Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yjgN

Identifier: 30065456

GI number: 30065456

Start: 4398840

End: 4400036

Strand: Reverse

Name: yjgN

Synonym: S4493

Alternate gene names: 30065456

Gene position: 4400036-4398840 (Counterclockwise)

Preceding gene: 30065457

Following gene: 30065452

Centisome position: 95.67

GC content: 37.26

Gene sequence:

>1197_bases
ATGGCTCAAGTTATTAATGAAATGGATGTTCCGTCCCATTCTTTTGTTTTTCATGGTACAGGTGAGAGATATTTTCTTAT
TTGTGTGGTGAATGTGTTGTTAACGATTATAACGCTAGGTATCTATTTACCATGGGCATTAATGAAATGTAAGCGTTATC
TTTATGCTAATATGGAAGTTAACGGACAACGATTTTCTTATGGAATTACCGGTGGGAATGTTTTTGTTAGTTGTCTTGTT
TTTGTTTTTTTCTATTTCGCAATCTTAATGACAGTGTCAGCAGATATGCCGCTTGTTGGCTGTGTTTTGACTTTGTTACT
GTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTTATCAGGCCTTAATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTA
GTTTTAATTGCTCTTTGAAAGGGTTCTGGTGGGTAACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGATGGGGACTGTT
TTCTTTATCTCGACAAAGATGCTACATGCCAATAGTTCAAGTAGTGTTATTATATCTGTGGTTCTGATGGCAATAGTTGG
TATTGTTTCCATTGGTATTTTTAATGGTACTTTATATAGCCTGGTAATGAGTTTTCTCTGGAGCAATACCAGTTTCGGTA
TACATCGTTTCAAGGTGAAATTAGATACTGCGTATTGTATAAAATATGCCATCCTCGCATTTTTAGCTTTATTACCTTTT
CTCGCTGTTGCTGGTTATATTATCTTCGATCAAATATTAAATGAGTATGATAGTTCTGGGTATGCAAATGATGATATTGA
GAATTTACAGCAATTTATGGAAATGCAACGTAAAATGATAATCGCGCAGTTAATTTATTATTTTGGGATTGCTGTTAGCA
CCAGTTATTTAACGGTGTCGTTGCGAAATCATTTTATGAGCAACCTGTCACTGAATGATGGGCGTATTCGTTTTCGCTCA
ACTTTAACGTACCACGGTATGCTTTATCGCATGTGTGCGTTGGTGGTGATATCCGGGATTACGGGTGGTCTGGCTTACCC
ACTGCTGAAAATATGGATGATTGACTGGCAGGCAAAAAATACGTATTTGCTGGGCGATTTGGATGACCTTCCTTTAATCA
ATAAAGAAGAACAACCAGATAAAGGCTTCTTAGCCAGTATTTCTCGGGGAGTTATGCCTTCTTTACCATTTCTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCCAGCCTATTACTGATAAGAGTATTGTAACGTGGCAGAACATTTTACTGTCTGTATCTATAAATTATATCAATGGATT
TTTTAATTCAGGGGATTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAGATAAAAAAGGCCGGAGCATGCTCCGGCCTTCGTTTTCATCACTGTGTTGATTACAGTGCGGCGATAACAGCCTGCTG
TTCAATCAGCTTGGCTTTCG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 398; Mature: 397

Protein sequence:

>398_residues
MAQVINEMDVPSHSFVFHGTGERYFLICVVNVLLTIITLGIYLPWALMKCKRYLYANMEVNGQRFSYGITGGNVFVSCLV
FVFFYFAILMTVSADMPLVGCVLTLLLLVLLIFMAAKGLRYQALMTSLNGVRFSFNCSLKGFWWVTFFLPILMAIGMGTV
FFISTKMLHANSSSSVIISVVLMAIVGIVSIGIFNGTLYSLVMSFLWSNTSFGIHRFKVKLDTAYCIKYAILAFLALLPF
LAVAGYIIFDQILNEYDSSGYANDDIENLQQFMEMQRKMIIAQLIYYFGIAVSTSYLTVSLRNHFMSNLSLNDGRIRFRS
TLTYHGMLYRMCALVVISGITGGLAYPLLKIWMIDWQAKNTYLLGDLDDLPLINKEEQPDKGFLASISRGVMPSLPFL

Sequences:

>Translated_398_residues
MAQVINEMDVPSHSFVFHGTGERYFLICVVNVLLTIITLGIYLPWALMKCKRYLYANMEVNGQRFSYGITGGNVFVSCLV
FVFFYFAILMTVSADMPLVGCVLTLLLLVLLIFMAAKGLRYQALMTSLNGVRFSFNCSLKGFWWVTFFLPILMAIGMGTV
FFISTKMLHANSSSSVIISVVLMAIVGIVSIGIFNGTLYSLVMSFLWSNTSFGIHRFKVKLDTAYCIKYAILAFLALLPF
LAVAGYIIFDQILNEYDSSGYANDDIENLQQFMEMQRKMIIAQLIYYFGIAVSTSYLTVSLRNHFMSNLSLNDGRIRFRS
TLTYHGMLYRMCALVVISGITGGLAYPLLKIWMIDWQAKNTYLLGDLDDLPLINKEEQPDKGFLASISRGVMPSLPFL
>Mature_397_residues
AQVINEMDVPSHSFVFHGTGERYFLICVVNVLLTIITLGIYLPWALMKCKRYLYANMEVNGQRFSYGITGGNVFVSCLVF
VFFYFAILMTVSADMPLVGCVLTLLLLVLLIFMAAKGLRYQALMTSLNGVRFSFNCSLKGFWWVTFFLPILMAIGMGTVF
FISTKMLHANSSSSVIISVVLMAIVGIVSIGIFNGTLYSLVMSFLWSNTSFGIHRFKVKLDTAYCIKYAILAFLALLPFL
AVAGYIIFDQILNEYDSSGYANDDIENLQQFMEMQRKMIIAQLIYYFGIAVSTSYLTVSLRNHFMSNLSLNDGRIRFRST
LTYHGMLYRMCALVVISGITGGLAYPLLKIWMIDWQAKNTYLLGDLDDLPLINKEEQPDKGFLASISRGVMPSLPFL

Specific function: Unknown

COG id: COG4269

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI48995003, Length=398, Percent_Identity=97.7386934673367, Blast_Score=693, Evalue=0.0,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010295 [H]

Pfam domain/function: PF05987 DUF898 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44828; Mature: 44697

Theoretical pI: Translated: 8.59; Mature: 8.59

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
5.3 %Met     (Translated Protein)
7.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
5.0 %Met     (Mature Protein)
6.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAQVINEMDVPSHSFVFHGTGERYFLICVVNVLLTIITLGIYLPWALMKCKRYLYANMEV
CCCHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEE
NGQRFSYGITGGNVFVSCLVFVFFYFAILMTVSADMPLVGCVLTLLLLVLLIFMAAKGLR
CCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
YQALMTSLNGVRFSFNCSLKGFWWVTFFLPILMAIGMGTVFFISTKMLHANSSSSVIISV
HHHHHHHHCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHH
VLMAIVGIVSIGIFNGTLYSLVMSFLWSNTSFGIHRFKVKLDTAYCIKYAILAFLALLPF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVAGYIIFDQILNEYDSSGYANDDIENLQQFMEMQRKMIIAQLIYYFGIAVSTSYLTVS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRNHFMSNLSLNDGRIRFRSTLTYHGMLYRMCALVVISGITGGLAYPLLKIWMIDWQAKN
HHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEEEECCC
TYLLGDLDDLPLINKEEQPDKGFLASISRGVMPSLPFL
EEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AQVINEMDVPSHSFVFHGTGERYFLICVVNVLLTIITLGIYLPWALMKCKRYLYANMEV
CCHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEE
NGQRFSYGITGGNVFVSCLVFVFFYFAILMTVSADMPLVGCVLTLLLLVLLIFMAAKGLR
CCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
YQALMTSLNGVRFSFNCSLKGFWWVTFFLPILMAIGMGTVFFISTKMLHANSSSSVIISV
HHHHHHHHCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHH
VLMAIVGIVSIGIFNGTLYSLVMSFLWSNTSFGIHRFKVKLDTAYCIKYAILAFLALLPF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVAGYIIFDQILNEYDSSGYANDDIENLQQFMEMQRKMIIAQLIYYFGIAVSTSYLTVS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRNHFMSNLSLNDGRIRFRSTLTYHGMLYRMCALVVISGITGGLAYPLLKIWMIDWQAKN
HHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEEEECCC
TYLLGDLDDLPLINKEEQPDKGFLASISRGVMPSLPFL
EEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]