Definition Clostridium tetani E88 chromosome, complete genome.
Accession NC_004557
Length 2,799,251

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The map label for this gene is yjbB [H]

Identifier: 28210590

GI number: 28210590

Start: 931494

End: 933143

Strand: Direct

Name: yjbB [H]

Synonym: CTC00877

Alternate gene names: 28210590

Gene position: 931494-933143 (Clockwise)

Preceding gene: 28210589

Following gene: 28210591

Centisome position: 33.28

GC content: 32.06

Gene sequence:

>1650_bases
ATGGACATTTGGTCAATGCTTGTAGGGCTTTTTGGAGGTCTAGGACTTTTCCTATATGGAATGAAGATAATGGGAGATGG
ACTAGAAAACGTAGCAGGTGACAAGCTGAAAGGTTTTTTTGAAAAGATAGCTTCTAATCCAATAAAAGCAGTTTTAACTG
GTGTGGTAGTTACTGCAGTTATTCAAAGTAGTAGTGCGACAACAGTAATGGTAATAGGTTTTGTTAATGCAGGGCTTATG
AATTTATTCCAAGCAACAGGTGTAATAATGGGAGCTAATATAGGAACTACTGTAACAGGGCAATTGGTAGCTCTTAATCT
AACTGGCATAGCACCTATATTTATAGGTGTTGGTGCTATAATGCTTTTATTTTCTAAAGGAAATAAAATTAAAGATATAG
GAAGTATAGTGCTAGGATTTGGTATGTTATTCTTAGGAATGAAGACTATGTCATCTTCTATGGCACCTTTAGCAGACTCA
GAAGGATTTAAATCTGTAATAGCTACATTAGCTTTTAATCCAATTTTAGGAGTATTAGTAGGGATAGGTTTAACAGCTAT
AGTACAGAGCTCATCAGCAACTATTGGTATATTAATAGTATTAGCTAATAATGGTGCATTACCTGTACATGTTGCCCTAC
CTGTGTTATTTGGTGATAATATAGGTACTTGTGTAACCGCTCTTTTATCTAGTGTTGGAACTAATAGAAATGCACGAAGA
GCAGCAACTATACATCTAACTTTTAATATAATTGGTACCGTAATATTTGTATTATTATTGACGCCTGTAAGTAATCTCGT
AGGATACATAACGCCAGGTGATGTGGGAAAACAAATAGCTAATGCACATACATTTTTTAACATAGCAAATGTAATTATAC
AAATACCTTTTATTAAATATCTTGTGGCCTTTGTAAATAAAGTAATACCTCAAGAAGAAGAAGAAGAGGTATTGGGAATA
AAGTATATAGACGACAGATTGTTAGAAACACCTGTAATAGCGGTAGGACAATGTAGTAAAGAAATAGTCAGAATGGCTGA
AAAATCTAAAGAAATATTAGAACAAGCAGTGGAATCTTTACATACTGGAGACGAAGAATTAATAAAAAAAGCTATGGAAG
GTGAAGACTTTGTAGATTTACTAGAAGAGGAGATAACTAAGTATTTAGTAAAACTTTCAAACACTCAAATATCTACAAAG
GAGATAGATGTTGTAACGTCTATGTTTAGAGTGGTTAAAGATATAGAACGTATAGGAGACCATGGTAAAAATATTGCAGA
CTTATCTTCAGAAAAGATATCTAAAAGACTTATTTTCTCTGAAGCGGCTATGAAAGAATTATCTGAAATATATAAATGTG
TTATACTGGCTTTAGAGAAGACTATATTAAGTTTTCAAAATAACGACATAGAATTAGCAAGTGAGGTTTATGTATTAGAA
GATAAAATAGATGAACTTCAAGATAAGTCTAGGGATAATGATATAAAGAGATTGAATTCTCAAGCTTGTGAAGCAAGAGT
TAGTGCTATATATTTAGATATAATAAGCAATTTTGAAAGAGTAGGGGATCACTCTTTAAATATTGCTGAAGTTGTATTAA
ATTTAAATAATAATTTAAAAAAGATTGAAGAAGCTTCGATGGGAAGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTGTTGAATTAATGTATATTAAAATTAGTAAAACAAAAGTAAAGCATGTAAACAATCCATAATGTTTGGACAGTTTAAA
TTATTGGAGGGAATAATTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATAAGGATGCATATTATGCATCCTTATTTTTATCTTCTATAGTATCTTCAATAGCAATCTCTTCATTATTAGATATTT
CTTCATTTACATCTTCATCT

Product: sodium-dependent phosphate transport protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 549; Mature: 549

Protein sequence:

>549_residues
MDIWSMLVGLFGGLGLFLYGMKIMGDGLENVAGDKLKGFFEKIASNPIKAVLTGVVVTAVIQSSSATTVMVIGFVNAGLM
NLFQATGVIMGANIGTTVTGQLVALNLTGIAPIFIGVGAIMLLFSKGNKIKDIGSIVLGFGMLFLGMKTMSSSMAPLADS
EGFKSVIATLAFNPILGVLVGIGLTAIVQSSSATIGILIVLANNGALPVHVALPVLFGDNIGTCVTALLSSVGTNRNARR
AATIHLTFNIIGTVIFVLLLTPVSNLVGYITPGDVGKQIANAHTFFNIANVIIQIPFIKYLVAFVNKVIPQEEEEEVLGI
KYIDDRLLETPVIAVGQCSKEIVRMAEKSKEILEQAVESLHTGDEELIKKAMEGEDFVDLLEEEITKYLVKLSNTQISTK
EIDVVTSMFRVVKDIERIGDHGKNIADLSSEKISKRLIFSEAAMKELSEIYKCVILALEKTILSFQNNDIELASEVYVLE
DKIDELQDKSRDNDIKRLNSQACEARVSAIYLDIISNFERVGDHSLNIAEVVLNLNNNLKKIEEASMGR

Sequences:

>Translated_549_residues
MDIWSMLVGLFGGLGLFLYGMKIMGDGLENVAGDKLKGFFEKIASNPIKAVLTGVVVTAVIQSSSATTVMVIGFVNAGLM
NLFQATGVIMGANIGTTVTGQLVALNLTGIAPIFIGVGAIMLLFSKGNKIKDIGSIVLGFGMLFLGMKTMSSSMAPLADS
EGFKSVIATLAFNPILGVLVGIGLTAIVQSSSATIGILIVLANNGALPVHVALPVLFGDNIGTCVTALLSSVGTNRNARR
AATIHLTFNIIGTVIFVLLLTPVSNLVGYITPGDVGKQIANAHTFFNIANVIIQIPFIKYLVAFVNKVIPQEEEEEVLGI
KYIDDRLLETPVIAVGQCSKEIVRMAEKSKEILEQAVESLHTGDEELIKKAMEGEDFVDLLEEEITKYLVKLSNTQISTK
EIDVVTSMFRVVKDIERIGDHGKNIADLSSEKISKRLIFSEAAMKELSEIYKCVILALEKTILSFQNNDIELASEVYVLE
DKIDELQDKSRDNDIKRLNSQACEARVSAIYLDIISNFERVGDHSLNIAEVVLNLNNNLKKIEEASMGR
>Mature_549_residues
MDIWSMLVGLFGGLGLFLYGMKIMGDGLENVAGDKLKGFFEKIASNPIKAVLTGVVVTAVIQSSSATTVMVIGFVNAGLM
NLFQATGVIMGANIGTTVTGQLVALNLTGIAPIFIGVGAIMLLFSKGNKIKDIGSIVLGFGMLFLGMKTMSSSMAPLADS
EGFKSVIATLAFNPILGVLVGIGLTAIVQSSSATIGILIVLANNGALPVHVALPVLFGDNIGTCVTALLSSVGTNRNARR
AATIHLTFNIIGTVIFVLLLTPVSNLVGYITPGDVGKQIANAHTFFNIANVIIQIPFIKYLVAFVNKVIPQEEEEEVLGI
KYIDDRLLETPVIAVGQCSKEIVRMAEKSKEILEQAVESLHTGDEELIKKAMEGEDFVDLLEEEITKYLVKLSNTQISTK
EIDVVTSMFRVVKDIERIGDHGKNIADLSSEKISKRLIFSEAAMKELSEIYKCVILALEKTILSFQNNDIELASEVYVLE
DKIDELQDKSRDNDIKRLNSQACEARVSAIYLDIISNFERVGDHSLNIAEVVLNLNNNLKKIEEASMGR

Specific function: Unknown

COG id: COG1283

COG function: function code P; Na+/phosphate symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To B.subtilis yqeW [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=534, Percent_Identity=23.9700374531835, Blast_Score=170, Evalue=3e-43,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003841
- InterPro:   IPR004633 [H]

Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59261; Mature: 59261

Theoretical pI: Translated: 4.85; Mature: 4.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDIWSMLVGLFGGLGLFLYGMKIMGDGLENVAGDKLKGFFEKIASNPIKAVLTGVVVTAV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
IQSSSATTVMVIGFVNAGLMNLFQATGVIMGANIGTTVTGQLVALNLTGIAPIFIGVGAI
HHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCEECEEEEEEECHHHHHHHHHHHH
MLLFSKGNKIKDIGSIVLGFGMLFLGMKTMSSSMAPLADSEGFKSVIATLAFNPILGVLV
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIGLTAIVQSSSATIGILIVLANNGALPVHVALPVLFGDNIGTCVTALLSSVGTNRNARR
HHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE
AATIHLTFNIIGTVIFVLLLTPVSNLVGYITPGDVGKQIANAHTFFNIANVIIQIPFIKY
EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVAFVNKVIPQEEEEEVLGIKYIDDRLLETPVIAVGQCSKEIVRMAEKSKEILEQAVESL
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HTGDEELIKKAMEGEDFVDLLEEEITKYLVKLSNTQISTKEIDVVTSMFRVVKDIERIGD
CCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HGKNIADLSSEKISKRLIFSEAAMKELSEIYKCVILALEKTILSFQNNDIELASEVYVLE
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHH
DKIDELQDKSRDNDIKRLNSQACEARVSAIYLDIISNFERVGDHSLNIAEVVLNLNNNLK
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCHH
KIEEASMGR
HHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MDIWSMLVGLFGGLGLFLYGMKIMGDGLENVAGDKLKGFFEKIASNPIKAVLTGVVVTAV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
IQSSSATTVMVIGFVNAGLMNLFQATGVIMGANIGTTVTGQLVALNLTGIAPIFIGVGAI
HHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCEECEEEEEEECHHHHHHHHHHHH
MLLFSKGNKIKDIGSIVLGFGMLFLGMKTMSSSMAPLADSEGFKSVIATLAFNPILGVLV
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIGLTAIVQSSSATIGILIVLANNGALPVHVALPVLFGDNIGTCVTALLSSVGTNRNARR
HHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE
AATIHLTFNIIGTVIFVLLLTPVSNLVGYITPGDVGKQIANAHTFFNIANVIIQIPFIKY
EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVAFVNKVIPQEEEEEVLGIKYIDDRLLETPVIAVGQCSKEIVRMAEKSKEILEQAVESL
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HTGDEELIKKAMEGEDFVDLLEEEITKYLVKLSNTQISTKEIDVVTSMFRVVKDIERIGD
CCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HGKNIADLSSEKISKRLIFSEAAMKELSEIYKCVILALEKTILSFQNNDIELASEVYVLE
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHH
DKIDELQDKSRDNDIKRLNSQACEARVSAIYLDIISNFERVGDHSLNIAEVVLNLNNNLK
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCHH
KIEEASMGR
HHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]