Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46446762

Identifier: 46446762

GI number: 46446762

Start: 1351926

End: 1354250

Strand: Direct

Name: 46446762

Synonym: pc1128

Alternate gene names: NA

Gene position: 1351926-1354250 (Clockwise)

Preceding gene: 46446758

Following gene: 46446765

Centisome position: 55.99

GC content: 32.3

Gene sequence:

>2325_bases
ATGCAGTTTTCAACGATTTTTCAACACATCGATCACTTGTTATTAGAGGCACCCAAGTTCTTAATAAAAAACGAAGAAAA
TAAAAAAACTTTTGCAGTTTTTTTAACGACACTATTACAAAATCCATGTTTAGATAATCGGCTCAATTTATCACCTATGA
TCATAGGAAAAATAACCAAAAATATTAATCATACAAAAGAATTTATTTCTTATGTGCAAAAATCTCTCAATATTGCTGCA
ACAAATAAATTAATAACAAACGAGGATGGTCTACAATCTTTTAACAGCCTCCTTAAGCAAATCATCAAAGAAAGCATCCC
TCTTAGCTTTTTTGAAATGTTATCTGATCTTTCTCTTTCATCCACTGATATGTATGAAATATTGGATGTGTGGAATGATA
TGCATCCTCAACAATTTCTTGAGTTATTGAAAAAGTATCAAAATCAAATTGTCAAGTCGCATATAAGTTCGGATCAAATG
ATTTCTTTGCTTAAAAAAAATAGCCAAATCCATCCCGAAACTTTGATAGCTATCATTGAACATCTTAAAATTGATGATCC
TCGTCATCAAATTGAAATAATTCGCTATTTATTAGCTATTTATCCAGAGGAAATGCTTTATAAAATTGAAAATATCAAAA
CTATTTCGTCGTTACAGAAGCTAGATTGTTATCTTAACGCAGTTTCTTTATATCCAAGATTGATTTCAAACTGGAAAGCT
GCTTTTTTCGCTAAAACAAGAGAAGAATTAGCTAAACAATCGAGCTTTATCTCGATTCTTAAGACATATGATCAAATCAA
AATGGAAAGCGAAGCGGAAGAACTCGTTATTTCAAAACTTGAAAGTCAATGGGAAAAATGTTTTAAAGAAAAAGAATCTT
TAAGTTCTCTTTTGTCTCAATGCAATTTTATGAATGACTTTTTCTATTCGAGGAAAGAATTATGTATTTGGCTAGGATTT
CTTTTGGAACATATTTCAAAGTGCAATTTTTCACAAAAAGAATTAGCTTACGTTGCATCGATTGTTCCTCTCATTGCATC
ATCTGAACATTCTTTAAGATATCAGCTCACAGCATATCTAATGGAACCTGAAATTATTCAAAAGCTCTTAAATCAATATC
CCCTCAACCAACCCCCTTCTTTATTTCTCATGATTTACGACCTTTTTAAAATTCCTCAAGATTTATATACTTCTTTTCAA
AAGCGAAACCATCTCGTAAGCTTATCAACTTTACTATCATTACAACTATCGACCAGCTATACAACAAAGACTAAAAACCA
ACTTTTTGGCATTTTACAAGCTAGTGCAACTGCGCGGTTTTTCCTTTTTAATGTATATGCTTTGCGTGACCTACTGAGCC
TCCAAGAACCAAAACTTTTTGAAAACAACTGCTTATCCTCCTTAAATTTGAGAGAGCTATTTTTTTCTATTTTTAATAAT
TATCTCCGGCTAAAGGATTTAGATTTAGATGATTTTTTCGACCATTACATACGAACATTTGGGTTATTTCGAATTCCAGA
AGCTTTAATTGTCTACGCAAAAAATTTACAAAACCTACCTAAAGCTAAAGAAAAAAAGATTATTTTAAATTCCCTTAAGG
AGCTCGTTTTAGATGTTTTTTCTGGAGAGTACGCAAAAAAAAGATATCAAGGAAATCTGAGTCCTCACCTTCACAATTTG
CATAAGATCGATTCAAACTTGATGAATCTTTGGCAAGAAAATCAAATTAAGGGTTTAATCACCGATTTTTTAAATGCATC
TCCGAGATTAACACTAGAGGGATGCGTTTTGGAAGAAACGGATCAAATCGAAGAAATTTTTATTTGCACAACAGAAGTTG
CTGGAAGCTGCTTATCTGTCAGAGGTAATCCAGAAGACAATCAAAGTTTTTTAGCTATCCCTCTTAATGGGAAAAATAAA
ATATTTTGCATCAAAGAAAAAAGTGGGAAGAATGGCAAAATGATTGCCAGAGCTAAGCTTAGTTTTTTAATAGACGATCA
AGAAAATTGTGTTCTTTTACTAGATACTTTATTTAGTTCTCTTCCTTATGAAGAAAGTAAAACATTTTCCACTCCATATG
AACAAATGGAAAAGGCGATCATGACTGCCGCCATTCAAAAAGCTAAAAAGATGAACTGCTCTCTTGTGAAAACCTACTCT
TCTTCAGATCAAACTTATCCAACTTATCCTCGACCTATTCTTTCTCTAGGAGGAAGAGCTCCTATTGAATGTTGTAATGC
TGTAGGAGCTCTAGGAGAGGATGAGCTTTGCCAAAGTAGCAAATTTACAATTTCAAAGACTCAAATCCTTTGGTCACCGG
ACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGATCGAAGTAGAGTGGATACCGAAAAAACAAACCCTCTTGATTAATAATCCTAAATGGCTTGTAATAAATTTTTTATC
TTCTTCACGAGGTTTGGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTTGTAACTCAAGAGAGCTTATCTAAGGCTTCCTTAAGGCTTCCATATTGTGTTTGTCTTTTTGAGAGTATATAAACCG
GACAATTCTTCTGGGGTTCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 774; Mature: 774

Protein sequence:

>774_residues
MQFSTIFQHIDHLLLEAPKFLIKNEENKKTFAVFLTTLLQNPCLDNRLNLSPMIIGKITKNINHTKEFISYVQKSLNIAA
TNKLITNEDGLQSFNSLLKQIIKESIPLSFFEMLSDLSLSSTDMYEILDVWNDMHPQQFLELLKKYQNQIVKSHISSDQM
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IFCIKEKSGKNGKMIARAKLSFLIDDQENCVLLLDTLFSSLPYEESKTFSTPYEQMEKAIMTAAIQKAKKMNCSLVKTYS
SSDQTYPTYPRPILSLGGRAPIECCNAVGALGEDELCQSSKFTISKTQILWSPD

Sequences:

>Translated_774_residues
MQFSTIFQHIDHLLLEAPKFLIKNEENKKTFAVFLTTLLQNPCLDNRLNLSPMIIGKITKNINHTKEFISYVQKSLNIAA
TNKLITNEDGLQSFNSLLKQIIKESIPLSFFEMLSDLSLSSTDMYEILDVWNDMHPQQFLELLKKYQNQIVKSHISSDQM
ISLLKKNSQIHPETLIAIIEHLKIDDPRHQIEIIRYLLAIYPEEMLYKIENIKTISSLQKLDCYLNAVSLYPRLISNWKA
AFFAKTREELAKQSSFISILKTYDQIKMESEAEELVISKLESQWEKCFKEKESLSSLLSQCNFMNDFFYSRKELCIWLGF
LLEHISKCNFSQKELAYVASIVPLIASSEHSLRYQLTAYLMEPEIIQKLLNQYPLNQPPSLFLMIYDLFKIPQDLYTSFQ
KRNHLVSLSTLLSLQLSTSYTTKTKNQLFGILQASATARFFLFNVYALRDLLSLQEPKLFENNCLSSLNLRELFFSIFNN
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HKIDSNLMNLWQENQIKGLITDFLNASPRLTLEGCVLEETDQIEEIFICTTEVAGSCLSVRGNPEDNQSFLAIPLNGKNK
IFCIKEKSGKNGKMIARAKLSFLIDDQENCVLLLDTLFSSLPYEESKTFSTPYEQMEKAIMTAAIQKAKKMNCSLVKTYS
SSDQTYPTYPRPILSLGGRAPIECCNAVGALGEDELCQSSKFTISKTQILWSPD
>Mature_774_residues
MQFSTIFQHIDHLLLEAPKFLIKNEENKKTFAVFLTTLLQNPCLDNRLNLSPMIIGKITKNINHTKEFISYVQKSLNIAA
TNKLITNEDGLQSFNSLLKQIIKESIPLSFFEMLSDLSLSSTDMYEILDVWNDMHPQQFLELLKKYQNQIVKSHISSDQM
ISLLKKNSQIHPETLIAIIEHLKIDDPRHQIEIIRYLLAIYPEEMLYKIENIKTISSLQKLDCYLNAVSLYPRLISNWKA
AFFAKTREELAKQSSFISILKTYDQIKMESEAEELVISKLESQWEKCFKEKESLSSLLSQCNFMNDFFYSRKELCIWLGF
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IFCIKEKSGKNGKMIARAKLSFLIDDQENCVLLLDTLFSSLPYEESKTFSTPYEQMEKAIMTAAIQKAKKMNCSLVKTYS
SSDQTYPTYPRPILSLGGRAPIECCNAVGALGEDELCQSSKFTISKTQILWSPD

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89218; Mature: 89218

Theoretical pI: Translated: 7.02; Mature: 7.02

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.1 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
2.1 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQFSTIFQHIDHLLLEAPKFLIKNEENKKTFAVFLTTLLQNPCLDNRLNLSPMIIGKITK
CCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
NINHTKEFISYVQKSLNIAATNKLITNEDGLQSFNSLLKQIIKESIPLSFFEMLSDLSLS
CCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCC
STDMYEILDVWNDMHPQQFLELLKKYQNQIVKSHISSDQMISLLKKNSQIHPETLIAIIE
CCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
HLKIDDPRHQIEIIRYLLAIYPEEMLYKIENIKTISSLQKLDCYLNAVSLYPRLISNWKA
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFFAKTREELAKQSSFISILKTYDQIKMESEAEELVISKLESQWEKCFKEKESLSSLLSQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CNFMNDFFYSRKELCIWLGFLLEHISKCNFSQKELAYVASIVPLIASSEHSLRYQLTAYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
MEPEIIQKLLNQYPLNQPPSLFLMIYDLFKIPQDLYTSFQKRNHLVSLSTLLSLQLSTSY
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TTKTKNQLFGILQASATARFFLFNVYALRDLLSLQEPKLFENNCLSSLNLRELFFSIFNN
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YLRLKDLDLDDFFDHYIRTFGLFRIPEALIVYAKNLQNLPKAKEKKIILNSLKELVLDVF
HHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGEYAKKRYQGNLSPHLHNLHKIDSNLMNLWQENQIKGLITDFLNASPRLTLEGCVLEET
CCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCEECCH
DQIEEIFICTTEVAGSCLSVRGNPEDNQSFLAIPLNGKNKIFCIKEKSGKNGKMIARAKL
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SFLIDDQENCVLLLDTLFSSLPYEESKTFSTPYEQMEKAIMTAAIQKAKKMNCSLVKTYS
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>Mature Secondary Structure
MQFSTIFQHIDHLLLEAPKFLIKNEENKKTFAVFLTTLLQNPCLDNRLNLSPMIIGKITK
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CCCCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCEEEEEEEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA