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The map label for this gene is pepF [H]

Identifier: 46446812

GI number: 46446812

Start: 1403990

End: 1405834

Strand: Direct

Name: pepF [H]

Synonym: pc1178

Alternate gene names: 46446812

Gene position: 1403990-1405834 (Clockwise)

Preceding gene: 46446810

Following gene: 46446813

Centisome position: 58.15

GC content: 35.61

Gene sequence:

>1845_bases
TTGAAACAAAGGAAGCTAAATATGACTAAATCTCGCGAAGAAGTTTCATTAAGTGACCGTTGGAATGTAGAAGAACTTTA
TCTTTCTCATGAAGCTTGGGAACAAGCTTTTCAAACATTTTCTAATGCTGGAAGCCAGCAAACATCACTTTGCCCTGCTA
TCCAAGCTTTACAAGGTTCACTTCACCGAGGCCCTGAATATGTTAAAAATACTCTAGATTTAATGATGAGCATGGATCGA
GAGCTTTCTAAGCTTTACACATATGCTCATTTACGTCATGACGAGGATATTGCGAATCCAATATTTAAAAAATCTTATGA
GCAAATTCTGACTATTGCTCACAAGTTTTCTCAAGAAATTTCTTGGTTTCAACCTGAATTGCTTGCTCTATCTAATGAAC
AATTAGAAGAATATTTAAACTCTCCTGCTTTAGTCGCTTATAAATTTCATTTAGAAAAAATTATCCGCACCAAAAAGCAT
ACATTATCGTTCGAAAATGAAAAATTACTAGCTTTTGCCGGTCAAGCTTTGCAAACATCTTATAAAGCGTTTAATGCAAT
TAGTGATGCGGATTTTAAATTTGCTCCTATCAAAGATGATAAAGGAAGCGAACATGCCCTGTCTCATGCTACTTATAGTC
TATATATTCGAGACCAAGATCGCTTTTTGAGAGAAAAAGCCTTTAACCAGTATCATCATCAGTATTTAGCTTATGAAAAT
ACTCTTTGTGAACTCCTTTCGGGTCAAGTGCAAAATCATCTTTTTCAAGCACGTTCTAGACATTATACTTCCTGCTTAGA
ATCAGCCTTATTCCCTAAAAATATACCCACATCTGTTTACCATGCTTTAATTGAGGCTGTAACAGAAAAAATCTCAGTTT
TACATCGGTATATGGGCTTGCGCAAAAGAATCTTGAAATTAGACCAACTCCATCTTTACGATATTTACGTCCCTCTAACT
AGTGCCGTGGATATTCGTTTATCTTATAAAGAGGCAGAAGATATTGTCATTGAATCTGTCGCTCCTCTCGGTTCCGAATA
TCAATCTTTATTGGCGAAAGGATTAAAAGAAGAGCGTTGGGTAGATCGCTACGAAAACCAAAATAAGCGTTCGGGTGCTT
ATTCTAGTGGATGTTTTGACAGTATGCCTTATATTCTTATGAATTATAAGAATCTTTTAAGAGATGTATTTACATTGGCT
CATGAAGCTGGCCATAGCATGCACAGCCTTTATAGTCGCCGCACACAACCCTATCAATATAGCGACTATCCTATTTTCTT
AGCAGAAGTCGCTTCAACTTTTAATGAAGATCTTTTGAGTCGTTTACTTATTAATCGCTGTCAAGATCCTATTGAGAAAA
TTTTCTTAGTCAATCAAAAAGTTGAGGATATTCGAGCCACTTTATTTAGACAAACAATGTTTGCTGAATTTGAACTTTTA
ATCCATGAACAAGTAGAACAAGATATTCCTCTCACACCTCAGCTTCTTAAACAAGAATATCGCAAACTCAATCATAAATA
TTTTGGCCCCGACGTTATAATTGATAAAGCAATCGATATTGAATGGGCTCGTATTCCTCATTTTTATTATAATTTTTATG
TATTTCAGTATGCAACTGGGATTAGTGCAGCTCTTGCCATAGCAGACAAAGTTGTTAATGGTCAACAACAAGATCGTGAA
AACTATCTGAACTTTCTAAAAGGAGGCTGCAGCCAATACCCTATTGAAATGTTAAAGATGGCAGGTATTGACATGGAATC
TCCCCTTCCAGTCAAATCTACTATTCAAAAATTTGATCAACTTCTGAATGAACTTGAATCTTTATTGACGGACGTCAAAG
TCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGCTTTTATTTTCATCAAAATATTCCCTTTAAACTAAAAAACTAATACTATCACCAGTTTTAAAAAACTTTATCGAAAA
TAAAGCATTATTGATATTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCTACCTAATTGCCGACAAAGAAATGGGTTTCTTGTCGGCATGTTAACTTTAGTTAGAAACCAAAAAATTAGCAATTAAG
TTGATTCACTGCTAATTCAC

Product: putative oligoendopeptidase F

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 614; Mature: 614

Protein sequence:

>614_residues
MKQRKLNMTKSREEVSLSDRWNVEELYLSHEAWEQAFQTFSNAGSQQTSLCPAIQALQGSLHRGPEYVKNTLDLMMSMDR
ELSKLYTYAHLRHDEDIANPIFKKSYEQILTIAHKFSQEISWFQPELLALSNEQLEEYLNSPALVAYKFHLEKIIRTKKH
TLSFENEKLLAFAGQALQTSYKAFNAISDADFKFAPIKDDKGSEHALSHATYSLYIRDQDRFLREKAFNQYHHQYLAYEN
TLCELLSGQVQNHLFQARSRHYTSCLESALFPKNIPTSVYHALIEAVTEKISVLHRYMGLRKRILKLDQLHLYDIYVPLT
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HEAGHSMHSLYSRRTQPYQYSDYPIFLAEVASTFNEDLLSRLLINRCQDPIEKIFLVNQKVEDIRATLFRQTMFAEFELL
IHEQVEQDIPLTPQLLKQEYRKLNHKYFGPDVIIDKAIDIEWARIPHFYYNFYVFQYATGISAALAIADKVVNGQQQDRE
NYLNFLKGGCSQYPIEMLKMAGIDMESPLPVKSTIQKFDQLLNELESLLTDVKV

Sequences:

>Translated_614_residues
MKQRKLNMTKSREEVSLSDRWNVEELYLSHEAWEQAFQTFSNAGSQQTSLCPAIQALQGSLHRGPEYVKNTLDLMMSMDR
ELSKLYTYAHLRHDEDIANPIFKKSYEQILTIAHKFSQEISWFQPELLALSNEQLEEYLNSPALVAYKFHLEKIIRTKKH
TLSFENEKLLAFAGQALQTSYKAFNAISDADFKFAPIKDDKGSEHALSHATYSLYIRDQDRFLREKAFNQYHHQYLAYEN
TLCELLSGQVQNHLFQARSRHYTSCLESALFPKNIPTSVYHALIEAVTEKISVLHRYMGLRKRILKLDQLHLYDIYVPLT
SAVDIRLSYKEAEDIVIESVAPLGSEYQSLLAKGLKEERWVDRYENQNKRSGAYSSGCFDSMPYILMNYKNLLRDVFTLA
HEAGHSMHSLYSRRTQPYQYSDYPIFLAEVASTFNEDLLSRLLINRCQDPIEKIFLVNQKVEDIRATLFRQTMFAEFELL
IHEQVEQDIPLTPQLLKQEYRKLNHKYFGPDVIIDKAIDIEWARIPHFYYNFYVFQYATGISAALAIADKVVNGQQQDRE
NYLNFLKGGCSQYPIEMLKMAGIDMESPLPVKSTIQKFDQLLNELESLLTDVKV
>Mature_614_residues
MKQRKLNMTKSREEVSLSDRWNVEELYLSHEAWEQAFQTFSNAGSQQTSLCPAIQALQGSLHRGPEYVKNTLDLMMSMDR
ELSKLYTYAHLRHDEDIANPIFKKSYEQILTIAHKFSQEISWFQPELLALSNEQLEEYLNSPALVAYKFHLEKIIRTKKH
TLSFENEKLLAFAGQALQTSYKAFNAISDADFKFAPIKDDKGSEHALSHATYSLYIRDQDRFLREKAFNQYHHQYLAYEN
TLCELLSGQVQNHLFQARSRHYTSCLESALFPKNIPTSVYHALIEAVTEKISVLHRYMGLRKRILKLDQLHLYDIYVPLT
SAVDIRLSYKEAEDIVIESVAPLGSEYQSLLAKGLKEERWVDRYENQNKRSGAYSSGCFDSMPYILMNYKNLLRDVFTLA
HEAGHSMHSLYSRRTQPYQYSDYPIFLAEVASTFNEDLLSRLLINRCQDPIEKIFLVNQKVEDIRATLFRQTMFAEFELL
IHEQVEQDIPLTPQLLKQEYRKLNHKYFGPDVIIDKAIDIEWARIPHFYYNFYVFQYATGISAALAIADKVVNGQQQDRE
NYLNFLKGGCSQYPIEMLKMAGIDMESPLPVKSTIQKFDQLLNELESLLTDVKV

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71499; Mature: 71499

Theoretical pI: Translated: 6.51; Mature: 6.51

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKQRKLNMTKSREEVSLSDRWNVEELYLSHEAWEQAFQTFSNAGSQQTSLCPAIQALQGS
CCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LHRGPEYVKNTLDLMMSMDRELSKLYTYAHLRHDEDIANPIFKKSYEQILTIAHKFSQEI
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SWFQPELLALSNEQLEEYLNSPALVAYKFHLEKIIRTKKHTLSFENEKLLAFAGQALQTS
HHCCHHHHHHCHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
YKAFNAISDADFKFAPIKDDKGSEHALSHATYSLYIRDQDRFLREKAFNQYHHQYLAYEN
HHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLCELLSGQVQNHLFQARSRHYTSCLESALFPKNIPTSVYHALIEAVTEKISVLHRYMGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKRILKLDQLHLYDIYVPLTSAVDIRLSYKEAEDIVIESVAPLGSEYQSLLAKGLKEERW
HHHHHHHHHHEEEEEEEECCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHH
VDRYENQNKRSGAYSSGCFDSMPYILMNYKNLLRDVFTLAHEAGHSMHSLYSRRTQPYQY
HHHHCCCCCCCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCC
SDYPIFLAEVASTFNEDLLSRLLINRCQDPIEKIFLVNQKVEDIRATLFRQTMFAEFELL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IHEQVEQDIPLTPQLLKQEYRKLNHKYFGPDVIIDKAIDIEWARIPHFYYNFYVFQYATG
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
ISAALAIADKVVNGQQQDRENYLNFLKGGCSQYPIEMLKMAGIDMESPLPVKSTIQKFDQ
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
LLNELESLLTDVKV
HHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKQRKLNMTKSREEVSLSDRWNVEELYLSHEAWEQAFQTFSNAGSQQTSLCPAIQALQGS
CCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LHRGPEYVKNTLDLMMSMDRELSKLYTYAHLRHDEDIANPIFKKSYEQILTIAHKFSQEI
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SWFQPELLALSNEQLEEYLNSPALVAYKFHLEKIIRTKKHTLSFENEKLLAFAGQALQTS
HHCCHHHHHHCHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
YKAFNAISDADFKFAPIKDDKGSEHALSHATYSLYIRDQDRFLREKAFNQYHHQYLAYEN
HHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLCELLSGQVQNHLFQARSRHYTSCLESALFPKNIPTSVYHALIEAVTEKISVLHRYMGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKRILKLDQLHLYDIYVPLTSAVDIRLSYKEAEDIVIESVAPLGSEYQSLLAKGLKEERW
HHHHHHHHHHEEEEEEEECCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHH
VDRYENQNKRSGAYSSGCFDSMPYILMNYKNLLRDVFTLAHEAGHSMHSLYSRRTQPYQY
HHHHCCCCCCCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCC
SDYPIFLAEVASTFNEDLLSRLLINRCQDPIEKIFLVNQKVEDIRATLFRQTMFAEFELL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IHEQVEQDIPLTPQLLKQEYRKLNHKYFGPDVIIDKAIDIEWARIPHFYYNFYVFQYATG
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
ISAALAIADKVVNGQQQDRENYLNFLKGGCSQYPIEMLKMAGIDMESPLPVKSTIQKFDQ
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
LLNELESLLTDVKV
HHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]