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The map label for this gene is nrfI [H]

Identifier: 32266497

GI number: 32266497

Start: 973476

End: 976286

Strand: Direct

Name: nrfI [H]

Synonym: HH0998

Alternate gene names: 32266497

Gene position: 973476-976286 (Clockwise)

Preceding gene: 32266496

Following gene: 32266498

Centisome position: 54.11

GC content: 37.28

Gene sequence:

>2811_bases
ATGATGAATATAATTAAAACACTTTTTTGTTCAATGAAGATGGTTCTTTTGCTCATAGGCATATATGCCACAGCTTGTGG
CATAGCAACATTTATTGAAAAATATGAGGGCACACTTGCAGCTCGTTTATGGGTATATGACGCATTTTGGTTTGAGATAT
TACATATTTGGCTTGTAGCTTGTCTCATTGGCTGTTTTATCACTTCAAAAGCGTGGCAGAGAAAAAAATATGCTTCATTG
CTCTTGCACGCCTCTTTTATCGTTATCATCATTGGTGCGGGTATTACTCGTTATTATGGGTTTGAGGGCTTAATGAATTT
GCGTGAGGGACAAAGCGTGAATTTTATTTCTACAAATACCCATTATATTTTTATCCAAATCAAAAATCCTCAAGGCGATG
TAGAATCTGTAAGGATTCCCACTTATATTGATGAGAAAGTCAATCATAAAATCAATCAACATTTAACATTTTTTGGCAAA
CCTTTGACATTGCATACAGAAGAATTTACAGCAAAACAAGTAAATATGTCTGAACTTTTTATACTCAATGCGAGTATTGA
TTTTTTAGGAAAAAATGAGAAAACACTTATTATGCGCGATGGGAATAATGCACCTACAAAAGAAAACATTACTATGCTTG
AAATTGAAGGCTATAAGATATTTCTTGCGTGGGGCATAGATAATATTGCCCTCCCCTTTAGTATAAAACTTAAAAAATTT
GAACTTGAGCGATACCCGGGTTCAAACTCTCCTGCCTCATATACTTCGGAAGTAGAAGTGCTAGATGGGCAAAATCCTCC
CTTGCCTTTTAGAATCTTTATGAATAATGTATTAGACTATGGTGGTTATCGCTTTTTTCAATCCTCTTATCACCCTGATG
AAAAAGGCTCTATTCTCTCTGTTAATAATGACCCGGGCAAAACACCTACATACATAGGCTATGCTATGCTTATACTTGGC
GTGATTTGGCTACTTTTTGATAAAAACGGACGATTTGCCACACTTGGTAGATTCTTAAAAACACAAAAGTTTTTCTCACT
TATGCTTTGTAGTGCACTTTGTTATGCTTTGAGTAGCCCACAAATAGCTTATGCCTCAACACAATCACAAACTGACTTCC
AGCCTTTATCTGAAAATGAAATACCACCTTTACAAGATATCCCCTCTATGATAAAGGCATTGGCGGATACTTCAAGCCTC
ACAAATGATTTTGATAGAATCCTCGTTCAAGATTTTGGTGGGCGTATAAAGCCTATGCACACCCTTGCCAATGAGTATAT
TCATAAATTGACTCAACAAAGAACATTTAAAGGGCTCAATCCTTCACAAGTTTTCTTAGGTATGCTCTTTTATCCACAAG
AATGGCAAAGTATCCAAATGATAGCCACCAAAAGTCCAAAGCTCCGCCAGATTCTAGGATTAGACGAAAATCAAAAACAT
ATTGCTTATATTGATGTTTTTACGCCTCAAGGACAATATATTCTCCAAAACTATGTTGAAGCCGCAAACCTCAAAAGCCC
ATCTTTGCGCGATACTTTTGAAAAAGATGTAATAAGCGTAGATGAGCGCATTAATTATGCTTTCCTTATTTACACAGGGC
AGGTGCTTAGAATTTTCCCCGATAACAAATCTCCTAATAACCAATGGCTCTACCCACTTCAAGCCATAAGCAGTGCTGTG
GCACAAGATGATACAAAAAAAGCAAAAGAGTTAATGCAAATTTATAAAAAATTCGCTCAAGGTATGCAACAAGGAATAAA
TACCCATAATTGGCAAGAAGCCGCTCAAGCAACACGAGACATTCGCACATTTCAACAAAACAATGGTGGCTCTTTACTTA
TTTCGCCTGCAAAGGTAGATTCTGAAATTTGGCTTAATCTTTATAATCCATTTTATCAGCTCACCTATCCTTATATCTTC
ATAAGCATTGTGCTTTTTATCATTGTGCTTGTAGGAATTCTCAAAAATACTCCTACACGTCCGCTTATTCACAAAGTATT
TTATATTCTTTTGTTTGCGCTTTTTATTTTGCATACTTGCGGATTGGGATTGCGATGGTATGTAAGCGAACACGCCCCTT
GGAGTAATGCCTATGAATCTATGCTTTATATTGCGTGGGCAGCAATTCTCTCTGGTGTAGTATTTTTTAGGCGCTCAAAT
CTTGCATTATGCGCCTCAAGCTTTTTGGCAGGAATGACTCTCTTTGTGGCTAATCTTGGTGATATGGACCCACAAATTGG
GAATCTTATGCCCGTGCTTAAATCTTATTGGCTCAACATTCACGTCTCCGTCATCACTGCAAGTTATGGATTCTTAGGTT
TATGCTTTATGCTTGGACTTATCACACTCATTATGTTTTTGTTACGAAATGAAAAAAGATCTCAAGTGGATTGCTCAATC
CTCTCTTTAAGCGCATTGAATGAAATGAGTATGATTTTGGGCTTATTTTTGCTAAGTGTAGGGAACTTCCTTGGTGGCAT
TTGGGCTAATGAATCTTGGGGCAGATATTGGGGCTGGGATTCTAAAGAAACTTGGGCACTTATTAGTATTGGTGTATATG
CAATTATCTTACACTTGCGCTTTGTTGTGCCTAAAAACTTTCCTTTTATCTTTGCAAGCGCGTCTGTAATAGGCTTTTTC
TCAGTGCTAATGACCTATTTTGGAGTGAATTATTATCTCACAGGTATGCACAGCTATGCCGCAGGAGAAGCGGAGCCTGT
GCCTTTATGGGTAGAACTTATGGTAGCAGGGATTATACTGCTCATAATTATCGCAAGTAGAAAAAGAGTGCTTGATATGC
CCCATTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCAAAGTCAAAAATGGAAAGGAAAAGACAAAGATACAATCTCACTTGAAATTAATGAATCTCTTAGAAATGCTTTTATA
GATTTATGAAGGAGTGAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTTTTTATAATTTTACAAATTTGTATCACCATTGATAAAGGGGGAAAATAAATGAAAAAAACTATTTTATGGATACT
GGGCGTTATTCTTGCATTAA

Product: cytochrome c biogenesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 936; Mature: 936

Protein sequence:

>936_residues
MMNIIKTLFCSMKMVLLLIGIYATACGIATFIEKYEGTLAARLWVYDAFWFEILHIWLVACLIGCFITSKAWQRKKYASL
LLHASFIVIIIGAGITRYYGFEGLMNLREGQSVNFISTNTHYIFIQIKNPQGDVESVRIPTYIDEKVNHKINQHLTFFGK
PLTLHTEEFTAKQVNMSELFILNASIDFLGKNEKTLIMRDGNNAPTKENITMLEIEGYKIFLAWGIDNIALPFSIKLKKF
ELERYPGSNSPASYTSEVEVLDGQNPPLPFRIFMNNVLDYGGYRFFQSSYHPDEKGSILSVNNDPGKTPTYIGYAMLILG
VIWLLFDKNGRFATLGRFLKTQKFFSLMLCSALCYALSSPQIAYASTQSQTDFQPLSENEIPPLQDIPSMIKALADTSSL
TNDFDRILVQDFGGRIKPMHTLANEYIHKLTQQRTFKGLNPSQVFLGMLFYPQEWQSIQMIATKSPKLRQILGLDENQKH
IAYIDVFTPQGQYILQNYVEAANLKSPSLRDTFEKDVISVDERINYAFLIYTGQVLRIFPDNKSPNNQWLYPLQAISSAV
AQDDTKKAKELMQIYKKFAQGMQQGINTHNWQEAAQATRDIRTFQQNNGGSLLISPAKVDSEIWLNLYNPFYQLTYPYIF
ISIVLFIIVLVGILKNTPTRPLIHKVFYILLFALFILHTCGLGLRWYVSEHAPWSNAYESMLYIAWAAILSGVVFFRRSN
LALCASSFLAGMTLFVANLGDMDPQIGNLMPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFMLGLITLIMFLLRNEKRSQVDCSI
LSLSALNEMSMILGLFLLSVGNFLGGIWANESWGRYWGWDSKETWALISIGVYAIILHLRFVVPKNFPFIFASASVIGFF
SVLMTYFGVNYYLTGMHSYAAGEAEPVPLWVELMVAGIILLIIIASRKRVLDMPHL

Sequences:

>Translated_936_residues
MMNIIKTLFCSMKMVLLLIGIYATACGIATFIEKYEGTLAARLWVYDAFWFEILHIWLVACLIGCFITSKAWQRKKYASL
LLHASFIVIIIGAGITRYYGFEGLMNLREGQSVNFISTNTHYIFIQIKNPQGDVESVRIPTYIDEKVNHKINQHLTFFGK
PLTLHTEEFTAKQVNMSELFILNASIDFLGKNEKTLIMRDGNNAPTKENITMLEIEGYKIFLAWGIDNIALPFSIKLKKF
ELERYPGSNSPASYTSEVEVLDGQNPPLPFRIFMNNVLDYGGYRFFQSSYHPDEKGSILSVNNDPGKTPTYIGYAMLILG
VIWLLFDKNGRFATLGRFLKTQKFFSLMLCSALCYALSSPQIAYASTQSQTDFQPLSENEIPPLQDIPSMIKALADTSSL
TNDFDRILVQDFGGRIKPMHTLANEYIHKLTQQRTFKGLNPSQVFLGMLFYPQEWQSIQMIATKSPKLRQILGLDENQKH
IAYIDVFTPQGQYILQNYVEAANLKSPSLRDTFEKDVISVDERINYAFLIYTGQVLRIFPDNKSPNNQWLYPLQAISSAV
AQDDTKKAKELMQIYKKFAQGMQQGINTHNWQEAAQATRDIRTFQQNNGGSLLISPAKVDSEIWLNLYNPFYQLTYPYIF
ISIVLFIIVLVGILKNTPTRPLIHKVFYILLFALFILHTCGLGLRWYVSEHAPWSNAYESMLYIAWAAILSGVVFFRRSN
LALCASSFLAGMTLFVANLGDMDPQIGNLMPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFMLGLITLIMFLLRNEKRSQVDCSI
LSLSALNEMSMILGLFLLSVGNFLGGIWANESWGRYWGWDSKETWALISIGVYAIILHLRFVVPKNFPFIFASASVIGFF
SVLMTYFGVNYYLTGMHSYAAGEAEPVPLWVELMVAGIILLIIIASRKRVLDMPHL
>Mature_936_residues
MMNIIKTLFCSMKMVLLLIGIYATACGIATFIEKYEGTLAARLWVYDAFWFEILHIWLVACLIGCFITSKAWQRKKYASL
LLHASFIVIIIGAGITRYYGFEGLMNLREGQSVNFISTNTHYIFIQIKNPQGDVESVRIPTYIDEKVNHKINQHLTFFGK
PLTLHTEEFTAKQVNMSELFILNASIDFLGKNEKTLIMRDGNNAPTKENITMLEIEGYKIFLAWGIDNIALPFSIKLKKF
ELERYPGSNSPASYTSEVEVLDGQNPPLPFRIFMNNVLDYGGYRFFQSSYHPDEKGSILSVNNDPGKTPTYIGYAMLILG
VIWLLFDKNGRFATLGRFLKTQKFFSLMLCSALCYALSSPQIAYASTQSQTDFQPLSENEIPPLQDIPSMIKALADTSSL
TNDFDRILVQDFGGRIKPMHTLANEYIHKLTQQRTFKGLNPSQVFLGMLFYPQEWQSIQMIATKSPKLRQILGLDENQKH
IAYIDVFTPQGQYILQNYVEAANLKSPSLRDTFEKDVISVDERINYAFLIYTGQVLRIFPDNKSPNNQWLYPLQAISSAV
AQDDTKKAKELMQIYKKFAQGMQQGINTHNWQEAAQATRDIRTFQQNNGGSLLISPAKVDSEIWLNLYNPFYQLTYPYIF
ISIVLFIIVLVGILKNTPTRPLIHKVFYILLFALFILHTCGLGLRWYVSEHAPWSNAYESMLYIAWAAILSGVVFFRRSN
LALCASSFLAGMTLFVANLGDMDPQIGNLMPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFMLGLITLIMFLLRNEKRSQVDCSI
LSLSALNEMSMILGLFLLSVGNFLGGIWANESWGRYWGWDSKETWALISIGVYAIILHLRFVVPKNFPFIFASASVIGFF
SVLMTYFGVNYYLTGMHSYAAGEAEPVPLWVELMVAGIILLIIIASRKRVLDMPHL

Specific function: May play a role in cytochrome c biogenesis and may be required for maturation of the NrfA protein [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: In the C-terminal section; belongs to the ccmF/cycK/ccl1/nrfE/ccsA family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002541
- InterPro:   IPR007816 [H]

Pfam domain/function: PF01578 Cytochrom_C_asm; PF05140 ResB [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 106370; Mature: 106370

Theoretical pI: Translated: 8.33; Mature: 8.33

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MMNIIKTLFCSMKMVLLLIGIYATACGIATFIEKYEGTLAARLWVYDAFWFEILHIWLVA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CLIGCFITSKAWQRKKYASLLLHASFIVIIIGAGITRYYGFEGLMNLREGQSVNFISTNT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHCHHHHHHHCCCCCEEEEECCC
HYIFIQIKNPQGDVESVRIPTYIDEKVNHKINQHLTFFGKPLTLHTEEFTAKQVNMSELF
EEEEEEEECCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEECHHHHHHHCCHHHEE
ILNASIDFLGKNEKTLIMRDGNNAPTKENITMLEIEGYKIFLAWGIDNIALPFSIKLKKF
EEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCEEEEEEECCCCEECCEEEEEEEE
ELERYPGSNSPASYTSEVEVLDGQNPPLPFRIFMNNVLDYGGYRFFQSSYHPDEKGSILS
EHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCEEE
VNNDPGKTPTYIGYAMLILGVIWLLFDKNGRFATLGRFLKTQKFFSLMLCSALCYALSSP
ECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
QIAYASTQSQTDFQPLSENEIPPLQDIPSMIKALADTSSLTNDFDRILVQDFGGRIKPMH
CEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
TLANEYIHKLTQQRTFKGLNPSQVFLGMLFYPQEWQSIQMIATKSPKLRQILGLDENQKH
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCE
IAYIDVFTPQGQYILQNYVEAANLKSPSLRDTFEKDVISVDERINYAFLIYTGQVLRIFP
EEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCEEEEEC
DNKSPNNQWLYPLQAISSAVAQDDTKKAKELMQIYKKFAQGMQQGINTHNWQEAAQATRD
CCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
IRTFQQNNGGSLLISPAKVDSEIWLNLYNPFYQLTYPYIFISIVLFIIVLVGILKNTPTR
HHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PLIHKVFYILLFALFILHTCGLGLRWYVSEHAPWSNAYESMLYIAWAAILSGVVFFRRSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
LALCASSFLAGMTLFVANLGDMDPQIGNLMPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFMLGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
ITLIMFLLRNEKRSQVDCSILSLSALNEMSMILGLFLLSVGNFLGGIWANESWGRYWGWD
HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
SKETWALISIGVYAIILHLRFVVPKNFPFIFASASVIGFFSVLMTYFGVNYYLTGMHSYA
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEECCHHHC
AGEAEPVPLWVELMVAGIILLIIIASRKRVLDMPHL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MMNIIKTLFCSMKMVLLLIGIYATACGIATFIEKYEGTLAARLWVYDAFWFEILHIWLVA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CLIGCFITSKAWQRKKYASLLLHASFIVIIIGAGITRYYGFEGLMNLREGQSVNFISTNT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHCHHHHHHHCCCCCEEEEECCC
HYIFIQIKNPQGDVESVRIPTYIDEKVNHKINQHLTFFGKPLTLHTEEFTAKQVNMSELF
EEEEEEEECCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEECHHHHHHHCCHHHEE
ILNASIDFLGKNEKTLIMRDGNNAPTKENITMLEIEGYKIFLAWGIDNIALPFSIKLKKF
EEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCEEEEEEECCCCEECCEEEEEEEE
ELERYPGSNSPASYTSEVEVLDGQNPPLPFRIFMNNVLDYGGYRFFQSSYHPDEKGSILS
EHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCEEE
VNNDPGKTPTYIGYAMLILGVIWLLFDKNGRFATLGRFLKTQKFFSLMLCSALCYALSSP
ECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
QIAYASTQSQTDFQPLSENEIPPLQDIPSMIKALADTSSLTNDFDRILVQDFGGRIKPMH
CEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
TLANEYIHKLTQQRTFKGLNPSQVFLGMLFYPQEWQSIQMIATKSPKLRQILGLDENQKH
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCE
IAYIDVFTPQGQYILQNYVEAANLKSPSLRDTFEKDVISVDERINYAFLIYTGQVLRIFP
EEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCEEEEEC
DNKSPNNQWLYPLQAISSAVAQDDTKKAKELMQIYKKFAQGMQQGINTHNWQEAAQATRD
CCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
IRTFQQNNGGSLLISPAKVDSEIWLNLYNPFYQLTYPYIFISIVLFIIVLVGILKNTPTR
HHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PLIHKVFYILLFALFILHTCGLGLRWYVSEHAPWSNAYESMLYIAWAAILSGVVFFRRSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
LALCASSFLAGMTLFVANLGDMDPQIGNLMPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFMLGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
ITLIMFLLRNEKRSQVDCSILSLSALNEMSMILGLFLLSVGNFLGGIWANESWGRYWGWD
HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
SKETWALISIGVYAIILHLRFVVPKNFPFIFASASVIGFFSVLMTYFGVNYYLTGMHSYA
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEECCHHHC
AGEAEPVPLWVELMVAGIILLIIIASRKRVLDMPHL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10672190; 14500908 [H]