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The map label for this gene is 45358596

Identifier: 45358596

GI number: 45358596

Start: 1025552

End: 1028482

Strand: Direct

Name: 45358596

Synonym: MMP1033

Alternate gene names: NA

Gene position: 1025552-1028482 (Clockwise)

Preceding gene: 45358592

Following gene: 45358597

Centisome position: 61.74

GC content: 32.14

Gene sequence:

>2931_bases
ATGAACATTAAAAGAATCGTATCTGACCTTAAAAAAGAAAGCTGGTATGCTAAATTAGATGCTGTAAATAGGTTAGGAAA
CATTGTCTACGAATCACAAGACGATGCAGATTACGTACTTAATAATTTACTTATTGAACTTGAATCTCCAAAAACCGTAA
TGCAAGCACGAACGCTTTGGGCTACGAACAATATCATAAAACAGTACCCCCAATTAGCTTACAAAATAGTACCGCATCTT
TTGAGACTTTCAAATTATGATAATAAAGCAATTAAAGAAATTTCAAATGAACTTTTAAATAAGCCCCTGATACAATACGC
AATTTCAAGATATAATACGATACTTTCAAAGAGTATCCATTCAGAAGATTATTACGAAAAATTAGGGGCTATTATAAATA
TTTGGAAAATGGCACCGGTAGATCCTGACTTAATAGACTCTATTCTTCCGGAATTAATTGAATCAATGATTAATAAAAAT
CATTTAAAAATAGGCATATTTTCATGGATATTGCTCGAATCCGATGATAATGAAACAATCGAAGAAATTGTAGATGTAAT
AAATAAAGTATATCTACACCTTGATTTTAATGCCCAATACCCTCCAAGCTATATCAAAAAACTGATAAACAGTCCAGATC
CAGTACTTAATCACGTTGGGCTGTCATCTATCGAAAAAAACCCTGAAAATGCAAATAACGAACTTATGGAAGATTTATTG
AAATTATTTACTTCCGAAAATACCGATAGGTTTGTAAAAGCTAAAATGTTCTACACTATAGGATTACTTTCAAAAACCAA
ACCCTATCTAAAAACAATACTTATACACGAAGCCAATAAAACAATTAAAAATGAAAAAGATTGGCTTTTAACATTTGCTG
CATTGATCGGGTTTTACTTAATAGAAGAAAAAATAACAAATTTAGAATTATTACACCATTCAAATTCATTAATCCGTGCA
GTTGCAATCCAATTGATAGATTCTAGAAGTTCTGAACAGATTCTATCGGCTTTTGCTGATAACCACATAACTGTATTCAT
CTCGGCCATCGACAGGAGCATTATGCAAGATGTTTCAGATGAAATAAAATTAAAATTTTTAAACGAATTAAGTAATCCCG
ATAATTATCCATATATGAGCGAAAATATTGATGAAAATTCAGTTACCAAGCTAAGAGATAGCGTTGGTGACATTGTACAC
TCGTGGGATTCTGAACACTGGCTTTCTAAAATAAATTTAATGAATGACCTTGGAAATTTAGCTAAAAACAATCAGGACTA
CATTGATAGTTCTATTGATCTAATAATAAAATCTATGGAAGACAATTACGGAATGGTTCGTGCACAAGGTCTCTGGATTA
TTCGGGCCATATTATACAACAGTAAAGATCCATTTTATATTTTAGAAGCATTGGATGGGCATTTAGAACCCATTTTAAAG
ATAAATGATCCAAATGTATTCGTAAGGCTAAATTACATACTAATACTTAGGAATTTCGCGGAATTTTTAAATAAAATTGA
AGGTACTGAAGATAAACGTTCAGAAATTGCAGGATACTTGCTTTATATGGCACTGAACGATTCGACAAAACTTGTTTCTG
ACGTTGCAAAGCTTGTTTTAAAATTTGACTTTGATACTGAAATAAACAAAAAAGAAATTAATCTGGACAACTTCCAAAAA
TACCTGGAAGCATTCCCTTATTCCGCACTTGGAATTATAAGATACATGTTGTTAAAAAATCAAGGCAATGAACAAGTTGT
ATCAATGCTTATCGACCTTTGCAGAACTTATCATGATTATGGTTGCGATATGTTTTGTATCCTTTATGGGGTTGATATGG
ATTTAACTTCGGAAAGCATTTGCGAAAAATTGAAGGAATATTCGACATGCGTGTCTAATGAAGACCAAAAATCCGTAAAA
TTGATCATAAAAATGCATTTGAATGAGCATAACTGGAAAGTAAGAATGACTGGTCTTTCGATCCTTGAAAAAATATCAGT
AATGGATCCAAAGATTATCGACGATTTCGTAATAGATCTAATTAATATCGCATTGTCGGACAGGATATTTGAAATAAGAG
AATTTGCCGGAAAATTACTTGGAATGATCGATTATGAAAGTCCAGAAATAGATAGGGAAACTTCAATAAACTACCTTTTC
AAAAGAAGCGATGAACTGCTTGAAATTATAAAAGACGGAAAATTTGGAGTCGATGAAGCGTTCTACGCACTTAGTATCCG
AACTAAAGAAATAGATAGTATTGAAAACCTAATGTCTGTTGTTTCGAAATTTAAAAATGACGAACACTGGTATAGGAGAG
CTTATGCATATAAAATCCTTGAAAACTTAATTAAAAATCCAAAAGCAGACCATTACCACTACGAAATTATAAATTGGTGT
CTTGAAGCTACTGAAGATAAAAATCCCGTCATTTCAGGATTATCAAAAGGAATACTGGAAAAATTAGGCCGTGCTGTTCA
GCCATCGTGTCAAAAAACTGCGTATGACAGAATCAGACGTATTGAAAACCTGCTTGAAAGTGGGGACTGGACTGTAAAAG
TAGAAGCGCTCCAATCAGTTCGAGATTTCATCAACGAAGGGCACTACGGATATTTAGATATCGTAATGGAAAAGTTAGAT
GATCCACACTGGAAAGTTAAAAATGCAGCATTAGGAATTTTGGCAGATATTGACCCAGATTTAATAAAACCTGCAATTCC
GAAAATAATCAGTCTTTTAAATGACGGTGATGAATCGGTAATATTAAAAACACTCCTTACATTAAAAAAATTCGGTCAAA
AGGACATGAAAATCCTTGAAAAAGTTATGCCCAAACTTGATAAACTTGAAAATTACGGAACATGGAGCATAAAAGAAGAA
ATAATGAGATTAAAATTATCATACTACAATAAATTAAGACAAAAACACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATAATAATGTTGAACATCCATTTTTATATTTGTTTGTATATAATATATGACAAAAGTACTCAGAATATATACTTAACGA
TTTAGAATACTTGGGAAATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATCTCTTTTTGGTAATATTATGAACAAATTCATCGTTTTTGAAGGAATTGACGGCTGTGGAAAAACTACTCAGGCAAA
ACTCGTAGCTGAAAAATTAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 976; Mature: 976

Protein sequence:

>976_residues
MNIKRIVSDLKKESWYAKLDAVNRLGNIVYESQDDADYVLNNLLIELESPKTVMQARTLWATNNIIKQYPQLAYKIVPHL
LRLSNYDNKAIKEISNELLNKPLIQYAISRYNTILSKSIHSEDYYEKLGAIINIWKMAPVDPDLIDSILPELIESMINKN
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INDPNVFVRLNYILILRNFAEFLNKIEGTEDKRSEIAGYLLYMALNDSTKLVSDVAKLVLKFDFDTEINKKEINLDNFQK
YLEAFPYSALGIIRYMLLKNQGNEQVVSMLIDLCRTYHDYGCDMFCILYGVDMDLTSESICEKLKEYSTCVSNEDQKSVK
LIIKMHLNEHNWKVRMTGLSILEKISVMDPKIIDDFVIDLINIALSDRIFEIREFAGKLLGMIDYESPEIDRETSINYLF
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DPHWKVKNAALGILADIDPDLIKPAIPKIISLLNDGDESVILKTLLTLKKFGQKDMKILEKVMPKLDKLENYGTWSIKEE
IMRLKLSYYNKLRQKH

Sequences:

>Translated_976_residues
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LRLSNYDNKAIKEISNELLNKPLIQYAISRYNTILSKSIHSEDYYEKLGAIINIWKMAPVDPDLIDSILPELIESMINKN
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INDPNVFVRLNYILILRNFAEFLNKIEGTEDKRSEIAGYLLYMALNDSTKLVSDVAKLVLKFDFDTEINKKEINLDNFQK
YLEAFPYSALGIIRYMLLKNQGNEQVVSMLIDLCRTYHDYGCDMFCILYGVDMDLTSESICEKLKEYSTCVSNEDQKSVK
LIIKMHLNEHNWKVRMTGLSILEKISVMDPKIIDDFVIDLINIALSDRIFEIREFAGKLLGMIDYESPEIDRETSINYLF
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DPHWKVKNAALGILADIDPDLIKPAIPKIISLLNDGDESVILKTLLTLKKFGQKDMKILEKVMPKLDKLENYGTWSIKEE
IMRLKLSYYNKLRQKH
>Mature_976_residues
MNIKRIVSDLKKESWYAKLDAVNRLGNIVYESQDDADYVLNNLLIELESPKTVMQARTLWATNNIIKQYPQLAYKIVPHL
LRLSNYDNKAIKEISNELLNKPLIQYAISRYNTILSKSIHSEDYYEKLGAIINIWKMAPVDPDLIDSILPELIESMINKN
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SWDSEHWLSKINLMNDLGNLAKNNQDYIDSSIDLIIKSMEDNYGMVRAQGLWIIRAILYNSKDPFYILEALDGHLEPILK
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DPHWKVKNAALGILADIDPDLIKPAIPKIISLLNDGDESVILKTLLTLKKFGQKDMKILEKVMPKLDKLENYGTWSIKEE
IMRLKLSYYNKLRQKH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 112978; Mature: 112978

Theoretical pI: Translated: 5.15; Mature: 5.15

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNIKRIVSDLKKESWYAKLDAVNRLGNIVYESQDDADYVLNNLLIELESPKTVMQARTLW
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHH
ATNNIIKQYPQLAYKIVPHLLRLSNYDNKAIKEISNELLNKPLIQYAISRYNTILSKSIH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SEDYYEKLGAIINIWKMAPVDPDLIDSILPELIESMINKNHLKIGIFSWILLESDDNETI
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEEECCCCHHH
EEIVDVINKVYLHLDFNAQYPPSYIKKLINSPDPVLNHVGLSSIEKNPENANNELMEDLL
HHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH
KLFTSENTDRFVKAKMFYTIGLLSKTKPYLKTILIHEANKTIKNEKDWLLTFAALIGFYL
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IEEKITNLELLHHSNSLIRAVAIQLIDSRSSEQILSAFADNHITVFISAIDRSIMQDVSD
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EIKLKFLNELSNPDNYPYMSENIDENSVTKLRDSVGDIVHSWDSEHWLSKINLMNDLGNL
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AKNNQDYIDSSIDLIIKSMEDNYGMVRAQGLWIIRAILYNSKDPFYILEALDGHLEPILK
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHCCCCCCEEE
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ECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
IMRLKLSYYNKLRQKH
HHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
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IMRLKLSYYNKLRQKH
HHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA