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The map label for this gene is 46446643

Identifier: 46446643

GI number: 46446643

Start: 1200784

End: 1203594

Strand: Reverse

Name: 46446643

Synonym: pc1009

Alternate gene names: NA

Gene position: 1203594-1200784 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46446644

Following gene: 46446642

Centisome position: 49.85

GC content: 30.91

Gene sequence:

>2811_bases
ATGAATTCTGCTGACTTCTATAATCCTTCTTTAGTCGCCAGCACATCTTCCCCAATTGAAGGAATTCAAAAATCTTCAAA
ACAAATAAAGAAATCAACTGAAAAAACTATTGAGGAGGCTACCAGTAAATTAATGCCGCAGCCCACAGAAGAGGGAACGA
AATTAACGCCTCTTGTAAAGCAATCGACTAAATTTTCTAAAGGAAGATTTTTATGTTCTTATAGTAAAAAACCTGATTTA
AGAGCTTCAAGTATAGAAAAAAACACTTTACAAAGTAGAATTCGAATTGAATTAAATAAAAAAATCGAAAAAAAATTTAA
TAAAAAAACTGTAAAATCCTGGATAAATGCATACCCTCAGAGTACGTCGGAAATGATAGTTAAATTACCCCATGAAGGTT
TGAGTGAATCAATTAGCATTCGACATAAGGATATTCTATGCGAGCAAAGTCAAGCATATCAAGAAATAAAAGTACAGCTA
GATGAAAAAAAAATGCAATTGAATATTTTGCATCAGCGCTTAAATAATATTAATAAAAAATCTTATAATGATAAGTTAAA
AGAATTAGAAGGATTAAAACGACTAAATTTAGATATAGAAGCTATTAATAAATTTTTACCAATATTTGAACAGTTTGCAG
AAAGATGCCAAAAAATTGACTTGGAAAAATTAACATCTGAAGAAATCGACTTACTAAAAAAAGAACATGGGGAATTGAAA
GAAGCTTATAAGAAATTTGAAAAAATAGTACAAGGTATTATACAAAAAGTAAACAAGTGTTTACCAAAAGGAAACAAATT
TCAATTTAAAAATAAACATTTAATAAAAAATATGGGGGCCGTGTTAGACAGCATTGACAATATCCTTTTTGTAAGGGAAG
CAAATAAATTAAATGAATTTATAGATAATTTCAAAGAAAGTAAAAAATCAATCGAACAAGATTTATTACCTTATACTCAT
CAATTGAATCAAGTCAAAAAGGAAGTTGATGAAACTTGTCCTTCCTACATAAAATCGTTTCTGGAAATTAAAAAGGGAAA
TTCAAAGCAATATAGTGAGTTTATTGACGCGATTCAATTAACTTTCGAACTGCACAATGATCCTGTTGATCCTGTCGTTC
ATATGGAAGTTTGGCAAACGCTATTGGAGGTTTTTAATTTTATTCAAACGCATGAACTATTTAAATTAACAGGAGAAATC
AAAGAGGAGCTATGTAGAAAAAAGGATGAGGAGATTATTACTGATCGAGATTACGGCCCTTTAGATACCTACATTGAGAG
TTATTTAAAACCCCTTTTGGCATTGCCAGCAGGATTAACGGCAAAAGTGCCAGCACCCGTATTTGAGGAAAAATTTAAAA
CTTTACTCGCATTACTTCCCGATTCTAATAATACAATGACCGTTCAACAGGCTAAAACAAAACTTACTTTATTTAATCAA
GCCAAAGAAGATTTAGATAACTCTTTTAAAGTTTATCGAAACCTTTTAAATGAAAACATAGCTCAAACTAAAAAAGGACT
GAATCAAGAAACAAGAATTAAAAAAGAAATTGATGAATTATCACATCAGCTAAAAGAATTAAAAGAAAAAAAAACTGTTA
TTTTGGATAACTTTTTTAGCGAAATTATAAAAAATGAAGATGAAAAAATTTCAGACTTATTACAAAAGGGTATTCAGCAA
ACTCAAGATTTTGTAGATATTTTTTTAGGCCATTATCTTGTTCATTCCCAAGAACGCTTTCCTAAACTTTTAGAAAACCA
TCGAGACTTTGCTCTTAGAGTCTTTGACATGTTCGAGCTATTAAAAGATCATTTATCTGAGGAGCAATTAGATAAAATCA
AATTAGTTTTAAATGAATTTTTAACGCATCATATTACAAATCAAACAAGTGAGATTGAAGAAAGTTTAGAAACATCACTT
AATCAGAGTAAAAAAAGTTTGGAAAAGGTTACTAAACCTGCCAAACCTTTATATAGAAAAGTTCAAGCTGCACATGAATC
TGGTGATGCCTTTTCAATAGAATGCCAACGCATTAGTAAACAAGTCGAAGTACTTTTACCTTGGTTATTTGGAAAAGGAT
TTGTTGCTTCACCTCAAGCCGCGCATTTAGTCCCTTTTCCTGGAGTAGTCTCTTGGGATGCTAATTATCTGTCTACATTT
TTTAATGACAAGCTTGGACTAGAGTTAAGCCAAGAAAAAACGGATCGATTAGACTTGTTTAATCAAAATGTGGAACCTTT
TTTAAGTACCGTCCAAGTAAATGGAAAAATTCCTCAGGAATTGGTCAAAGAAGAACTACAAGCTAGGTTTAAGGTTATTG
AAGAGCAATATAAGACCTTTCATTCCATTTTTAATGCTTTGATTTTTTTAAGTCATCTATCTTCTTTAGAAATGTCAGAA
ACTAGGCATTTACCAGAGTTTTTTAATCAGACAATGGATAAATTTTCGGAAACTGCTATAAATAATGAGAAAGGTGGTGC
TAGAGGGTATAAGGTTTTATTAGGAGAGGCTCTCATTGACCTTATTGTTTCCCCAGATGAAACGCTATTCAATTTAAAAA
CGGGTTTGAGTGATAAACATGTAGAGTATTTACAAGCCACTATTAACACTGTTTCTGATCGACTAGAGCAATTGGCTTTC
AAAAAAACGCAAAGTGGAAAATTAGCACCACTAGAGCTTGTAGAGTGCCATGCCCTGCAGAGTATTTATTTAGGAGTGAA
AAATTTATGCGATCAAAAAGAATTGCCCACTGATATTCTACAAAATGAAGAACAAATTATTGAAAAAACTAAAGTTATTC
TAAGTAATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAATTATTTAATTAATAAATTAAGTGATAATATTGTATAATTAATTATATAATTAAATTTATATAATCATTTTAATAAT
ATTATTAGTAAGGAGTAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTCAACAGGCGGGCCTACCCGCCTATTTTAATGTTTGTTTTGCATTCTTTTTTTCACCTCATGAAAAAAAGAATTCTAT
TTGAATTTTAGATGTAACCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 936; Mature: 936

Protein sequence:

>936_residues
MNSADFYNPSLVASTSSPIEGIQKSSKQIKKSTEKTIEEATSKLMPQPTEEGTKLTPLVKQSTKFSKGRFLCSYSKKPDL
RASSIEKNTLQSRIRIELNKKIEKKFNKKTVKSWINAYPQSTSEMIVKLPHEGLSESISIRHKDILCEQSQAYQEIKVQL
DEKKMQLNILHQRLNNINKKSYNDKLKELEGLKRLNLDIEAINKFLPIFEQFAERCQKIDLEKLTSEEIDLLKKEHGELK
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QLNQVKKEVDETCPSYIKSFLEIKKGNSKQYSEFIDAIQLTFELHNDPVDPVVHMEVWQTLLEVFNFIQTHELFKLTGEI
KEELCRKKDEEIITDRDYGPLDTYIESYLKPLLALPAGLTAKVPAPVFEEKFKTLLALLPDSNNTMTVQQAKTKLTLFNQ
AKEDLDNSFKVYRNLLNENIAQTKKGLNQETRIKKEIDELSHQLKELKEKKTVILDNFFSEIIKNEDEKISDLLQKGIQQ
TQDFVDIFLGHYLVHSQERFPKLLENHRDFALRVFDMFELLKDHLSEEQLDKIKLVLNEFLTHHITNQTSEIEESLETSL
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TRHLPEFFNQTMDKFSETAINNEKGGARGYKVLLGEALIDLIVSPDETLFNLKTGLSDKHVEYLQATINTVSDRLEQLAF
KKTQSGKLAPLELVECHALQSIYLGVKNLCDQKELPTDILQNEEQIIEKTKVILSN

Sequences:

>Translated_936_residues
MNSADFYNPSLVASTSSPIEGIQKSSKQIKKSTEKTIEEATSKLMPQPTEEGTKLTPLVKQSTKFSKGRFLCSYSKKPDL
RASSIEKNTLQSRIRIELNKKIEKKFNKKTVKSWINAYPQSTSEMIVKLPHEGLSESISIRHKDILCEQSQAYQEIKVQL
DEKKMQLNILHQRLNNINKKSYNDKLKELEGLKRLNLDIEAINKFLPIFEQFAERCQKIDLEKLTSEEIDLLKKEHGELK
EAYKKFEKIVQGIIQKVNKCLPKGNKFQFKNKHLIKNMGAVLDSIDNILFVREANKLNEFIDNFKESKKSIEQDLLPYTH
QLNQVKKEVDETCPSYIKSFLEIKKGNSKQYSEFIDAIQLTFELHNDPVDPVVHMEVWQTLLEVFNFIQTHELFKLTGEI
KEELCRKKDEEIITDRDYGPLDTYIESYLKPLLALPAGLTAKVPAPVFEEKFKTLLALLPDSNNTMTVQQAKTKLTLFNQ
AKEDLDNSFKVYRNLLNENIAQTKKGLNQETRIKKEIDELSHQLKELKEKKTVILDNFFSEIIKNEDEKISDLLQKGIQQ
TQDFVDIFLGHYLVHSQERFPKLLENHRDFALRVFDMFELLKDHLSEEQLDKIKLVLNEFLTHHITNQTSEIEESLETSL
NQSKKSLEKVTKPAKPLYRKVQAAHESGDAFSIECQRISKQVEVLLPWLFGKGFVASPQAAHLVPFPGVVSWDANYLSTF
FNDKLGLELSQEKTDRLDLFNQNVEPFLSTVQVNGKIPQELVKEELQARFKVIEEQYKTFHSIFNALIFLSHLSSLEMSE
TRHLPEFFNQTMDKFSETAINNEKGGARGYKVLLGEALIDLIVSPDETLFNLKTGLSDKHVEYLQATINTVSDRLEQLAF
KKTQSGKLAPLELVECHALQSIYLGVKNLCDQKELPTDILQNEEQIIEKTKVILSN
>Mature_936_residues
MNSADFYNPSLVASTSSPIEGIQKSSKQIKKSTEKTIEEATSKLMPQPTEEGTKLTPLVKQSTKFSKGRFLCSYSKKPDL
RASSIEKNTLQSRIRIELNKKIEKKFNKKTVKSWINAYPQSTSEMIVKLPHEGLSESISIRHKDILCEQSQAYQEIKVQL
DEKKMQLNILHQRLNNINKKSYNDKLKELEGLKRLNLDIEAINKFLPIFEQFAERCQKIDLEKLTSEEIDLLKKEHGELK
EAYKKFEKIVQGIIQKVNKCLPKGNKFQFKNKHLIKNMGAVLDSIDNILFVREANKLNEFIDNFKESKKSIEQDLLPYTH
QLNQVKKEVDETCPSYIKSFLEIKKGNSKQYSEFIDAIQLTFELHNDPVDPVVHMEVWQTLLEVFNFIQTHELFKLTGEI
KEELCRKKDEEIITDRDYGPLDTYIESYLKPLLALPAGLTAKVPAPVFEEKFKTLLALLPDSNNTMTVQQAKTKLTLFNQ
AKEDLDNSFKVYRNLLNENIAQTKKGLNQETRIKKEIDELSHQLKELKEKKTVILDNFFSEIIKNEDEKISDLLQKGIQQ
TQDFVDIFLGHYLVHSQERFPKLLENHRDFALRVFDMFELLKDHLSEEQLDKIKLVLNEFLTHHITNQTSEIEESLETSL
NQSKKSLEKVTKPAKPLYRKVQAAHESGDAFSIECQRISKQVEVLLPWLFGKGFVASPQAAHLVPFPGVVSWDANYLSTF
FNDKLGLELSQEKTDRLDLFNQNVEPFLSTVQVNGKIPQELVKEELQARFKVIEEQYKTFHSIFNALIFLSHLSSLEMSE
TRHLPEFFNQTMDKFSETAINNEKGGARGYKVLLGEALIDLIVSPDETLFNLKTGLSDKHVEYLQATINTVSDRLEQLAF
KKTQSGKLAPLELVECHALQSIYLGVKNLCDQKELPTDILQNEEQIIEKTKVILSN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 107966; Mature: 107966

Theoretical pI: Translated: 6.86; Mature: 6.86

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNSADFYNPSLVASTSSPIEGIQKSSKQIKKSTEKTIEEATSKLMPQPTEEGTKLTPLVK
CCCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHH
QSTKFSKGRFLCSYSKKPDLRASSIEKNTLQSRIRIELNKKIEKKFNKKTVKSWINAYPQ
HHCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
STSEMIVKLPHEGLSESISIRHKDILCEQSQAYQEIKVQLDEKKMQLNILHQRLNNINKK
CHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
SYNDKLKELEGLKRLNLDIEAINKFLPIFEQFAERCQKIDLEKLTSEEIDLLKKEHGELK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EAYKKFEKIVQGIIQKVNKCLPKGNKFQFKNKHLIKNMGAVLDSIDNILFVREANKLNEF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHH
IDNFKESKKSIEQDLLPYTHQLNQVKKEVDETCPSYIKSFLEIKKGNSKQYSEFIDAIQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
TFELHNDPVDPVVHMEVWQTLLEVFNFIQTHELFKLTGEIKEELCRKKDEEIITDRDYGP
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCC
LDTYIESYLKPLLALPAGLTAKVPAPVFEEKFKTLLALLPDSNNTMTVQQAKTKLTLFNQ
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH
AKEDLDNSFKVYRNLLNENIAQTKKGLNQETRIKKEIDELSHQLKELKEKKTVILDNFFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EIIKNEDEKISDLLQKGIQQTQDFVDIFLGHYLVHSQERFPKLLENHRDFALRVFDMFEL
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
LKDHLSEEQLDKIKLVLNEFLTHHITNQTSEIEESLETSLNQSKKSLEKVTKPAKPLYRK
HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
VQAAHESGDAFSIECQRISKQVEVLLPWLFGKGFVASPQAAHLVPFPGVVSWDANYLSTF
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FNDKLGLELSQEKTDRLDLFNQNVEPFLSTVQVNGKIPQELVKEELQARFKVIEEQYKTF
HCCCCCCEECHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HSIFNALIFLSHLSSLEMSETRHLPEFFNQTMDKFSETAINNEKGGARGYKVLLGEALID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LIVSPDETLFNLKTGLSDKHVEYLQATINTVSDRLEQLAFKKTQSGKLAPLELVECHALQ
HHCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
SIYLGVKNLCDQKELPTDILQNEEQIIEKTKVILSN
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNSADFYNPSLVASTSSPIEGIQKSSKQIKKSTEKTIEEATSKLMPQPTEEGTKLTPLVK
CCCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHH
QSTKFSKGRFLCSYSKKPDLRASSIEKNTLQSRIRIELNKKIEKKFNKKTVKSWINAYPQ
HHCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
STSEMIVKLPHEGLSESISIRHKDILCEQSQAYQEIKVQLDEKKMQLNILHQRLNNINKK
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TFELHNDPVDPVVHMEVWQTLLEVFNFIQTHELFKLTGEIKEELCRKKDEEIITDRDYGP
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HCCCCCCEECHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HSIFNALIFLSHLSSLEMSETRHLPEFFNQTMDKFSETAINNEKGGARGYKVLLGEALID
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LIVSPDETLFNLKTGLSDKHVEYLQATINTVSDRLEQLAFKKTQSGKLAPLELVECHALQ
HHCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
SIYLGVKNLCDQKELPTDILQNEEQIIEKTKVILSN
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA