Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46446659

Identifier: 46446659

GI number: 46446659

Start: 1212370

End: 1214457

Strand: Direct

Name: 46446659

Synonym: pc1025

Alternate gene names: NA

Gene position: 1212370-1214457 (Clockwise)

Preceding gene: 46446658

Following gene: 46446661

Centisome position: 50.21

GC content: 39.56

Gene sequence:

>2088_bases
TTGAACATTTCTAATACAGGGTTTAATTCTAGTTATCTTGTCAATACAACGAATCCATCTTACTATCCTCTTCAAGACAT
TAACGATCAACTTGAGAATGAAAATACTCCCTTAGACAATCCTTTGCCTAATCTAGAAGAAACTAGTGCGTCAACGATTC
AACCTTCCGCTCTTTCACCTTCATCTGAAGAAGTCCAACTAAGCTTTCAAGAGGGAACTTCTCTGACTATTTCTTACTCT
CAGCTAGCTTTGTTAAGGGAAAAATCACGCTACTTTAACAATCTGTGGTCGGGGCAATTTCAAGAAACCCTGCAACATCC
TCTCGCTTTGACACAAAAGGAATTTACGCATCTGCTTAATTGTGTCATGGATGCTAACTTTAAAGTTCCCTTAGAAGAAA
TTACTTCTACCATTCACCTAGCCGATTATTATGAACTAACAGAAGTGATAAAACATTTAGAAGCACAGCTAATAAGTGGA
TATAGGTCCCAGAGATTCGAACCCTTTAACTCCACTGAAGAGAGTTTAGTCGGATTAAAAGAACTTTTAAATTTTGCTCA
TCGCTATCAATTAAATAGATTGAAGAATTATTTAGAATTCACCGTTGTGAGCGCCTTATTAAACCAGACCTCTCAATTGG
CGGAGTTTGAAAGAATTATAAATCACTTTTCAAAGAAGATAGAGGGACTCAATTTTTCAAACAATCGTTATTTAACTGAT
GCGCATCTTCTAATATTAAAAAATTGTAAAAACTTAAAAGTGCTTCATTTAGAGAAGTGCCGGGCTCTCACTGACGATGG
GTTAGCGCATTTAACACCCTTAACGGCTTTGCAGTATCTAAATCTGAGTGCGAGCTATAATCTCACCGATGCAGGATTAG
TTCATTTGGCACCCTTAACCGCTTTACAAAAACTAAATTTAGGCAGGTACAATCAACTCACCGATGCAGGATTAGCTCAT
TTGAAACCCTTAACGGCTTTGCAGCGTCTAGATTTGAGCTTCTGCGAGGATCTCACTGACGATGGTTTGGCGCATTTAAG
ACCCTTAACGGCTTTGCAGCGTCTAGATTTGCGCTACTGTGAGAAACTCACTGACGATGGTTTGGTGCATTTAAGACCCT
TAACGGCTTTGCAGCGTCTAAATCTGAGCAATTGCTGGCACACCGGTGCAGGATTATCCCATTTGTCCCCCTTAACGGGT
TTACAGCATCTAAATCTATACGAATGTATAAATCTCACCGATGCCGGATTAGTGCATTTGAAACTCTTAACAGGTTTGCA
GCATTTAAATCTAAGCTATTGTGATGAACTCACCGATGCCGGATTAGTGCATTTGAAACTCTTAACGGGTTTGCAGCATC
TAAATCTGAGCAATTGCAATAATCTCACCGATGCCGGATTAGTGCATTTGAAATTCTTAACAGGTTTGCAGCATTTAAAT
CTAAGCTATTGTGATGAACTCACCGATGCCGGATTAGTGCATTTGAAACTCTTAACGGGTTTGCAGCATCTAAATCTGAG
CAATTGCAATAATCTCACCGATGCCGGATTAGCCCATTTGACACCCTTAACGGGTTTGCAGCATCTAGATTTAAGCTACT
GTTCGAAACTCACTGACGATGGTTTGGCGCATTTGAAACCCTTAACGGCTTTGCAGTGTTTAAATCTAAGCAACTGTAGG
AATCTCACCGATGCCGGATTAGTGCATTTGAAACTCTTAACGGGTTTGCAGCATCTCAATCTAAGCGATTATAAGAATCT
CACTGATGATGGATTAATCCATTTGATGCCCTTAATGGCTTTGCGGCATCTAGAGCTGTTAGGGTGTGAGAATCTTACTG
ATGCAGGATTAGTGCATTTGACACCCTTAACGGCTTTGCAGCATCTAAATCTAAGCCATTGTGATGATCTCACGGATGCT
GGATTAGCCCATTTAACATCCTTAACGGGTTTGCAGCATCTAGAGCTGTTAGGGTGTGAGAATCTTACTGATGCAGGATT
AGCACGCTTTAAAACTGTAGCAAATTCACTCTATCTAATAATAAAAAGGTTCTTTGTTTTAAGAGAATCAAGAATAAAAT
TTCATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCTATTTTAACTTATTAATATTGCAATAATTTTTATCTATCCATCATATTGTTAAAATATCTATAAATGAAAATTTATTT
TACTCATTGGGACGGTCATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTTGATCAATTTCCATTGAGACGCTTATTTAATAGAGATATCCGCTATAAGATGTATTATAGGATGGAAATTAAGCTTA
TAAACCAATTTTAGTGGCGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 695; Mature: 695

Protein sequence:

>695_residues
MNISNTGFNSSYLVNTTNPSYYPLQDINDQLENENTPLDNPLPNLEETSASTIQPSALSPSSEEVQLSFQEGTSLTISYS
QLALLREKSRYFNNLWSGQFQETLQHPLALTQKEFTHLLNCVMDANFKVPLEEITSTIHLADYYELTEVIKHLEAQLISG
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AHLLILKNCKNLKVLHLEKCRALTDDGLAHLTPLTALQYLNLSASYNLTDAGLVHLAPLTALQKLNLGRYNQLTDAGLAH
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LSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLAHLTPLTGLQHLDLSYCSKLTDDGLAHLKPLTALQCLNLSNCR
NLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSDYKNLTDDGLIHLMPLMALRHLELLGCENLTDAGLVHLTPLTALQHLNLSHCDDLTDA
GLAHLTSLTGLQHLELLGCENLTDAGLARFKTVANSLYLIIKRFFVLRESRIKFH

Sequences:

>Translated_695_residues
MNISNTGFNSSYLVNTTNPSYYPLQDINDQLENENTPLDNPLPNLEETSASTIQPSALSPSSEEVQLSFQEGTSLTISYS
QLALLREKSRYFNNLWSGQFQETLQHPLALTQKEFTHLLNCVMDANFKVPLEEITSTIHLADYYELTEVIKHLEAQLISG
YRSQRFEPFNSTEESLVGLKELLNFAHRYQLNRLKNYLEFTVVSALLNQTSQLAEFERIINHFSKKIEGLNFSNNRYLTD
AHLLILKNCKNLKVLHLEKCRALTDDGLAHLTPLTALQYLNLSASYNLTDAGLVHLAPLTALQKLNLGRYNQLTDAGLAH
LKPLTALQRLDLSFCEDLTDDGLAHLRPLTALQRLDLRYCEKLTDDGLVHLRPLTALQRLNLSNCWHTGAGLSHLSPLTG
LQHLNLYECINLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLVHLKFLTGLQHLN
LSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLAHLTPLTGLQHLDLSYCSKLTDDGLAHLKPLTALQCLNLSNCR
NLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSDYKNLTDDGLIHLMPLMALRHLELLGCENLTDAGLVHLTPLTALQHLNLSHCDDLTDA
GLAHLTSLTGLQHLELLGCENLTDAGLARFKTVANSLYLIIKRFFVLRESRIKFH
>Mature_695_residues
MNISNTGFNSSYLVNTTNPSYYPLQDINDQLENENTPLDNPLPNLEETSASTIQPSALSPSSEEVQLSFQEGTSLTISYS
QLALLREKSRYFNNLWSGQFQETLQHPLALTQKEFTHLLNCVMDANFKVPLEEITSTIHLADYYELTEVIKHLEAQLISG
YRSQRFEPFNSTEESLVGLKELLNFAHRYQLNRLKNYLEFTVVSALLNQTSQLAEFERIINHFSKKIEGLNFSNNRYLTD
AHLLILKNCKNLKVLHLEKCRALTDDGLAHLTPLTALQYLNLSASYNLTDAGLVHLAPLTALQKLNLGRYNQLTDAGLAH
LKPLTALQRLDLSFCEDLTDDGLAHLRPLTALQRLDLRYCEKLTDDGLVHLRPLTALQRLNLSNCWHTGAGLSHLSPLTG
LQHLNLYECINLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLVHLKFLTGLQHLN
LSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLAHLTPLTGLQHLDLSYCSKLTDDGLAHLKPLTALQCLNLSNCR
NLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSDYKNLTDDGLIHLMPLMALRHLELLGCENLTDAGLVHLTPLTALQHLNLSHCDDLTDA
GLAHLTSLTGLQHLELLGCENLTDAGLARFKTVANSLYLIIKRFFVLRESRIKFH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI22748931, Length=355, Percent_Identity=33.8028169014084, Blast_Score=152, Evalue=1e-36,
Organism=Homo sapiens, GI284447308, Length=331, Percent_Identity=33.2326283987915, Blast_Score=119, Evalue=1e-26,
Organism=Homo sapiens, GI27734755, Length=358, Percent_Identity=31.8435754189944, Blast_Score=113, Evalue=7e-25,
Organism=Homo sapiens, GI296531375, Length=304, Percent_Identity=32.2368421052632, Blast_Score=105, Evalue=1e-22,
Organism=Homo sapiens, GI161333852, Length=437, Percent_Identity=28.3752860411899, Blast_Score=105, Evalue=2e-22,
Organism=Homo sapiens, GI6912466, Length=262, Percent_Identity=32.824427480916, Blast_Score=103, Evalue=5e-22,
Organism=Homo sapiens, GI161333854, Length=351, Percent_Identity=28.2051282051282, Blast_Score=99, Evalue=2e-20,
Organism=Homo sapiens, GI284447314, Length=257, Percent_Identity=33.852140077821, Blast_Score=96, Evalue=1e-19,
Organism=Homo sapiens, GI289666746, Length=261, Percent_Identity=35.632183908046, Blast_Score=84, Evalue=3e-16,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI25151694, Length=334, Percent_Identity=29.940119760479, Blast_Score=100, Evalue=2e-21,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI25151696, Length=334, Percent_Identity=29.940119760479, Blast_Score=100, Evalue=3e-21,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6322549, Length=359, Percent_Identity=27.0194986072423, Blast_Score=77, Evalue=1e-14,
Organism=Drosophila melanogaster, GI17647819, Length=325, Percent_Identity=34.4615384615385, Blast_Score=140, Evalue=4e-33,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24662818, Length=264, Percent_Identity=35.2272727272727, Blast_Score=89, Evalue=1e-17,
Organism=Drosophila melanogaster, GI21357913, Length=271, Percent_Identity=30.2583025830258, Blast_Score=86, Evalue=8e-17,
Organism=Drosophila melanogaster, GI161076545, Length=288, Percent_Identity=30.9027777777778, Blast_Score=86, Evalue=1e-16,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24652783, Length=288, Percent_Identity=30.9027777777778, Blast_Score=85, Evalue=2e-16,
Organism=Drosophila melanogaster, GI161076547, Length=288, Percent_Identity=30.9027777777778, Blast_Score=85, Evalue=2e-16,
Organism=Drosophila melanogaster, GI161076549, Length=288, Percent_Identity=30.9027777777778, Blast_Score=84, Evalue=3e-16,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24646754, Length=304, Percent_Identity=29.6052631578947, Blast_Score=81, Evalue=2e-15,
Organism=Drosophila melanogaster, GI19921840, Length=466, Percent_Identity=27.8969957081545, Blast_Score=75, Evalue=2e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77656; Mature: 77656

Theoretical pI: Translated: 6.34; Mature: 6.34

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.4 %Cys     (Translated Protein)
0.6 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
2.4 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNISNTGFNSSYLVNTTNPSYYPLQDINDQLENENTPLDNPLPNLEETSASTIQPSALSP
CCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
SSEEVQLSFQEGTSLTISYSQLALLREKSRYFNNLWSGQFQETLQHPLALTQKEFTHLLN
CCCCEEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CVMDANFKVPLEEITSTIHLADYYELTEVIKHLEAQLISGYRSQRFEPFNSTEESLVGLK
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
ELLNFAHRYQLNRLKNYLEFTVVSALLNQTSQLAEFERIINHFSKKIEGLNFSNNRYLTD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEH
AHLLILKNCKNLKVLHLEKCRALTDDGLAHLTPLTALQYLNLSASYNLTDAGLVHLAPLT
HHHHEECCCCCCEEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
ALQKLNLGRYNQLTDAGLAHLKPLTALQRLDLSFCEDLTDDGLAHLRPLTALQRLDLRYC
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKLTDDGLVHLRPLTALQRLNLSNCWHTGAGLSHLSPLTGLQHLNLYECINLTDAGLVHL
HHCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHH
KLLTGLQHLNLSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLVHLKFLTGLQHLN
HHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC
LSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLAHLTPLTGLQHLDLSYCSKLTDD
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHCCCC
GLAHLKPLTALQCLNLSNCRNLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSDYKNLTDDGLIHLMPLMA
CHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
LRHLELLGCENLTDAGLVHLTPLTALQHLNLSHCDDLTDAGLAHLTSLTGLQHLELLGCE
HHHHHHHCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NLTDAGLARFKTVANSLYLIIKRFFVLRESRIKFH
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNISNTGFNSSYLVNTTNPSYYPLQDINDQLENENTPLDNPLPNLEETSASTIQPSALSP
CCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
SSEEVQLSFQEGTSLTISYSQLALLREKSRYFNNLWSGQFQETLQHPLALTQKEFTHLLN
CCCCEEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CVMDANFKVPLEEITSTIHLADYYELTEVIKHLEAQLISGYRSQRFEPFNSTEESLVGLK
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
ELLNFAHRYQLNRLKNYLEFTVVSALLNQTSQLAEFERIINHFSKKIEGLNFSNNRYLTD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEH
AHLLILKNCKNLKVLHLEKCRALTDDGLAHLTPLTALQYLNLSASYNLTDAGLVHLAPLT
HHHHEECCCCCCEEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
ALQKLNLGRYNQLTDAGLAHLKPLTALQRLDLSFCEDLTDDGLAHLRPLTALQRLDLRYC
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKLTDDGLVHLRPLTALQRLNLSNCWHTGAGLSHLSPLTGLQHLNLYECINLTDAGLVHL
HHCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHH
KLLTGLQHLNLSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLVHLKFLTGLQHLN
HHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC
LSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLAHLTPLTGLQHLDLSYCSKLTDD
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHCCCC
GLAHLKPLTALQCLNLSNCRNLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSDYKNLTDDGLIHLMPLMA
CHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
LRHLELLGCENLTDAGLVHLTPLTALQHLNLSHCDDLTDAGLAHLTSLTGLQHLELLGCE
HHHHHHHCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NLTDAGLARFKTVANSLYLIIKRFFVLRESRIKFH
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA