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The map label for this gene is 46446530

Identifier: 46446530

GI number: 46446530

Start: 1085168

End: 1086589

Strand: Reverse

Name: 46446530

Synonym: pc0896

Alternate gene names: NA

Gene position: 1086589-1085168 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46446532

Following gene: 46446529

Centisome position: 45.0

GC content: 35.86

Gene sequence:

>1422_bases
ATGTTTAATACCTCCTCCTCTACTCCGAAGACACTTAAGCAATTTTGGATCCTTTTAACAAATCGCTGGGCATTTGGATG
CTTTGCCCTCCTCACTTTTCAACAACTTATCGAAGCTTCATCAACAATTTGGCTAGTAATAATTGTTAAAAAAATTACAG
CGGGAGAAGCTTTTTTTTCTTATTTATTTATCTATCTTACTTCCTTAGTATTTCCCTATATTCCCGGTTGTATGGCGAGC
ATTATAAAAATTTCTTGGCGCCAGGAAGCTCAACGCTCTTTCATCAATGCATTTGTCTCGTCTAATCGCAATCAAATTGG
TGAATGGAATAATAAAGGAATAAGAGAAGAAAAACTTTCTATTCTAACTGCAGAAGCTCCCAACGCTTTACAAACTCTAA
TCGATTATGTTTATGATTTGTATGCCTATGTGATTAGTGTGTTTTTTAACATCTTTGCTCTGTCAATTGTCGTCGAGCCT
TTGTTTGGACTAGCGTATGCTATTAGTGTTTTAACAGTTTTGGTTGTGATGAAAGCTAAACGACGCTTGCAAAGGCGTTT
AACGAAAAAAGCTTTAACAGCCCGGATAGATCTTTATCAATCTTTATTGGCTGCGTGGGATAATGTATTATTAGGCAACC
GGTATAATTTTAAATTGTGGGAAGATAGAACGACCCAACGTTTAAATCGATGTTTGCAAAAGAACGTAGATTTAGAGCGA
TTTGATCAAGTTTTAGCAATTGTTATCTCTTTACTGACCTGCATTCCTTCACTTATCGTTGTTGTTTACCATGTTTACAC
AAATCGTCATAGCGTAGCTAATTTAACAGCATTTTTAGTCACTCTCCCTATCCTTTTTAATATCTTATCTTATACTTATC
AAACCCTTAGCTTAATTTTCCGCTGGACAATGCATCGGAGTAAGCTACTATCAATTTATAAAACCATTCAACCCGCTACT
GATGCTCAACAAATGATGGAGAAAAAAATCAAATGGTCAAAAATTCAATTAGATGCTTCTAATTTACCTAAAACTGACCA
TGTGTCTTTATCAGTCCCTCCAACCTTAAGTTCCCACTTAGATTTGTTAACTTTCACTCAACAATCTGGTCGAATTACAT
TAAGAGGTGAAAATGGAGCAGGAAAGTCAACAGTCCTTATGCTTGTAAAAAATGCACTTTGCGACCGAGCTTTTTTTCTC
CCGACACAAAACCAGCTAAGCTTCATTTCTGAGACAAATAAATATTCTACAGGCGAGTCTTTGCGAAGTAGACTCTTAGA
AATTATTGACAAGGTTGATGTAGATGTTCTTTTGCTTGACGAATGGGATGCTAATTTAGACAAAGACAATCGCGAAAGTT
TATCAGCGTTAATCGATGAACTTGCTGAAAAAAAATGTGTCATCGAAGTTTGTCATCGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGGCATAAATATATAAGTATTATTTTAATTTTTCTATATAATTTTTTTTGAAAGATTCTAAATAAAAACACATTTAAATA
GCGGCTTAGCAAAACATTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACTTTTTTTAGATGTTTTTAAACCTAAATTTTGTTTTTCCGCGAAATAAACTTTTTACAAAACTATATTTCCTTTATATG
TTAATTTCATTAATTGGTTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 473; Mature: 473

Protein sequence:

>473_residues
MFNTSSSTPKTLKQFWILLTNRWAFGCFALLTFQQLIEASSTIWLVIIVKKITAGEAFFSYLFIYLTSLVFPYIPGCMAS
IIKISWRQEAQRSFINAFVSSNRNQIGEWNNKGIREEKLSILTAEAPNALQTLIDYVYDLYAYVISVFFNIFALSIVVEP
LFGLAYAISVLTVLVVMKAKRRLQRRLTKKALTARIDLYQSLLAAWDNVLLGNRYNFKLWEDRTTQRLNRCLQKNVDLER
FDQVLAIVISLLTCIPSLIVVVYHVYTNRHSVANLTAFLVTLPILFNILSYTYQTLSLIFRWTMHRSKLLSIYKTIQPAT
DAQQMMEKKIKWSKIQLDASNLPKTDHVSLSVPPTLSSHLDLLTFTQQSGRITLRGENGAGKSTVLMLVKNALCDRAFFL
PTQNQLSFISETNKYSTGESLRSRLLEIIDKVDVDVLLLDEWDANLDKDNRESLSALIDELAEKKCVIEVCHR

Sequences:

>Translated_473_residues
MFNTSSSTPKTLKQFWILLTNRWAFGCFALLTFQQLIEASSTIWLVIIVKKITAGEAFFSYLFIYLTSLVFPYIPGCMAS
IIKISWRQEAQRSFINAFVSSNRNQIGEWNNKGIREEKLSILTAEAPNALQTLIDYVYDLYAYVISVFFNIFALSIVVEP
LFGLAYAISVLTVLVVMKAKRRLQRRLTKKALTARIDLYQSLLAAWDNVLLGNRYNFKLWEDRTTQRLNRCLQKNVDLER
FDQVLAIVISLLTCIPSLIVVVYHVYTNRHSVANLTAFLVTLPILFNILSYTYQTLSLIFRWTMHRSKLLSIYKTIQPAT
DAQQMMEKKIKWSKIQLDASNLPKTDHVSLSVPPTLSSHLDLLTFTQQSGRITLRGENGAGKSTVLMLVKNALCDRAFFL
PTQNQLSFISETNKYSTGESLRSRLLEIIDKVDVDVLLLDEWDANLDKDNRESLSALIDELAEKKCVIEVCHR
>Mature_473_residues
MFNTSSSTPKTLKQFWILLTNRWAFGCFALLTFQQLIEASSTIWLVIIVKKITAGEAFFSYLFIYLTSLVFPYIPGCMAS
IIKISWRQEAQRSFINAFVSSNRNQIGEWNNKGIREEKLSILTAEAPNALQTLIDYVYDLYAYVISVFFNIFALSIVVEP
LFGLAYAISVLTVLVVMKAKRRLQRRLTKKALTARIDLYQSLLAAWDNVLLGNRYNFKLWEDRTTQRLNRCLQKNVDLER
FDQVLAIVISLLTCIPSLIVVVYHVYTNRHSVANLTAFLVTLPILFNILSYTYQTLSLIFRWTMHRSKLLSIYKTIQPAT
DAQQMMEKKIKWSKIQLDASNLPKTDHVSLSVPPTLSSHLDLLTFTQQSGRITLRGENGAGKSTVLMLVKNALCDRAFFL
PTQNQLSFISETNKYSTGESLRSRLLEIIDKVDVDVLLLDEWDANLDKDNRESLSALIDELAEKKCVIEVCHR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54190; Mature: 54190

Theoretical pI: Translated: 9.52; Mature: 9.52

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFNTSSSTPKTLKQFWILLTNRWAFGCFALLTFQQLIEASSTIWLVIIVKKITAGEAFFS
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHH
YLFIYLTSLVFPYIPGCMASIIKISWRQEAQRSFINAFVSSNRNQIGEWNNKGIREEKLS
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHH
ILTAEAPNALQTLIDYVYDLYAYVISVFFNIFALSIVVEPLFGLAYAISVLTVLVVMKAK
HEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RRLQRRLTKKALTARIDLYQSLLAAWDNVLLGNRYNFKLWEDRTTQRLNRCLQKNVDLER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
FDQVLAIVISLLTCIPSLIVVVYHVYTNRHSVANLTAFLVTLPILFNILSYTYQTLSLIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RWTMHRSKLLSIYKTIQPATDAQQMMEKKIKWSKIQLDASNLPKTDHVSLSVPPTLSSHL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHEEECCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHH
DLLTFTQQSGRITLRGENGAGKSTVLMLVKNALCDRAFFLPTQNQLSFISETNKYSTGES
HHHEEECCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCHHHHHHHHCCCCCCHHH
LRSRLLEIIDKVDVDVLLLDEWDANLDKDNRESLSALIDELAEKKCVIEVCHR
HHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MFNTSSSTPKTLKQFWILLTNRWAFGCFALLTFQQLIEASSTIWLVIIVKKITAGEAFFS
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHH
YLFIYLTSLVFPYIPGCMASIIKISWRQEAQRSFINAFVSSNRNQIGEWNNKGIREEKLS
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHH
ILTAEAPNALQTLIDYVYDLYAYVISVFFNIFALSIVVEPLFGLAYAISVLTVLVVMKAK
HEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RRLQRRLTKKALTARIDLYQSLLAAWDNVLLGNRYNFKLWEDRTTQRLNRCLQKNVDLER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
FDQVLAIVISLLTCIPSLIVVVYHVYTNRHSVANLTAFLVTLPILFNILSYTYQTLSLIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RWTMHRSKLLSIYKTIQPATDAQQMMEKKIKWSKIQLDASNLPKTDHVSLSVPPTLSSHL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHEEECCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHH
DLLTFTQQSGRITLRGENGAGKSTVLMLVKNALCDRAFFLPTQNQLSFISETNKYSTGES
HHHEEECCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCHHHHHHHHCCCCCCHHH
LRSRLLEIIDKVDVDVLLLDEWDANLDKDNRESLSALIDELAEKKCVIEVCHR
HHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA