| Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005861 |
| Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is 46445807
Identifier: 46445807
GI number: 46445807
Start: 257123
End: 260713
Strand: Direct
Name: 46445807
Synonym: pc0173
Alternate gene names: NA
Gene position: 257123-260713 (Clockwise)
Preceding gene: 46445806
Following gene: 46445808
Centisome position: 10.65
GC content: 31.83
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TTAAAGAATGTAAATATGAAAAATTAATATTTTTATATTTTGATTAATAAATTAATTATAAATTAAAATATTATTTTTAT TAATATTTTAAGGATGTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTCAAATTTTGATCATCGTGCAAAAGTAGGCAATTAGAGAGAAATGCTTACTTTTGAATTTGAAAATGCCTTAAATTTAT TGTCTAATAAATAATTTTTT
Product: putative O-linked N-acetylglucosamine transferase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1196; Mature: 1195
Protein sequence:
>1196_residues MPAEFINNLSQLLKFTFEPIETAVIPPKKTHEGHTYVKIGEIKTNSSTWVRVAYAIKGIAAMAFACLLLPLLFPSFRFYL SHSWSQFWNSSKNTNIYLKDTSRSSQVSGLNGVSQVTSLYPPFLGTNILAQEAKKLEKQGRYFEAGLFYQKCLEIDPKNA PLRVEYAEVLKKQGEEHTKELRKLYEEGIKLAPNSKTLLFNHAKFDVEDKEAERDYKKALEKNPDNVDLRITYAKLLIKR YKNSKSTLLDDGERIRDEVLDIYKTGLQRQPHHPLLLLKYAKFLIMHLNQTQEAVDWYQNAQVDSSNIDFHTSYANILPR YLQEMAQEIYQRCLDQQPNNVHLLLRYAEFLQNQFWHANNDKIIFYGERALAISPDSVEVYFRYGNLLSVIDPAKAQVIY QTGLDLQPDNLKLLGKSFHDETENALNESIHRYQKGLAINPKNTELRIAAYSHLACRTSQQKILHFLEEGLDLQPCDQIL LEEYKFACDQLHQPEKAIERYQRAFEIDSDNHYFLTEIIQNSDENQQVKLIEKAIKRQPDNPQNLITYGYLLYAKIQQAD VIDEKLINLCLSQFRKAAKLAPTNGCLRTKYAQALFYFEKTSEAVEQYKRMINLGIPLSRESRAKYIEALEELKLEKEIE IYYQTFLQNNPNFFLHEEYIEWLTCQDRMQDALNELEKTLNYHIQYDKYVYLLHHILINNGRIRREEVDETCENYLLGKI AEQPQNTILKWFLARFLEEKNQFNTAIEQCKEILKLHPHLSKIQAKYVDLLEKNENWDDLEAYAESLDQNHSQDTSTIFR IISILKYENEIERVIRLYEKVRPILSNAQLEDYEDCLLRGDNRTVAVEALHKFKCKKYPSVENFQSYGTFLYTSDKSDEE KANIYFRLLSASDECMQSGIKNLYIEILQKLNKQKDLQNFLERLCKKYPTIDSLEYYMDYLRDWANPDEHKLTQIQNILI ELYKIELDNSNMRANYLEHSGLRSRYFNLLSITGQEDKICNYFKKEDEYYQHAYLTQPQLIKSYGLMLNDWSKYLKEEEQ FFLIQKSADLLAQALEKADAQLYLDLKNIFPNQLLKLNKLDEIEAFYQKGLVLNPDSIPMRLDYAKYLKNRHNFEKSLDE FLLIIEKEKTSWTWYATNISTYYLEAAHILDQLNRLDEAASYYKKYEKLSRHQTDEKYQEFKRKQSNLLDCAVDLP
Sequences:
>Translated_1196_residues MPAEFINNLSQLLKFTFEPIETAVIPPKKTHEGHTYVKIGEIKTNSSTWVRVAYAIKGIAAMAFACLLLPLLFPSFRFYL SHSWSQFWNSSKNTNIYLKDTSRSSQVSGLNGVSQVTSLYPPFLGTNILAQEAKKLEKQGRYFEAGLFYQKCLEIDPKNA PLRVEYAEVLKKQGEEHTKELRKLYEEGIKLAPNSKTLLFNHAKFDVEDKEAERDYKKALEKNPDNVDLRITYAKLLIKR YKNSKSTLLDDGERIRDEVLDIYKTGLQRQPHHPLLLLKYAKFLIMHLNQTQEAVDWYQNAQVDSSNIDFHTSYANILPR YLQEMAQEIYQRCLDQQPNNVHLLLRYAEFLQNQFWHANNDKIIFYGERALAISPDSVEVYFRYGNLLSVIDPAKAQVIY QTGLDLQPDNLKLLGKSFHDETENALNESIHRYQKGLAINPKNTELRIAAYSHLACRTSQQKILHFLEEGLDLQPCDQIL LEEYKFACDQLHQPEKAIERYQRAFEIDSDNHYFLTEIIQNSDENQQVKLIEKAIKRQPDNPQNLITYGYLLYAKIQQAD VIDEKLINLCLSQFRKAAKLAPTNGCLRTKYAQALFYFEKTSEAVEQYKRMINLGIPLSRESRAKYIEALEELKLEKEIE IYYQTFLQNNPNFFLHEEYIEWLTCQDRMQDALNELEKTLNYHIQYDKYVYLLHHILINNGRIRREEVDETCENYLLGKI AEQPQNTILKWFLARFLEEKNQFNTAIEQCKEILKLHPHLSKIQAKYVDLLEKNENWDDLEAYAESLDQNHSQDTSTIFR IISILKYENEIERVIRLYEKVRPILSNAQLEDYEDCLLRGDNRTVAVEALHKFKCKKYPSVENFQSYGTFLYTSDKSDEE KANIYFRLLSASDECMQSGIKNLYIEILQKLNKQKDLQNFLERLCKKYPTIDSLEYYMDYLRDWANPDEHKLTQIQNILI ELYKIELDNSNMRANYLEHSGLRSRYFNLLSITGQEDKICNYFKKEDEYYQHAYLTQPQLIKSYGLMLNDWSKYLKEEEQ FFLIQKSADLLAQALEKADAQLYLDLKNIFPNQLLKLNKLDEIEAFYQKGLVLNPDSIPMRLDYAKYLKNRHNFEKSLDE FLLIIEKEKTSWTWYATNISTYYLEAAHILDQLNRLDEAASYYKKYEKLSRHQTDEKYQEFKRKQSNLLDCAVDLP >Mature_1195_residues PAEFINNLSQLLKFTFEPIETAVIPPKKTHEGHTYVKIGEIKTNSSTWVRVAYAIKGIAAMAFACLLLPLLFPSFRFYLS HSWSQFWNSSKNTNIYLKDTSRSSQVSGLNGVSQVTSLYPPFLGTNILAQEAKKLEKQGRYFEAGLFYQKCLEIDPKNAP LRVEYAEVLKKQGEEHTKELRKLYEEGIKLAPNSKTLLFNHAKFDVEDKEAERDYKKALEKNPDNVDLRITYAKLLIKRY KNSKSTLLDDGERIRDEVLDIYKTGLQRQPHHPLLLLKYAKFLIMHLNQTQEAVDWYQNAQVDSSNIDFHTSYANILPRY LQEMAQEIYQRCLDQQPNNVHLLLRYAEFLQNQFWHANNDKIIFYGERALAISPDSVEVYFRYGNLLSVIDPAKAQVIYQ TGLDLQPDNLKLLGKSFHDETENALNESIHRYQKGLAINPKNTELRIAAYSHLACRTSQQKILHFLEEGLDLQPCDQILL EEYKFACDQLHQPEKAIERYQRAFEIDSDNHYFLTEIIQNSDENQQVKLIEKAIKRQPDNPQNLITYGYLLYAKIQQADV IDEKLINLCLSQFRKAAKLAPTNGCLRTKYAQALFYFEKTSEAVEQYKRMINLGIPLSRESRAKYIEALEELKLEKEIEI YYQTFLQNNPNFFLHEEYIEWLTCQDRMQDALNELEKTLNYHIQYDKYVYLLHHILINNGRIRREEVDETCENYLLGKIA EQPQNTILKWFLARFLEEKNQFNTAIEQCKEILKLHPHLSKIQAKYVDLLEKNENWDDLEAYAESLDQNHSQDTSTIFRI ISILKYENEIERVIRLYEKVRPILSNAQLEDYEDCLLRGDNRTVAVEALHKFKCKKYPSVENFQSYGTFLYTSDKSDEEK ANIYFRLLSASDECMQSGIKNLYIEILQKLNKQKDLQNFLERLCKKYPTIDSLEYYMDYLRDWANPDEHKLTQIQNILIE LYKIELDNSNMRANYLEHSGLRSRYFNLLSITGQEDKICNYFKKEDEYYQHAYLTQPQLIKSYGLMLNDWSKYLKEEEQF FLIQKSADLLAQALEKADAQLYLDLKNIFPNQLLKLNKLDEIEAFYQKGLVLNPDSIPMRLDYAKYLKNRHNFEKSLDEF LLIIEKEKTSWTWYATNISTYYLEAAHILDQLNRLDEAASYYKKYEKLSRHQTDEKYQEFKRKQSNLLDCAVDLP
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 141106; Mature: 140975
Theoretical pI: Translated: 6.24; Mature: 6.24
Prosite motif: PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPAEFINNLSQLLKFTFEPIETAVIPPKKTHEGHTYVKIGEIKTNSSTWVRVAYAIKGIA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH AMAFACLLLPLLFPSFRFYLSHSWSQFWNSSKNTNIYLKDTSRSSQVSGLNGVSQVTSLY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHC PPFLGTNILAQEAKKLEKQGRYFEAGLFYQKCLEIDPKNAPLRVEYAEVLKKQGEEHTKE CCHHCHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHCCHHHHHH LRKLYEEGIKLAPNSKTLLFNHAKFDVEDKEAERDYKKALEKNPDNVDLRITYAKLLIKR HHHHHHCCCEECCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHH YKNSKSTLLDDGERIRDEVLDIYKTGLQRQPHHPLLLLKYAKFLIMHLNQTQEAVDWYQN HCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHC AQVDSSNIDFHTSYANILPRYLQEMAQEIYQRCLDQQPNNVHLLLRYAEFLQNQFWHANN CCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC DKIIFYGERALAISPDSVEVYFRYGNLLSVIDPAKAQVIYQTGLDLQPDNLKLLGKSFHD CEEEEEECEEEEECCCCEEEEEEECCCHHHCCCHHHEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH ETENALNESIHRYQKGLAINPKNTELRIAAYSHLACRTSQQKILHFLEEGLDLQPCDQIL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH LEEYKFACDQLHQPEKAIERYQRAFEIDSDNHYFLTEIIQNSDENQQVKLIEKAIKRQPD HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC NPQNLITYGYLLYAKIQQADVIDEKLINLCLSQFRKAAKLAPTNGCLRTKYAQALFYFEK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH TSEAVEQYKRMINLGIPLSRESRAKYIEALEELKLEKEIEIYYQTFLQNNPNFFLHEEYI HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHH EWLTCQDRMQDALNELEKTLNYHIQYDKYVYLLHHILINNGRIRREEVDETCENYLLGKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH AEQPQNTILKWFLARFLEEKNQFNTAIEQCKEILKLHPHLSKIQAKYVDLLEKNENWDDL HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH EAYAESLDQNHSQDTSTIFRIISILKYENEIERVIRLYEKVRPILSNAQLEDYEDCLLRG HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCC DNRTVAVEALHKFKCKKYPSVENFQSYGTFLYTSDKSDEEKANIYFRLLSASDECMQSGI CCCEEHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCEEEECCCCCCHHHHEEEEEECCCHHHHHHHH KNLYIEILQKLNKQKDLQNFLERLCKKYPTIDSLEYYMDYLRDWANPDEHKLTQIQNILI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH ELYKIELDNSNMRANYLEHSGLRSRYFNLLSITGQEDKICNYFKKEDEYYQHAYLTQPQL HHHHEEECCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH IKSYGLMLNDWSKYLKEEEQFFLIQKSADLLAQALEKADAQLYLDLKNIFPNQLLKLNKL HHHHCHHHHHHHHHHCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEHHHHCHHHHHHHCCH DEIEAFYQKGLVLNPDSIPMRLDYAKYLKNRHNFEKSLDEFLLIIEKEKTSWTWYATNIS HHHHHHHHCCCEECCCCCCEEECHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEEEECCH TYYLEAAHILDQLNRLDEAASYYKKYEKLSRHQTDEKYQEFKRKQSNLLDCAVDLP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHEECCCC >Mature Secondary Structure PAEFINNLSQLLKFTFEPIETAVIPPKKTHEGHTYVKIGEIKTNSSTWVRVAYAIKGIA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH AMAFACLLLPLLFPSFRFYLSHSWSQFWNSSKNTNIYLKDTSRSSQVSGLNGVSQVTSLY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHC PPFLGTNILAQEAKKLEKQGRYFEAGLFYQKCLEIDPKNAPLRVEYAEVLKKQGEEHTKE CCHHCHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHCCHHHHHH LRKLYEEGIKLAPNSKTLLFNHAKFDVEDKEAERDYKKALEKNPDNVDLRITYAKLLIKR HHHHHHCCCEECCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHH YKNSKSTLLDDGERIRDEVLDIYKTGLQRQPHHPLLLLKYAKFLIMHLNQTQEAVDWYQN HCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHC AQVDSSNIDFHTSYANILPRYLQEMAQEIYQRCLDQQPNNVHLLLRYAEFLQNQFWHANN CCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC DKIIFYGERALAISPDSVEVYFRYGNLLSVIDPAKAQVIYQTGLDLQPDNLKLLGKSFHD CEEEEEECEEEEECCCCEEEEEEECCCHHHCCCHHHEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH ETENALNESIHRYQKGLAINPKNTELRIAAYSHLACRTSQQKILHFLEEGLDLQPCDQIL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH LEEYKFACDQLHQPEKAIERYQRAFEIDSDNHYFLTEIIQNSDENQQVKLIEKAIKRQPD HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC NPQNLITYGYLLYAKIQQADVIDEKLINLCLSQFRKAAKLAPTNGCLRTKYAQALFYFEK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH TSEAVEQYKRMINLGIPLSRESRAKYIEALEELKLEKEIEIYYQTFLQNNPNFFLHEEYI HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHH EWLTCQDRMQDALNELEKTLNYHIQYDKYVYLLHHILINNGRIRREEVDETCENYLLGKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH AEQPQNTILKWFLARFLEEKNQFNTAIEQCKEILKLHPHLSKIQAKYVDLLEKNENWDDL HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH EAYAESLDQNHSQDTSTIFRIISILKYENEIERVIRLYEKVRPILSNAQLEDYEDCLLRG HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCC DNRTVAVEALHKFKCKKYPSVENFQSYGTFLYTSDKSDEEKANIYFRLLSASDECMQSGI CCCEEHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCEEEECCCCCCHHHHEEEEEECCCHHHHHHHH KNLYIEILQKLNKQKDLQNFLERLCKKYPTIDSLEYYMDYLRDWANPDEHKLTQIQNILI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH ELYKIELDNSNMRANYLEHSGLRSRYFNLLSITGQEDKICNYFKKEDEYYQHAYLTQPQL HHHHEEECCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH IKSYGLMLNDWSKYLKEEEQFFLIQKSADLLAQALEKADAQLYLDLKNIFPNQLLKLNKL HHHHCHHHHHHHHHHCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEHHHHCHHHHHHHCCH DEIEAFYQKGLVLNPDSIPMRLDYAKYLKNRHNFEKSLDEFLLIIEKEKTSWTWYATNIS HHHHHHHHCCCEECCCCCCEEECHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEEEECCH TYYLEAAHILDQLNRLDEAASYYKKYEKLSRHQTDEKYQEFKRKQSNLLDCAVDLP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHEECCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA