| Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005861 |
| Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is 46446762
Identifier: 46446762
GI number: 46446762
Start: 1351926
End: 1354250
Strand: Direct
Name: 46446762
Synonym: pc1128
Alternate gene names: NA
Gene position: 1351926-1354250 (Clockwise)
Preceding gene: 46446758
Following gene: 46446765
Centisome position: 55.99
GC content: 32.3
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGTTGTAACTCAAGAGAGCTTATCTAAGGCTTCCTTAAGGCTTCCATATTGTGTTTGTCTTTTTGAGAGTATATAAACCG GACAATTCTTCTGGGGTTCT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 774; Mature: 774
Protein sequence:
>774_residues MQFSTIFQHIDHLLLEAPKFLIKNEENKKTFAVFLTTLLQNPCLDNRLNLSPMIIGKITKNINHTKEFISYVQKSLNIAA TNKLITNEDGLQSFNSLLKQIIKESIPLSFFEMLSDLSLSSTDMYEILDVWNDMHPQQFLELLKKYQNQIVKSHISSDQM ISLLKKNSQIHPETLIAIIEHLKIDDPRHQIEIIRYLLAIYPEEMLYKIENIKTISSLQKLDCYLNAVSLYPRLISNWKA AFFAKTREELAKQSSFISILKTYDQIKMESEAEELVISKLESQWEKCFKEKESLSSLLSQCNFMNDFFYSRKELCIWLGF LLEHISKCNFSQKELAYVASIVPLIASSEHSLRYQLTAYLMEPEIIQKLLNQYPLNQPPSLFLMIYDLFKIPQDLYTSFQ KRNHLVSLSTLLSLQLSTSYTTKTKNQLFGILQASATARFFLFNVYALRDLLSLQEPKLFENNCLSSLNLRELFFSIFNN YLRLKDLDLDDFFDHYIRTFGLFRIPEALIVYAKNLQNLPKAKEKKIILNSLKELVLDVFSGEYAKKRYQGNLSPHLHNL HKIDSNLMNLWQENQIKGLITDFLNASPRLTLEGCVLEETDQIEEIFICTTEVAGSCLSVRGNPEDNQSFLAIPLNGKNK IFCIKEKSGKNGKMIARAKLSFLIDDQENCVLLLDTLFSSLPYEESKTFSTPYEQMEKAIMTAAIQKAKKMNCSLVKTYS SSDQTYPTYPRPILSLGGRAPIECCNAVGALGEDELCQSSKFTISKTQILWSPD
Sequences:
>Translated_774_residues MQFSTIFQHIDHLLLEAPKFLIKNEENKKTFAVFLTTLLQNPCLDNRLNLSPMIIGKITKNINHTKEFISYVQKSLNIAA TNKLITNEDGLQSFNSLLKQIIKESIPLSFFEMLSDLSLSSTDMYEILDVWNDMHPQQFLELLKKYQNQIVKSHISSDQM ISLLKKNSQIHPETLIAIIEHLKIDDPRHQIEIIRYLLAIYPEEMLYKIENIKTISSLQKLDCYLNAVSLYPRLISNWKA AFFAKTREELAKQSSFISILKTYDQIKMESEAEELVISKLESQWEKCFKEKESLSSLLSQCNFMNDFFYSRKELCIWLGF LLEHISKCNFSQKELAYVASIVPLIASSEHSLRYQLTAYLMEPEIIQKLLNQYPLNQPPSLFLMIYDLFKIPQDLYTSFQ KRNHLVSLSTLLSLQLSTSYTTKTKNQLFGILQASATARFFLFNVYALRDLLSLQEPKLFENNCLSSLNLRELFFSIFNN YLRLKDLDLDDFFDHYIRTFGLFRIPEALIVYAKNLQNLPKAKEKKIILNSLKELVLDVFSGEYAKKRYQGNLSPHLHNL HKIDSNLMNLWQENQIKGLITDFLNASPRLTLEGCVLEETDQIEEIFICTTEVAGSCLSVRGNPEDNQSFLAIPLNGKNK IFCIKEKSGKNGKMIARAKLSFLIDDQENCVLLLDTLFSSLPYEESKTFSTPYEQMEKAIMTAAIQKAKKMNCSLVKTYS SSDQTYPTYPRPILSLGGRAPIECCNAVGALGEDELCQSSKFTISKTQILWSPD >Mature_774_residues MQFSTIFQHIDHLLLEAPKFLIKNEENKKTFAVFLTTLLQNPCLDNRLNLSPMIIGKITKNINHTKEFISYVQKSLNIAA TNKLITNEDGLQSFNSLLKQIIKESIPLSFFEMLSDLSLSSTDMYEILDVWNDMHPQQFLELLKKYQNQIVKSHISSDQM ISLLKKNSQIHPETLIAIIEHLKIDDPRHQIEIIRYLLAIYPEEMLYKIENIKTISSLQKLDCYLNAVSLYPRLISNWKA AFFAKTREELAKQSSFISILKTYDQIKMESEAEELVISKLESQWEKCFKEKESLSSLLSQCNFMNDFFYSRKELCIWLGF LLEHISKCNFSQKELAYVASIVPLIASSEHSLRYQLTAYLMEPEIIQKLLNQYPLNQPPSLFLMIYDLFKIPQDLYTSFQ KRNHLVSLSTLLSLQLSTSYTTKTKNQLFGILQASATARFFLFNVYALRDLLSLQEPKLFENNCLSSLNLRELFFSIFNN YLRLKDLDLDDFFDHYIRTFGLFRIPEALIVYAKNLQNLPKAKEKKIILNSLKELVLDVFSGEYAKKRYQGNLSPHLHNL HKIDSNLMNLWQENQIKGLITDFLNASPRLTLEGCVLEETDQIEEIFICTTEVAGSCLSVRGNPEDNQSFLAIPLNGKNK IFCIKEKSGKNGKMIARAKLSFLIDDQENCVLLLDTLFSSLPYEESKTFSTPYEQMEKAIMTAAIQKAKKMNCSLVKTYS SSDQTYPTYPRPILSLGGRAPIECCNAVGALGEDELCQSSKFTISKTQILWSPD
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 89218; Mature: 89218
Theoretical pI: Translated: 7.02; Mature: 7.02
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
2.1 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 2.1 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQFSTIFQHIDHLLLEAPKFLIKNEENKKTFAVFLTTLLQNPCLDNRLNLSPMIIGKITK CCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH NINHTKEFISYVQKSLNIAATNKLITNEDGLQSFNSLLKQIIKESIPLSFFEMLSDLSLS CCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCC STDMYEILDVWNDMHPQQFLELLKKYQNQIVKSHISSDQMISLLKKNSQIHPETLIAIIE CCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH HLKIDDPRHQIEIIRYLLAIYPEEMLYKIENIKTISSLQKLDCYLNAVSLYPRLISNWKA HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFFAKTREELAKQSSFISILKTYDQIKMESEAEELVISKLESQWEKCFKEKESLSSLLSQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CNFMNDFFYSRKELCIWLGFLLEHISKCNFSQKELAYVASIVPLIASSEHSLRYQLTAYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH MEPEIIQKLLNQYPLNQPPSLFLMIYDLFKIPQDLYTSFQKRNHLVSLSTLLSLQLSTSY CCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHCCCC TTKTKNQLFGILQASATARFFLFNVYALRDLLSLQEPKLFENNCLSSLNLRELFFSIFNN CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH YLRLKDLDLDDFFDHYIRTFGLFRIPEALIVYAKNLQNLPKAKEKKIILNSLKELVLDVF HHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGEYAKKRYQGNLSPHLHNLHKIDSNLMNLWQENQIKGLITDFLNASPRLTLEGCVLEET CCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCEECCH DQIEEIFICTTEVAGSCLSVRGNPEDNQSFLAIPLNGKNKIFCIKEKSGKNGKMIARAKL HHHHHHEEEEHHHCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEE SFLIDDQENCVLLLDTLFSSLPYEESKTFSTPYEQMEKAIMTAAIQKAKKMNCSLVKTYS EEEEECCCCEEEEHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC SSDQTYPTYPRPILSLGGRAPIECCNAVGALGEDELCQSSKFTISKTQILWSPD CCCCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCEEEEEEEEECCC >Mature Secondary Structure MQFSTIFQHIDHLLLEAPKFLIKNEENKKTFAVFLTTLLQNPCLDNRLNLSPMIIGKITK CCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH NINHTKEFISYVQKSLNIAATNKLITNEDGLQSFNSLLKQIIKESIPLSFFEMLSDLSLS CCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCC STDMYEILDVWNDMHPQQFLELLKKYQNQIVKSHISSDQMISLLKKNSQIHPETLIAIIE CCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH HLKIDDPRHQIEIIRYLLAIYPEEMLYKIENIKTISSLQKLDCYLNAVSLYPRLISNWKA HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFFAKTREELAKQSSFISILKTYDQIKMESEAEELVISKLESQWEKCFKEKESLSSLLSQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CNFMNDFFYSRKELCIWLGFLLEHISKCNFSQKELAYVASIVPLIASSEHSLRYQLTAYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH MEPEIIQKLLNQYPLNQPPSLFLMIYDLFKIPQDLYTSFQKRNHLVSLSTLLSLQLSTSY CCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHCCCC TTKTKNQLFGILQASATARFFLFNVYALRDLLSLQEPKLFENNCLSSLNLRELFFSIFNN CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH YLRLKDLDLDDFFDHYIRTFGLFRIPEALIVYAKNLQNLPKAKEKKIILNSLKELVLDVF HHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGEYAKKRYQGNLSPHLHNLHKIDSNLMNLWQENQIKGLITDFLNASPRLTLEGCVLEET CCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCEECCH DQIEEIFICTTEVAGSCLSVRGNPEDNQSFLAIPLNGKNKIFCIKEKSGKNGKMIARAKL HHHHHHEEEEHHHCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEE SFLIDDQENCVLLLDTLFSSLPYEESKTFSTPYEQMEKAIMTAAIQKAKKMNCSLVKTYS EEEEECCCCEEEEHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC SSDQTYPTYPRPILSLGGRAPIECCNAVGALGEDELCQSSKFTISKTQILWSPD CCCCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCEEEEEEEEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA