Definition Methanococcus maripaludis S2 chromosome, complete genome.
Accession NC_005791
Length 1,661,137

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The map label for this gene is 45359216

Identifier: 45359216

GI number: 45359216

Start: 1594017

End: 1597127

Strand: Direct

Name: 45359216

Synonym: MMP1653

Alternate gene names: NA

Gene position: 1594017-1597127 (Clockwise)

Preceding gene: 45359211

Following gene: 45359217

Centisome position: 95.96

GC content: 27.84

Gene sequence:

>3111_bases
TTGATTTTATTTGAGTCTTTTTTTGGTGAAGCCATGTATAGAGAACTGTCTAAAGAAGAATTGTTAGAAAAATTTGATGA
GTATATTACTTCAGAAGATATTAAAAAAAGAGCAGAATCGACCAAAATATTGGGATACCTCGGAATAAACGACATTAAAA
GTAGAATGGATAATATTTTAAGCCTTACTTTTGAAAATGACATTTCAATACGGCTAAATTTAATAACTGCTTTTTCAAAT
ATTTTAAACAAATTTCCGGAAGTTTTTAGCGAATTAATTGGTTGTATTTACTACAATACCGAATTTTCAAATAATATTTT
ATCAGAACATGCAAAAAACGAAATAAAAGCACTTGGACCCGAAGTGATCGAAAGACACGTTGAACACTTTCGAAACGGAA
TTTATTCAAAAAATACTGAAGAAAGATTAAAATCAGTTATATTACTTTCGTTAATATCTAGATTCAGCCCGGAATATTTG
GATAAAGCATTATCTGAGATCGTAATGGCGTCTACTTATGATTCATCTGCATTAATACAGTTGCTTGCACTTGGAACCCT
TGACGATTTTTCAGAAATTAATAGAAACTTTTTAAGATATTCCTACCTCGTTTTTAATAAAAAAATGGATATAACACCAT
TAAATAAATCAAAAACCGGCGCTGAAATTACTAAATCATTGATTAGACTTACAGTTTCAGACGAAATCGATGGAAATACA
ATAAATGAGTTGTTGAAGTATTTATCAATTGAAAACGACTTTTGTACACTGCTTGCAGCCATATCCCTTCAAAATAATAT
TTTAAAAGTTGAAAAAAATTTTGAAGATTATCCGCTAATATTTCAAGACCAACTCTCAAAATTTTACAAAAAACATCCAA
ACAATGTTCAACAGCTGATTTCTTATTCCTTAATTTTAGATATAACCCATTCTTTAAATTTAGAAATTAAAAACGTGGAT
TTTGAAAAAATATTTTATTATTTAAAAAAGAATATTTCTGGAAAAGACCACATTTCAAAAGCATTCTCTTTAATCATTCT
TTATTTGCTACACAAAATGGAAAAATTGAATCTGGATGAAGAAATTGATGAAATTTTTGATAATTATCCGTTTGAAAATA
TATTAAAAGAACATCCGCTTTGCTACTACTTTGGAATGCCTCTTTTGGCCGAAAAATATAATACTTTGCCGGAAGTTGAC
AAAAGTCCATATCTAATCCGGTCTCTTGAATTAAAAATGCAGTATATGGCCCCGACAGAACGCCACCATTACATAAAATC
AGCCGAAAAGAATATTAAAAGTGATTACTGGCTTGAACGATATAATGGGGCAAAAAAAATTGGAAGTGCATTATATTTTG
ATGAATCAAAAGAGTTTATGGATTTTGAACTTGTAAAAAGTATCATCCATGACGAAATATACCTTGTACGAAATATAGGA
ATATGGATACTTCGAATACTTGTAAAATACAACATAAAACTTCCTGAAAGGATTATTTTAGAAGTAATTCACGATTTAAA
CAGTCCATACTGGGAATTAAGGTTTGAATATTACCTTTTATTAAATGAATTACTGGAAAAACGTCCAGAACTGTTAACTG
AATTTAACACTGCTTCAAAAATTAAATCAATATTGGGGAGTCACTACGTAAATGAAAATTATCCTCCTTTCAAAATAGCG
ATAAAAAGTATACTGGATAAAATATTAAAAAATTTAGAAAATACTCCAAAAAAGTTTCAGGATGAACTAAGCGGGGAATT
ATATTCAGAACAGTTATTTGAAAACCCGGTAACTTCTGCTGCATTTTTAGAAAAATTAAAAATAAACCTTGATAGTTACA
TACTAAAAAATGATGAAAAAAATATTTTAAAAGTATTAACATTCCTAAAAACGCATGAATCAAAAGTTGATTGTTCCTAT
CTTTTGGAAGAACTCGTAAAATTGAAAGATAATTATCCTGACGCGAATTATTTTTTAAATAACATAAAAAATAGGTACAA
ATTAATTCCAAAACCTCTTGAAATCAGGATATTAAACAGTCTGAATAACCCTATCCCAGAATATAAAAAAGATGGGCTGG
AAGAGATTATTACGTATTTAAATGAAGGATTTAAGATTAATAATGGTATAGGCCTTAAAATAAAGGAAATTTTAGTAATG
TACAGGGATGAAAAACTGACTGACCTCTGTATTAATATACTAAATTTACAAAACGATATCGAAAGTAAAAGGCTGATTTT
TGAAAAAAGAGAATTTGATACACATTTAAACGACTTAAAAGAGATTAAAGAAAAATCTGATGAAAACATTAAACAAATGT
CCACTGAAGAGCTCTATGTAAAATTAAGTAGCCAACTGCATAAAACTTCAGAATATGACTACCAATCTATTAATTTTAAC
GATATTTTGTACTTTTTATCAGATTATTCGAAACGTCCATCAGTAATCCTGACAACAATGATATTAAAAATCCTAAAAAA
TGTTATAACTGACCCAAATTCAAATATATTAAACAGTCCTGATATAGATAATCCAAAAGTCCTTGAAAATTTATATTATT
TGATTTATTCAACAGATTACGAAATATTATCAAAAAATGCAATTATATTAACTGTAGAAATTGTTAAAAATAAACCTGAA
TGGTTATTAAGGAATATAACCAATGTTTCCAAAAATAAAAATTGGCCATTATTTTTAAATTCACTTTTAGATTACCCTGA
CAATAAAGTACTCGGAGAAACCATAAATGCATTTAATTATTACGCCAAAAATTCAAATTCGTTTGATTTATCCGCAGAGT
TTCTTGAAAAACTTGTAAACCGGCTAGATACATCAAACTGGGAAAATTTCAAAAAAATTGTAAAGGTACTTGGAAATTAC
GAAATGGACGAAAAAATGTTAAACCGGTTTTCCAAACTTTTACTTGAAAAAATCGAAAATTCAAACGATGACTCTAAATT
AATACTGTTGAGATTCTTTAAAATTCAAGATATATCAAGATTAAACAGCAATTTAGTGGCTCAACTTTTAAATCTAAAAA
ATTCTAAAAACTACGACATTAAAAGAGATATTGAAGAAATAGAATCCATGAAAATCAAATTAAGGGGCTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTAAAGGATTTTTTAAAACAGCCCTTAAACAGAAATTATGGAAATGTTGATATATGTAGGAAAAGAGAAAGTAATAACG
ATAGTTTTAACTCGATATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATGTACCAAAGCACGGATAAAAACGACCTTGCAGCACTTTTTGATAAATATATTGAGTCTGATAATTATAAAGATAAA
ACAGAAGCTGCAAAAATTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1036; Mature: 1036

Protein sequence:

>1036_residues
MILFESFFGEAMYRELSKEELLEKFDEYITSEDIKKRAESTKILGYLGINDIKSRMDNILSLTFENDISIRLNLITAFSN
ILNKFPEVFSELIGCIYYNTEFSNNILSEHAKNEIKALGPEVIERHVEHFRNGIYSKNTEERLKSVILLSLISRFSPEYL
DKALSEIVMASTYDSSALIQLLALGTLDDFSEINRNFLRYSYLVFNKKMDITPLNKSKTGAEITKSLIRLTVSDEIDGNT
INELLKYLSIENDFCTLLAAISLQNNILKVEKNFEDYPLIFQDQLSKFYKKHPNNVQQLISYSLILDITHSLNLEIKNVD
FEKIFYYLKKNISGKDHISKAFSLIILYLLHKMEKLNLDEEIDEIFDNYPFENILKEHPLCYYFGMPLLAEKYNTLPEVD
KSPYLIRSLELKMQYMAPTERHHYIKSAEKNIKSDYWLERYNGAKKIGSALYFDESKEFMDFELVKSIIHDEIYLVRNIG
IWILRILVKYNIKLPERIILEVIHDLNSPYWELRFEYYLLLNELLEKRPELLTEFNTASKIKSILGSHYVNENYPPFKIA
IKSILDKILKNLENTPKKFQDELSGELYSEQLFENPVTSAAFLEKLKINLDSYILKNDEKNILKVLTFLKTHESKVDCSY
LLEELVKLKDNYPDANYFLNNIKNRYKLIPKPLEIRILNSLNNPIPEYKKDGLEEIITYLNEGFKINNGIGLKIKEILVM
YRDEKLTDLCINILNLQNDIESKRLIFEKREFDTHLNDLKEIKEKSDENIKQMSTEELYVKLSSQLHKTSEYDYQSINFN
DILYFLSDYSKRPSVILTTMILKILKNVITDPNSNILNSPDIDNPKVLENLYYLIYSTDYEILSKNAIILTVEIVKNKPE
WLLRNITNVSKNKNWPLFLNSLLDYPDNKVLGETINAFNYYAKNSNSFDLSAEFLEKLVNRLDTSNWENFKKIVKVLGNY
EMDEKMLNRFSKLLLEKIENSNDDSKLILLRFFKIQDISRLNSNLVAQLLNLKNSKNYDIKRDIEEIESMKIKLRG

Sequences:

>Translated_1036_residues
MILFESFFGEAMYRELSKEELLEKFDEYITSEDIKKRAESTKILGYLGINDIKSRMDNILSLTFENDISIRLNLITAFSN
ILNKFPEVFSELIGCIYYNTEFSNNILSEHAKNEIKALGPEVIERHVEHFRNGIYSKNTEERLKSVILLSLISRFSPEYL
DKALSEIVMASTYDSSALIQLLALGTLDDFSEINRNFLRYSYLVFNKKMDITPLNKSKTGAEITKSLIRLTVSDEIDGNT
INELLKYLSIENDFCTLLAAISLQNNILKVEKNFEDYPLIFQDQLSKFYKKHPNNVQQLISYSLILDITHSLNLEIKNVD
FEKIFYYLKKNISGKDHISKAFSLIILYLLHKMEKLNLDEEIDEIFDNYPFENILKEHPLCYYFGMPLLAEKYNTLPEVD
KSPYLIRSLELKMQYMAPTERHHYIKSAEKNIKSDYWLERYNGAKKIGSALYFDESKEFMDFELVKSIIHDEIYLVRNIG
IWILRILVKYNIKLPERIILEVIHDLNSPYWELRFEYYLLLNELLEKRPELLTEFNTASKIKSILGSHYVNENYPPFKIA
IKSILDKILKNLENTPKKFQDELSGELYSEQLFENPVTSAAFLEKLKINLDSYILKNDEKNILKVLTFLKTHESKVDCSY
LLEELVKLKDNYPDANYFLNNIKNRYKLIPKPLEIRILNSLNNPIPEYKKDGLEEIITYLNEGFKINNGIGLKIKEILVM
YRDEKLTDLCINILNLQNDIESKRLIFEKREFDTHLNDLKEIKEKSDENIKQMSTEELYVKLSSQLHKTSEYDYQSINFN
DILYFLSDYSKRPSVILTTMILKILKNVITDPNSNILNSPDIDNPKVLENLYYLIYSTDYEILSKNAIILTVEIVKNKPE
WLLRNITNVSKNKNWPLFLNSLLDYPDNKVLGETINAFNYYAKNSNSFDLSAEFLEKLVNRLDTSNWENFKKIVKVLGNY
EMDEKMLNRFSKLLLEKIENSNDDSKLILLRFFKIQDISRLNSNLVAQLLNLKNSKNYDIKRDIEEIESMKIKLRG
>Mature_1036_residues
MILFESFFGEAMYRELSKEELLEKFDEYITSEDIKKRAESTKILGYLGINDIKSRMDNILSLTFENDISIRLNLITAFSN
ILNKFPEVFSELIGCIYYNTEFSNNILSEHAKNEIKALGPEVIERHVEHFRNGIYSKNTEERLKSVILLSLISRFSPEYL
DKALSEIVMASTYDSSALIQLLALGTLDDFSEINRNFLRYSYLVFNKKMDITPLNKSKTGAEITKSLIRLTVSDEIDGNT
INELLKYLSIENDFCTLLAAISLQNNILKVEKNFEDYPLIFQDQLSKFYKKHPNNVQQLISYSLILDITHSLNLEIKNVD
FEKIFYYLKKNISGKDHISKAFSLIILYLLHKMEKLNLDEEIDEIFDNYPFENILKEHPLCYYFGMPLLAEKYNTLPEVD
KSPYLIRSLELKMQYMAPTERHHYIKSAEKNIKSDYWLERYNGAKKIGSALYFDESKEFMDFELVKSIIHDEIYLVRNIG
IWILRILVKYNIKLPERIILEVIHDLNSPYWELRFEYYLLLNELLEKRPELLTEFNTASKIKSILGSHYVNENYPPFKIA
IKSILDKILKNLENTPKKFQDELSGELYSEQLFENPVTSAAFLEKLKINLDSYILKNDEKNILKVLTFLKTHESKVDCSY
LLEELVKLKDNYPDANYFLNNIKNRYKLIPKPLEIRILNSLNNPIPEYKKDGLEEIITYLNEGFKINNGIGLKIKEILVM
YRDEKLTDLCINILNLQNDIESKRLIFEKREFDTHLNDLKEIKEKSDENIKQMSTEELYVKLSSQLHKTSEYDYQSINFN
DILYFLSDYSKRPSVILTTMILKILKNVITDPNSNILNSPDIDNPKVLENLYYLIYSTDYEILSKNAIILTVEIVKNKPE
WLLRNITNVSKNKNWPLFLNSLLDYPDNKVLGETINAFNYYAKNSNSFDLSAEFLEKLVNRLDTSNWENFKKIVKVLGNY
EMDEKMLNRFSKLLLEKIENSNDDSKLILLRFFKIQDISRLNSNLVAQLLNLKNSKNYDIKRDIEEIESMKIKLRG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 121759; Mature: 121759

Theoretical pI: Translated: 5.55; Mature: 5.55

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MILFESFFGEAMYRELSKEELLEKFDEYITSEDIKKRAESTKILGYLGINDIKSRMDNIL
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHH
SLTFENDISIRLNLITAFSNILNKFPEVFSELIGCIYYNTEFSNNILSEHAKNEIKALGP
EEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
EVIERHVEHFRNGIYSKNTEERLKSVILLSLISRFSPEYLDKALSEIVMASTYDSSALIQ
HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
LLALGTLDDFSEINRNFLRYSYLVFNKKMDITPLNKSKTGAEITKSLIRLTVSDEIDGNT
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
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HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
SYSLILDITHSLNLEIKNVDFEKIFYYLKKNISGKDHISKAFSLIILYLLHKMEKLNLDE
HHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
EIDEIFDNYPFENILKEHPLCYYFGMPLLAEKYNTLPEVDKSPYLIRSLELKMQYMAPTE
HHHHHHCCCCHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCH
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HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH
IKSILGSHYVNENYPPFKIAIKSILDKILKNLENTPKKFQDELSGELYSEQLFENPVTSA
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
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HHHHHHHHCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
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HHHHHHHCCCCCHHHHEEHHCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHCCEEECCCCCHHHHHHHHH
YRDEKLTDLCINILNLQNDIESKRLIFEKREFDTHLNDLKEIKEKSDENIKQMSTEELYV
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
KLSSQLHKTSEYDYQSINFNDILYFLSDYSKRPSVILTTMILKILKNVITDPNSNILNSP
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SLLDYPDNKVLGETINAFNYYAKNSNSFDLSAEFLEKLVNRLDTSNWENFKKIVKVLGNY
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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
KRDIEEIESMKIKLRG
HHHHHHHHHHEEEECC
>Mature Secondary Structure
MILFESFFGEAMYRELSKEELLEKFDEYITSEDIKKRAESTKILGYLGINDIKSRMDNIL
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHH
SLTFENDISIRLNLITAFSNILNKFPEVFSELIGCIYYNTEFSNNILSEHAKNEIKALGP
EEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
EVIERHVEHFRNGIYSKNTEERLKSVILLSLISRFSPEYLDKALSEIVMASTYDSSALIQ
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HHHHHHHHCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
NIKNRYKLIPKPLEIRILNSLNNPIPEYKKDGLEEIITYLNEGFKINNGIGLKIKEILVM
HHHHHHHCCCCCHHHHEEHHCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHCCEEECCCCCHHHHHHHHH
YRDEKLTDLCINILNLQNDIESKRLIFEKREFDTHLNDLKEIKEKSDENIKQMSTEELYV
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
KLSSQLHKTSEYDYQSINFNDILYFLSDYSKRPSVILTTMILKILKNVITDPNSNILNSP
HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
DIDNPKVLENLYYLIYSTDYEILSKNAIILTVEIVKNKPEWLLRNITNVSKNKNWPLFLN
CCCCHHHHHHHHHHHEECCHHHHCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH
SLLDYPDNKVLGETINAFNYYAKNSNSFDLSAEFLEKLVNRLDTSNWENFKKIVKVLGNY
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCC
EMDEKMLNRFSKLLLEKIENSNDDSKLILLRFFKIQDISRLNSNLVAQLLNLKNSKNYDI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
KRDIEEIESMKIKLRG
HHHHHHHHHHEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA