Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 32266038

Identifier: 32266038

GI number: 32266038

Start: 519753

End: 521816

Strand: Direct

Name: 32266038

Synonym: HH0539

Alternate gene names: NA

Gene position: 519753-521816 (Clockwise)

Preceding gene: 161546631

Following gene: 32266039

Centisome position: 28.89

GC content: 36.24

Gene sequence:

>2064_bases
ATGCGGAGAGATGCACTTCTTTTTGTCTTTACATTATGTTTTTTCGCAACTTTGGGTGTGTTTTGGTGGGCTTTTGAACC
AGAGCGTATAAGTCAAGAGGTGCTTGATCTCTTTCCACATAATGATGATAAAGAAGTGATTGAAGCATACAGATATTTTT
CTAGCTCTAAATATGTGCCTGTGGCGATTAAAGGCTTTGATGAAAATGCACAAAAGCGTATGCAAGATATTGTTCGCATT
ATTCAATCTCTTCCCTATGTTTCCTCTGTCATTGAAGAAAATATCCCCTTAGAAAAACAGCTCTATACCTTTTTAGCACA
AAATACTTCTTATATCCTCGCTCCACACAACGCCTCATTTGATTCTCATTCGCAATATACTCTTATTTCGCTTGAGGCGC
AAAAGATTTTCGCTCCTTTATTACACCAACTTACAAATCATTTTGCATCTTCTGCTCCGCCAGCCTCCTCTACCCTTATA
GCAAAAGATTATGGCTTAATGGTATTAGTAGAGCTTGCAAACCTTGAAGATGAAGCTATTAAATCCACGCTACAAAGCTT
TAAAGCCATAGCTCAAGATTATCCTGATATGCGCTATTTTTCGTCTGATTTTATGCGTGTAGAGAATCTAGAATTAATTT
TAAATGAAGTAAATTTTCTTTTAGGTTTTGCCTCATTTGTATTTGTATTGCTGTATTTTGTGATTATTCGCATACCACTT
TTGACTTTTTATACTATTTGCACACTCATTCTCTCTAATGCCCTTGCAATTTTGCTTACCCTTTGCATATATCCAAAAGT
TACGATTATGGCATTAAGCTTTGGTATGGGCATTTCAAATATTGCCATTGATTATATGATGCATCATCACTTCTTTGGGC
TTTATACACAAAGTGCGGCTTTTCGTAAGCAATCTTCATATCCTCGTCCACCATTTAATCTTCCTGTGTTTTATGGTTAT
TTTACAACAATGGTAGGCTTTGGTGCGTGTTTGTTTATCCCTTTTCCTCTCTTATCACAACTTGCTCTTTATGCAATGAT
TTCTTTAAGCGTAGCATATATTAACTTCGCATTCATATATCCACGCATAGGTTTTAAGCCACCACGACTTTTTAGTGTAA
TTTCGGCATTGAGGAAACCCTTTATCCCGAGTATTGTATTTTTAAGCATAGCGCTAATAGGTTTTATCTACATAAGCACA
CAACTTAAACTTGATTTTGACCTCTCTAAACTTGATTATCAAAATAAACCTATGCTCAAAGAAAGAGCATTTTTTGCGCA
CATTCAAGACAAAGATGAAAATGATGTATTACTCTTTGCAGATAAAAGTGAGGGGCTTATGCTCTTTGTGCGTGGGCTTA
TACAATCCACAGGTGCGATAAACTTCAGACAAAGTGAAGGAGAATCTCATTTAGAGAAATATTATTATCTCGTGCATATG
TCAAAACCCCAAATTGTTAAGACACAAGAACTTTTAAAATCTCTGCAAGCAGCTGATAGCGATTCTAAAGACACTACAAA
ATTACAAGAAAATGTGCAAAGTCTGTGGAGCGTAGAAGAGCAAGAAAAAATTGCACAATCTAATGTGCACCTTGACGCAC
GCCCTTTGCAAAGCATTATGGATAACTTAGCAGATTCTATCTACCAACCTATGCTTATCGTGCTTGGCATTGCGCTATGC
CTTATGCTCTTAACCCTTGCATTTAGCACACATAAAGCATTTTTAAGTGCGGCAAGCTTTGTGCTTTTTCCTTTGAGTAT
GGCACTCTGTGTCATATCAAGCCATAGCGTATTAAATATGATGCACCTTTTCGCTTTGCTCATTTTAGTAGTTGTAAGTG
TGGATTATGGAATCTATGCCATAAAAGAAGGGGATAATCCACGTTCAACTCACGCTATTGTATTTTCTGCACTTACTACA
GGCTTGAGCTTTGGGATCTTGATGATCTCAAACACAAAAGCTCTTAATTCTTTTGGAGAAGTTATTTTCAGCGGAATGAG
TTGTATATTATTATTGCTTATATGCGGACGCTTTAAACACAAAGCAATTAAACAAATAATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACATTTCCGCATTAGCCATAACTTGCTTTGATTTTTGGTGCAAAATAAAATTAATAATAGAATTCTGCTATAATCAAAAG
TCTATACTCAAAGGATAAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTCTTAATCTAAACCCATACAAAAGGAATAAAATGAAACAAAAAATGCCCATATGGAAAAAAATTTTAAGAGAAATATC
ACGCCCATTTTATCAAATGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 687; Mature: 687

Protein sequence:

>687_residues
MRRDALLFVFTLCFFATLGVFWWAFEPERISQEVLDLFPHNDDKEVIEAYRYFSSSKYVPVAIKGFDENAQKRMQDIVRI
IQSLPYVSSVIEENIPLEKQLYTFLAQNTSYILAPHNASFDSHSQYTLISLEAQKIFAPLLHQLTNHFASSAPPASSTLI
AKDYGLMVLVELANLEDEAIKSTLQSFKAIAQDYPDMRYFSSDFMRVENLELILNEVNFLLGFASFVFVLLYFVIIRIPL
LTFYTICTLILSNALAILLTLCIYPKVTIMALSFGMGISNIAIDYMMHHHFFGLYTQSAAFRKQSSYPRPPFNLPVFYGY
FTTMVGFGACLFIPFPLLSQLALYAMISLSVAYINFAFIYPRIGFKPPRLFSVISALRKPFIPSIVFLSIALIGFIYIST
QLKLDFDLSKLDYQNKPMLKERAFFAHIQDKDENDVLLFADKSEGLMLFVRGLIQSTGAINFRQSEGESHLEKYYYLVHM
SKPQIVKTQELLKSLQAADSDSKDTTKLQENVQSLWSVEEQEKIAQSNVHLDARPLQSIMDNLADSIYQPMLIVLGIALC
LMLLTLAFSTHKAFLSAASFVLFPLSMALCVISSHSVLNMMHLFALLILVVVSVDYGIYAIKEGDNPRSTHAIVFSALTT
GLSFGILMISNTKALNSFGEVIFSGMSCILLLLICGRFKHKAIKQII

Sequences:

>Translated_687_residues
MRRDALLFVFTLCFFATLGVFWWAFEPERISQEVLDLFPHNDDKEVIEAYRYFSSSKYVPVAIKGFDENAQKRMQDIVRI
IQSLPYVSSVIEENIPLEKQLYTFLAQNTSYILAPHNASFDSHSQYTLISLEAQKIFAPLLHQLTNHFASSAPPASSTLI
AKDYGLMVLVELANLEDEAIKSTLQSFKAIAQDYPDMRYFSSDFMRVENLELILNEVNFLLGFASFVFVLLYFVIIRIPL
LTFYTICTLILSNALAILLTLCIYPKVTIMALSFGMGISNIAIDYMMHHHFFGLYTQSAAFRKQSSYPRPPFNLPVFYGY
FTTMVGFGACLFIPFPLLSQLALYAMISLSVAYINFAFIYPRIGFKPPRLFSVISALRKPFIPSIVFLSIALIGFIYIST
QLKLDFDLSKLDYQNKPMLKERAFFAHIQDKDENDVLLFADKSEGLMLFVRGLIQSTGAINFRQSEGESHLEKYYYLVHM
SKPQIVKTQELLKSLQAADSDSKDTTKLQENVQSLWSVEEQEKIAQSNVHLDARPLQSIMDNLADSIYQPMLIVLGIALC
LMLLTLAFSTHKAFLSAASFVLFPLSMALCVISSHSVLNMMHLFALLILVVVSVDYGIYAIKEGDNPRSTHAIVFSALTT
GLSFGILMISNTKALNSFGEVIFSGMSCILLLLICGRFKHKAIKQII
>Mature_687_residues
MRRDALLFVFTLCFFATLGVFWWAFEPERISQEVLDLFPHNDDKEVIEAYRYFSSSKYVPVAIKGFDENAQKRMQDIVRI
IQSLPYVSSVIEENIPLEKQLYTFLAQNTSYILAPHNASFDSHSQYTLISLEAQKIFAPLLHQLTNHFASSAPPASSTLI
AKDYGLMVLVELANLEDEAIKSTLQSFKAIAQDYPDMRYFSSDFMRVENLELILNEVNFLLGFASFVFVLLYFVIIRIPL
LTFYTICTLILSNALAILLTLCIYPKVTIMALSFGMGISNIAIDYMMHHHFFGLYTQSAAFRKQSSYPRPPFNLPVFYGY
FTTMVGFGACLFIPFPLLSQLALYAMISLSVAYINFAFIYPRIGFKPPRLFSVISALRKPFIPSIVFLSIALIGFIYIST
QLKLDFDLSKLDYQNKPMLKERAFFAHIQDKDENDVLLFADKSEGLMLFVRGLIQSTGAINFRQSEGESHLEKYYYLVHM
SKPQIVKTQELLKSLQAADSDSKDTTKLQENVQSLWSVEEQEKIAQSNVHLDARPLQSIMDNLADSIYQPMLIVLGIALC
LMLLTLAFSTHKAFLSAASFVLFPLSMALCVISSHSVLNMMHLFALLILVVVSVDYGIYAIKEGDNPRSTHAIVFSALTT
GLSFGILMISNTKALNSFGEVIFSGMSCILLLLICGRFKHKAIKQII

Specific function: Unknown

COG id: COG4258

COG function: function code R; Predicted exporter

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77713; Mature: 77713

Theoretical pI: Translated: 6.86; Mature: 6.86

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRRDALLFVFTLCFFATLGVFWWAFEPERISQEVLDLFPHNDDKEVIEAYRYFSSSKYVP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEE
VAIKGFDENAQKRMQDIVRIIQSLPYVSSVIEENIPLEKQLYTFLAQNTSYILAPHNASF
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCC
DSHSQYTLISLEAQKIFAPLLHQLTNHFASSAPPASSTLIAKDYGLMVLVELANLEDEAI
CCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEHHCCCHHHH
KSTLQSFKAIAQDYPDMRYFSSDFMRVENLELILNEVNFLLGFASFVFVLLYFVIIRIPL
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTFYTICTLILSNALAILLTLCIYPKVTIMALSFGMGISNIAIDYMMHHHFFGLYTQSAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FRKQSSYPRPPFNLPVFYGYFTTMVGFGACLFIPFPLLSQLALYAMISLSVAYINFAFIY
HHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
PRIGFKPPRLFSVISALRKPFIPSIVFLSIALIGFIYISTQLKLDFDLSKLDYQNKPMLK
CCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECHHHCCCCCCCCHH
ERAFFAHIQDKDENDVLLFADKSEGLMLFVRGLIQSTGAINFRQSEGESHLEKYYYLVHM
HHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHEEEEEEC
SKPQIVKTQELLKSLQAADSDSKDTTKLQENVQSLWSVEEQEKIAQSNVHLDARPLQSIM
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
DNLADSIYQPMLIVLGIALCLMLLTLAFSTHKAFLSAASFVLFPLSMALCVISSHSVLNM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
MHLFALLILVVVSVDYGIYAIKEGDNPRSTHAIVFSALTTGLSFGILMISNTKALNSFGE
HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHH
VIFSGMSCILLLLICGRFKHKAIKQII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MRRDALLFVFTLCFFATLGVFWWAFEPERISQEVLDLFPHNDDKEVIEAYRYFSSSKYVP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEE
VAIKGFDENAQKRMQDIVRIIQSLPYVSSVIEENIPLEKQLYTFLAQNTSYILAPHNASF
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCC
DSHSQYTLISLEAQKIFAPLLHQLTNHFASSAPPASSTLIAKDYGLMVLVELANLEDEAI
CCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEHHCCCHHHH
KSTLQSFKAIAQDYPDMRYFSSDFMRVENLELILNEVNFLLGFASFVFVLLYFVIIRIPL
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTFYTICTLILSNALAILLTLCIYPKVTIMALSFGMGISNIAIDYMMHHHFFGLYTQSAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FRKQSSYPRPPFNLPVFYGYFTTMVGFGACLFIPFPLLSQLALYAMISLSVAYINFAFIY
HHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
PRIGFKPPRLFSVISALRKPFIPSIVFLSIALIGFIYISTQLKLDFDLSKLDYQNKPMLK
CCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECHHHCCCCCCCCHH
ERAFFAHIQDKDENDVLLFADKSEGLMLFVRGLIQSTGAINFRQSEGESHLEKYYYLVHM
HHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHEEEEEEC
SKPQIVKTQELLKSLQAADSDSKDTTKLQENVQSLWSVEEQEKIAQSNVHLDARPLQSIM
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
DNLADSIYQPMLIVLGIALCLMLLTLAFSTHKAFLSAASFVLFPLSMALCVISSHSVLNM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
MHLFALLILVVVSVDYGIYAIKEGDNPRSTHAIVFSALTTGLSFGILMISNTKALNSFGE
HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHH
VIFSGMSCILLLLICGRFKHKAIKQII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA