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The map label for this gene is 45658471

Identifier: 45658471

GI number: 45658471

Start: 3189821

End: 3193198

Strand: Reverse

Name: 45658471

Synonym: LIC12634

Alternate gene names: NA

Gene position: 3193198-3189821 (Counterclockwise)

Preceding gene: 45658481

Following gene: 45658470

Centisome position: 74.66

GC content: 31.97

Gene sequence:

>3378_bases
ATGATTTTTAGACCGAAAGACTTTCAAAAAAAGACAATTCCAAAATACTACTCAGACTATTTCGAAAGACTGAATCATTT
TGATTTTGAAGGAGCCATAAAACTTCTTGAGAAAATTTTTCAAGATGAACGCAACCAAAATAAAAAGGGAAAACCTACCG
ACTTTTTAAACGAAAAGAAAGAATACAAAAGTTTATCTGTTCGTTTTCAAGAGATGTTAGATGGATTTCATTTTTCTAAA
CCGTTGTCTAAAAAAGTGGATCTGGTCTTAAAACATTTAGAAGAGAGTTTCAATCCGGAAAATTTAAGGATTCATCGATT
TAAACCTTTTAACGGTTTTCTTTTTAAGATGTCCGATGATGGATTTTCTAGTGCTGTTTTAAATTCGATTCATTTTGATC
CGGAAACACGAGAAGTTTCAAATGTATTTGGACTCAATCACGAAATCATTTTTGAAAAAGATTCGTATCCTTCTGGAGAA
GATGTGGAGGAAACAGAAGAAAACAGTTCCGAACTCTATGATTTTATATACGATATGGAAGAGGGGAAATATTCGATTTA
CTATCAAGAAGAAAAAATCGAAGGAAAGGACTTACACGTTCATACTAAACTGCTTCTATTTGCAAAAATGATTCGTGAAA
TTGTAGATAAACTTTTGTTAGACGAAAGGTTCGCAAGGTTTCCGAAAGTTTTTCCTTTTTACGTTCTAGTGAACTCGGAA
GAATGTTACTCTTACACTCAGGAATTATTTTTTCTGGAAATTTTGCCTTCGATCGAATTACAATCGCTTCGAGAGAATCC
TAATTTCACGTCGTATGAAACGTCATCCAAAATCGAAAATTCCATTTCTGCAAAGGAAGAATTTTTATTTTATCTTAAAT
TTTTAGATCAACAAGACTCTAGGGAATTTCAGACCTTACTTAGAATTGTAGATTCTAATCCGGAATTTCAATCTATTTTA
GAAGAATTAGCCTTAGATTCTCTCAATTATAACTTTGAAGACGAAGAACTTGCAAGAGTAAGAGATTTTGAGCCTTATCT
ATTTTCTTCGTTTTTTTGGAAACTGGCGCAATTCAATCCCAAATCTCATCTGGAAAACGCCCGAAGTTTTCAAAACAAAG
TTTTTTTCCGTTCCCCACCTCCGTTGGTTGATTCATACAAAATAGCAATTCCTAATATTAATAATTTTTCATATGTTCTG
TTTGATTCTTATTTGTCTATACCGGAAGAATATAGATCTGAGTTTTATAATTCGTTTGAAGAGACGTTAAATCAAATGAA
GTCCCTGGCTCATCCTGGATTTAAAATCCTAGCTATGGAGATCGAGGCTAGATTTAAATCCAATCAATTGGATTCCGAAG
AAAATCCGATATATTTAGATCCACCCGAAGAATTTATAGATGTGATCATCGATCTGATTCATTGTATGCCGAAAAATTTT
CCTTGGTTTGGAGAAGCGTGGGATTTTATTTTTGAAGATAGACTTTTGTCTTTAGGAAAAAAGGCAAAAAGGGCGGTTCC
CGCAGTGATTGAAGTGATGGAAAGATATAATTACGAGGATTCTACGCGTAATCTTGCTACTATTTTATACAACATCGGAT
GTGATGATATTCCTTCTCTTGTTCATGAATTGCATAAAGAAAACGAATTTTATATGGAGGAATTTTACGATCAGTGGTCT
AAGCAGGCCCCTGCGGTACGTTGGGCATATTTTTTAGATCGGTTTGAAAATTTTCCAGAAGATTTTGCGCGTTCTGAAAT
TTGGGAAGATCTTCTTTATGATAGCGAGCCTGGTTTTTTAGTATATTATGAAAATATTGAAAAGAGTATAAATCGAAACC
GAATTTTTTATGCGTTTTTAAAAGCCCTAAAAAACGACCCTCAAGACGTCCCTTTTCGTTTTGCTTTATTTTACGCAGAA
AAGTTAAGGAATAAGGCTAAAAAAAATCGAGAGAACTTTTTTCAGATTATATCCGAAATGACGGAAATTTTAAAGTTATT
GAATGTATATGAGAAACTCAATAGCAAACAAAAAGTATATCTTGAATGTGGGATTGTAGCAAAGTCAATTGAAGCCTTTT
TACTAGAAAAGGCGGATGCGTTAGATATTTTCAATAAAACGTTATCTAAAAACCATTTATTAGTTTTTTTGAAAGTAAAT
TACATAGAAAAAAAAGAAGGGGTCAAACGGGGTATGGAAGAATTAAGACAAATTCTTCCTATTTTTTGGAAAGACGATCT
TATACTTTCAAAAGCGTTCTTTTTATATCTTTTATTTCCGAATCAGAATTGGGACGAGATCCCTTTCGGAAAGTTATATG
CTTTTTATACAAAAGTTCGTTTCGTTTTTCAAAATCATTTTTTTCGGGACGGTAATTTCGTAGCCGATTTAGAATCCTTT
GATATGAATTTGTTTATAGACGTATTAAAAGAAGAATATTCAAAACTTGAAATAGACTCACATAAGGCCTGGGTTCAAAA
TCAAGCCGAAGAATACTTCCTTTTCGAAAGCTTAGGTTCTGCTTCCGAAAAGGAACTAGTTACGTTTTTAAAACCTGGTA
ATTTATCTCTCAACCTTTCGATTGTGTCTAAACTTTTAAGAAGTTCTAAAAACTTTTCTAAGGAATTTTTACAACTTTTA
GAATGGGAAACCGAGGAAGCTTCAATTTTTCAGATTTTGAAATTGTATTATCCAAATGAGTTTTTAAAAGAAGAACTTTT
ACAAAATTCAGTTTTTCATACTCATTTGTCATTTTTTATTAGAAACTACAAAGGGGTTTCTTCTAGAGAACTCGCTAAAT
TCATTTTTTCTAAACTTAAGGAAAAACAAAATTCATTAGTAATTGTAGAAACCATAAAAGACTTGGACCCGGATACGATC
ATATATTGTTTTTTTTCCGTTTACTGGGCGTTTCAAAATGAAAATCGTTTGAATGAGTTTGAATCGATTCTGATTCAAAT
TCTGAAAGGTTTGGATCAGAGAAAACCTGAGTATGTTTTGATTGCTACTAATTTAGGAGTTTTGCAAATAGAAATTGGCA
ATTTAGAAATAGCTAAACAAACTTTTGATTCAATTTTTTCCATGGATTGGAGTCATTTTGACTACACAAAGGAATCTGAA
CTTATGGATAAGATTTTTGGTGAGGATTTAGATAAGCAGTATTCGGATATTTTTCGTAAATATTATGCACTCGCAAAGTT
TAACGCGGCCTGTTTATATTCCAAGTTGCAAGATCCGGAAAGAAGCATATCTTATTTGAAAGAAGCTGTAGTTCTTGAGC
CAGAAATTTACAATAGAGTAAAAATTCTTTCTGAAAAAGATTTTTTATCTATAGAACATCACGAAATATATAAGGAATTT
ATAAACTCTTTAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATATTTACGTCCTCAATTTGTAATCTTTAGGATAAAAAGTGATATGACTTTCTAAGTCGTCTGTTATGTTACCGAATAC
TTTTGATTGAACTGTAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGATCAAGATGTTAAGTTTTCATTTGGAATTGTTGGATAAAATTTTTCTAAAAAATGTAAACCAATTTGTAGTTTATAAA
GATTATGCGTTCGTATACGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1125; Mature: 1125

Protein sequence:

>1125_residues
MIFRPKDFQKKTIPKYYSDYFERLNHFDFEGAIKLLEKIFQDERNQNKKGKPTDFLNEKKEYKSLSVRFQEMLDGFHFSK
PLSKKVDLVLKHLEESFNPENLRIHRFKPFNGFLFKMSDDGFSSAVLNSIHFDPETREVSNVFGLNHEIIFEKDSYPSGE
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ECYSYTQELFFLEILPSIELQSLRENPNFTSYETSSKIENSISAKEEFLFYLKFLDQQDSREFQTLLRIVDSNPEFQSIL
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FDSYLSIPEEYRSEFYNSFEETLNQMKSLAHPGFKILAMEIEARFKSNQLDSEENPIYLDPPEEFIDVIIDLIHCMPKNF
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KQAPAVRWAYFLDRFENFPEDFARSEIWEDLLYDSEPGFLVYYENIEKSINRNRIFYAFLKALKNDPQDVPFRFALFYAE
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IYCFFSVYWAFQNENRLNEFESILIQILKGLDQRKPEYVLIATNLGVLQIEIGNLEIAKQTFDSIFSMDWSHFDYTKESE
LMDKIFGEDLDKQYSDIFRKYYALAKFNAACLYSKLQDPERSISYLKEAVVLEPEIYNRVKILSEKDFLSIEHHEIYKEF
INSLN

Sequences:

>Translated_1125_residues
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EELALDSLNYNFEDEELARVRDFEPYLFSSFFWKLAQFNPKSHLENARSFQNKVFFRSPPPLVDSYKIAIPNINNFSYVL
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PWFGEAWDFIFEDRLLSLGKKAKRAVPAVIEVMERYNYEDSTRNLATILYNIGCDDIPSLVHELHKENEFYMEEFYDQWS
KQAPAVRWAYFLDRFENFPEDFARSEIWEDLLYDSEPGFLVYYENIEKSINRNRIFYAFLKALKNDPQDVPFRFALFYAE
KLRNKAKKNRENFFQIISEMTEILKLLNVYEKLNSKQKVYLECGIVAKSIEAFLLEKADALDIFNKTLSKNHLLVFLKVN
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EWETEEASIFQILKLYYPNEFLKEELLQNSVFHTHLSFFIRNYKGVSSRELAKFIFSKLKEKQNSLVIVETIKDLDPDTI
IYCFFSVYWAFQNENRLNEFESILIQILKGLDQRKPEYVLIATNLGVLQIEIGNLEIAKQTFDSIFSMDWSHFDYTKESE
LMDKIFGEDLDKQYSDIFRKYYALAKFNAACLYSKLQDPERSISYLKEAVVLEPEIYNRVKILSEKDFLSIEHHEIYKEF
INSLN
>Mature_1125_residues
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PLSKKVDLVLKHLEESFNPENLRIHRFKPFNGFLFKMSDDGFSSAVLNSIHFDPETREVSNVFGLNHEIIFEKDSYPSGE
DVEETEENSSELYDFIYDMEEGKYSIYYQEEKIEGKDLHVHTKLLLFAKMIREIVDKLLLDERFARFPKVFPFYVLVNSE
ECYSYTQELFFLEILPSIELQSLRENPNFTSYETSSKIENSISAKEEFLFYLKFLDQQDSREFQTLLRIVDSNPEFQSIL
EELALDSLNYNFEDEELARVRDFEPYLFSSFFWKLAQFNPKSHLENARSFQNKVFFRSPPPLVDSYKIAIPNINNFSYVL
FDSYLSIPEEYRSEFYNSFEETLNQMKSLAHPGFKILAMEIEARFKSNQLDSEENPIYLDPPEEFIDVIIDLIHCMPKNF
PWFGEAWDFIFEDRLLSLGKKAKRAVPAVIEVMERYNYEDSTRNLATILYNIGCDDIPSLVHELHKENEFYMEEFYDQWS
KQAPAVRWAYFLDRFENFPEDFARSEIWEDLLYDSEPGFLVYYENIEKSINRNRIFYAFLKALKNDPQDVPFRFALFYAE
KLRNKAKKNRENFFQIISEMTEILKLLNVYEKLNSKQKVYLECGIVAKSIEAFLLEKADALDIFNKTLSKNHLLVFLKVN
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EWETEEASIFQILKLYYPNEFLKEELLQNSVFHTHLSFFIRNYKGVSSRELAKFIFSKLKEKQNSLVIVETIKDLDPDTI
IYCFFSVYWAFQNENRLNEFESILIQILKGLDQRKPEYVLIATNLGVLQIEIGNLEIAKQTFDSIFSMDWSHFDYTKESE
LMDKIFGEDLDKQYSDIFRKYYALAKFNAACLYSKLQDPERSISYLKEAVVLEPEIYNRVKILSEKDFLSIEHHEIYKEF
INSLN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 133992; Mature: 133992

Theoretical pI: Translated: 4.76; Mature: 4.76

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIFRPKDFQKKTIPKYYSDYFERLNHFDFEGAIKLLEKIFQDERNQNKKGKPTDFLNEKK
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EYKSLSVRFQEMLDGFHFSKPLSKKVDLVLKHLEESFNPENLRIHRFKPFNGFLFKMSDD
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HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
RSISYLKEAVVLEPEIYNRVKILSEKDFLSIEHHEIYKEFINSLN
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
EYKSLSVRFQEMLDGFHFSKPLSKKVDLVLKHLEESFNPENLRIHRFKPFNGFLFKMSDD
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PWFGEAWDFIFEDRLLSLGKKAKRAVPAVIEVMERYNYEDSTRNLATILYNIGCDDIPSL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
VHELHKENEFYMEEFYDQWSKQAPAVRWAYFLDRFENFPEDFARSEIWEDLLYDSEPGFL
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
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HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCHHHHH
TFDSIFSMDWSHFDYTKESELMDKIFGEDLDKQYSDIFRKYYALAKFNAACLYSKLQDPE
HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
RSISYLKEAVVLEPEIYNRVKILSEKDFLSIEHHEIYKEFINSLN
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA