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The map label for this gene is yaaJ [C]

Identifier: 28210864

GI number: 28210864

Start: 1250908

End: 1252284

Strand: Direct

Name: yaaJ [C]

Synonym: CTC01172

Alternate gene names: 28210864

Gene position: 1250908-1252284 (Clockwise)

Preceding gene: 28210863

Following gene: 28210865

Centisome position: 44.69

GC content: 32.46

Gene sequence:

>1377_bases
ATGAAATTTCTAGAGGAATTTTTTAGAAACTTCTCAAATTTAATTTGGGGAAATTGGCTTATAATTACCTTAATTAGTAT
TGGCATATATTACACTATCATGACAGGATTTATTCAGATAAGAAAAATTCCTTTTATTTTTCGAGAAACTATTGTTAAAT
CATTTATAAAGAAAAATAAGAAAAAGTTAACTGGGGAAGGGACCCTTACACCATTCCAAGCCTTATGTGCAGCTTTGGCA
AGTTGTGTGGGAAATGGTAACATTGTAGGAGTAGCTACAGCTTTAGTATCAGGAGGACCGGGAGCTATATTTTGGATGTG
GATTGCTGGAATTTTAGGAATGGCAACAAAGTTTGGAGAAATAGTTATAGGAATGATATATAGGGAGAAGTCTGAAGATG
GAACTTATGTTGGAGGTCCTATGTATTATATTTCTAAAGGGTTAAAAATGCCATGGTTAGCCAATTTATATGCAGTTTTG
ATGGTACTTCAAATCTGTGGTGGAAATTTAATACAATCTAATGCGGTGGCGGGAGTAGTTGAAAATATTATAGGTATTCC
TCCAGCAATTACAGCAATCATTCTTGTTTTTTCTGTTGGACTTGTTGTTATAGGAGGGATTAAAAGATTAGGATCCTTTG
CAGAAAGAGTAGTGCCTTTTATGGCTGGGATTTATATAATATGTGGTATAATTGTAATCATTTTCAACATAAAAACAATT
CCCATTGTGTTTGCAAGCATATTTAAAAGTGCTTTTAATATAAAAGCTGGAGTAGCAGGTGTAGTAGGTTATTCTATTAG
ACAATCTATGAGATATGGAGTAGCTAGAGGGCTTTATTCCAATGAAGCAGGAGAAGGATCTGCTCCAGTTTTACATGCCT
CAGCAATTACAGATCATCCAGTTAGACAAGGACTCTATGGTATTACAGAGGTACTAATAGATACCATAGTTGTCTGTACT
ATAACAGGTTTATCTATTTTAAGTACTGGTGTTATCGAATCAGGACATCAGGCTTCTATACTTACTAGTATGGCATTTGG
TCAGGTTCATCCTATATTTAAAGATATAGTTGGAATATGTATGATTTTATTTGCTTATTCCACTATTCCAGTTCAATGTT
ATTTTGGAACAGTAGGAGTAAATTATTTATTAGGAAGTAAAAAAGCTTATTATTTTAGATATCCATTTATCTTTTTTACG
GCACTAGGTTGTATTAGCAGTTTATCATTGGTTTGGCACATTCAAGACTGCATTTTAGGATTGTTAATTATTCCTAATCT
AGCTGCAATTGTATATTTAAGTCCACAAGTATTTAAGTTAACTAGAGAGTTTTTTAATCCTGTAAATGAATATATATTTG
ATGATAATGAAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGATAATTACTGATTCTAAAATTAAGAAAAATGTTTTAGAAAAATATTTGAATAATGGAATAGAAGTGATAAATATATA
GATATGAAAGGAGAAATTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGAATGAGTTTTTATATGAAAATATCTCTTAAAGCACCTATAGAGGGCTGTAGGAGATATTTTTTTACTTTCACATAAT
TTCCAAATTTGAAGATACTT

Product: Na(+)-linked D-alanine glycine permease

Products: Na (I) [Cytoplasm]; L-alanine [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 458; Mature: 458

Protein sequence:

>458_residues
MKFLEEFFRNFSNLIWGNWLIITLISIGIYYTIMTGFIQIRKIPFIFRETIVKSFIKKNKKKLTGEGTLTPFQALCAALA
SCVGNGNIVGVATALVSGGPGAIFWMWIAGILGMATKFGEIVIGMIYREKSEDGTYVGGPMYYISKGLKMPWLANLYAVL
MVLQICGGNLIQSNAVAGVVENIIGIPPAITAIILVFSVGLVVIGGIKRLGSFAERVVPFMAGIYIICGIIVIIFNIKTI
PIVFASIFKSAFNIKAGVAGVVGYSIRQSMRYGVARGLYSNEAGEGSAPVLHASAITDHPVRQGLYGITEVLIDTIVVCT
ITGLSILSTGVIESGHQASILTSMAFGQVHPIFKDIVGICMILFAYSTIPVQCYFGTVGVNYLLGSKKAYYFRYPFIFFT
ALGCISSLSLVWHIQDCILGLLIIPNLAAIVYLSPQVFKLTREFFNPVNEYIFDDNEE

Sequences:

>Translated_458_residues
MKFLEEFFRNFSNLIWGNWLIITLISIGIYYTIMTGFIQIRKIPFIFRETIVKSFIKKNKKKLTGEGTLTPFQALCAALA
SCVGNGNIVGVATALVSGGPGAIFWMWIAGILGMATKFGEIVIGMIYREKSEDGTYVGGPMYYISKGLKMPWLANLYAVL
MVLQICGGNLIQSNAVAGVVENIIGIPPAITAIILVFSVGLVVIGGIKRLGSFAERVVPFMAGIYIICGIIVIIFNIKTI
PIVFASIFKSAFNIKAGVAGVVGYSIRQSMRYGVARGLYSNEAGEGSAPVLHASAITDHPVRQGLYGITEVLIDTIVVCT
ITGLSILSTGVIESGHQASILTSMAFGQVHPIFKDIVGICMILFAYSTIPVQCYFGTVGVNYLLGSKKAYYFRYPFIFFT
ALGCISSLSLVWHIQDCILGLLIIPNLAAIVYLSPQVFKLTREFFNPVNEYIFDDNEE
>Mature_458_residues
MKFLEEFFRNFSNLIWGNWLIITLISIGIYYTIMTGFIQIRKIPFIFRETIVKSFIKKNKKKLTGEGTLTPFQALCAALA
SCVGNGNIVGVATALVSGGPGAIFWMWIAGILGMATKFGEIVIGMIYREKSEDGTYVGGPMYYISKGLKMPWLANLYAVL
MVLQICGGNLIQSNAVAGVVENIIGIPPAITAIILVFSVGLVVIGGIKRLGSFAERVVPFMAGIYIICGIIVIIFNIKTI
PIVFASIFKSAFNIKAGVAGVVGYSIRQSMRYGVARGLYSNEAGEGSAPVLHASAITDHPVRQGLYGITEVLIDTIVVCT
ITGLSILSTGVIESGHQASILTSMAFGQVHPIFKDIVGICMILFAYSTIPVQCYFGTVGVNYLLGSKKAYYFRYPFIFFT
ALGCISSLSLVWHIQDCILGLLIIPNLAAIVYLSPQVFKLTREFFNPVNEYIFDDNEE

Specific function: Unknown

COG id: COG1115

COG function: function code E; Na+/alanine symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:alanine (SAF) symporter family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786188, Length=462, Percent_Identity=33.3333333333333, Blast_Score=236, Evalue=2e-63,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001463 [H]

Pfam domain/function: PF01235 Na_Ala_symp [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49925; Mature: 49925

Theoretical pI: Translated: 8.83; Mature: 8.83

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.0 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
2.0 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Na (I) [Periplasm]; L-alanine [Periplasm] [C]

Specific reaction: Na (I) [Periplasm] + L-alanine [Periplasm] = Na (I) [Cytoplasm] + L-alanine [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]