| Definition | Corynebacterium diphtheriae NCTC 13129 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002935 |
| Length | 2,488,635 |
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The map label for this gene is 38232838
Identifier: 38232838
GI number: 38232838
Start: 175497
End: 181139
Strand: Direct
Name: 38232838
Synonym: DIP0212
Alternate gene names: NA
Gene position: 175497-181139 (Clockwise)
Preceding gene: 38232837
Following gene: 38232839
Centisome position: 7.05
GC content: 53.43
Gene sequence:
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ATTGCGTGGGTCACTGCAGCAATTGCTGCGGTGGGAGCTGGACTTGTGTGGTTCTTCACTCAAACGGAGACCGGAAAGCA AGCGTGGCAGAGCTTCACCTCTGCGCTACAAGCTGGGTGGGATCTATTTTCCTCAGCATTGCGTACAGGCTGGGAGATGC TCAAAACTGCAGTGTTTGATGCGTGGACAGTCCGTGTGGAGACGCTTAAAAGCGTCTGGGAGGCAACAACCGGGGCTATC GGTGCTGGTTGGGAATGGCTCAAAGGTGCCCTGTACAGCGGATGGATGTGGATCTCTGGCAACGTTATCGAAGGGTTCAA AGCTGGGCTTAGCGGTCTCAGAGATTTCTTTTCCTCGGTTGTCAATGGGATCAAATCGACCTGGGCGACGCTTCGATCAG CACTGGCAAAACCAGTGAACTTCATGATTAACACTGTCTATAACGGTGGCATTCTCAAGGCTTGGAATGTTATCGCGGGG CTGTTGCCAGGGCTGAAACAAGGCAACCCACTCGCAGGAATCCCAGAGCACGCAACAGGTGGCCGAATTGCAGGACCAGG AACCGGAACATCAGACGATGTTCTGATGTGGGGCTCGAATGGTGAGCACATGCTCACAGCGAAGGAAGTCCAACGCGCCG GTGGACACAATGCGATCTACTTCATGCGTGATTTGATCGCAAGCAGAACCCCATTCACGTGGGACGGCGGAAGATTCATC GCTGAACACCGCAAGTCTGTCAACGACTACGGCTCCGAGGTAAAACGCCGAGGAATCGGAAACGTTGATGACAACGGACT GTTCTCAATGCTGCCAAAGTTCAAAGACGGCGGAGCAATCCGCCCAATGTGGGAACTCCAACTCGAAAACGGCCATAAGG CCGCAAAATCGAGAAACGGCAACCCATATACATGGGGCTACGAGGACTGCTCTGGTTACATGTCTGCCATTGCTGACGCG 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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GAGGTCATAATGCAGGTGATGTTTTACTCACCATCAGGTCAAAAGCTCTTTGGTGAAAATGGATCACCTGCATTCCTCCT GAAAGGGGGAATCACAGATT
Product: immunity-specific protein Beta241
Products: NA
Alternate protein names: Phage Tail Tape Measure Protein; Phage Minor Tail Protein; Prophage Pi2 Protein; Tail Tape Meausure Protein; Phage-Related Minor Tail Protein; Prophage; Immunity-Specific Protein Beta
Number of amino acids: Translated: 1880; Mature: 1880
Protein sequence:
>1880_residues MDSDATYVPILASFDGFFKSIDKNAEKAGQQAATTFAESMERNLQRAERAAEKAGTVFERAHNRAADAAAKTQIAELKLL EVKEKQGAKASEVAAAEAKVEKARRDQEAADKAVAKAAKSLASAQDDVAKATQQAGDAMEVNAEKAGLFSKMTGGLGDKL GALPALAAGAVAGFAGFVAIKETLLDVGSAFDSAYDTIRIGTGASGEAFAGLQQSMRNVAANNIGIGDDMEAVGTALADI NTRLGLTGAPLEKMTAQMLQLQHMGVDADINAVSQALNGFGIEADAMPAALDSLFQVSQATGLTITELSNSAVKAGPQLR QFGFSMADSAALVGQLDKAGVNADGVLSKMSKALTTFAAEGKDAPKALNETITSIEQLVKAGNSQGAINLAEGIFGAKGA EQFVDAVQTGTLSVEDFMSATGATNDTISGLAAETASFKEHWHQFKMQAMLAIEPVATAVFNMLTPAILNLKDGFTSAIE FVENTLVPGFKKIPDVLAVTAQWLDDNRNKLIALAVAVSPIVVPFLVGLAAKWTAAGVAATVSAAKQAQAWVLTKIEAAQ ASAANIAALWTTGAGWIKAGAQAILGAGQIAGAWLLTKAQSGVSIVASIAAVGIGWVTTGIQALAGAAQVAAAWVIGLGP IAWVTAAIAAVGAGLVWFFTQTETGKQAWQSFTSALQAGWDLFSSALRTGWEMLKTAVFDAWTVRVETLKSVWEATTGAI GAGWEWLKGALYSGWMWISGNVIEGFKAGLSGLRDFFSSVVNGIKSTWATLRSALAKPVNFMINTVYNGGILKAWNVIAG LLPGLKQGNPLAGIPEHATGGRIAGPGTGTSDDVLMWGSNGEHMLTAKEVQRAGGHNAIYFMRDLIASRTPFTWDGGRFI AEHRKSVNDYGSEVKRRGIGNVDDNGLFSMLPKFKDGGAIRPMWELQLENGHKAAKSRNGNPYTWGYEDCSGYMSAIADA ILHGGRGRRAWATGSFPGGQPWAPGLGKGFSVGVHDNPGGPGGGHTAGTLTGVGPYSTVNVESGGSHGTVAYGGPAIGAD HAQFNGVRPGRFHLAIGADGAFETAGSGGVSPQAQRSMIAKAFGGVISTVMDPIAAKLPSPPPAWQTIPRGAYDSGKDAL VKGVDNAVNSIEDSLATVYRGISKIPNLLKEKGPRGIEKKAKIYDRGGILGHGEIAINHGAPERILPPALTASFDKFTTV VPQVADRFGIIADKLLGTKIRETPTAPGSLNAQVDMEKLNDQLSGLHSMADKVVPVLETVNAMGIEGLKGLTHITGAWKE YVSVENSVAKAAEDSKAANEALATARKELADLEREIAKKGPNAKGQAEDSKKLAEARKKVSDAESKAVDSSSALEKALGD VAVGQIKLALSVVSAIAEIGKAIAGAFTAVYEGQSRGWSLVSQMAEEVEKGRQKLSEMRIENANLTIQQIKAINDLRIAQ WDTHRAALNGALGIAQAQAELDKRRREGIMLGASGIDAMARAMDRYRKTGIFAIEEVTWYTEEQKRKIKAAEWKVHEARI QSAIDQLDAQGKVELAGLAAAEATLKQHTAVRLLELSAQKLSAQAASFYGVTAQGATALERMNQGKALQGKGAGSIFGGI LKGLGGAAGGAAAGFALGGPVGALLGGIAGLLFGGAGQVMNGIAEIKQGRMQESTYKKYAEEELKKLPPEVQKEIHSAGV MGGIASFFGGNGAMIASTPFEAMKIKNQFATWDYEKKLQSMEHDSSIQKQLLATQRAQIEQRLAAQKAALEAERDAAGYH AAAGEADNEGVRQAYDALAQDSARRARDLAETAQRGKSQLDEIVGRLKDLADRSAANIINQGINQTVVVKLEKTGRLHTD QDIAKALEETLNAVKGLEARVEMVEAARAPSALEAAHSQL
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: COG5280
COG function: function code S; Phage-related minor tail protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 196718; Mature: 196718
Theoretical pI: Translated: 7.05; Mature: 7.05
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDSDATYVPILASFDGFFKSIDKNAEKAGQQAATTFAESMERNLQRAERAAEKAGTVFER CCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AHNRAADAAAKTQIAELKLLEVKEKQGAKASEVAAAEAKVEKARRDQEAADKAVAKAAKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LASAQDDVAKATQQAGDAMEVNAEKAGLFSKMTGGLGDKLGALPALAAGAVAGFAGFVAI HHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KETLLDVGSAFDSAYDTIRIGTGASGEAFAGLQQSMRNVAANNIGIGDDMEAVGTALADI HHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH NTRLGLTGAPLEKMTAQMLQLQHMGVDADINAVSQALNGFGIEADAMPAALDSLFQVSQA HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH TGLTITELSNSAVKAGPQLRQFGFSMADSAALVGQLDKAGVNADGVLSKMSKALTTFAAE CCCEEECCCCHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC GKDAPKALNETITSIEQLVKAGNSQGAINLAEGIFGAKGAEQFVDAVQTGTLSVEDFMSA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH TGATNDTISGLAAETASFKEHWHQFKMQAMLAIEPVATAVFNMLTPAILNLKDGFTSAIE 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