALNFSNNAHLTDAHLLTLKNCENLKVLHLEACQAITDDGLAHLA PLTALQHLNLNGCYKLTDAGLVHLKSLTALQTLDLSYCKNLKDAGLVHLKPLTALQNLALTSCKNLTDRGLSHLKSLTAL QTLDLSYCKNFKDAGLAHLPPLTALQTLDLSYCKDLTDRGLSHLKSLTALQTLNLSYCKKLKDAGLAHLKPLTALQYLAL NSCKNLTDRGLSHLKSLMALQHLVLSGCDNLTDAGLAHLKPLTALQTLGLRRCQNLTGDGLAHLAPLTALQTLDLSYCKK LKDAGLAHLKPLTALQTLGLKWCSNLTDAGLAHLKPLAALQHLDLSYCNNLTRAGLANFKILGASLNLEIVR >Mature_552_residues MDENNGLDNPLANTEKTSASTIQSSAPSPTSEELQLSFHEGTSLTISHSQLALLREKSLYFKSLWSGNFQETLQHPLALT QKDFTLLLNYLENSKEIPLEEITSAIQLADSYELTEVVKHLEEQLIDGYKSQRFEPFNSTEESLVEFKELLNFAHRYQLN ILKNYLEFTVVSALLNQTIQLAEFEKIINHFSNEIEALNFSNNAHLTDAHLLTLKNCENLKVLHLEACQAITDDGLAHLA PLTALQHLNLNGCYKLTDAGLVHLKSLTALQTLDLSYCKNLKDAGLVHLKPLTALQNLALTSCKNLTDRGLSHLKSLTAL QTLDLSYCKNFKDAGLAHLPPLTALQTLDLSYCKDLTDRGLSHLKSLTALQTLNLSYCKKLKDAGLAHLKPLTALQYLAL NSCKNLTDRGLSHLKSLMALQHLVLSGCDNLTDAGLAHLKPLTALQTLGLRRCQNLTGDGLAHLAPLTALQTLDLSYCKK LKDAGLAHLKPLTALQTLGLKWCSNLTDAGLAHLKPLAALQHLDLSYCNNLTRAGLANFKILGASLNLEIVR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI22748931, Length=339, Percent_Identity=33.6283185840708, Blast_Score=152, Evalue=1e-36, Organism=Homo sapiens, GI284447308, Length=333, Percent_Identity=31.8318318318318, Blast_Score=114, Evalue=2e-25, Organism=Homo sapiens, GI27734755, Length=443, Percent_Identity=27.9909706546275, Blast_Score=112, Evalue=1e-24, Organism=Homo sapiens, GI161333852, Length=381, Percent_Identity=28.8713910761155, Blast_Score=105, Evalue=9e-23, Organism=Homo sapiens, GI296531375, Length=405, Percent_Identity=27.6543209876543, Blast_Score=102, Evalue=1e-21, Organism=Homo sapiens, GI284447314, Length=241, Percent_Identity=32.7800829875519, Blast_Score=99, Evalue=1e-20, Organism=Homo sapiens, GI6912466, Length=302, Percent_Identity=28.476821192053, Blast_Score=99, Evalue=2e-20, Organism=Homo sapiens, GI161333854, Length=353, Percent_Identity=28.328611898017, Blast_Score=96, Evalue=1e-19, Organism=Homo sapiens, GI289666746, Length=381, Percent_Identity=27.5590551181102, Blast_Score=85, Evalue=2e-16, Organism=Caenorhabditis elegans, GI25151694, Length=307, Percent_Identity=31.2703583061889, Blast_Score=109, Evalue=4e-24, Organism=Caenorhabditis elegans, GI25151696, Length=307, Percent_Identity=31.2703583061889, Blast_Score=108, Evalue=7e-24, Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6322549, Length=374, Percent_Identity=26.4705882352941, Blast_Score=90, Evalue=8e-19, Organism=Drosophila melanogaster, GI17647819, Length=302, Percent_Identity=35.0993377483444, Blast_Score=140, Evalue=2e-33, Organism=Drosophila melanogaster, GI161076545, Length=389, Percent_Identity=26.2210796915167, Blast_Score=94, Evalue=2e-19, Organism=Drosophila melanogaster, GI161076547, Length=386, Percent_Identity=26.1658031088083, Blast_Score=94, Evalue=3e-19, Organism=Drosophila melanogaster, GI161076549, Length=386, Percent_Identity=26.1658031088083, Blast_Score=93, Evalue=4e-19, Organism=Drosophila melanogaster, GI24652783, Length=386, Percent_Identity=25.9067357512953, Blast_Score=93, Evalue=4e-19, Organism=Drosophila melanogaster, GI24662818, Length=396, Percent_Identity=28.7878787878788, Blast_Score=91, Evalue=2e-18, Organism=Drosophila melanogaster, GI21357913, Length=301, Percent_Identity=29.9003322259136, Blast_Score=86, Evalue=1e-16, Organism=Drosophila melanogaster, GI19921840, Length=359, Percent_Identity=26.1838440111421, Blast_Score=76, Evalue=5e-14, Organism=Drosophila melanogaster, GI24646754, Length=316, Percent_Identity=28.1645569620253, Blast_Score=72, Evalue=7e-13,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 60887; Mature: 60887
Theoretical pI: Translated: 6.86; Mature: 6.86
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.5 %Cys (Translated Protein) 0.4 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 2.5 %Cys (Mature Protein) 0.4 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDENNGLDNPLANTEKTSASTIQSSAPSPTSEELQLSFHEGTSLTISHSQLALLREKSLY CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHH FKSLWSGNFQETLQHPLALTQKDFTLLLNYLENSKEIPLEEITSAIQLADSYELTEVVKH HHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LEEQLIDGYKSQRFEPFNSTEESLVEFKELLNFAHRYQLNILKNYLEFTVVSALLNQTIQ HHHHHHCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAEFEKIINHFSNEIEALNFSNNAHLTDAHLLTLKNCENLKVLHLEACQAITDDGLAHLA HHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEECHHHEEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCHHHHH PLTALQHLNLNGCYKLTDAGLVHLKSLTALQTLDLSYCKNLKDAGLVHLKPLTALQNLAL HHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHH TSCKNLTDRGLSHLKSLTALQTLDLSYCKNFKDAGLAHLPPLTALQTLDLSYCKDLTDRG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSHLKSLTALQTLNLSYCKKLKDAGLAHLKPLTALQYLALNSCKNLTDRGLSHLKSLMAL HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QHLVLSGCDNLTDAGLAHLKPLTALQTLGLRRCQNLTGDGLAHLAPLTALQTLDLSYCKK HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKDAGLAHLKPLTALQTLGLKWCSNLTDAGLAHLKPLAALQHLDLSYCNNLTRAGLANFK HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHCCCCEE ILGASLNLEIVR EEECCCCEEEEC >Mature Secondary Structure MDENNGLDNPLANTEKTSASTIQSSAPSPTSEELQLSFHEGTSLTISHSQLALLREKSLY CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHH FKSLWSGNFQETLQHPLALTQKDFTLLLNYLENSKEIPLEEITSAIQLADSYELTEVVKH HHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LEEQLIDGYKSQRFEPFNSTEESLVEFKELLNFAHRYQLNILKNYLEFTVVSALLNQTIQ HHHHHHCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAEFEKIINHFSNEIEALNFSNNAHLTDAHLLTLKNCENLKVLHLEACQAITDDGLAHLA HHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEECHHHEEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCHHHHH PLTALQHLNLNGCYKLTDAGLVHLKSLTALQTLDLSYCKNLKDAGLVHLKPLTALQNLAL HHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHH TSCKNLTDRGLSHLKSLTALQTLDLSYCKNFKDAGLAHLPPLTALQTLDLSYCKDLTDRG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSHLKSLTALQTLNLSYCKKLKDAGLAHLKPLTALQYLALNSCKNLTDRGLSHLKSLMAL HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QHLVLSGCDNLTDAGLAHLKPLTALQTLGLRRCQNLTGDGLAHLAPLTALQTLDLSYCKK HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKDAGLAHLKPLTALQTLGLKWCSNLTDAGLAHLKPLAALQHLDLSYCNNLTRAGLANFK HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHCCCCEE ILGASLNLEIVR EEECCCCEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA