| Definition | Clostridium tetani E88 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004557 |
| Length | 2,799,251 |
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The map label for this gene is yjbB [H]
Identifier: 28210590
GI number: 28210590
Start: 931494
End: 933143
Strand: Direct
Name: yjbB [H]
Synonym: CTC00877
Alternate gene names: 28210590
Gene position: 931494-933143 (Clockwise)
Preceding gene: 28210589
Following gene: 28210591
Centisome position: 33.28
GC content: 32.06
Gene sequence:
>1650_bases ATGGACATTTGGTCAATGCTTGTAGGGCTTTTTGGAGGTCTAGGACTTTTCCTATATGGAATGAAGATAATGGGAGATGG ACTAGAAAACGTAGCAGGTGACAAGCTGAAAGGTTTTTTTGAAAAGATAGCTTCTAATCCAATAAAAGCAGTTTTAACTG GTGTGGTAGTTACTGCAGTTATTCAAAGTAGTAGTGCGACAACAGTAATGGTAATAGGTTTTGTTAATGCAGGGCTTATG AATTTATTCCAAGCAACAGGTGTAATAATGGGAGCTAATATAGGAACTACTGTAACAGGGCAATTGGTAGCTCTTAATCT AACTGGCATAGCACCTATATTTATAGGTGTTGGTGCTATAATGCTTTTATTTTCTAAAGGAAATAAAATTAAAGATATAG GAAGTATAGTGCTAGGATTTGGTATGTTATTCTTAGGAATGAAGACTATGTCATCTTCTATGGCACCTTTAGCAGACTCA GAAGGATTTAAATCTGTAATAGCTACATTAGCTTTTAATCCAATTTTAGGAGTATTAGTAGGGATAGGTTTAACAGCTAT AGTACAGAGCTCATCAGCAACTATTGGTATATTAATAGTATTAGCTAATAATGGTGCATTACCTGTACATGTTGCCCTAC CTGTGTTATTTGGTGATAATATAGGTACTTGTGTAACCGCTCTTTTATCTAGTGTTGGAACTAATAGAAATGCACGAAGA GCAGCAACTATACATCTAACTTTTAATATAATTGGTACCGTAATATTTGTATTATTATTGACGCCTGTAAGTAATCTCGT AGGATACATAACGCCAGGTGATGTGGGAAAACAAATAGCTAATGCACATACATTTTTTAACATAGCAAATGTAATTATAC AAATACCTTTTATTAAATATCTTGTGGCCTTTGTAAATAAAGTAATACCTCAAGAAGAAGAAGAAGAGGTATTGGGAATA AAGTATATAGACGACAGATTGTTAGAAACACCTGTAATAGCGGTAGGACAATGTAGTAAAGAAATAGTCAGAATGGCTGA AAAATCTAAAGAAATATTAGAACAAGCAGTGGAATCTTTACATACTGGAGACGAAGAATTAATAAAAAAAGCTATGGAAG GTGAAGACTTTGTAGATTTACTAGAAGAGGAGATAACTAAGTATTTAGTAAAACTTTCAAACACTCAAATATCTACAAAG GAGATAGATGTTGTAACGTCTATGTTTAGAGTGGTTAAAGATATAGAACGTATAGGAGACCATGGTAAAAATATTGCAGA CTTATCTTCAGAAAAGATATCTAAAAGACTTATTTTCTCTGAAGCGGCTATGAAAGAATTATCTGAAATATATAAATGTG TTATACTGGCTTTAGAGAAGACTATATTAAGTTTTCAAAATAACGACATAGAATTAGCAAGTGAGGTTTATGTATTAGAA GATAAAATAGATGAACTTCAAGATAAGTCTAGGGATAATGATATAAAGAGATTGAATTCTCAAGCTTGTGAAGCAAGAGT TAGTGCTATATATTTAGATATAATAAGCAATTTTGAAAGAGTAGGGGATCACTCTTTAAATATTGCTGAAGTTGTATTAA ATTTAAATAATAATTTAAAAAAGATTGAAGAAGCTTCGATGGGAAGATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGTGTTGAATTAATGTATATTAAAATTAGTAAAACAAAAGTAAAGCATGTAAACAATCCATAATGTTTGGACAGTTTAAA TTATTGGAGGGAATAATTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATAAGGATGCATATTATGCATCCTTATTTTTATCTTCTATAGTATCTTCAATAGCAATCTCTTCATTATTAGATATTT CTTCATTTACATCTTCATCT
Product: sodium-dependent phosphate transport protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 549; Mature: 549
Protein sequence:
>549_residues MDIWSMLVGLFGGLGLFLYGMKIMGDGLENVAGDKLKGFFEKIASNPIKAVLTGVVVTAVIQSSSATTVMVIGFVNAGLM NLFQATGVIMGANIGTTVTGQLVALNLTGIAPIFIGVGAIMLLFSKGNKIKDIGSIVLGFGMLFLGMKTMSSSMAPLADS EGFKSVIATLAFNPILGVLVGIGLTAIVQSSSATIGILIVLANNGALPVHVALPVLFGDNIGTCVTALLSSVGTNRNARR AATIHLTFNIIGTVIFVLLLTPVSNLVGYITPGDVGKQIANAHTFFNIANVIIQIPFIKYLVAFVNKVIPQEEEEEVLGI KYIDDRLLETPVIAVGQCSKEIVRMAEKSKEILEQAVESLHTGDEELIKKAMEGEDFVDLLEEEITKYLVKLSNTQISTK EIDVVTSMFRVVKDIERIGDHGKNIADLSSEKISKRLIFSEAAMKELSEIYKCVILALEKTILSFQNNDIELASEVYVLE DKIDELQDKSRDNDIKRLNSQACEARVSAIYLDIISNFERVGDHSLNIAEVVLNLNNNLKKIEEASMGR
Sequences:
>Translated_549_residues MDIWSMLVGLFGGLGLFLYGMKIMGDGLENVAGDKLKGFFEKIASNPIKAVLTGVVVTAVIQSSSATTVMVIGFVNAGLM NLFQATGVIMGANIGTTVTGQLVALNLTGIAPIFIGVGAIMLLFSKGNKIKDIGSIVLGFGMLFLGMKTMSSSMAPLADS EGFKSVIATLAFNPILGVLVGIGLTAIVQSSSATIGILIVLANNGALPVHVALPVLFGDNIGTCVTALLSSVGTNRNARR AATIHLTFNIIGTVIFVLLLTPVSNLVGYITPGDVGKQIANAHTFFNIANVIIQIPFIKYLVAFVNKVIPQEEEEEVLGI KYIDDRLLETPVIAVGQCSKEIVRMAEKSKEILEQAVESLHTGDEELIKKAMEGEDFVDLLEEEITKYLVKLSNTQISTK EIDVVTSMFRVVKDIERIGDHGKNIADLSSEKISKRLIFSEAAMKELSEIYKCVILALEKTILSFQNNDIELASEVYVLE DKIDELQDKSRDNDIKRLNSQACEARVSAIYLDIISNFERVGDHSLNIAEVVLNLNNNLKKIEEASMGR >Mature_549_residues MDIWSMLVGLFGGLGLFLYGMKIMGDGLENVAGDKLKGFFEKIASNPIKAVLTGVVVTAVIQSSSATTVMVIGFVNAGLM NLFQATGVIMGANIGTTVTGQLVALNLTGIAPIFIGVGAIMLLFSKGNKIKDIGSIVLGFGMLFLGMKTMSSSMAPLADS EGFKSVIATLAFNPILGVLVGIGLTAIVQSSSATIGILIVLANNGALPVHVALPVLFGDNIGTCVTALLSSVGTNRNARR AATIHLTFNIIGTVIFVLLLTPVSNLVGYITPGDVGKQIANAHTFFNIANVIIQIPFIKYLVAFVNKVIPQEEEEEVLGI KYIDDRLLETPVIAVGQCSKEIVRMAEKSKEILEQAVESLHTGDEELIKKAMEGEDFVDLLEEEITKYLVKLSNTQISTK EIDVVTSMFRVVKDIERIGDHGKNIADLSSEKISKRLIFSEAAMKELSEIYKCVILALEKTILSFQNNDIELASEVYVLE DKIDELQDKSRDNDIKRLNSQACEARVSAIYLDIISNFERVGDHSLNIAEVVLNLNNNLKKIEEASMGR
Specific function: Unknown
COG id: COG1283
COG function: function code P; Na+/phosphate symporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To B.subtilis yqeW [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=534, Percent_Identity=23.9700374531835, Blast_Score=170, Evalue=3e-43,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003841 - InterPro: IPR004633 [H]
Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 59261; Mature: 59261
Theoretical pI: Translated: 4.85; Mature: 4.85
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 3.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 3.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDIWSMLVGLFGGLGLFLYGMKIMGDGLENVAGDKLKGFFEKIASNPIKAVLTGVVVTAV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH IQSSSATTVMVIGFVNAGLMNLFQATGVIMGANIGTTVTGQLVALNLTGIAPIFIGVGAI HHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCEECEEEEEEECHHHHHHHHHHHH MLLFSKGNKIKDIGSIVLGFGMLFLGMKTMSSSMAPLADSEGFKSVIATLAFNPILGVLV HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GIGLTAIVQSSSATIGILIVLANNGALPVHVALPVLFGDNIGTCVTALLSSVGTNRNARR HHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE AATIHLTFNIIGTVIFVLLLTPVSNLVGYITPGDVGKQIANAHTFFNIANVIIQIPFIKY EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVAFVNKVIPQEEEEEVLGIKYIDDRLLETPVIAVGQCSKEIVRMAEKSKEILEQAVESL HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HTGDEELIKKAMEGEDFVDLLEEEITKYLVKLSNTQISTKEIDVVTSMFRVVKDIERIGD CCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HGKNIADLSSEKISKRLIFSEAAMKELSEIYKCVILALEKTILSFQNNDIELASEVYVLE CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHH DKIDELQDKSRDNDIKRLNSQACEARVSAIYLDIISNFERVGDHSLNIAEVVLNLNNNLK HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCHH KIEEASMGR HHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MDIWSMLVGLFGGLGLFLYGMKIMGDGLENVAGDKLKGFFEKIASNPIKAVLTGVVVTAV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH IQSSSATTVMVIGFVNAGLMNLFQATGVIMGANIGTTVTGQLVALNLTGIAPIFIGVGAI HHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCEECEEEEEEECHHHHHHHHHHHH MLLFSKGNKIKDIGSIVLGFGMLFLGMKTMSSSMAPLADSEGFKSVIATLAFNPILGVLV HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GIGLTAIVQSSSATIGILIVLANNGALPVHVALPVLFGDNIGTCVTALLSSVGTNRNARR HHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE AATIHLTFNIIGTVIFVLLLTPVSNLVGYITPGDVGKQIANAHTFFNIANVIIQIPFIKY EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVAFVNKVIPQEEEEEVLGIKYIDDRLLETPVIAVGQCSKEIVRMAEKSKEILEQAVESL HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HTGDEELIKKAMEGEDFVDLLEEEITKYLVKLSNTQISTKEIDVVTSMFRVVKDIERIGD CCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HGKNIADLSSEKISKRLIFSEAAMKELSEIYKCVILALEKTILSFQNNDIELASEVYVLE CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHH DKIDELQDKSRDNDIKRLNSQACEARVSAIYLDIISNFERVGDHSLNIAEVVLNLNNNLK HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCHH KIEEASMGR HHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11206551; 11258796 [H]