| Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005861 |
| Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is 46446659
Identifier: 46446659
GI number: 46446659
Start: 1212370
End: 1214457
Strand: Direct
Name: 46446659
Synonym: pc1025
Alternate gene names: NA
Gene position: 1212370-1214457 (Clockwise)
Preceding gene: 46446658
Following gene: 46446661
Centisome position: 50.21
GC content: 39.56
Gene sequence:
>2088_bases TTGAACATTTCTAATACAGGGTTTAATTCTAGTTATCTTGTCAATACAACGAATCCATCTTACTATCCTCTTCAAGACAT TAACGATCAACTTGAGAATGAAAATACTCCCTTAGACAATCCTTTGCCTAATCTAGAAGAAACTAGTGCGTCAACGATTC AACCTTCCGCTCTTTCACCTTCATCTGAAGAAGTCCAACTAAGCTTTCAAGAGGGAACTTCTCTGACTATTTCTTACTCT CAGCTAGCTTTGTTAAGGGAAAAATCACGCTACTTTAACAATCTGTGGTCGGGGCAATTTCAAGAAACCCTGCAACATCC TCTCGCTTTGACACAAAAGGAATTTACGCATCTGCTTAATTGTGTCATGGATGCTAACTTTAAAGTTCCCTTAGAAGAAA TTACTTCTACCATTCACCTAGCCGATTATTATGAACTAACAGAAGTGATAAAACATTTAGAAGCACAGCTAATAAGTGGA TATAGGTCCCAGAGATTCGAACCCTTTAACTCCACTGAAGAGAGTTTAGTCGGATTAAAAGAACTTTTAAATTTTGCTCA TCGCTATCAATTAAATAGATTGAAGAATTATTTAGAATTCACCGTTGTGAGCGCCTTATTAAACCAGACCTCTCAATTGG CGGAGTTTGAAAGAATTATAAATCACTTTTCAAAGAAGATAGAGGGACTCAATTTTTCAAACAATCGTTATTTAACTGAT GCGCATCTTCTAATATTAAAAAATTGTAAAAACTTAAAAGTGCTTCATTTAGAGAAGTGCCGGGCTCTCACTGACGATGG GTTAGCGCATTTAACACCCTTAACGGCTTTGCAGTATCTAAATCTGAGTGCGAGCTATAATCTCACCGATGCAGGATTAG TTCATTTGGCACCCTTAACCGCTTTACAAAAACTAAATTTAGGCAGGTACAATCAACTCACCGATGCAGGATTAGCTCAT TTGAAACCCTTAACGGCTTTGCAGCGTCTAGATTTGAGCTTCTGCGAGGATCTCACTGACGATGGTTTGGCGCATTTAAG ACCCTTAACGGCTTTGCAGCGTCTAGATTTGCGCTACTGTGAGAAACTCACTGACGATGGTTTGGTGCATTTAAGACCCT TAACGGCTTTGCAGCGTCTAAATCTGAGCAATTGCTGGCACACCGGTGCAGGATTATCCCATTTGTCCCCCTTAACGGGT TTACAGCATCTAAATCTATACGAATGTATAAATCTCACCGATGCCGGATTAGTGCATTTGAAACTCTTAACAGGTTTGCA GCATTTAAATCTAAGCTATTGTGATGAACTCACCGATGCCGGATTAGTGCATTTGAAACTCTTAACGGGTTTGCAGCATC TAAATCTGAGCAATTGCAATAATCTCACCGATGCCGGATTAGTGCATTTGAAATTCTTAACAGGTTTGCAGCATTTAAAT CTAAGCTATTGTGATGAACTCACCGATGCCGGATTAGTGCATTTGAAACTCTTAACGGGTTTGCAGCATCTAAATCTGAG CAATTGCAATAATCTCACCGATGCCGGATTAGCCCATTTGACACCCTTAACGGGTTTGCAGCATCTAGATTTAAGCTACT GTTCGAAACTCACTGACGATGGTTTGGCGCATTTGAAACCCTTAACGGCTTTGCAGTGTTTAAATCTAAGCAACTGTAGG AATCTCACCGATGCCGGATTAGTGCATTTGAAACTCTTAACGGGTTTGCAGCATCTCAATCTAAGCGATTATAAGAATCT CACTGATGATGGATTAATCCATTTGATGCCCTTAATGGCTTTGCGGCATCTAGAGCTGTTAGGGTGTGAGAATCTTACTG ATGCAGGATTAGTGCATTTGACACCCTTAACGGCTTTGCAGCATCTAAATCTAAGCCATTGTGATGATCTCACGGATGCT GGATTAGCCCATTTAACATCCTTAACGGGTTTGCAGCATCTAGAGCTGTTAGGGTGTGAGAATCTTACTGATGCAGGATT AGCACGCTTTAAAACTGTAGCAAATTCACTCTATCTAATAATAAAAAGGTTCTTTGTTTTAAGAGAATCAAGAATAAAAT TTCATTAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AGTTGATCAATTTCCATTGAGACGCTTATTTAATAGAGATATCCGCTATAAGATGTATTATAGGATGGAAATTAAGCTTA TAAACCAATTTTAGTGGCGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 695; Mature: 695
Protein sequence:
>695_residues MNISNTGFNSSYLVNTTNPSYYPLQDINDQLENENTPLDNPLPNLEETSASTIQPSALSPSSEEVQLSFQEGTSLTISYS QLALLREKSRYFNNLWSGQFQETLQHPLALTQKEFTHLLNCVMDANFKVPLEEITSTIHLADYYELTEVIKHLEAQLISG YRSQRFEPFNSTEESLVGLKELLNFAHRYQLNRLKNYLEFTVVSALLNQTSQLAEFERIINHFSKKIEGLNFSNNRYLTD AHLLILKNCKNLKVLHLEKCRALTDDGLAHLTPLTALQYLNLSASYNLTDAGLVHLAPLTALQKLNLGRYNQLTDAGLAH LKPLTALQRLDLSFCEDLTDDGLAHLRPLTALQRLDLRYCEKLTDDGLVHLRPLTALQRLNLSNCWHTGAGLSHLSPLTG LQHLNLYECINLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLVHLKFLTGLQHLN LSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLAHLTPLTGLQHLDLSYCSKLTDDGLAHLKPLTALQCLNLSNCR NLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSDYKNLTDDGLIHLMPLMALRHLELLGCENLTDAGLVHLTPLTALQHLNLSHCDDLTDA GLAHLTSLTGLQHLELLGCENLTDAGLARFKTVANSLYLIIKRFFVLRESRIKFH
Sequences:
>Translated_695_residues MNISNTGFNSSYLVNTTNPSYYPLQDINDQLENENTPLDNPLPNLEETSASTIQPSALSPSSEEVQLSFQEGTSLTISYS QLALLREKSRYFNNLWSGQFQETLQHPLALTQKEFTHLLNCVMDANFKVPLEEITSTIHLADYYELTEVIKHLEAQLISG YRSQRFEPFNSTEESLVGLKELLNFAHRYQLNRLKNYLEFTVVSALLNQTSQLAEFERIINHFSKKIEGLNFSNNRYLTD AHLLILKNCKNLKVLHLEKCRALTDDGLAHLTPLTALQYLNLSASYNLTDAGLVHLAPLTALQKLNLGRYNQLTDAGLAH LKPLTALQRLDLSFCEDLTDDGLAHLRPLTALQRLDLRYCEKLTDDGLVHLRPLTALQRLNLSNCWHTGAGLSHLSPLTG LQHLNLYECINLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLVHLKFLTGLQHLN LSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLAHLTPLTGLQHLDLSYCSKLTDDGLAHLKPLTALQCLNLSNCR NLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSDYKNLTDDGLIHLMPLMALRHLELLGCENLTDAGLVHLTPLTALQHLNLSHCDDLTDA GLAHLTSLTGLQHLELLGCENLTDAGLARFKTVANSLYLIIKRFFVLRESRIKFH >Mature_695_residues MNISNTGFNSSYLVNTTNPSYYPLQDINDQLENENTPLDNPLPNLEETSASTIQPSALSPSSEEVQLSFQEGTSLTISYS QLALLREKSRYFNNLWSGQFQETLQHPLALTQKEFTHLLNCVMDANFKVPLEEITSTIHLADYYELTEVIKHLEAQLISG YRSQRFEPFNSTEESLVGLKELLNFAHRYQLNRLKNYLEFTVVSALLNQTSQLAEFERIINHFSKKIEGLNFSNNRYLTD AHLLILKNCKNLKVLHLEKCRALTDDGLAHLTPLTALQYLNLSASYNLTDAGLVHLAPLTALQKLNLGRYNQLTDAGLAH LKPLTALQRLDLSFCEDLTDDGLAHLRPLTALQRLDLRYCEKLTDDGLVHLRPLTALQRLNLSNCWHTGAGLSHLSPLTG LQHLNLYECINLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLVHLKFLTGLQHLN LSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLAHLTPLTGLQHLDLSYCSKLTDDGLAHLKPLTALQCLNLSNCR NLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSDYKNLTDDGLIHLMPLMALRHLELLGCENLTDAGLVHLTPLTALQHLNLSHCDDLTDA GLAHLTSLTGLQHLELLGCENLTDAGLARFKTVANSLYLIIKRFFVLRESRIKFH
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI22748931, Length=355, Percent_Identity=33.8028169014084, Blast_Score=152, Evalue=1e-36, Organism=Homo sapiens, GI284447308, Length=331, Percent_Identity=33.2326283987915, Blast_Score=119, Evalue=1e-26, Organism=Homo sapiens, GI27734755, Length=358, Percent_Identity=31.8435754189944, Blast_Score=113, Evalue=7e-25, Organism=Homo sapiens, GI296531375, Length=304, Percent_Identity=32.2368421052632, Blast_Score=105, Evalue=1e-22, Organism=Homo sapiens, GI161333852, Length=437, Percent_Identity=28.3752860411899, Blast_Score=105, Evalue=2e-22, Organism=Homo sapiens, GI6912466, Length=262, Percent_Identity=32.824427480916, Blast_Score=103, Evalue=5e-22, Organism=Homo sapiens, GI161333854, Length=351, Percent_Identity=28.2051282051282, Blast_Score=99, Evalue=2e-20, Organism=Homo sapiens, GI284447314, Length=257, Percent_Identity=33.852140077821, Blast_Score=96, Evalue=1e-19, Organism=Homo sapiens, GI289666746, Length=261, Percent_Identity=35.632183908046, Blast_Score=84, Evalue=3e-16, Organism=Caenorhabditis elegans, GI25151694, Length=334, Percent_Identity=29.940119760479, Blast_Score=100, Evalue=2e-21, Organism=Caenorhabditis elegans, GI25151696, Length=334, Percent_Identity=29.940119760479, Blast_Score=100, Evalue=3e-21, Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6322549, Length=359, Percent_Identity=27.0194986072423, Blast_Score=77, Evalue=1e-14, Organism=Drosophila melanogaster, GI17647819, Length=325, Percent_Identity=34.4615384615385, Blast_Score=140, Evalue=4e-33, Organism=Drosophila melanogaster, GI24662818, Length=264, Percent_Identity=35.2272727272727, Blast_Score=89, Evalue=1e-17, Organism=Drosophila melanogaster, GI21357913, Length=271, Percent_Identity=30.2583025830258, Blast_Score=86, Evalue=8e-17, Organism=Drosophila melanogaster, GI161076545, Length=288, Percent_Identity=30.9027777777778, Blast_Score=86, Evalue=1e-16, Organism=Drosophila melanogaster, GI24652783, Length=288, Percent_Identity=30.9027777777778, Blast_Score=85, Evalue=2e-16, Organism=Drosophila melanogaster, GI161076547, Length=288, Percent_Identity=30.9027777777778, Blast_Score=85, Evalue=2e-16, Organism=Drosophila melanogaster, GI161076549, Length=288, Percent_Identity=30.9027777777778, Blast_Score=84, Evalue=3e-16, Organism=Drosophila melanogaster, GI24646754, Length=304, Percent_Identity=29.6052631578947, Blast_Score=81, Evalue=2e-15, Organism=Drosophila melanogaster, GI19921840, Length=466, Percent_Identity=27.8969957081545, Blast_Score=75, Evalue=2e-13,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 77656; Mature: 77656
Theoretical pI: Translated: 6.34; Mature: 6.34
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.4 %Cys (Translated Protein) 0.6 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 2.4 %Cys (Mature Protein) 0.6 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNISNTGFNSSYLVNTTNPSYYPLQDINDQLENENTPLDNPLPNLEETSASTIQPSALSP CCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC SSEEVQLSFQEGTSLTISYSQLALLREKSRYFNNLWSGQFQETLQHPLALTQKEFTHLLN CCCCEEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CVMDANFKVPLEEITSTIHLADYYELTEVIKHLEAQLISGYRSQRFEPFNSTEESLVGLK HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH ELLNFAHRYQLNRLKNYLEFTVVSALLNQTSQLAEFERIINHFSKKIEGLNFSNNRYLTD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEH AHLLILKNCKNLKVLHLEKCRALTDDGLAHLTPLTALQYLNLSASYNLTDAGLVHLAPLT HHHHEECCCCCCEEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH ALQKLNLGRYNQLTDAGLAHLKPLTALQRLDLSFCEDLTDDGLAHLRPLTALQRLDLRYC HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKLTDDGLVHLRPLTALQRLNLSNCWHTGAGLSHLSPLTGLQHLNLYECINLTDAGLVHL HHCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHH KLLTGLQHLNLSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLVHLKFLTGLQHLN HHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC LSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLAHLTPLTGLQHLDLSYCSKLTDD HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHCCCC GLAHLKPLTALQCLNLSNCRNLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSDYKNLTDDGLIHLMPLMA CHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHH LRHLELLGCENLTDAGLVHLTPLTALQHLNLSHCDDLTDAGLAHLTSLTGLQHLELLGCE HHHHHHHCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NLTDAGLARFKTVANSLYLIIKRFFVLRESRIKFH CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MNISNTGFNSSYLVNTTNPSYYPLQDINDQLENENTPLDNPLPNLEETSASTIQPSALSP CCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC SSEEVQLSFQEGTSLTISYSQLALLREKSRYFNNLWSGQFQETLQHPLALTQKEFTHLLN CCCCEEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CVMDANFKVPLEEITSTIHLADYYELTEVIKHLEAQLISGYRSQRFEPFNSTEESLVGLK HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH ELLNFAHRYQLNRLKNYLEFTVVSALLNQTSQLAEFERIINHFSKKIEGLNFSNNRYLTD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEH AHLLILKNCKNLKVLHLEKCRALTDDGLAHLTPLTALQYLNLSASYNLTDAGLVHLAPLT HHHHEECCCCCCEEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH ALQKLNLGRYNQLTDAGLAHLKPLTALQRLDLSFCEDLTDDGLAHLRPLTALQRLDLRYC HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKLTDDGLVHLRPLTALQRLNLSNCWHTGAGLSHLSPLTGLQHLNLYECINLTDAGLVHL HHCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHH KLLTGLQHLNLSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLVHLKFLTGLQHLN HHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC LSYCDELTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSNCNNLTDAGLAHLTPLTGLQHLDLSYCSKLTDD HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHCCCC GLAHLKPLTALQCLNLSNCRNLTDAGLVHLKLLTGLQHLNLSDYKNLTDDGLIHLMPLMA CHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHH LRHLELLGCENLTDAGLVHLTPLTALQHLNLSHCDDLTDAGLAHLTSLTGLQHLELLGCE HHHHHHHCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NLTDAGLARFKTVANSLYLIIKRFFVLRESRIKFH CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA